Os01g0746200

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Gene Name

Os01g0746200

Description

Nup85 nucleoporin family protein

Version

NM_001050763.1 GI:115439896 GeneID:4326176

Length

7791 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0746200, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:32959291..32967081

Sequence Coding Region

32959413..32959840,32961777..32961879,32961990..32962100,32962202..32962285,32962503..32962574
,32962661..32962717,32963015..32963134,32963889..32964089,32964541..32964651
,32964753..32964790,32964875..32965031,32965288..32965389,32965466..32965522
,32965701..32965847,32966017..32966087,32966170..32966257,32966398..32966454
,32966584..32966781

Expression

GEO Profiles:Os01g0746200

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgccagggatgctgatggacggcggcggcgccatcgtgccgttctcgggagaaccaggccacgcggtggcggcggccccgcccgtgcggaacatccgccacggcgtggccccgcccatctcccgcgtctacgtttccttttctagcggcaacctcctgcaggtcgcctgcctccgcccaccgaatccggagggtggcggagaccgtggggcggaggaggtctccggggggagagtggtggaggtaaacctcggaggtggcggtagcgggcctggcggcgcggatgcggaggagatcgatgaggcggaaatgcggaggatcgagtacgggtcggtaccggcgtttgcgctgcttcagagcaggaagaacgcgctcgtagatggctccggtatgtcgcgcttgccctcagtctcggagcacgcagaatggtggcaatatgtgcttgaatacagtaaaaccatcggtagtctccttgggaacccagattctctttctgcttacatgattgatgacccaaagatgatccttaaggtcaaggagaagcctactagtttaaaggctgcgtgggagttgctagagatattctttgttgataaacagttgcaaacttggcttccagagcgtcttgttgattggttagccgactatgacagcctcttgaccaagacagagaacacgatatatcgcacgctgatcaatttccagaaaaagctcatcaacctgcaggttgttgaagatgatcctgattattggagtggattatcagcagctctatcggttggatggcttgatattgtggtgaatatgctacgttttcatggatcataccaattggatcagatggacagccgtgagacagaaaatgggttggttgaagctgttgctgttcttgtgtcaacaatgccacgcatgcgaccagatttgccatcgggtaaattaggccagtgttgtaaaacaagaccagattttataaaggcattggaaaaatggcgaggtcaagtaagtaaactggagtgcagtgcattctggattcagtgcggtcaccaaaaaactcgtgatggtctgaagagtttgcttcatattatgttggggaacataaagaacctcactgcttctacttcacattggctggagctctttgcttctcatttactttatataaggccattcacagtgggttttgaagggatgcatcagttagcacaaaagtgcatacagcttaaaccgtctgctgacaatagcggattgacaggcctccttactggtatcctttcagaaaatagagaggttgtcttggctgaatgcacaaaaaattttggtccttggatggtcacacatgctatggagctgctgactgctgacaatgactatgcggatatgatgttgcatgaagagaggcctaacttcggtggtataagcatagaggagctgcacaggcttgtttatgctcaagttttgtgctctcatgctttaacatggcagattgcaccaacttatctgtcctcatgtctaaaccaaggcctagggctgttggagattctgcttctgaagcaacccatacaagataatcgtgttgtattgaagactttggaaatttgccgcttgtatgagctggagaatgttagtacaaatatcatgaagattgctggcatttatcattggaaacatggtaggaaaggaactggagtttactggttccagcaagctaatgataaagttcgtcttgacagaattgctcaacaattattcgaacatattggcaagtcggtcacagatgatagttttaagcaatgggaggggctgcttgagttactaggttctgacatcggtagtgcaggtggtcttgagttccttcacaggtaccgagatttcaaaaggtcccttcagatggcacaagaaggaaggactggcgagtctgttcggcaaaccgtggagtttcttatacagctgatgagaaatccttctacacctcaacgtttctggctaccacttttacatgactcggtgaggcttctcaattgcaaaccctgcccattgttaaatgttgctgaaacgactttgttgctcaacaagctacaagaactgtcattggccaaacttcggcctgacttttccaacattcacctaccaagccatgcattgaactccgtcagattagctctagcatcaaaccttgcgcgtgcaattcttgaagaaccttaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPGMLMDGGGAIVPFSGEPGHAVAAAPPVRNIRHGVAPPISRVY VSFSSGNLLQVACLRPPNPEGGGDRGAEEVSGGRVVEVNLGGGGSGPGGADAEEIDEA EMRRIEYGSVPAFALLQSRKNALVDGSGMSRLPSVSEHAEWWQYVLEYSKTIGSLLGN PDSLSAYMIDDPKMILKVKEKPTSLKAAWELLEIFFVDKQLQTWLPERLVDWLADYDS LLTKTENTIYRTLINFQKKLINLQVVEDDPDYWSGLSAALSVGWLDIVVNMLRFHGSY QLDQMDSRETENGLVEAVAVLVSTMPRMRPDLPSGKLGQCCKTRPDFIKALEKWRGQV SKLECSAFWIQCGHQKTRDGLKSLLHIMLGNIKNLTASTSHWLELFASHLLYIRPFTV GFEGMHQLAQKCIQLKPSADNSGLTGLLTGILSENREVVLAECTKNFGPWMVTHAMEL LTADNDYADMMLHEERPNFGGISIEELHRLVYAQVLCSHALTWQIAPTYLSSCLNQGL GLLEILLLKQPIQDNRVVLKTLEICRLYELENVSTNIMKIAGIYHWKHGRKGTGVYWF QQANDKVRLDRIAQQLFEHIGKSVTDDSFKQWEGLLELLGSDIGSAGGLEFLHRYRDF KRSLQMAQEGRTGESVRQTVEFLIQLMRNPSTPQRFWLPLLHDSVRLLNCKPCPLLNV AETTLLLNKLQELSLAKLRPDFSNIHLPSHALNSVRLALASNLARAILEEP</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>123..550#2487..2589#2700..2810#2912..2995#3213..3284#3371..3427#3725..3844#4599..4799#5251..5361#5463..5500#5585..5741#5998..6099#6176..6232#6411..6557#6727..6797#6880..6967#7108..7164#7294..7491#ttctagtctgaaggctaacctgtagacttgtacagtacctcagttacccgggcccccgaacccccaaacccccgccgtctcccgcttccaaaaccctagctcatcgtcgtccggcggcggggatgccagggatgctgatggacggcggcggcgccatcgtgccgttctcgggagaaccaggccacgcggtggcggcggccccgcccgtgcggaacatccgccacggcgtggccccgcccatctcccgcgtctacgtttccttttctagcggcaacctcctgcaggtcgcctgcctccgcccaccgaatccggagggtggcggagaccgtggggcggaggaggtctccggggggagagtggtggaggtaaacctcggaggtggcggtagcgggcctggcggcgcggatgcggaggagatcgatgaggcggaaatgcggaggatcgagtacgggtcggtaccggcgtttgcgctgcttcagagcaggaagaacgcgctcgtagatggctccggtatgtcgcgcttgccctcagtctcggagcacgcagaatggtaagacattggaatttggaccgcctactttgctaaatgctagtatttttagtctggactgatgattaatatggcattttggctgctgtataagactttagaggtctataaactgttaactaggtgataccctgcgcgctgctgtgggaaatgaagaatacaactttgaagcatgggtgaaagattgagatagaagtcaataagaccagacaacttttggttttgttcatgaatcatggggagtgtagataatagcattaattcaaattggtgatgactttgtttcagggcaatgcctatatattggagataaacttgtccaggtagaatataaatccaagaagtatggctattctcgttgtatgggtagaatcacccatcgcaccaatcacaggacagaccgtaaacttacgattcattgactggttgagaaaaaaaaaagaaaggaactgttcttatttaacagtcagctcttatagcaacaatgtctacattgtgcgagggaatagtccgaaaaagatgacaacaattgtagtttacgaataaatacacatcactacaaatataaacaactgctaggatacttatgaattccaattcgaaactatgaaaatttcacaagcaaaactgacgaacaactaagcagtatagctaattgtatgcttacactgggaactttattggaaggagggcatgcatagcttttccggaaagaaaactgtagaccattgacaacatatcattttaatcattgtatataagcatccttcgatgttctattatctgctacaaatttgtccttgaattagcacatacatcattgactcatccttcttggagcacagccataacatatttctatacctgcccaagaaccattaatatttaaatcagagtgaaataaaaaaaggacttaaaccaatcaaatcatcaaaaagctatcttgcggttgagagaacagcggaaggcaaaataatctgcaggttgtacaaaattgcttttaagatcagcatcgaatcaaaagtaagagtcaaatgaaccgatcaaatcatcaaatcaaatatgttatcacttattcacttatcacctggtggatagaaaaagcaatagcccttggggggaaaaagataatactgtaaattaatatgaagatctaatgagaaaaaaatgatagcaaatatatcactcaccatgcaagagctgatgatcaaatatccggttggtctacaaaagagatagcgctggtatgcgtggctgcaggactgcaagaggatttcaaagatgctttggaagagaataaatctgattaaccatgacatttggtctcgctgctataattatcagaggcagtttctgctgcacaattgcttccatcgtaatgggagaagtagatgcggcaggctaggtgtgaaggggattggatccactaattaagaatttgtaggattcagagataaggggactggtccgaggataatcgtttagcgtcttgattatatctaatggctgagataattgtgatgatgtggcttaacctggtggctgctttgtagtagtaattgcactaagtgggttccaactatatagaaagaaaggattactgcccaagctatgcttgtactgggataggcatgtcacatatcgctcagaattttaagttttagcaatgctttgttatattgtttgtgttcgatagctatccaactattcagataccctttttcatattgtagaagctgaatttgtagctcttaggcttccgcctaaatggataaatcgacatatctgaagtacacatatggttaaattttaaacatctgtgccaaagtggtattataatcactgtttatacagttaatctagatcaaacctctgcctagtataagctatccattttttccatgtgcttgcttctgattctactatgttttgtcaggtggcaatatgtgcttgaatacagtaaaaccatcggtagtctccttgggaacccagattctctttctgcttacatgattgatgacccaaagatgatccttaaggtgaccatatctatgtgtcacattgtttcctgttttcttgctttgcctttgtttgaagttaaatttacttttttgcctatagaaagtaattggtatattttatcttgcaggtcaaggagaagcctactagtttaaaggctgcgtgggagttgctagagatattctttgttgataaacagttgcaaacttggcttccagagcgtcttgttgattggttagccgtaatgctctttctttgatctattgctttgtttcaattgtgagcggactttgctgttacaatacctaggggcgtctcttatcaggcttcctgtggttttaggactatgacagcctcttgaccaagacagagaacacgatatatcgcacgctgatcaatttccagaaaaagctcatcaacctgcaggtttgactcattatatttgttgtagcatatagcattagacgtcaaatttgtacctctcaatcattttatttgttcttttctctataaaacttctacaactccatgctttgagttgattgttttgtagtctattttactaatgttcatttgtgctacttccaaccattgattcaatagcagtaatgagtataaatgaataatgagtgatgctctataggttgttgaagatgatcctgattattggagtggattatcagcagctctatcggttggatggcttgatattgtggtaagctattttcttgcacgctattttatagacatgtcagttttgattgaatcctacaatcagaagttgttttttttttcttttaggtgaatatgctacgttttcatggatcataccaattggatcagatggacagccgtgaggtagttaggttgctttgagaccattctttatttcttcatgacttgcatctatcattcacataaaaatcattttatttgcttcaagggcttaatttgttatgttttctagtagtatttacagtgttgcactaatcttttgaaataaagaaaatgtgctatatcttcctatagtgtacctgattgtatacaattatatttcgttgtagctttgacaaatatgctatttttatgtcaccagttgatttatatacacttgcttttttaacatcacccttttcccccattttggtccatcagacagaaaatgggttggttgaagctgttgctgttcttgtgtcaacaatgccacgcatgcgaccagatttgccatcgggtaaattaggccagtgttgtaaaacaagaccagattttataaaggtatgttttgtgatgcagagttttgatgcatagaacattttgaatgtgtctgtctgatgttttgactttctggctgcatatccagtagtgcaaatctatgtttctgaagaatctaactctcttgctatgaaatgctatcattatttgattatattgattttaccctttttgctgccttagcacgcaattacacactacgctgtttgcctttcatgaccactaattcactatgatcttctcacatgactatcagtacactgcttattctttattagcccactagttcttcatttcaatgtatgccacttgtgcaactatttcttcacagtaaagcataatatttctttgtgcttctgatatattgtgaaccttctgaattcactccactggattcaaatgagagctgctctactgtgctcttttgtcactgattgctgctgcatcctcgggctgctgctggctttgcacccaccaccattgttccactgctcatctatgctgagagttactgactatgttggctgaactttgaattttgcacaatatgttcttttgtgattaataattatatgtttatatcctctcaagctcagtagcataatggttacttcaaaaaaaaaaaggaaggaaagggcagtgaaaatttgtgtaaaaacttgtatagtttcctgcccaagtgtttggaggtacacagaaattgtattgcctccattgacgtcagctaaaagcatttgccaaattgtattttttacaggcattggaaaaatggcgaggtcaagtaagtaaactggagtgcagtgcattctggattcagtgcggtcaccaaaaaactcgtgatggtctgaagagtttgcttcatattatgttggggaacataaagaacctcactgcttctacttcacattggctggagctctttgcttctcatttactttatataaggcca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External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0746200, RefSeq:Os01g0746200