Os10g0508500
| Gene Name |
Os10g0508500 |
|---|---|
| Description |
Similar to Tubulin folding cofactor D |
| Version |
NM_001071558.1 GI:115482859 GeneID:4349076 |
| Length |
8287 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0508500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:19972428..19980714 |
| Sequence Coding Region |
19972428..19972721,19972863..19973045,19973463..19973504,19973641..19973910,19974318..19974869 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:19972428..19980714 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008403:19972428..19980714 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggaggaaaccgccgccattcgtacatctggcatccccgtctctgtgtcctccacggcctctgcggatggcgacgcctctgctgatcccactgcctcggccgccgccgccgccgccacggtcggcgacgatgagcacgactcgaaggaggtcgtcctgcgcaggtacttcatccaggagtgggagatcgtctccgacatcctccgccgcatcgtcgacgccggtggcgtcgccgaacccgccgatgtccagaggatccgctccatcatggataaatatcaagaggagggtcaactcctagagccatatctagagagcatcatctctccacttatgctattagtccgttccaaaacaatggaactaggcgcttgcactgatgagctccttgacattatcaagcctctgtgtattatcatatacactctggtcacagtatgcgggtacaaaagcgtcatcaagttcttccctcatcaagtttcagatctagagcctgcagttgctctccttgaggagtgtcataaaatgagctcagcaacagctcttaggcaggagagcacaggagaaatggagactaagtgtgtcgttctattgtggctttatatactggtcttgatcccatttgatatctccagtgtggatacaagcattgctactgctgatcacgtggatgggcctgaaactgttccacttgtgacaaggatattagacatatgtaaggattatctctgcagttctggtccaatgagaaggatgtcaggattgctgctcgcaaggctattgactcgtccagacatgccaaaggttttcagcagttttatggaatgggcacaaaggatcttgttatctgtcacagatgactttgtggatcaatttagatcgattggtatagtggaagcattagcatcaatatttaagattggtaaccggaaagtgctatgtgatgctgtttctggaatttggaatgattgttcagttgtgatgaagactaacattgcatccagaagctctctccttagaaagtttctggtcaaactggcgcaacgagttgcactcattagcttgcctccccgttcaccgtcatggcgctatcagtcgataagtagttcactgggtgcaaacctttcaacttctactgatggaactgggacttcaagtggttcaactaaacaagtgaacattgaccagacagacacatcttctttagaggaagatatggatgttccagaaatcgtggaagagattattgacttgctgttgactggtttgagggattccgatactattgtgagatggtctgctgccaaaggagttggtaggataactgcacgtttaacacctgcattgtcagaggaagttctatcatcaatcttgcagcttttttctcctggggagggtgatggttcctggcatggaggctgcttggctttggctgaacttgctcgtaggggactgttgctgccttctagctttcctgatgttattcctgttataataaaggctttgcactatgatgtacgaagaggtccacatagcattggttcacatgttaattgcagaagagctgcttctgctgcctttcaagagaatgttggaagacagggaaattttccgcatggcattgatattgtgaatgcagcagactactttgcactggcttccagatcaaactcttatctgaatgtcgctgtttttgttgctcaatataaggagtatcttcatccgtttgcagaggagctactgtgcaacaaaatatcccactgggagagaagcttgcgagagttggctgctcaggccctttctatgcttgtacagtatgacatgaactactttgctggatatgcccttgaaaagttagttccctgcactctttcatcagatttgtgcactcgacatggggccactttagctgctggtgagattgctttgaagttgtatcagctcggttttacttttaccacagacatgcagaaagctctgtcaggaattgttcctgcaattgaaaaggcacgcctttatcgaggtaaaggaggagagataatgcgttctgctgtttcccgattcattgcatgcatttctatgtctgggatatccttgaatgagaagacaaagagaagtttgttagaaacccttaatgagaatttgaggcatcccaatgctcaaatacagtgtgctgctgttgatgcattgaagcattttattccaacatatctggtttcttccggtgaaaagactgctaatggcatcatcacgaagtacttgacccttctagatgacccaaatgttgctgcaagacgaggtgcagcacttgcccttggaacattaccatatgagttcttggtattaaaatggatgcctgtcataagtaagctgtgcagctcatgcacaattgaggataagcctgatgaccctgatgctgaagcacgtgtgaactctgttagggggctaattttggtttgcgaaacattaactgcttctgttgaacacagctcaagttttggcgattccatgtattcatacattaaagataaggtcatgcaagctttatttagagcacttgacgattatgctgtagataacagaggtgatgtgggttcctgggtacgtgaagctgcaatggatgcactagaacggtgcacatttattctctgcaagagagataatattgcagtgaaaataacaccagttgctgagcatgagtctaaatcgattgacattgacaccaatgcagttaacaccagatgccaactatttgattctagtattgcacaggatctggttgcaggcattgcaaaacaggctgttgagaaaatagataagataagagaaattgcagtcaaaactctgaagaggattctttacaatgaggaactgtttgtcccatctataccatacagggagctgctggaacaaattatacccaacagtgcagatctggagtgggcagttcctgcagtatcatatccacgatttgtgaagcttcttcaggtcagctgttacagcaagcctgtgctttctgggcttgtgatttctactggaggattgcaggaatctttgaggaaagcttcaacatcagctttagtagattatcttcaagattcagacatcaatacaaatgatgaaggaaaaaacagagaatatctattgagttgtgatcttctatgggttcttgagcattaccagaagtgtgaccgtgtagttactcccacattgaagactgttgaaactctcctcagtaaaaaggttttcttgcgtgaggggcattgtgagttctatagtggactgataaaatcgctgggcccggagctgaagggatcaaaggactttgcaaagttaagcgcaggtctctcaatacttgggtacatttcttcccagtcggatggaaatggcagcacggccttctctcaactcctcacattcctaggccacagataccccaagatccggaaagccgcagctgatcaggtgtacctcgtactgctgcaaaatgatagtttgatcgccgcggaaaatatggaaaaagcccaggaagtcatcgcggagacatgctgggaaggtgatgtggaggaagctaggcgcaagaggtcagaactgaatgagatggccggcttcggcgccgccacttcacagaagcctgggaatgaacaaacaaggaggaaaaccgaagagagaaatgctgcttcaactgacgagaacaaatcttactcttctttggttgatttcagtggatactag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEETAAIRTSGIPVSVSSTASADGDASADPTASAAAAAATVGDD EHDSKEVVLRRYFIQEWEIVSDILRRIVDAGGVAEPADVQRIRSIMDKYQEEGQLLEP YLESIISPLMLLVRSKTMELGACTDELLDIIKPLCIIIYTLVTVCGYKSVIKFFPHQV SDLEPAVALLEECHKMSSATALRQESTGEMETKCVVLLWLYILVLIPFDISSVDTSIA TADHVDGPETVPLVTRILDICKDYLCSSGPMRRMSGLLLARLLTRPDMPKVFSSFMEW AQRILLSVTDDFVDQFRSIGIVEALASIFKIGNRKVLCDAVSGIWNDCSVVMKTNIAS RSSLLRKFLVKLAQRVALISLPPRSPSWRYQSISSSLGANLSTSTDGTGTSSGSTKQV NIDQTDTSSLEEDMDVPEIVEEIIDLLLTGLRDSDTIVRWSAAKGVGRITARLTPALS EEVLSSILQLFSPGEGDGSWHGGCLALAELARRGLLLPSSFPDVIPVIIKALHYDVRR GPHSIGSHVNCRRAASAAFQENVGRQGNFPHGIDIVNAADYFALASRSNSYLNVAVFV AQYKEYLHPFAEELLCNKISHWERSLRELAAQALSMLVQYDMNYFAGYALEKLVPCTL SSDLCTRHGATLAAGEIALKLYQLGFTFTTDMQKALSGIVPAIEKARLYRGKGGEIMR SAVSRFIACISMSGISLNEKTKRSLLETLNENLRHPNAQIQCAAVDALKHFIPTYLVS SGEKTANGIITKYLTLLDDPNVAARRGAALALGTLPYEFLVLKWMPVISKLCSSCTIE DKPDDPDAEARVNSVRGLILVCETLTASVEHSSSFGDSMYSYIKDKVMQALFRALDDY AVDNRGDVGSWVREAAMDALERCTFILCKRDNIAVKITPVAEHESKSIDIDTNAVNTR CQLFDSSIAQDLVAGIAKQAVEKIDKIREIAVKTLKRILYNEELFVPSIPYRELLEQI IPNSADLEWAVPAVSYPRFVKLLQVSCYSKPVLSGLVISTGGLQESLRKASTSALVDY LQDSDINTNDEGKNREYLLSCDLLWVLEHYQKCDRVVTPTLKTVETLLSKKVFLREGH CEFYSGLIKSLGPELKGSKDFAKLSAGLSILGYISSQSDGNGSTAFSQLLTFLGHRYP KIRKAAADQVYLVLLQNDSLIAAENMEKAQEVIAETCWEGDVEEARRKRSELNEMAGF GAATSQKPGNEQTRRKTEERNAASTDENKSYSSLVDFSGY</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7994..8287#7670..7852#7211..7252#6805..7074#5846..6397#5530..5754#4660..4865#4364..4562#3919..4134#3625..3672#3309..3413#3057..3173#2752..2934#1832..2008#1484..1586#687..1234#1..267#atggaggaaaccgccgccattcgtacatctggcatccccgtctctgtgtcctccacggcctctgcggatggcgacgcctctgctgatcccactgcctcggccgccgccgccgccgccacggtcggcgacgatgagcacgactcgaaggaggtcgtcctgcgcaggtacttcatccaggagtgggagatcgtctccgacatcctccgccgcatcgtcgacgccggtggcgtcgccgaacccgccgatgtccagaggatccgctccatcgtatgctccttgtgccaacccccttctctctagatgttccatttcgctgaactatagatctatacatgagaacaatgcgtatttctagtaacaatgctccttttctgttcgttactaacttgctttgggttagagaacaaaaatcagtccgttccacagtttcagcgtctattactcaatgcagaaccaaatctgaattgcacagaattttaacccctatttgaattgtgttatgtttcacctaaataagttgagctatataggatgcaatgtaatctgtttgcttctactagttagcgaattgtacactgaaagcagttacagtttatcaatgttatgttatgaactatatgtcaaatcctccatgcttaagagtttggtacaaattaacttcatcttcttatttttttgctaaatagatggataaatatcaagaggagggtcaactcctagagccatatctagagagcatcatctctccacttatgctattagtccgttccaaaacaatggaactaggcgcttgcactgatgagctccttgacattatcaagcctctgtgtattatcatatacactctggtcacagtatgcgggtacaaaagcgtcatcaagttcttccctcatcaagtttcagatctagagcctgcagttgctctccttgaggagtgtcataaaatgagctcagcaacagctcttaggcaggagagcacaggagaaatggagactaagtgtgtcgttctattgtggctttatatactggtcttgatcccatttgatatctccagtgtggatacaagcattgctactgctgatcacgtggatgggcctgaaactgttccacttgtgacaaggatattagacatatgtaaggattatctctgcagttctggtccaatgagaaggatgtcaggattgctgctcgcaaggctattgactcgtccagacatgccaaaggttttcagcaggttatccttgcaactactttgttgcaacttacaactcttatccatacacatttcaaattgctgtagtacatttgagaatttcgtatcaccggtgaactgtcttgtttctaccagtacactgaatatttatattctctgaaatgattgtaatatattgatggttaatatccagttaactatttcagtgtagttctatgctactgtatgataaaggacaatgtttcaagttaccttgattctgtttttcagttttatggaatgggcacaaaggatcttgttatctgtcacagatgactttgtggatcaatttagatcgattggtatagtggaagcattagcatcaatatttaaggtttgtcccgcctttatcttttacttttgcaccaaacatcatactgtaaatttagtagagatagctttttctttagtatttagtactattgttcatttgtcttttctctaaacatgcgatcttgttttacatatatcattcttttaggatgttatcagtagggaatgagcacgacttttaacttttcataaaaaaacaatcattaaattttcctattcccttctttctgcttcatcgtgttgcagattggtaaccggaaagtgctatgtgatgctgtttctggaatttggaatgattgttcagttgtgatgaagactaacattgcatccagaagctctctccttagaaagtttctggtcaaactggcgcaacgagttgcactcattagcttgcctccccgttcaccgtcatggcgctatcaggttttaaaattttattaattgttagtacatcagtatctcgcaatcattactcgtaatttgacctttcctaagtcattgtggggttcagtaattattttatttagtatgatacaactctagaacctttagattgtttttgtagattcatatatcctttagtgaagttccagttatgatgtaaacgccagtttattactggagcatatgattactcgtacagtttactacagaatttaataagacatcgggttgacatgtgattgcagtctgattatattttatgcactgtgcacaactccagatcatatcaaaattttatggagattattatttttaattgttaaatgttgatatatgaaccattcagttggagaagagcttgactttaatcctagaacaccaatcctgttcagtgaaagaaataaacatagcttgctattaacctatcatctaccttattgatctgctatatttctgaataatagacatcttgcagaaaggtgtgatgatttaacacttctcatgaaaaataccgttttcttgggatctacctgctgaagcctgttgaaacatggaaataaatcctggcatgatatctatttgtgattaagtttcaagttttttcacatatttctttttatgggatgctatcatgtttgctctcattttttgtatcattacttccatttgtaggttgtaagacgatgtttccaccattatgttaatcgatttcccttatgcagtcgataagtagttcactgggtgcaaacctttcaacttctactgatggaactgggacttcaagtggttcaactaaacaagtgaacattgaccagacagacacatcttctttagaggaagatatggatgttccagaaatcgtggaagagattattgacttgctgttgactggtttgagggattccgtatgttgtcatcctaatattgttttgtaaagatccgaaatattttctaggtcatgttatacttattctcctttctatttaaccttgaattctgtaataatatttcttgattctctcttcaggatactattgtgagatggtctgctgccaaaggagttggtaggataactgcacgtttaacacctgcattgtcagaggaagttctatcatcaatcttgcagcttttttctcctggggaggtttgttgaagaactcatgtagtttaagacatcatttgactttttaaatattcctcagtttccatctctacctttcaaaagtgcaagtcctgagtgaaccacaagtatataccttatgacttttgggttctgaagggtgatggttcctggcatggaggctgcttggctttggctgaacttgctcgtaggggactgttgctgccttctagctttcctgatgttattcctgttataataaaggtacatactagaatggtaccaaataccacttatacatatatatagatcccatgatatattcttttagatgctaacactggcatcaaaggtgcatgttttctcaattctttacttgataaccaaaatgtttctgattatttggttaaacaagtcttgcctatattctgataaaacatttgaggcaaatccagtgacaattttagctctgcaggctttgcactatgatgtacgaagaggtccacatagcattggttcacatgtaagagatgctgcagcatatgtctgttgggcatttggtcgagcctataccaatttcgatatgaaggctgtattgcaacaacttgctccccatcttctaacggttgcatgttatgatcgagaggcaagttcattctgatttagtcattcatttgtggcatctagattttgtgatgcattctctagcatcttagtattttttttcttactgccgaatcatgtgtgtccttatacatatatgatgtaggttaattgcagaagagctgcttctgctgcctttcaagagaatgttggaagacagggaaattttccgcatggcattgatattgtgaatgcagcagactactttgcactggcttccagatcaaactcttatctgaatgtcgctgtttttgttgctcaatataaggagtatcttcatccgtttgcagaggagctactgtgcaacaaaatatcccactgggtactgtagtactacgacttattaattgtttcttgttcctgcattatatctgttttctgactttgcatgcttcaatctgaagatattaggcgtgatgcccttgaccaaacaagtttcatgatattcgatctcttggcccattgccttagtttgttcctattgtaaatttcagtgagatgagcttatgatttgtcagacgtgatgttggctgactttattttctttctaggagagaagcttgcgagagttggctgctcaggccctttctatgcttgtacagtatgacatgaactactttgctggatatgcccttgaaaagttagttccctgcactctttcatcagatttgtgcactcgacatggggccactttagctgctggtgagattgctttgaagttgtatcagctcggttttacttttaccacaggtaagagatccatttatctagattatctcttgtaatactttttatctgaattgtttaccctataaactcctttgcatgggtgttcattattctatagacatgcagaaagctctgtcaggaattgttcctgcaattgaaaaggcacgcctttatcgaggtaaaggaggagagataatgcgttctgctgtttcccgattcattgcatgcatttctatgtctgggatatccttgaatgagaagacaaagagaagtttgttagaaacccttaatgagaatttgaggcatcccaatgctcaaatacaggtgagagctttctttggtcttgaatcagcaactgaacaaatttcccatgtaattatgcttggttaggctacagtctactataactttccagttctcaggtttatttctaaaaatactccctacattccatattataagacgttttgggtttgtcctaggtgaaacttcatgtttgaccaagtttacatataaaaaaaaacgtagcaagtccacaaaacaaacacacttacaaaatatattcaatggtaaattttgatgaaattagtttggtgttgtagatgttgctatttttttttctataaacttggtcaaacttgaagtacaattgtagtaccgctccaatatatatttaatcaatacactattatagcctagacccactgtgcaaatcaacaatgtaaatctttctccttttctccattgacataataatttctaggccctgagagcaacattgtggctacttcttttccctgttttaataatatattagataacaacataggcttgttgatgtcaattattcactcaaaagtgaccctctcagcaaccacctgtatcttattgtcttgtgttctgttgtttgatatggcactgaacattgtacaagcatgactggtgcatctgtgctttagactgagtgttattctacaattttgtccagtgtgctgctgttgatgcattgaagcattttattccaacatatctggtttcttccggtgaaaagactgctaatggcatcatcacgaagtacttgacccttctagatgacccaaatgttgctgcaagacgaggtgcagcacttgcccttggaacattaccatatgagttcttggtattaaaatggatgcctgtcataagtaagctgtgcagctcatgcacaattgaggtaatgagattacctgagccaaatattaactcattctgttgatttgcttctgggattgtagaactgaaacttcagtttcatgaatatgtaggataagcctgatgaccctgatgctgaagcacgtgtgaactctgttagggggctaattttggtttgcgaaacattaactgcttctgttgaacacagctcaagttttggcgattccatgtattcatacattaaagataaggtcatgcaagctttatttagagcacttgacgattatgctgtagataacagaggtgatgtgggttcctgggtacgtgaagctgcaatggatgcactagaacggtgcacatttattctctgcaagagagataatattgcagtgaaaataacaccagttgctgagcatgagtctaaatcgattgacattgacaccaatgcagttaacaccagatgccaactatttgattctagtattgcacaggatctggttgcaggcattgcaaaacaggctgttgagaaaatagataagataagagaaattgcagtcaaaactctgaagaggattctttacaatgaggaactgtttgtcccatctataccatacagggagctgctggaacaaattatacccaacagtgcagatctggagtgggcagtaagtgattattcatcaatttctcttctgttgttcaatgtattgtttctaatgctggcgttgctgttgttacaagactagttgaggtgcctataactctgatctcataattcccatatgctcaacaatttattcttattgctcaaaaaacttaagttatcatgaaagtggatttaagggtttagatttacagtgaccttgacttgtaagtttatctatttcttgagtaactgatttttatattgttctattgaacaaattttagttgtttaaccattgttgcctcagtaattattttcactgccagtgcacatattatttaaccattgtttaaccattgtgcacatattatttgactaggtggtagtgttatccagatttggctgacaacacatttccttcgttaggttcctgcagtatcatatccacgatttgtgaagcttcttcaggtcagctgttacagcaagcctgtgctttctgggcttgtgatttctactggaggattgcaggaatctttgaggaaagcttcaacatcagctttagtagattatcttcaagattcagacatcaatacaaatgatgaaggaaaaaacagagaatatctattgagttgtgatcttctatgggttcttgagcattaccagaagtgtgaccgtgtagttactcccacattgaaggtaacagaaacataattatattgccgagcggcatgtttcggttgatgatttgaaccaataaattttcacatgattttatatactttttccacagtcgagcttacacatttatcttctttttattaaatgtatgcagactgttgaaactctcctcagtaaaaaggttttcttgcgtgaggtgagtttttactaatgttgtgctgtacactgttagaggctaggaagtttgctgtggcacatttgtgaatgaaaaataagcacaaaagatatttttgttaggcctttaagattgggaggcatggtaaagaaaaagaaaagaaaaagaaatagaacatcataagataagataagaaaaaagaaatagaacattataagatttcaaaggttggaacatgctcatcgctgatcagaatttggagcacataacttcatactgtatcatacttttgtagcttaaatctataacttgaaagcccatgcagtaggaaataactacagaaactgggttagttcatggtattacagaaagaatcttgaaataatcttatgatttacaaggtacacttatacctcctggtcttgcaacactgagcaggggcattgtgagttctatagtggactgataaaatcgctgggcccggagctgaagggatcaaaggactttgcaaagttaagcgcaggtctctcaatacttgggtacatttcttcccagtcggatggaaatggcagcacggccttctctcaactcctcacattcctaggccacagataccccaaggtgaatactttcaccatttgttgcctgagaattgcagaacaccacgcaatgataaattgagctcagatgttctctccaaagtacacaacaccatgcaatgataaactgatctcatatgttatgttctctaccaacttgcagatccggaaagccgcagctgatcaggtgtacctcgtactgctgcaaaatgatagtttgatcgccgcggaaaatatggaaaaagcccaggaagtcatcgcggagacatgctgggaaggtgatgtggaggaagctaggcgcaagaggtcagaactgaatgagatggccggcttcggcgccgccacttcacagaagcctgggaatgaacaaacaaggaggaaaaccgaagagagaaatgctgcttcaactgacgagaacaaatcttactcttctttggttgatttcagtggatactag</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
