Os01g0775300
| Gene Name |
Os01g0775300 |
|---|---|
| Description |
TRAF-like domain containing protein |
| Version |
NM_001050943.1 GI:115440256 GeneID:4327886 |
| Length |
10007 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0775300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:34529411..34539417 |
| Sequence Coding Region |
34529582..34531429,34532184..34532370,34532448..34532575,34532668..34532871,34532961..34533111 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:34529411..34539417 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MEHDMTVEDFIRTNGLGASGLIETNNQGVSTSSVSDCRSCEHVE NGSPSTAPPFWDSDGEDDDPVTSGPRPSDLFGRYTWRIENFSKEKKREMKSEPFEAGG YKWYILVYPQGCDVSNHLSLFLCVANHDKLLPGWSHFAQFTIAVGNLDPKKVKYSDTL HKFWKKEHDWGWKKFMELSKIQDGFLVDDVLEIIAQVQVIREKVDRPFRCLDRPYRRE LLRVYMTNIEQIYRRFVEERRSKLCKLIEDKMRWSSFRAFWLAIDQSTRHRMSTEKSD VILKIIVKHFFVEKEVTSTLVMDSLYTGLKALECQSKSKSKKGIIDSVDFVELPVPMV HVDVDMFVLAGDVIALLERAALEPLPCQPVSPKDDKCSQSRTKDGSSGEVNKVSIERE ERRLTELGQKIIETFALSHIFSGIEVAYQEAVALKRQEELIREEEEAWLLENEMKGKR GSTTEKDKRAKKKQAKQKKNNRKVKDKDREEKCDSNFPERSQDENTIHDREDSKQAGQ ISMKVDTSEEGASDVSDNLDGSIEIQKKHSTMENKSLSCSSESATMNNAQGKINNLLE SKDQISRNRGKARSRSTSNMNITEDVDDLPSSTTSSDRNTSGCGPAPKLDQETVLLTL KDRLRKLGQRLHEKEIEGRKLLQAHLEKKAAAESATGSSSSLSSNSLEETPEVLKSPD QSSVTISDADINASPSKFGASKEVTPVTPTTILSTEPVPTVASTLSKDEPVLCEDHVS CSTPQIDTPITSNPPQVVKTVTLPSGMLLVGHAIQAPSRSPAPQVDRVSKAIAAPTKS PAPQVDKVSIAVPTPSKSPATQGEKVAKAILVPPKSLAPQVGKVAKTIPTPKQPAPLV DKVTSLDPVSKQMSSMSNSEAREAILPKKAAVLSVSQTPAISRPSSAPLFQVPRSTLP PTPAVQVPPMLSRSMTLAGRSRNEPSPSVPSYTAQTYRNAIIGKSNLDTASASLDHST SFGQNVALSQPLSSYASAASAMVPPVGRNGQLPGKQGFMFGQGKSEAIDNWNPWKGDS NANKYMWKDDSPYHQMTKGDAHTQSWRDNSYQQAGCSGTGEQGEFGGLQYRQFQREIP TNLVSYQLPGPVGEEFPHLDIINDLLEEEQSSGSMAEPTLHGYHTLGLPYSSRGNLVD SEVTSISSSGRLNLADHYYDEGYPMAYDRLNALYRLREGQNSTLDAYSNGRMDSITSK PWLHNFSNPAVNLGVNPNGFSQQMGNYTNLGSGRVNGEHLYRHANGQW</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7989..9836#7048..7234#6843..6970#6547..6750#6307..6457#5297..5406#3927..4296#3641..3799#2982..3111#2841..2909#2676..2764#2391..2511#760..952#gccgccgccgccgccgccgccgccgccgcagtagagtctgcagcagccgcagccgccgccgacgcggcggctctctctgctcgccatccgcgtccggcgtaccggctgccgacgcaggtgagacgctaggccctttcctcccggccgacacgggatcggggaggcgcgcgcgcgtggcgccgcgggcgctgatgagatatggttgcggcgggggactagggtttgagggttagatgcgccggcctgtttggtttggctgttggggattttttggagtcgcgaaaggaattcaacgttgtctcgaggggaggcgtacctgagtttctcccgcctgcttgtagctttgcgttccgtatatatttccagtgaaattcggttgcccgcgcttcgtaacgaagggcttttggttttatatggatggtacttgtgtgcagtgatcatggatttctgtgggtggattatagttattctgaagccggtttggcttgagttttgagggcttagcacaggtttgactagcctgccattttgatactgtaaagtacacatgctgatatagtgatatttctggatttctgtggttgggttagttaccctggaatcggcttggcatgagttttgaaggcttaggcgcttagcacatgtttgattagactgccattttgagacagtaaagtaagcatgttgaatttagcacatatttccttgtttctgtacacagatccgaagtcaggctctgtacggttctacgattatttgatggagcatgatatgacagttgaagattttattagaactaatgggttaggggcaagtggattgatagagaccaataatcaaggtgtatccacttcttctgtgtctgattgtcggtcctgcgagcatgtcgagaatgggagcccttccacggcccctcccttttgggactctgatggtgaagatgacgatcctggtatgcaaataacactacttttgttcactgtgatgataattaccgtaataattcaaaatgatagcgctagagtttgaaatttttatagcctatttatgggaaaaacaaacagccatttctcaactaagagttatgattagttccttaggaagataatattatgttgaaatatgtgtctggcaggccagtgctggaaactgtaatcttgagggacgcgcattaggccctgtttctttcagcttgggattattataatccagattattgggagtaagcagaaagaaacaaacaacttattgaagtagcttattataatctgttaagctcatttaggtgagctttttccagattattgggtgaaaaattacccaccatgccaccccactccctctttagacttgcaaacccaataatctaggctccattctactacagattataacaatctagcttatattaatctgactcaataatctagattataataatcttaagctgaaagaaacagggccttagtatggacagagattacatgcttaaatttgctatgaagacctgaaagaactattttttctagtcatactcaaaagtatcattagtttgtttactcctattgtttcttcctcttgtacacataacacattcaacgtgccagtgcaatgcagttgcccttctgaatattgcacttttggccacctgtacttatctctacctttaagccctatgtttcactctgggttaaataactaggttaacttaactcatttcttgtgtttggcagcagacgtagttaacctaagatactgtttagcttgattagtatctgtttagctgggttgacagttcagaagcctagaagggttaattgtgtctttttagctaattcactttttggttattcgctaatcaccatatttctgcttgtatccagaaacagttgcctgaaaacatgtgtttcttgcttgcatcccaaatacattatgttacagttgacatatttttatgtcatcatcatatgccgtgcattcctatccatgtcaatatatcaccatgtcattaagttaacgaagcttcctaaaaacttatctccaaaagtattatttgccgttgtacatatgaattatttatccacgaagaatgctgttatccattctattcttggtctttgtaaagttgaactgagtttagggcataaaaagagttttggagtacacatgctgctgtctatggctactaatatatgttactagtatttaccaacatttttgtttgacagaagtgataaacctgcgaacttcttgtcagttacagttcttgacacaatagtaattatagttccatcttcaaattaacctgttttttttttctttagcgatgtttctttctttattgtaattgaataattgcagctacatttcatttggctaatctctgtcagttacctcagggcctagaccttcagatttatttgggcgatatacttggagaattgaaaacttttcaaaggagaaaaaaagagaaatgaaaagcgaaccatttgaagctggtggttacaaatggtaggattcctgatggtaacttactagaaaatttggtcacagcaattctcttttcggagctggaaactctaaattgcttagtagctcagtttgtaatgcattctgcttagattctctattccattgactgacaaatcactcatcactaattgttatttgtgcaggtacattctagtttaccctcaaggatgtgatgtctccaatcacttgtcattatttctatgtgttgctaatcatgacaaacttctcccaggtttgctgttattatgttggctaaactatcttatgtgttcctcacagtatttaatcacacccttaacacatttcaggatggagccatttcgcacagtttactatagctgtgggtaatcttgatccaaagaaagttaaatattcaggtgaggcaatctgtgattcttattgtttgaattaaacactctgtttcagagtttaactaagtaagtttgcagacaccctgcacaaattctggaagaaagaacatgactggggatggaaaaaatttatggagttgtcaaaaatccaagatggtttccttgttgatgatgttcttgaaatcattgctcaagttcaagttatcaggtaggcagtttaccaattttcaggattagcacctaaaagagtaaaatttgtttgcagttctatatgattgaaataaattgcatatctatggccttatatgtaaagcattccacagatatgcttttagatatgtttttcctatgtccctgaaacacgaaagatcacttcatttaattgttcctacgatgcttttgtgctaagatgattttgttgggggcatttatgctctccataattcaagttttactcttcatgtgcagtttcgacttattgaaatcttaactgtaccctgttgtgagctgtataaacctttcttttgtttttattgcatgttgcaacatgttatactgcgatttattcaaagatctctctttgttaatgcctctattttctctaattatttaagtcctagcttctatgtttaatttgtcaatgctcaactatggtgtgctcagaaatttggttatatacttataaattgattgctggacattcagtaactgttctcttctgcttttcaatactggagggagaaagtggatcgcccatttcgttgcctcgatcgcccttatcgacgagaattactccgtgtctatatgaccaatatagagcaaatttaccgacgctttgttgaagagcgcagaagtaaactttgcaagctcattgaggacaaaatgagatggtccaggttatacaattaaagttatcaacatcctgttatcctttcataatgattaagtatctgtgcgcgctcgcgtgtgtgtgtttttaaaaaagttaatactaacacatgcatatctttgtttgtactgcagtttccgtgccttctggcttgcaattgaccaaagcacaaggcatcgcatgtcgacagagaagagtgatgtcatactgaaaataatagtgaaacatttctttgtggagaaagaagtaacttcaacgttagttatggactctctgtatacggggttgaaggcgctcgagtgccagagcaagagcaagagcaagaaaggcataatagactcagtggattttgtagagctgccagtgcctatggtccatgttgatgtggacatgtttgttttggctggtgatgtcatagctttgcttgagagggcagctttagaacccttgccttgtcagcctgtgtctccaaaggatgacaaatgttcccagagccgcactaaggtaggtatttttcatatgatttattcattcagtttctggactatacagttaataatattgagtttctggcccccaaaatgaatgttagtatttcttgtttcactgatatggaattaatttagtttagttcaaatctctttagtttgcatcctatgtcaaacttatttccttgtcttcccagtttccaccattatttgacctatttttagacagaaggccaatggcccagcttatattgaaagccaaagggttttacaacgctgggggttacccagttcaaaagcagcgcaacgcaggggaagtagtttgccttacaacagctttagaagctgaaacagagatggcacgcaggcccgaacattaaaaacaaagcaaaaagagccggggcatcaggaagtcatcccacaccggatctcagtgattgcacggctgccaggatcttctcctccagctggtccagttggacctatttaatattttaattttgcatcctctttcatgctttctccatagtttgttgttaagcaagaatgattctttttttcggag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