Os01g0872700
| Gene Name |
Os01g0872700 |
|---|---|
| Description |
Putative 5-3 exonuclease domain containing protein |
| Version |
NM_001051482.1 GI:115441334 GeneID:4324952 |
| Length |
7797 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0872700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:39600841..39608637 |
| Sequence Coding Region |
39601233..39601899,39601981..39602087,39602176..39602251,39602335..39602439,39602639..39602796 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:39600841..39608637 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:39600841..39608637 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgggtgtgccggcgttctaccggtggctggcggagaagtacccgatggtggtggtggacgtggtggaggaggaggcggtggagatcgagggcgtcaaggtgcccgtcgacacctccaagcccaaccccaacggcctcgagttcgacaacctctacctcgacatgaacgggatcattcacccctgcttccaccccgaggataggccctctccgacaacattcgctgaggttttccagtgcatgtttgattatatcgataggctatttgtcatggttcgccctcggaagcttatgtatatggccattgatggtgttgctcctcgtgccaagatgaaccagcaacgctctagacgattcagagctgcaaaagatgctgctgatgcggccgcagaagaagagaggttgcgtgaagagtttgagagggaaggcagaaaacttccaccaaaacagcaatctcaaacatgtgattctaacgttattactccaggaacagagtttatggctgttttatcgattgctttgcagtactacatccatctcaggttgaattatgatcctggatggaaacaagttaaagttattctttctgatgccaatgttcctggtgaaggggaacataaaattatgtcctacattcgcggtcaacggaatctccctggatttaacccaaatactcgccattgtttgtatggcctggatgcagacctgatcatgttagctcttgcaacacacgaagtacatttctctatactgagagaggtagtttatacacctggacagcaggacaaatgcttcttgtgtggtcaggttggacatctagcagcaaactgtgaaggaaaggttaagagaaaagctggggagtttgatgaaaaaggtgaagctattgttccaaagaaaccttaccagttcttgaatatatggaccctccgggagtacttagaatatgagttcagaatgcagaatccacctttcccgattgactttgaacgcatcgttgatgatttcatcttcatgtgtttttttgttggcaatgattttcttccacatatgccaacattagagattcgtgagggagctattaacttgctaatggctgtatacaagaaggaatttccttccatgggtggctatctaactgatgcttgcacgccggatctgaataaagttgaacactttattcaagcagttggctcctacgaggataaaatatttcagaaaagagctcgtttgcatcagcgtcaagctgaaaggataaaacgagaaaaggcccaagcaaaacgaggggatgacctggatccccatgtcagggatgatcttattgtacctgttgcacgcttccaagggtctcgccttgcatctggacctgtgccttcaccatatgaacaaaatggatctgacaaaaacaatgggggaaaaaatagtcgtgctcggaaagctgcacgggtatcatcgtcaggttcaagcattgcggctgctattgttgaagctgaaaatgaccttgaagcacaggaacgcgaaaacaaggaagatttgaagacaatgcttaaagatgcacttcgtgagaaatctgatgtttttaattctgaaaatccagaggaggacaagataaaacttggagaaccaggatggagggaaaggtactatgaagagaagtttggagcaagaacacccgggcagattgaagaaatacgcagagatgtcgttctgaaatatactgaaggtttgtgttgggtaatgcactactattatgaaggtgtctgctcgtggcaatggttttacccttaccattatgctccttttgcttcggatttgagtggtctaggtcaactcaatataacttttgaacttgggtcaccattcaaaccgtttgatcaacttatgggagttttcccagctgctagctcccatgcactccctgtacagtatcggcaattgatgacagatgcaaattcaccaataattgatttttatccaactgattttgaagtagatatgaatgggaagaggtattcatggcaggggatagcaaaactgcccttcattgatgaagcccggttgctagctgaaattaaaaaagttgagcatactttgacgcctgaagaagcaaggagaaacagtatcatgttcaatatgctttttgtgaatggctcccatccactttcgccttatatctactccctcaacagcaaatttggacacctacctgacagagagcgaaatgaaattaaagaaaagattgatccttcttctagtggaggaatgaatggttacatctcactttgtagtggggatccgtgccctcctgtcttcaggtctcctgttgatgggttggaggatatcatggacaatcaagtgatatgtacaatctacaagcttccggattctcataagcacatcgctcgtccacctgttggtgtaatcatacccaagaagactgttgaagctactgacctgaaaccaccacctgtgctatggcatgaagacagtggtaggaggcctcatgataataacaacaggaggccttatgaaaacagcaacaggcaaaacccagctggagcaatatctggccgccaacttggggaagctgcccaccgacttgtggtgaacagcttgaatgctcggagtggcggacaatacaataccccatcgatgccatatcaaaccataatgaatggcatgccttatccaaatgggattccaccaaggatggagcagcctgctcctggctggcatgttcctggtgatctaccaaatggtcaggtaccaccagcttatgcatcatcatcaggtcattatcagaacgataggtctgggccttctcagtatggacgagataaccatggaaggtacccatatgcaagagacaaccaccatgattcaagaggaagggttccaccataccatcagagcggtggaaactcgtatcaatcacattctgctccatcagcaggtcctggacggtatgcgcaacccccaccatatgctggggggtatggtaggagctaccagcctgcaccgtatggaggtggtcagcagtggcagcagcagcagcaacaaccttatggctcctatgctgggtcagggccttatgggggtggggcacctcctgcaaggcctaattcacgaccacagcagtcgcagaaccgttacaataccttagataggaattctaacaggagacctccaccaggtcatgggcgacactaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGVPAFYRWLAEKYPMVVVDVVEEEAVEIEGVKVPVDTSKPNPN GLEFDNLYLDMNGIIHPCFHPEDRPSPTTFAEVFQCMFDYIDRLFVMVRPRKLMYMAI DGVAPRAKMNQQRSRRFRAAKDAADAAAEEERLREEFEREGRKLPPKQQSQTCDSNVI TPGTEFMAVLSIALQYYIHLRLNYDPGWKQVKVILSDANVPGEGEHKIMSYIRGQRNL PGFNPNTRHCLYGLDADLIMLALATHEVHFSILREVVYTPGQQDKCFLCGQVGHLAAN CEGKVKRKAGEFDEKGEAIVPKKPYQFLNIWTLREYLEYEFRMQNPPFPIDFERIVDD FIFMCFFVGNDFLPHMPTLEIREGAINLLMAVYKKEFPSMGGYLTDACTPDLNKVEHF IQAVGSYEDKIFQKRARLHQRQAERIKREKAQAKRGDDLDPHVRDDLIVPVARFQGSR LASGPVPSPYEQNGSDKNNGGKNSRARKAARVSSSGSSIAAAIVEAENDLEAQERENK EDLKTMLKDALREKSDVFNSENPEEDKIKLGEPGWRERYYEEKFGARTPGQIEEIRRD VVLKYTEGLCWVMHYYYEGVCSWQWFYPYHYAPFASDLSGLGQLNITFELGSPFKPFD QLMGVFPAASSHALPVQYRQLMTDANSPIIDFYPTDFEVDMNGKRYSWQGIAKLPFID EARLLAEIKKVEHTLTPEEARRNSIMFNMLFVNGSHPLSPYIYSLNSKFGHLPDRERN EIKEKIDPSSSGGMNGYISLCSGDPCPPVFRSPVDGLEDIMDNQVICTIYKLPDSHKH IARPPVGVIIPKKTVEATDLKPPPVLWHEDSGRRPHDNNNRRPYENSNRQNPAGAISG RQLGEAAHRLVVNSLNARSGGQYNTPSMPYQTIMNGMPYPNGIPPRMEQPAPGWHVPG DLPNGQVPPAYASSSGHYQNDRSGPSQYGRDNHGRYPYARDNHHDSRGRVPPYHQSGG NSYQSHSAPSAGPGRYAQPPPYAGGYGRSYQPAPYGGGQQWQQQQQQPYGSYAGSGPY GGGAPPARPNSRPQQSQNRYNTLDRNSNRRPPPGHGRH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6739..7405#6551..6657#6387..6462#6199..6303#5842..5999#5665..5739#5544..5584#5380..5456#5167..5295#4990..5060#4718..4813#4466..4561#4097..4369#3093..3179#2872..2949#2536..2700#2282..2428#2067..2129#1849..1968#1507..1698#1302..1378#854..956#163..366#cctcccctccccgcccgcgtggcctacccccttcgttagggtttcgcgccctcttccctctctcccttcccctcggccgtcggcccggctcctcgcggcggcggcggcggcggctcgctttctagggttagggttagggttccggcggcggaggaggaggagatgggtgtgccggcgttctaccggtggctggcggagaagtacccgatggtggtggtggacgtggtggaggaggaggcggtggagatcgagggcgtcaaggtgcccgtcgacacctccaagcccaaccccaacggcctcgagttcgacaacctctacctcgacatgaacgggatcattcacccctgcttccaccccgaggatagggtacgtcgatgttttttttttgggcgtttctgtttgcgtagctctggggtttgtttgggtgttcgtatggtgtccctccgctgtacaggtgatggatttgtgtatgcctgattgatgtacgacggagctgtggcagaggagatagtttggtgaaatgattttgtagcttcctgttttgtaatttacctgagcgttaaacataattttgcaaataaccacaaactgctaaattgccacatgagccatcttaggatgaggatgctgctgtagtttaatcttcaaactctgcatcgcaaatttgttaatttgcctttttgagttatgtttattttcattcggtggacgcaccagtttagactgcatgatgctactctgtcattgccctgcatttctcttcgaacaaatattttaatgtttactgattgctcaagtgctttctgatttctctgctgaccatgatttcttgctattgtgttatcttttacagccctctccgacaacattcgctgaggttttccagtgcatgtttgattatatcgataggctatttgtcatggttcgccctcggaagcttatgtatatggccattggtacgtataacatctgatgtgtaggaattctcttactacctttttccttcctaaaggattaggagtgtttagtgtcattgctcttttacctgttggtcatcatcatagaacagcttgccatactgccaactaatgcctttgttgaagttagctatatactatgacgagtcatttacatgagttttgaatcaggcataatcctcacccgtaaactatttatttggcagcatagtacctgtgcttgtaaacttttgctgtccagggtcctgttttttaccacatatgttttgttcttgtcgatggtttcttgttgatattttgtattatcttacaatggttttacagatggtgttgctcctcgtgccaagatgaaccagcaacgctctagacgattcagagctgcaaaagatgctgctgatgcggtcagtattctagtgaaattatcttcctttatgcagtgtatgataatatgtcgacatttaaattcccattcatcgacggcttcaaggggtagaattgcatttatggcttattatttttctatctccaggccgcagaagaagagaggttgcgtgaagagtttgagagggaaggcagaaaacttccaccaaaacagcaatctcaaacatgtgattctaacgttattactccaggaacagagtttatggctgttttatcgattgctttgcagtactacatccatctcaggttgaattatgatcctggatggaaacaagttaaagtaagcatggttttaagcctatcagttttgttttggcattacattctgtcagtatgttccatatgttaacttcacaaactctaaggtttacattgattggaaaggcaagtatgaaaaagtcatgtgtgttctggttaaattcttttgaaggttattctttctgatgccaatgttcctggtgaaggggaacataaaattatgtcctacattcgcggtcaacggaatctccctggatttaacccaaatactcgccattgtttgtatggcctggtatgttctataaacctattttttatatattttaattgggcaatgtttcttctgttggtcctgctaatgcatttttttatatatactcttgaatgcaggatgcagacctgatcatgttagctcttgcaacacacgaagtacatttctctatactgagagaggttagctctcctcaggacctagaatcaatgcctttttgtgtaaatacattttaccatgttatgctaactaaaagagcggattagttccttatgctttcttgtttatgttatttgttttctctctcttctgactatattttggtttcttgcaggtagtttatacacctggacagcaggacaaatgcttcttgtgtggtcaggttggacatctagcagcaaactgtgaaggaaaggttaagagaaaagctggggagtttgatgaaaaaggtgaagctattgttccaaagaaaccttaccaggtaatattgtctctttcctttgttgcaatttgtggtctaataagtacactttatgaatttgctgaggaccttgttttattttaattgctccttgtgtgacattgcagttcttgaatatatggaccctccgggagtacttagaatatgagttcagaatgcagaatccacctttcccgattgactttgaacgcatcgttgatgatttcatcttcatgtgtttttttgttggcaatgattttcttccacatatgccaacattagagattcgtgaggtttgttacctgttgtaaagctaaatgttttactggatatcttcgtttgaagctagtagctatgaaattatcagattactacttactagtaaattggatatttattttattcctgcttacagttctcttgtagatttgttattgcatgatgttaacttggcttttctgcagggagctattaacttgctaatggctgtatacaagaaggaatttccttccatgggtggctatctaactgatgcttgcacggtaattaaaaagccactcctattgaagttacccatttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtttgcagaaagtagtattttattccaactgatccaagttggtatttcagtattaacatgtttttcatctgttacattagccggatctgaataaagttgaacactttattcaagcagttggctcctacgaggataaaatatttcagaaaagagctcgtttgcatcaggtgattttattttattttactccttagccttttcaattcccttgttatcatgttatcatctggcacctaatctttatttttactccatgccactatgcgccaaggggttcaccattagctatcagttgaaatttctgtttgtatttggcaatgtaatttccttatttgcaaagttcattgagtgtttattttgatatactggtaatttcagcctgatgtactgcgttatatcttctatgacatgttgtctataaacttccttcaaattggaggtagtgattgtgaatttgccacctgccaccaatagtccaacacactgcatttcttactaattgctccgtgtattgttttaatattacaccgtatatcttctctatgctgctttcttcttagctagccttgtaaattcacaatataacatggaaaggttcacaatgaccagataatccttgacatgtaggttagtgtttttttttttacaatacctctaaagaagttaattctacaattagcatgtgtgaacactgccaatccttgaaaagaagtaaatgctatgctccgtagaaatcacattatgttttgaacaatattgagacatttttgattcccatttagctagtaaaatcagaaaaaccagttgattgttcaagtatcttctaaactagttatttgttcaaggttttctcccccatactttcccctagaatttaaatgttacccatggaaaacttctgcatgcagcgtaccacgtccgtatggcttaggcatgttccatcattatttatccttagttatgcaaagccttctgatatgatcaacatgaactcttgagaaataaatgtttgcaacactattctatatatctggcggtcaaatattcaacaagtcattgatgttaagttcatatccttgtgtagcgtcaagctgaaaggataaaacgagaaaaggcccaagcaaaacgaggggatgacctggatccccatgtcagggatgatcttattgtacctgttgcacgcttccaagggtctcgccttgcatctggacctgtgccttcaccatatgaacaaaatggatctgacaaaaacaatgggggaaaaaatagtcgtgctcggaaagctgcacgggtatcatcgtcaggttcaagcattgcggctgctattgttgaagctgaaaatgaccttgaagcacaggtagctcatttcatctggctccaggagaatttatatttgtttttgaagaaacatttttgtgattttatctgacacttgttcctgtatctttcttaggaacgcgaaaacaaggaagatttgaagacaatgcttaaagatgcacttcgtgagaaatctgatgtttttaattctgaaaatccagaggaggacaaggttagtgtttacacacaagtcatgccactgctgtgctggaccttattatacgtttaattaaagtgtttactttccttttattttaactcatttactttctattagctatttgtttaaatgttttcaatttagtcataacattgtttgtcttctcagataaaacttggagaaccaggatggagggaaaggtactatgaagagaagtttggagcaagaacacccgggcagattgaagaaatacgcagagatgtcgtaagtgtcttgaatacctttgaattactgcattgcctgataatggtgtcatgatgatctattgctgttaatatatagttgtacaaacttccataaaagatgccatttcatcgctatttgagcatgtactcatttattatcttatatgtatgatgtgccctattcatcttcttcaggttctgaaatatactgaaggtttgtgttgggtaatgcactactattatgaaggtgtctgctcgtggcaatggtaatttagcttgagttggtcaatataggttgaattgtgtaaaggtttattttcaactctttgtcaatggccttaaattgttatctgtctacctcaccatgcacaggttttacccttaccattatgctccttttgcttcggatttgagtggtctaggtcaactcaatataacttttgaacttgggtcaccattcaaaccgtttgatcaacttatgggagttttcccagctgctaggtgaatacactaagataatgttccctagatcccagttccttaatgttgtggattttttgtaaaggttgtggcattacatttcagctcccatgcactccctgtacagtatcggcaattgatgacagatgcaaattcaccaataattgatttttatccaactggtatgcttatatttgtgatgtttgatatattttttattacctttccactttataattttacactgttttcacccatttgtgatgcagattttgaagtagatatgaatgggaagaggtattcatggcaggtaaattgattataatagggcatatatttatgtaatgtaagtataccttcatgtttaatctatatacttgaatttggcaggggatagcaaaactgcccttcattgatgaagcccggttgctagctgaaattaaaaaagttgagcatactttgacggtatggcaacaaaacagattgtcattcagttgtgcttttataatccatggaataggagatcttgttctaagatatgcatcgcttttcttaccttctgtacagcctgaagaagcaaggagaaacagtatcatgttcaatatgctttttgtgaatggctcccatccactttcgccttatatctactccctcaacagcaaatttggacacctacctgacagagagcgaaatgaaattaaagaaaagattgatccttcttctaggttagctaaccctattaggatccttgatttactgcaaatgctatttttattagtttaaaagcatatggcatttgcactgaccagtgttgtagattctgtaatgccttctgtgtcaggcaaaagttctggctagcataggccactgaattgtttttttcttcttattatttccttaacgcagctgccttgttttgtgcagtggaggaatgaatggttacatctcactttgtagtggggatccgtgccctcctgtcttcaggtctcctgttgatgggttggaggatatcatggacaatcaagtgatgtaagttcaatcccttctgggaaattaagataatatgatttattggcaatctaatttaccatcatgtcatctgtcttaattagatgtacaatctacaagcttccggattctcataagcacatcgctcgtccacctgttggtgtaatcatacccaagaaggtacatctctatcatttttgtctagtatcaacactagtaacatctttccacttgagaaatggtaataacaaataagtaaactctgcagactgttgaagctactgacctgaaaccaccacctgtgctatggcatgaagacagtggtaggaggcctcatgataataacaacaggaggccttatgaaaacagcaacaggtacactatctaccttttgtgttattttgtcaatccttgcaacgtcattgaaaatcctaaccttctggtgaaattgtttaggcaaaacccagctggagcaatatctggccgccaacttggggaagctgcccaccgacttgtggtgaacagcttgaatgctcggagtggcggacaatacaataccccatcgatgccatatcaaaccataatgaatggcatgccttatccaaatgggattccaccaaggatggagcagcctgctcctggctggcatgttcctggtgatctaccaaatggtcaggtaccaccagcttatgcatcatcatcaggtcattatcagaacgataggtctgggccttctcagtatggacgagataaccatggaaggtacccatatgcaagagacaaccaccatgattcaagaggaagggttccaccataccatcagagcggtggaaactcgtatcaatcacattctgctccatcagcaggtcctggacggtatgcgcaacccccaccatatgctggggggtatggtaggagctaccagcctgcaccgtatggaggtggtcagcagtggcagcagcagcagcaacaaccttatggctcctatgctgggtcagggccttatgggggtggggcacctcctgcaaggcctaattcacgaccacagcagtcgcagaaccgttacaataccttagataggaattctaacaggagacctccaccaggtcatgggcgacactaagcccaacctctgtttgttgtacctgtggttttgttgttagaaaacctgcgtactaaaatagagaacctcagcctagtaaaacagagaacctcagcttagagatatatatagagcaatttgcatagtctcgtgatcgacaagctgttatagcatcaaaggttctaagaggcatgtgttgtacaatagaattgtcagttcatcagatactggtggctgactgccgtttttcatttgtggcactcattattttagccccctaaggttgggaatatgtttaacaagttttgtatttttaagataataatgttctaggttaaatttcagttttggtggatatatgtcaaaatcttgtattcttttcttatttataatggaattgtggttttccctct</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
