Os01g0876800

From RiceWiki
Revision as of 05:13, 25 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os01g0876800| Description = RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif) domain containing protein| Version = NM_001051506.2 GI:297598039 Gen...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os01g0876800

Description

RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif) domain containing protein

Version

NM_001051506.2 GI:297598039 GeneID:4325083

Length

6314 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0876800, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:39803885..39810198

Sequence Coding Region

39804087..39804275

Expression

GEO Profiles:Os01g0876800

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008394:39803885..39810198 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008394:39803885..39810198 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgagtccaccgagtgtgatagggcaatttggggacacaacctacaccaaggtgtttgtaggagggctggcatgggagacccagaaggagaccatgaggaagtactttgagcagtttggggagatcctggaggcagttgttatcactgacaagaacactggcagatccaagggctatggatttgtatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSPPSVIGQFGDTTYTKVFVGGLAWETQKETMRKYFEQFGEILE AVVITDKNTGRSKGYGFV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>203..391#tctctcctacccccttttccttctaacctttagcttttcctgcctccctccttctttccctcctctcttctcttctcttctcttctcttccatctcctaatcttcccctaacaagtcctagctaaattcagatccttagttgctggtttttcttgttccttttctgagctagatttcttgctgctgagttgaagttagtatcatgagtccaccgagtgtgatagggcaatttggggacacaacctacaccaaggtgtttgtaggagggctggcatgggagacccagaaggagaccatgaggaagtactttgagcagtttggggagatcctggaggcagttgttatcactgacaagaacactggcagatccaagggctatggatttgtatgatcatttacagttctatctttcctttacgtgcacttaattgcagcagtttactttgcaaacctttcagttctagtccacgagttttttctttcctttttggtttgctgcaatatgcaaagaatgcttaatttttattaaattatgcaccacaaattcgtattgtaggttaccttccgggacccggatgcggcgatgagggcttgcgttgatcccgcgccggtgatcgacgggagaagggctaactgtaatctggcttcccttggggttcagagatctaggcctccaaccccacagcatggttagacatttgccattatctcaccagctaacaaaagcaacatagaacacacagttagctagcttgcttgaaagccttcgatgacaacttcttatgagttgaaaacagcccaacaccaaaagctcttgaaaaagagaagtgataatcattatagatgcactaactctggcattttctatgatttccacatatagtttcatgatcgcaaacttagctgttatgattttatgcgcaaaaaagttccttcctgccaatagaataaataagagcttaaagaacacgacatcaagtttgcctaactttgctaattggctaagccttgttagatgaggaccttttaaatgcattggtttagcttagtgctaactaatttttactaagtacagagcatacattttgacaggactgcccttttacctagcagcaaaaaaatccatagtcttgacgatattatcttggaatttagttactggaaaagtagataaggaggacgaacaacattagcagtacaaagatgttagttatccttgaaataagtgccttgtttcggataatgcgctatactaattataaatcctaggctcagataataaactataggatcaaaccttaaccctaaattaatcgggacagattcagagaatcttttacttctattatgtcgtcttgcaattcagcgaccgaagaatggtttgaccatctctgtgaataaactcattagtggtgcatcagaacaagtgcaaggctgctttcaagtgtctttttgcagataatgctagcaaggcaatgtgggtaaatttgctctaattttcttgacgatgttgctacaggaggggctaggagctttagggtgatgaagtcctttagccagcaggcagggatccaaggtggtctgggcgcagcttttccttctcacgccaccttcccccattatgctatcccacaaggtctcccttaccatgtctatgggtaagttctctctctctctctctccccccttaaagttcccaaggaccaactatgacggggggcttatcacatgcatgacatgtgcatcatgacatgccgccttggtcaatggtgaatggcatggaagctttttagcttgcacccccaaggccccaacccctcctctctcacacacacacagtggcaggctggcactggcagtgcatgctgatccagtggcacatgaaagggcagtcttgttatctcccttagactgcaagcacgccctactctccctctggcgcaagctattagatgcttagtcgagtagatgatttcataaccatgattgatacaaaattgatattatttcttctccttcccttaactactgcaggtactctccctattctccagactacagttatcccacagtaagttcctcttgcaaatccagcaagtactattagttggataaaaaatataataggatgctgatgttcttattatttaactgagatcagtttctgtgtgtgttgggggtgggtgcggggacaaatattaagcatatcaattttaagctaacataccattgtgacaatgcttataggtgtaccagaaattagttttgtagtatgcatttgcaatagcaatcaagatatgatacatgctgcatagaaaatagtagcacataaacatctaatagcaaaacaagacattgcacgaaattaaatgctgctacaggaacatatactatactgctatagcaaacagtaacccaaagaaggtgagaaatgctaagcatattagcctcttcaaccgcgagctttcaagccaacctggacggtttgtctccatactctagtgtactaaatgaaatctgtcttcatagcaaatcctacacaggttttacttacaaactgacatcctgcatgcaccgtcacttaaaaactggcatagcatgcttgtcaaacactcaaacttgtaaatcatgtacagatcccattaaaatgttactaatggaaagcacataactagctaatacaagcccacagccccacaccaaataaacattagtgtgtagcactaccccagtacccctatataaatataataacatgaatatacaaaaagaaaagctatcaaaataatcacttttgctactagaaaaccaaaaatcctagcaatttcaatacattgaaccatttgaaataccacaggctgataaagattttcctttaccagtagtttttacctgtcagttggcatgagttagcagctcttaagaatatccatcgcctgcctagcttcctccatgttcagtgacaatattatgtgctattgtgctgaaaggccctaagccatgcatcctttcaaaaccattcccttcacgtgtaacaggtattataatgttgaatttctgagtccagcttcgctaatggatatgaggttgttttccaacccccctcaaacagttgtcccatatgagatgagcccagtccaaacaatgtccatgcctgcattaaaaaaaatcatcaattatccatcctgagcctccatcaagtatagtgccttatggtcctagcagcttctatcttacctggtacaggcgcacatgacatgggccctagcttgtccagaccaaacctgttaaacactgggtccatcctcccatcagctagacccctttgttagccaaataaacttagtgacagcacatgcgtgggtccacaattctattcaaagctatacctctgtttggctccataaagacctaagtcacctattgggcctttgatgcatggacctaaatgtagtccagaatacaggtttttgcagttagtgcgccaatttagctttgtcccagattgatgcactgcatatgacaggaacagtcaagtgtctgtctaacatgtaatctgttgcagaggcacatgattttcatgaagtcaaataggaagcacagaaacttggtatttcaatactgtttgatagtttacatgagctagaaaaaaaaaactatttgaggtataccactctaataacgggactatagcctgcccccttctccccctcctctctctctcagttccaatttccaaaccatgcattttgacaccatccatttactagtgttggagcgaggaaaaaacaaaataagttacttgtttggatatagtaggatattttctagaataatgcaacagaacaccttttaaaagtaggtaaattgtacatctgcatagtgactgtgatacccagaattagattattggttatgtactgtaaaaggcatatccaaaatattaaaatgacaattaaaccaaattgttgcctttactttaacagttgctaacggttatgcacttacgccttagccgccttaatatagtactatcagagtcactgattcaaattcattagtaaattttcaacaagaagcaagaaaacttaacagaatatgcaagcacttaattcaactttttacataaagttacagatgctaaaatgcatctcttgcaaacctaacagattcaagctgcatataggtatgttttgaatgtaatgtgaactgaattataacagagttcctaacatacatcacagaattatatcagaaagaacaaacgtcatggaatcaagacttatcttctccttgtgctgttaattagaactactacaacatctacggaggagctcaatacccattttatggagcggcggcggcggcggcagcagcagcagctggcatggtgactggaagcagccccttttatccatatttccagtttgggcaatcaggaagcactacaaccaactatgcaagtggacaaggctacaacttgcaatacccacagatgtttcacttctcaactgtggcttctacagctgctgctgtaacaggttttgcacagcaatatggagggccattgtctcttgcagcgagtcctcaagcccaagcaggtattactagctctcttgtatatgcacctccatcataattcaaatcctctgtgtaggcatgatcctagtttcctaggtaaaatatagagctttcaaaagtacattagatttttttttctcttcacttgacaaaaatgcaattcagaggttactttgcatgaatattaaaacaagaaaagcaatccagcagctgttactaggttgcatttcaaccctaacaaaaggttgcatttcaatatggaacttttcagtctgccccagtacatttctaaggacaaattagctgtcttttacgcatttgtcaatcagtcagtgcataaagaatcctaactagtggacatgtaatgagaatgatacaaagtatggtttactttttcacgcttgtttgctaagaaagctatcattttctcataatatagttacattatttctttcttgctcagtagtgacactaatacattcacagtgtgtgtccccattaaacaggcatgactatggctctcacagctcctactttgccgactccaactcaggctgctcatccttaccggctcattccctcgcactttgctgtgtctgctgctccagagcaacccttggcctaaccatggtctcctttctcatcgtcactctcatttttatttcccacatgttgagtccatgcatccatctctaacaccagaaggcactattgttgacctcatgctcatcagctaaaagtgcacactccatatcccacatggtcatgtggtgattggagataagcttcagccccaggatgggctcaaagcttaatgcccccatggatggggctgtactaacagagaagcacaaaccaaccaatttaacaacagtccaaggaaggacttcatggattaatttcaaccctagcagagaaggctatgggcaaaagtaaccctaacaatcaagcattaacccagggagggttcatgctgatacaggccaattggacaaaagtgacatctaaacaactgatcgagcaagaatgccacttcaaaatttcgtcagtggaatctatattgtatttagcataggccatgtgcttctggatgaagcacaaaccatttagcagaccctaatcttctagtcttgctgttacctagaggaaatcaatttgacatgtaaccagtctttaacctcttcccatgcaaattagcccccagcaacttatctaacaccacgtgttaacttgtgtaaccaacttttaacctttagtaagcaactattaggtgctccaactaacattccttttttatcttccagtttatagcttgcatctaggtggttaaggctctaaggagagcctgtgccccttgtcagagacaggttcagaggagtgctaatgtttgtttttggcacttagtgctacctcctgtcatttctaacatagtgatggtaccccaaagaaggctttggaaatgccagacactgcctatgtatttcattcattaaccccaatggacccatagatatattttattgtcttgggtcggccactcatctagatgtccattgcttccccaatgtcactaccatggttaggtccaggatcactcctttctgctcccttccctccttccccacctctcttccctctctctgtgtgtacagagagaagccttaatgctttttaatgtactattatcggacatggtgattgtaataataaagtagtactgtgacacttttagg</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0876800, RefSeq:Os01g0876800