Os01g0920400

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Gene Name

Os01g0920400

Description

Similar to Dynamin-related protein 3A (Dynamin-like protein 2) (Dynamin-like protein 2a). Splice isoform 2

Version

NM_001051755.1 GI:115441880 GeneID:4327743

Length

8101 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0920400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:41938628..41946728

Sequence Coding Region

41939092..41939307,41939403..41939502,41939617..41939669,41940539..41940685,41940772..41940929
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,41943912..41944025,41944118..41944177,41944262..41944330,41944622..41944723
,41944823..41944851,41944936..41945218,41946162..41946548

Expression

GEO Profiles:Os01g0920400

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggaggacggcatctactcgtcctccgcgccgccgtcgacggcgacggcggccgcggcggcggcggcggtggggtcgtcggtgatcccgatcgtgaacaagctgcaggacatcttctcgcagctggggagcagctccacgatcgacctgccgcaggtcgccgtcgtggggagccagagcagcggcaagtccagcgtcctcgaggcgctcgtcggccgcgacttcctgccccggggctccgacatatgcacgcggcgacccctcgtgctgcagctcgtgcaccagccccgccgccccgccgacgccgaggcggatgagtggggcgagttcctccacctccccggccgccgcttctatgacttccgcgaaatccgccgcgagatccaggccgaaacagacagagaggcgggtggtaacaaaggtgtgtcagataagcagatacgactgaagatctactcaccaaatgttctaaacattacgttggttgacttgcctgggataactaaggtgccagttggtgaccaaccaactgacattgaggccagaataaggaccatgatattgtcgtatatcaagcacaagacatgtatcatcttggctgtttcgccagcaaatgcagacttatcgaattctgatgctcttcaaattgctcgaaatgctgaccctgatggttctcgaacaattggtgttataacaaagctggacataatggacaggggcacagatgctcgtaactttctgttgggaaatgtgattccattacgactaggctatgttggtgtggtaaaccgcagtcaacaggatatcaaatcagatctcagtatcaaggaagctctggcgcgcgaagaaagtttcttccgtaatcatccagcgtataatggtcttgctcagtactgtggtataccacaattagcaaagaagttaaaccagattttggtccagcatataaagactgttctgccaggattgaagtcacgtataagttctcaattgacaactactgctaaggagctttccttttatggtgatccagtcgagtccaaggctggtcaaggtgctaagcttttgaacattctggcaaagtactgtgaagctttctcctcaatggtggagggaaaaaatgaggacatatcaacaattgagctttgtggtggagcaaggatccattatatttttcaatctatatatgtaaaaagcttagaggatgttgacccttgtgaagatgttaccgatgaagacatccgtatggctatacagaacgcaactggtcctaggagtgctttgttcgtacctgaggtaccttttgaggtccttgtacgcaggcagatcagcagattgcttgatccaagccttcagtgtgcaggtttcatatacgatgagctagtcaagatgagccatcgctgtcttgctgttgagctgcagcagtttcctctgctccgtaggagcatggatgaagtcatcgggaggtttttacgggatgggcttaagcctgcgcaggatatgatagcacatatcattgagatggaggcggattacataaacacatctcatccaaatttcatcggcggcagcaaggctgttgagcaagcacagcagcaagttaggtcttctagactggcagctgtggctagaagagagggagtagatgctgataagtcacaagcttctgataaaactcaaaagccgcgtgcgcttttgggtagaactggtgtaaatggagtagtcacagatcatctccagggtttacggcctgctgctgaggctgagaggccaggatcttcaggtagtggaagcacatctttctggggatcaatatcaatattttcttctactagtgatgatcgtacacattcttctgcaaaagacaactcatcgaacaaatcttatacagcttctacttcccacctggagcattcactctctacgatacagttgagagagccaccagttgtcttgaaaccttcagaaagccagtctgagcaggaggcgcttgaaatagcaataactaagttgctactgaagtcatattacaatatagtgcggaaaaatgttgaggacttcgttccaaaggcaatcatgcattttctggttaaccacacaaaacgggagctgcataattaccttataactaagctttatagagacgacctctttgcggacatgctcagagaacccgatgaaataaccataaagaggaggcaaatacgtgacaccctcaaggtccttcagcaagcatacaagactttggatgagataccacttgaagcggacacagttgagagaggctattccctggatgccgatgcaacaggtctaccaagggctcatgggctttcttcatccttccaagatggaagctcgccatattcgaccccaaagcaaccaaggtcaaggaaatctagccactcaggggagcagctgccattcaatcccgatgcaagcggtaacggattttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEDGIYSSSAPPSTATAAAAAAAVGSSVIPIVNKLQDIFSQLGS SSTIDLPQVAVVGSQSSGKSSVLEALVGRDFLPRGSDICTRRPLVLQLVHQPRRPADA EADEWGEFLHLPGRRFYDFREIRREIQAETDREAGGNKGVSDKQIRLKIYSPNVLNIT LVDLPGITKVPVGDQPTDIEARIRTMILSYIKHKTCIILAVSPANADLSNSDALQIAR NADPDGSRTIGVITKLDIMDRGTDARNFLLGNVIPLRLGYVGVVNRSQQDIKSDLSIK EALAREESFFRNHPAYNGLAQYCGIPQLAKKLNQILVQHIKTVLPGLKSRISSQLTTT AKELSFYGDPVESKAGQGAKLLNILAKYCEAFSSMVEGKNEDISTIELCGGARIHYIF QSIYVKSLEDVDPCEDVTDEDIRMAIQNATGPRSALFVPEVPFEVLVRRQISRLLDPS LQCAGFIYDELVKMSHRCLAVELQQFPLLRRSMDEVIGRFLRDGLKPAQDMIAHIIEM EADYINTSHPNFIGGSKAVEQAQQQVRSSRLAAVARREGVDADKSQASDKTQKPRALL GRTGVNGVVTDHLQGLRPAAEAERPGSSGSGSTSFWGSISIFSSTSDDRTHSSAKDNS SNKSYTASTSHLEHSLSTIQLREPPVVLKPSESQSEQEALEIAITKLLLKSYYNIVRK NVEDFVPKAIMHFLVNHTKRELHNYLITKLYRDDLFADMLREPDEITIKRRQIRDTLK VLQQAYKTLDEIPLEADTVERGYSLDADATGLPRAHGLSSSFQDGSSPYSTPKQPRSR KSSHSGEQLPFNPDASGNGF</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>7422..7637#7227..7326#7060..7112#6044..6190#5800..5957#5590..5632#5387..5491#4619..4726#4189..4326#3895..3987#3707..3799#3504..3613#3006..3054#2704..2817#2552..2611#2399..2467#2006..2107#1878..1906#1511..1793#181..567#ctgaatcctcctctccttcccctcgacacctcccgattcaaatcgatacccaaaaaaaaaaaaaaattcacgcgagagctctcgatctagggatccctcgtgttgccgcagagtcgccgcctccgccgcacaaaaccctaggtctagcggcggagccccctcctccaccccttcgctcccatggaggacggcatctactcgtcctccgcgccgccgtcgacggcgacggcggccgcggcggcggcggcggtggggtcgtcggtgatcccgatcgtgaacaagctgcaggacatcttctcgcagctggggagcagctccacgatcgacctgccgcaggtcgccgtcgtggggagccagagcagcggcaagtccagcgtcctcgaggcgctcgtcggccgcgacttcctgccccggggctccgacatatgcacgcggcgacccctcgtgctgcagctcgtgcaccagccccgccgccccgccgacgccgaggcggatgagtggggcgagttcctccacctccccggccgccgcttctatgacttccgcgaaatccgccgcgagatccaggttcccctcccccctcgcattctctatcttctatcgatgttgatttaggcgttctgatggttgattaactgatagaggtactagtttggaaccttcgcttgtgctcttagcgtattctactgctcgagagttcactggtaatgttgtgttatgactgcttgctagggtttcgaatagtttgtggtgatttggatgaataattagtattgtactgctcgtgagtctactggtaatgtactaatgttgttgtgtaatggcagcttgctagggattcgagtagttctaccaggtttggatggatcattagtaatttgttcggttttatgatgtatgtgatgccggttaggctctataggtttagtgcaattgggtacattctaacactaccaggttggattgggggataacccttttgggttatattccatcttcagatttaggggtggcgatattttctcatagttgcttttatggtgacttgtgctgatgtccatttgtgtttcttcaaaggtgtgggtgtattgccttatctaaaatctctttgatttgttcattgcctttgagatgtttgtactttcagcctttggtatattgtcagtagtttaaacttagtgatttgcttgaatgtggagattgtatatgcctgtgtatttggtgacgcttatcctattctgattaattaccattgcttttatttgtccggaatgaactggtcgctgagtttagtggttatgtaaaatctgttattggagaagtgtgcacaatagtacctttgatttaatttttttttcagtatatgctagaaaaattgtaccatttgttgtgttatgcttttattgattcagttatgctggtttgtttagttatgccaatgcctgcaagtgttgaacaaactgtaccatagggcatagagcactattaatcattcccccaatcaatgcaggccgaaacagacagagaggcgggtggtaacaaaggtgtgtcagataagcagatacgactgaagatctactcaccaaatgttctaaacattacgttggttgacttgcctgggataactaaggtgccagttggtgaccaaccaactgacattgaggccagaataaggaccatgatattgtcgtatatcaagcacaagacatgtatcatcttggctgtttcgccagcaaatgcagacttatcgaattctgatgctcttcaaattgctcgaaatgctgaccctgatggtattcactacagactcaatccattagataattcatgttaatatattttgtttcttattaataattgattcattgttcttgtaggttctcgaacaattggtgttataacaaaggtttgaccctggtcttgagttttttgtctggattaaataagcattgtgttcataccagtgacccagtttgatcttggcttcacttctattatcttccagctggacataatggacaggggcacagatgctcgtaactttctgttgggaaatgtgattccattacgactaggctatgttggtgtggtaaaccgcagtcaacaggtactgcattctggtcattctcatgacttcgtgagcgaactcattctgtatgtctgtatgataaccatagcttccagatggtgtagttgtctagcatcagcctgctgattgttcataaaataatgggtaacaaatagagatgtgtatactaccttgtgattacaaacttgtcctagtagtttgtagcataccaaggatgtaatcctccataacctggacaaatgcttttccattgtagtgctaagtttagtgttattagatttctattatatagttttctcggcgatgcaggatatcaaatcagatctcagtatcaaggaagctctggcgcgcgaagaaagtttcttccgtaatcatccagtaggctgcaatgaattttgttattactttagtgcttattttcttcttacatgtttgtgaaatgcactttccttgactttttaggcgtataatggtcttgctcagtactgtggtataccacaattagcaaagaagttaaaccaggtatttatgtaattaaattatcagttgtaatcaatctgataactttcatatttctgttgtgatttaaacgaaaatacatctgtatgtttcagattttggtccagcatataaagactgttctgccaggattgaagtcacgtataagttctcaattgacaactactgctaaggagctttccttttatggtgatccagtcgagtccaaggtggggtttgaattaaaaaagaaattttgtccaagtgttagaagcataaaatttgtttgaaatgtttttcaacaatattacctgactttttttatttagggcttaatgaaatcaggccaattcatctgtgttctcagctaattttttgtcctctttgttgatggtccatctgtgtttctttactgcaggctggtcaaggtgctaagcttttgaacattctggcaaagtactgtgaaggtaatttttgaatcatgactaactgtgctggcaatttttaaataatggtcaattgtgccatttaatactgtgtatgattaaaagtcctgtgttattttttgtataagtcttatcatatactacctctgtttcatattataagtcgttttgactttttttctagtcaaactcttttaagtttgaccaagtttataaaaatatatagcaatatttccaacacaaaacaaacatattatcaaaatatattgaatgctacatttaatgaaactaatttggtgttatcaatgttgctattgttttatgaacttggtcaaacctaaagaaatttgactaagaaaaaaaagccaaagcgacttataatatgaaacggagggagtgtgtctattcttttgtttaagctgtatgtgataaattgtgccattttaagttgaaacatttttatgttatagctttctcctcaatggtggagggaaaaaatgaggacatatcaacaattgagctttgtggtggagcaaggatccattatatttttcaatctatatatgtaaaaagcttagaggttcgtgattttgttgcatgttcaattacaaccttttcattatgttgtaccacatcattgttctataatgaagttatagaactttttacacaggatgttgacccttgtgaagatgttaccgatgaagacatccgtatggctatacagaacgcaactggtcctaggagtgctttgttcgtacctgaggtataccatcccactttaggaagaacgattgtaagagtaattcatggatgatggccagttaagctgacaatttttccttcgctaacatttctcaggtaccttttgaggtccttgtacgcaggcagatcagcagattgcttgatccaagccttcagtgtgcaggtttcatatacgatgagctagtcaaggttagacctgacacctttttttgccacttgtctggcattgccgtatgctaatgcctagtatatctttgtggatatgctttttcttaatatgccacttgcacttttgatgcatctatctggttcacctcacagcatcaactaacattctgatgtattgttgctctgttacttcttgaactgacaatttaagtttttgtgtagatgagccatcgctgtcttgctgttgagctgcagcagtttcctctgctccgtaggagcatggatgaagtcatcgggaggtttttacgggatgggcttaagcctgcgcaggatatgatagcacatatcattgagatggaggtaataattcctcatcatgttggatattaatggttaacaaatttcctggtagccattggagtttagaaatatgccactagcaatatttgaatatagtcttccataaatagtgctgattactgacccccagacccacaatttatgaagtatgtagaaaccaagctatttcatctaagctagtgtttgggccattgatagctgatgttttttttcccctgatttactcttgactttgcatagatatgctataatctttttcattgtcataacctgcaactctattttggttcaggcggattacataaacacatctcatccaaatttcatcggcggcagcaaggctgttgagcaagcacagcagcaagttaggtcttctagactggcagctgtggctagaagagtatgtatacatcatatgcaccattaccttttccttttcgtt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External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0920400, RefSeq:Os01g0920400