Os01g0928700
| Gene Name |
Os01g0928700 |
|---|---|
| Description |
Similar to Serine palmitoyltransferase |
| Version |
NM_001051813.1 GI:115441996 GeneID:4326965 |
| Length |
4445 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0928700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:42562017..42566461 |
| Sequence Coding Region |
42562017..42562112,42562216..42562323,42562460..42562626,42563158..42563284,42563373..42563534 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:42562017..42566461 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:42562017..42566461 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggtgagggtgccgttcgtgaccgcggtcaccacggtgttcagctacggcgtcatcttcggcttcggccacctccgcgattggttccgcgccctcctccgctccctcttctccggccactcgccggcggcagccggtaccaacctcaagggttacgcgccaatttgcggaggacaggaggatttctattaccgacgattcgttcgtcgcgttcaggactgcttttggcgaccaatagccagcaagccggacgcatggttcgatgtggttgagcgctactcaaatgacagcaacaagacactccaccgtaccacaaaaacatccaggtgccttaacttaggttcctacaattaccttggctttgctgcggcagatgaatactgcactcctcgtgttattgagtcactaaagaaatactctgctagtacttgcagtgtccgagtcgatggaggcaacactaagctgcatgtggaacttgaagaactggttgcaagatttgttggcaagcctgcagctattctcttcggcatgggttatgtgacgaactctgcgatcattcctgccttgattgggaagggaggcctcataatcagtgattcactgaaccataattctatagtgaatggagcaaggggttcaggagctagtgttcaagttttccaacataacaatcctgcacacttggaagaggtattgagagagcagattgcaggaggccagcctcgcacacaccggcgatggaagaagattattgtgattgttgagggaatatatagcatggaaggggagctatgcaaactccctgagattgtagctgtctgcaagaaatataaggcttacacatatttagatgaggcacacagcattggggctgttggtaagacagggagaggtgtttgtgaattacttggagtggacccagcggatgttgatattatgatgggaacatttactaaatcatttggatcttgtggaggttacattgcagcatcaaaagagattattgatcatctgaagcacatatgccctgcccatatctatgcaacatccatgtcacctcccgctgtccagcaggtcatctctgcaatagaagtaatccttggtgaagatggatctgacagaggagccaagaagcttgctcagattcgggagaacagcaatttcttccgttcagaacttgagaaaatgggttttgaagttcttggagacaacgactcgcctgtcatgcctatcatgctttacaatcctgctaaaatgcctgcattctcaagagagtgcctgaggcaaaaggttgccattgttactgtttcatttccggcaacgccactgctacttgccagagctaggatatgcatatcagcttcccactctagggaagatcttattaaaggattggaggttatcagcaaagttggtgacctcgtgggaatcaaatatttaccagtggagcatgaaaagactacatctgctgagaaactgaagaagattcagtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVRVPFVTAVTTVFSYGVIFGFGHLRDWFRALLRSLFSGHSPAA AGTNLKGYAPICGGQEDFYYRRFVRRVQDCFWRPIASKPDAWFDVVERYSNDSNKTLH RTTKTSRCLNLGSYNYLGFAAADEYCTPRVIESLKKYSASTCSVRVDGGNTKLHVELE ELVARFVGKPAAILFGMGYVTNSAIIPALIGKGGLIISDSLNHNSIVNGARGSGASVQ VFQHNNPAHLEEVLREQIAGGQPRTHRRWKKIIVIVEGIYSMEGELCKLPEIVAVCKK YKAYTYLDEAHSIGAVGKTGRGVCELLGVDPADVDIMMGTFTKSFGSCGGYIAASKEI IDHLKHICPAHIYATSMSPPAVQQVISAIEVILGEDGSDRGAKKLAQIRENSNFFRSE LEKMGFEVLGDNDSPVMPIMLYNPAKMPAFSRECLRQKVAIVTVSFPATPLLLARARI CISASHSREDLIKGLEVISKVGDLVGIKYLPVEHEKTTSAEKLKKIQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4350..4445#4139..4246#3836..4002#3178..3304#2928..3089#2576..2739#2320..2413#2114..2238#1525..1670#1090..1178#456..521#1..150#atggtgagggtgccgttcgtgaccgcggtcaccacggtgttcagctacggcgtcatcttcggcttcggccacctccgcgattggttccgcgccctcctccgctccctcttctccggccactcgccggcggcagccggtaccaacctcaaggttggcttactacgtgtgtaccccctccgtttcatattatataattaagtcgtttaatttttttctatattattaaaatatattcaatgttaaatttaatgaaactaatttggtattataaatattgctaactttttttataaatttaattagtaaaaaaaaactttaataaaaaaaagttaaacgacttataatatgaaacggatcgagggagtagcttatcatcatcatcatcatcatcattactactactacataggttgtcatgctaaatgtatagactcgatcaatctatatgtatgtagggttacgcgccaatttgcggaggacaggaggatttctattaccgacgattcgttcgtcgcgttcaggtaagctatagtaacctacatttcctatatttctaaagatgattaataaaaccctatatttctgaagaggattaataaaagtgtacatgtgcacacagatatattaatttaaactttaaattttaatttgatgtttttactttttttttttctttttaagtcggtaaaaacaaacatatataaaaattttacatatgaattagtttttaatcagtaataagtactccctccatttcgaaatgtttgacaccgttaattttttagcacatgtttgaccgttcgtcttattcaaaaacttttgtaaaatatgtaaaattatatgcctacataaaaatatatttagcaatgaatcaaatgataggaaaagatgtaataattatttaaaatttttgaataagacaaacggtcaaacatgtgctaaaaagttaacggtgtcaaacattttgaaacggaggaagtttacagattataattagctatttagacttttaaattattagatgttttattgagatttgtgttttaattggcttatgtttatcaactatatatatgttgtcacatgcaggactgcttttggcgaccaatagccagcaagccggacgcatggttcgatgtggttgagcgctactcaaatgacagcaacaagacactccagtacgtattatactcctctctcgtataaaatatcacttttgctacaaatctaaagttgttttttataagacaaagagatatgtctttgtcacactatatatattttatacctaattgttaaaaactatatgatttatgttaactcgatatttcattttatttttaactctaaaacttattggttatatgcatgtcggcagaggacatagatgtaaaccatttttatcattttaagaaaattctgcacctaataagcataagcaaatgctgcggatatatatcttaattatattagaggatgcatgctagaaattaatctgacccaatgcttctctgatatatgcagccgtaccacaaaaacatccaggtgccttaacttaggttcctacaattaccttggctttgctgcggcagatgaatactgcactcctcgtgttattgagtcactaaagaaatactctgctagtacttgcagtgtccgagtcgatggaggtatgtctaatgtctctactttgttgccattggtgtccaagtagcatgtaaatatggtccatggaaggagttgaggatttttctcatcactctgtacctttttttagtgccaacaacgcaattggttatgtttgtcaatggcgaccagagatgtactcctgtatttaaaatatatggcactataaattttatttgatcaaattactaaaattttgatcactctcgaaatcttgaaatatttggtttcaaaacataaaaaattatatggagattttttttacaatattataattttcctagatattatcgttacgtactaatagaaaaatagcgaccatagttacgcaccaaagatcaaaagaaggtaacaacgctataaatttaaatcgtaattattgtaaaagcaagagcttactgcagctaatttatttcaatgatgttaggcaacactaagctgcatgtggaacttgaagaactggttgcaagatttgttggcaagcctgcagctattctcttcggcatgggttatgtgacgaactctgcgatcattcctgccttgattgggaaggtcagtggcagagaaactgccatgttttcataattcctgttctttctgtacattatggagctaatatattattgatttcagggaggcctcataatcagtgattcactgaaccataattctatagtgaatggagcaaggggttcaggagctagtgttcaagttttccaacataacagtaagcgagctcactgataattgctaattactcccctgtttttgaacatacggcattgttaatttttaaacatgatgcctgagaatgtttgcaactttgcaaatggcgtgtgccgaacaatatggatcacagaacttaattcttcccttcaatttcttgtagatcctgcacacttggaagaggtattgagagagcagattgcaggaggccagcctcgcacacaccggcgatggaagaagattattgtgattgttgagggaatatatagcatggaaggggagctatgcaaactccctgagattgtagctgtctgcaagaaatataaggttcaagaatttcttacactgacttcttgtatatgttctttcttcagatcattaagcatgtaaatctttttttaatcaaaagcttgtaaatctgtttactgtcatatacattacttcaacttttatcagctattaaaatcgataaatatttactgagttttgactattgtacttaaatttctggacaggcttacacatatttagatgaggcacacagcattggggctgttggtaagacagggagaggtgtttgtgaattacttggagtggacccagcggatgttgatattatgatgggaacatttactaaatcatttggatcttgtggaggttacattgcagcatcaaaagtatgaagcatattaacgtactatttagatgaacaactttagtctgtagattttaaatctgacccatggattactctatgtttatcaggagattattgatcatctgaagcacatatgccctgcccatatctatgcaacatccatgtcacctcccgctgtccagcaggtcatctctgcaatagaagtaatccttggtgaagatggatctgacagaggtataccagaatttgttgatttcttatttcttctcactctctttttgatttagattattgagagaattattgccatggattatctaattgactatagggacaaattataaatactttgagaaattgacttaacaaatactacttccgttttaggttataagacgttttgactttggtaaaagtcaaactgcttcaagtttgactaagtttgtagaaaaaaataataacgttttcaacccaaaacaaatttattatgaaaatatattcaattatttatttaatgaaactaatttggtattataaatattattatatttatctataaacttagtcaaactcttgactttgactaaagtcaaaacgtcttataacctgaaacggatggagaagcttaaaacaagtgggctaagtggtgcagtagaagtttttgagacaacatattttttaaagtacagaacaaatcatccgtttcaatgttcctaatactttagataatgaggagattcctaatgtaattattgttataaacaggagccaagaagcttgctcagattcgggagaacagcaatttcttccgttcagaacttgagaaaatgggttttgaagttcttggagacaacgactcgcctgtcatgcctatcatgctttacaatcctgctaaaatgcctgcattctcaagagagtgcctgaggcaaaaggttagttttattttcttcaataactaataattcattgttttagttttgaattcggtaatacacccagaatctcttctattaattgcaaattttttttctgattgaccaatgtgacaacatattttcataattctaggttgccattgttactgtttcatttccggcaacgccactgctacttgccagagctaggatatgcatatcagcttcccactctagggaagatcttattaaaggattggaggtaaattggtcaattttactggtgttatggcttgttgtgacaagtttgatttagttgcaaattaaccacatgcagttgctaattttcatgttaatttggttaggttatcagcaaagttggtgacctcgtgggaatcaaatatttaccagtggagcatgaaaagactacatctgctgagaaactgaagaagattcagtga</dnaseqindica> |
| External Link(s) |