Os01g0935500

From RiceWiki
Revision as of 05:21, 25 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os01g0935500| Description = Similar to Potassium transporter 7 (OsHAK7)| Version = NM_001051855.1 GI:115442080 GeneID:4326793| Length = 5915 bp|...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os01g0935500

Description

Similar to Potassium transporter 7 (OsHAK7)

Version

NM_001051855.1 GI:115442080 GeneID:4326793

Length

5915 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0935500, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:42855953..42861867

Sequence Coding Region

42856050..42856091,42857097..42857334,42857552..42857800,42857907..42857957,42858532..42858792
,42858910..42858962,42859441..42859555,42859638..42859892,42860019..42861106

Expression

GEO Profiles:Os01g0935500

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008394:42855953..42861867 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008394:42855953..42861867 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggacgccgaggccggcgtcggcggcgccgaccagctgccgtggaggcaacactacaggaatttactgcttttagcataccagagttttggtgttgtttatggggacctaagcacatcacctctttacgtttataaaagtacattctcaggaagactacgtcgatatcaagatgagcaaacagtctttggtgttctttccttgatattttggaccttcacacttattcctttgctgaagtatgtcactattgtattaagtgctgatgacaatggtgaaggtgggccgtttgctctttattcactgctttgcaggcatgcgaaacttagttttcttccaaatcaacaatcagcagatgaagagctatcgacatactacagaaatggttttacttcacgtcatggatctttaccttggctaagaaggttcatggagaagcacaagaatgccagaaccgtgcttctcctcatagttctgtgcggtgctagcatgatgattggtgatggtatccttactccagcaatctcagttctgtcatctatgtctggattgaaagttcgagctactggtttacatgatcgttctgttgtactcctttcatgcattgtgttggttggtctatttgcattgcaacaccgaggtactcagaaggtagcgttcatgtttgcaccaattgtcgtcatctggctcttttgcattggtggaattggtttatacaacataatacattggaacccaaggatataccaagctctctctccatattatattgttaagttctttaggacgacaggtaaagatggttggattgctctaggaggcatacttctttctatgacaggctgtgaagctatgtttgccgaccttggtcacttcacgagtgcatctgtcaggctagcttttatcaccatcatatacccatgtcttatattacaatatatgggtcaggcggcatttctgtcaaaaaatatccttgacatgcccacaggtttttatgattctatcccaggacctatattttggcctgtgtttgtggtggccactctcgctgctgttgttggtagccaagctgtcatttcagcaacattctctattgtgaagcagtgccattcgttgggatgtttccctcgagtgaaggttgtccacacatcaaggtggatctatggacagatatacattcctgaaataaattggatccttatggtgctctgtgtagctgtcacagttgcattccgtgatattacacttattggtaatgcctatggtgttgcgtgcatgactgttatgtttgtcactacattcttgatggcattgatcatgatcttcgtttggcaaaagaacataatatttgctctatctttctttttattattcggatccgttgaagttgtttatctctcctcatccctcatgaaggttactcagggaggatgggtgccgcttgtgcttgctttaatattcatgtctgtcatgtatatttggcactatgggacaaggaagaagtaccagtatgatcttcagaataaggtatcaatgagatatatcctgtccctgggtccaagccttgacgtagttcgtgtcccaggaattggtctgatttacacagaactggtgactggtgtacccaacatcttcacacatttcactactaatctccctgcctttcatgaagtcctagtctttctttgtgtcaagtcagtaccagtaccatatgtgtcgccagatgaacgataccttgtgggcaggattggacctagagcatatcggatgtaccgctgcattgttaggtatggttacaaagatgttcagagagatgatgacaattttgagaacatgttagttatgaacattgggaagttcattatgatggaagctgaggatgcatcttcttcagcaagttatgatactgctaatgaaggacgaatggccgtcataacaacatctgatgactatgactctccactagctgtgagagattccaatgacctagctgactccatgacgatgaggagcactaaatcagagagtcttcgaagcttgcaatcctcttatgagcaggaatcacctaatgtgagccggaggcgacgtgttcgctttgagctgccagaggaggatgacatggatcaacaggttaaagatgagctgttagcacttgtggaggcaaaacatacaggggtaacctacgtcatggggcatgtctatatcaaagctaggaagaactctagtttttttaagagatttgcaattgatgttggctactctttcctccggaagaactgcagaggtccatcggtcacactgcacattccacatattagtctgatagaagttggaatggcgtaccaagtgtag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDAEAGVGGADQLPWRQHYRNLLLLAYQSFGVVYGDLSTSPLYV YKSTFSGRLRRYQDEQTVFGVLSLIFWTFTLIPLLKYVTIVLSADDNGEGGPFALYSL LCRHAKLSFLPNQQSADEELSTYYRNGFTSRHGSLPWLRRFMEKHKNARTVLLLIVLC GASMMIGDGILTPAISVLSSMSGLKVRATGLHDRSVVLLSCIVLVGLFALQHRGTQKV AFMFAPIVVIWLFCIGGIGLYNIIHWNPRIYQALSPYYIVKFFRTTGKDGWIALGGIL LSMTGCEAMFADLGHFTSASVRLAFITIIYPCLILQYMGQAAFLSKNILDMPTGFYDS IPGPIFWPVFVVATLAAVVGSQAVISATFSIVKQCHSLGCFPRVKVVHTSRWIYGQIY IPEINWILMVLCVAVTVAFRDITLIGNAYGVACMTVMFVTTFLMALIMIFVWQKNIIF ALSFFLLFGSVEVVYLSSSLMKVTQGGWVPLVLALIFMSVMYIWHYGTRKKYQYDLQN KVSMRYILSLGPSLDVVRVPGIGLIYTELVTGVPNIFTHFTTNLPAFHEVLVFLCVKS VPVPYVSPDERYLVGRIGPRAYRMYRCIVRYGYKDVQRDDDNFENMLVMNIGKFIMME AEDASSSASYDTANEGRMAVITTSDDYDSPLAVRDSNDLADSMTMRSTKSESLRSLQS SYEQESPNVSRRRRVRFELPEEDDMDQQVKDELLALVEAKHTGVTYVMGHVYIKARKN SSFFKRFAIDVGYSFLRKNCRGPSVTLHIPHISLIEVGMAYQV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>98..139#1145..1382#1600..1848#1955..2005#2580..2840#2958..3010#3489..3603#3686..3940#4067..5154#ataacccgttccgttccattcctgtctcctcgtgatctctacctctcgacggaatcgcgcgccgcgctctcgcgacgccgccgccgccgatcgatcgatggacgccgaggccggcgtcggcggcgccgaccagctgccggtacgcgccccccgcctccggccgctctgctccctccccccctcattgccctgtctctctgctctccttcacgcgcgctctctctctctgtgctggtgcggattgcgctttgggggggggggggggggtgcggaggctggatcctaggtttggtaggttaagtggattacgagggatgattttgggggtgggattttgtggatttgagttatgtttcggatgggatcaagggtttcattgcgaggaatttcacccgcgattttttttaaaaaaaatcggcgttcgatggcgagggtttcgcttggaggaatcggtcgtcattgggtttgtttgtttgtttcgcttggtgaaatccttaggtcttcattttgttctggtcgtgtagagtggtttgatcgtgtaggtggtccagggattcgattatgatttcaaaaattgattcagaggggacgtacgatcacacctgctaagcagatagatttatcattcgtaatggaagatccccattggccactttgcggtagtccacatactactatagtcacatgatacaaaagcctgcaattcattgtaaatggaaaggactgtaacttgtcgggatgaagttatcgaattaaattgtagttttctttggttagatttattcgcagatataagttactatattaccatctgttatcggtaaattcagaaacatcagtatacacttaatgcctgtccctttccttaatgctatatactaaacggtaactctgcttgagtttgtgaacgtacaagtgttgataattttgattagtcatatgatgcttgcaagttttattaatatcagcctgttatatgtaaaccttagtacttgcatattcatggtattggtacgttctctttgatcatttttttggttatttgatgattgatcattatggtacttaagagtaactagcatgaaaattcatacttccaaggaaacatttcctgatggtagtttttttttccacatattttcagtggaggcaacactacaggaatttactgcttttagcataccagagttttggtgttgtttatggggacctaagcacatcacctctttacgtttataaaagtacattctcaggaagactacgtcgatatcaagatgagcaaacagtctttggtgttctttccttgatattttggaccttcacacttattcctttgctgaagtatgtcactattgtattaagtgctgatgacaatggtgaaggtacacagtacacactatttcttggaaatttggtataaacacacctgaccttacattatctatcatcttgatgaatcagcttacagtaaatatattatcaatctatttgctggagtatcacactaccaggcttcttcttgtctttttctttttacaaatttactctgtatctttgttcaacctgaagaaaaataagtaattcctgtcacttttgtaggtgggccgtttgctctttattcactgctttgcaggcatgcgaaacttagttttcttccaaatcaacaatcagcagatgaagagctatcgacatactacagaaatggttttacttcacgtcatggatctttaccttggctaagaaggttcatggagaagcacaagaatgccagaaccgtgcttctcctcatagttctgtgcggtgctagcatgatgattggtgatggtatccttactccagcaatctcaggtggatagtgccatctctctctgttagttcatgtaattcaaagttgttacatatcaacctctttgtatgttgatgtgctttgttctgcttgtttttccccctccagttctgtcatctatgtctggattgaaagttcgagctactggtttacatgatcgtaagtacaatatacctctaactcataactccttagtgcaacaattttagaacacatctaggctgttgagtgagtattgtcaatttcaaatttacagccctatgtaattacgttcgtaagtattaatcaatagaattattctttctctgaatgcattcaaaagtaggcacctctgttttgactgtaatttcatattattgtggattttttacttatgtgaacatctgaatgcacttgatttacttccctgagaatattagtttgtcatgtcaagatgcacctgcacagtatcttgcaaaatttaagttctgtagtgtctgcctgctactaccatgtattttgtagtgtctgcctgctactaccatgcacctgcacagtatcttgcaaaatttagtattttgtatttaccatgtcaaaggttggccagtataagtttctggctactatattttttttctggtgactatttctatatagtgagacttccatcctatttgcgtgataaacaatttcctttaggaattattgctattctacttttgggattaagtgtaataacttattttctgtacaggttctgttgtactcctttcatgcattgtgttggttggtctatttgcattgcaacaccgaggtactcagaaggtagcgttcatgtttgcaccaattgtcgtcatctggctcttttgcattggtggaattggtttatacaacataatacattggaacccaaggatataccaagctctctctccatattatattgttaagttctttaggacgacaggtaaagatggttggattgctctaggaggcatacttctttctatgacaggttggttactatttactccttactcttggggtataatctgtattcttgttgtactttactttggtaagtaaaatacttgttgggatttaaggttcattttctgtttcaattttacaggctgtgaagctatgtttgccgaccttggtcacttcacgagtgcatctgtcagggtgagttaacttatctgtctttagttgctcactttgtggagatatacttctaggtctgttaatatatgttatggtgtgatattgtgttgcctagtaaagcaaccatggaaacttagagaaagcaatttgagggaaaatataacggaagcaaaaagttaatgtactaaacagccttatctgaaaataaatttagttagcttgtgagttgtgactacatatttgaaaccaaccagaggctcaaaaggaatggaggaacctagtcattttctttgttgtggactaatgttgctcgtacaagttctctcatgtgacctatctggttcatttttattttgaagcctcctcctggattccatatagtattctttgctagtaattataatttatgtttactaaactttgcttgcttcttctgccagttttgctcattattttttttctattgctgaaatatatccatgttttgtccttgttacagctagcttttatcaccatcatatacccatgtcttatattacaatatatgggtcaggcggcatttctgtcaaaaaatatccttgacatgcccacaggtttttatgattctatcccaggtttgcactgtcacccctctctctcacatgcatgcatgcacacagatatgtaagtgtaatgttaattttaattgtcatccaggacctatattttggcctgtgtttgtggtggccactctcgctgctgttgttggtagccaagctgtcatttcagcaacattctctattgtgaagcagtgccattcgttgggatgtttccctcgagtgaaggttgtccacacatcaaggtggatctatggacagatatacattcctgaaataaattggatccttatggtgctctgtgtagctgtcacagttgcattccgtgatattacacttattggtaatgcctatggtaagcgcctgtaaccatgatttttcacgtgatcaagagctccttgcatatagccttttgtatatttccagtatactcaagtgctaagagtctaagcactgccattgccatggtttgtcattgcaggtgttgcgtgcatgactgttatgtttgtcactacattcttgatggcattgatcatgatcttcgtttggcaaaagaacataatatttgctctatctttctttttattattcggatccgttgaagttgtttatctctcctcatccctcatgaaggttactcagggaggatgggtgccgcttgtgcttgctttaatattcatgtctgtcatgtatatttggcactatgggacaaggaagaagtaccagtatgatcttcagaataaggtatcaatgagatatatcctgtccctgggtccaagccttgacgtagttcgtgtcccaggaattggtctgatttacacagaactggtgactggtgtacccaacatcttcacacatttcactactaatctccctgcctttcatgaagtcctagtctttctttgtgtcaagtcagtaccagtaccatatgtgtcgccagatgaacgataccttgtgggcaggattggacctagagcatatcggatgtaccgctgcattgttaggtatggttacaaagatgttcagagagatgatgacaattttgagaacatgttagttatgaacattgggaagttcattatgatggaagctgaggatgcatcttcttcagcaagttatgatactgctaatgaaggacgaatggccgtcataacaacatctgatgactatgactctccactagctgtgagagattccaatgacctagctgactccatgacgatgaggagcactaaatcagagagtcttcgaagcttgcaatcctcttatgagcaggaatcacctaatgtgagccggaggcgacgtgttcgctttgagctgccagaggaggatgacatggatcaacaggttaaagatgagctgttagcacttgtggaggcaaaacatacaggggtaacctacgtcatggggcatgtctatatcaaagctaggaagaactctagtttttttaagagatttgcaattgatgttggctactctttcctccggaagaactgcagaggtccatcggtcacactgcacattccacatattagtctgatagaagttggaatggcgtaccaagtgtagcgcgatgctcatcgcaggtcacgacgtcacgtggatacccggtagcaacaaatcatggtgagtactagccattaaaccatatgaacttacaattgttccagttttttgttcttgtaattatcatttggatatgcgccgcagctatatccctggaattggaagatattccagagagaacttggtgagcgaaagatctttttaagtatatgctgttctttagaggaaccaattaactttggcaacatcggatctatagcaatggaagttattatttttggttttatatcatttgataattgactaatcatcttcatttctccctctccagtgctacctgtggccgcctttttggagtcgaggctttgattcctatgctttatccatgcgttttcagtttcagttggtacagatgaagaggctctctatgttaatatgatcatttagctcaaataaagcatcagatctaatgatcgtagtttgctcttcccttttggtatatttacatgcatgctctgtaatttttatgggagctatgtaatggaaatatgcgtccccgtttttattgcagctatgtaatggaaatatgcgttctcgtagctgatatatcccaatttttgttaggaagcgattaccacatatattctttcatgtatgaatttcttatggaacagaacatctgtagatatacagtgcctcgtggaatttctctgcaaataaaccagatactagataacatcagtatgatttcctttttcatttgg</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0935500, RefSeq:Os01g0935500