Os01g0967600

From RiceWiki
Revision as of 05:24, 25 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os01g0967600| Description = Conserved hypothetical protein| Version = NM_001052045.1 GI:115442460 GeneID:4324008| Length = 5059 bp| Definition ...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os01g0967600

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001052045.1 GI:115442460 GeneID:4324008

Length

5059 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0967600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:44467867..44472925

Sequence Coding Region

44469602..44469620,44469824..44469855,44469937..44470310,44470383..44470516,44470635..44470791
,44471830..44472133,44472231..44472293

Expression

GEO Profiles:Os01g0967600

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008394:44467867..44472925 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008394:44467867..44472925 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggccccaggcacatcaggtcagccggagagcaaggggcagaaaaaaacgattaacattggttatgaactggcgcatcaagcatgggacttcaaaatacaacaaggaagttgcagggcaaaaattccttcaaatataccgcggcagtatgatcctatacagaaccttgattctgtgttaatttttgatttgatggataattcaaatgggcttcactgcttggagattatgacaaactgcctgcataagaacatattgcatgctccaattgttcagaagaaggaggatgttgactgcatttctgtatggcatgagccttacacaggcaatcttcttgcatatttggaatctactttgttaggggccaaacatatggttggggaaaaggttgtgctcccaacacctgtgctacagaatcttataagtcaagtttttgatggattgaagatgctgaggctctgtgggaaataccatggaaactttacacttgagaagacatactattacaagaagaatggaaatgaaatcattgtgaaacttgctaattttgaagttaaagatcaggtgaagtctactccagtattgcaagctaaggactgccaggctgttggtgatgcactcagaaagatctcaaagatggctaaagatcgaaaagatcttgattttgattgcagtcaaattgatagccttgctgaagaacttagggagttttccttcggggatttatgcaatattgagaagaagattggaggccatcctttcttttgggtttttgatgataggaagttccttttgacttgctcgattcctttggccatgaacaaacgcgcatttcgacaaaagattgagggcaatgaagatttgattgctcttccttgggacaaagaggactatgatggattaattaatttgatgatgaagtacagggcagatcatatgattaaaaagtttgatattaacagcagagttgactatgtgctgtgtgtaagtggaatgtatgctcatgaaaaggagctgaagaccaacattcaggtcgatagagtcatcatggagagaaaccccggcctttgctgtcgactataa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAPGTSGQPESKGQKKTINIGYELAHQAWDFKIQQGSCRAKIPS NIPRQYDPIQNLDSVLIFDLMDNSNGLHCLEIMTNCLHKNILHAPIVQKKEDVDCISV WHEPYTGNLLAYLESTLLGAKHMVGEKVVLPTPVLQNLISQVFDGLKMLRLCGKYHGN FTLEKTYYYKKNGNEIIVKLANFEVKDQVKSTPVLQAKDCQAVGDALRKISKMAKDRK DLDFDCSQIDSLAEELREFSFGDLCNIEKKIGGHPFFWVFDDRKFLLTCSIPLAMNKR AFRQKIEGNEDLIALPWDKEDYDGLINLMMKYRADHMIKKFDINSRVDYVLCVSGMYA HEKELKTNIQVDRVIMERNPGLCCRL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1736..1754#1958..1989#2071..2444#2517..2650#2769..2925#3964..4267#4365..4427#aggcttccgaatccgagcagctccattccccaaatcgcctcttgtctcgcgccctcccgccccgttgccggcgacgagcgctgcagggcacagggtgctcaggctgcagcttcgcctgtccccgccatctgccggacaccaagccccgccccaagtcctagcctgccatccgcccgccgcccgccagttgctgcctgactgtctcaactgttcaccgtgcgtaccctgcaggtatttgtttgtttcgtgtgtatacctttagtttttggcgcagattgtagtctgcagaatcgaccctacttgtcaatttcagggctaaaatttcattgttgagtcagtatgtgctatatttcacattgtttttttgcaccatagaataccgttgatgtgtcaggaaccaaatgattttggttcagacaaattcgaaagagattcaaatatggcaattagctaactagtaggaatcctaacacagcaaataattaaaattgtaatgctgaaattaactagaatggaaggaaatatatgtgtgcgccgcaagaacaagaggggaaattatattagggttcagattcgataaagagttacagccaaaacacggggcttatattgagtacgccctctgctagacgacaacgacgatgacgtccacagtacggcaattcttcccctctgtagcacatcgcggcgaatcagggccacccgatcttcataacccttccaatgaatcggtatctcacaatctcagccgtcgattctactacagctatcccccttaactctgaacttccaagtctgattcttcttcaggcctcacatgatgcgtgtttcttttgctgtaacagcgtagttaagatgaatcaactaccatggagtctttcactaaaatcaagacttctcttggtttgcgatgaaaatgaagtttcaaacatgtattcaattacttttgctgttctggcctgttcatggtgtgaatatcgcattgtaaatcaattgaatgacgatcattccatgtctaatatggcagacatttacccatgaatggctattttgttggtgctcgcaacgacttcctgggttatatgctccagtaatgtggaaacaagtataaaaccttgtctgccgtatgcttttatcatgttaacttgttagtagattctttttcttttttaaaaaaaacatggcagatatcaacagttgcggtagtaatttcgcttcatattattcactttcttcgattggtcatcttgagtggtttcctctttcttggttacattctgctactgtgttgttccttcatgcaagtgtactggtcatctttttttcccataatgatgtttgctgaattaactaggagcttagcctgttgtgttttgtgaatgtatgcggaaaatgaataagattttgtataaaaataatgaactgggtatttttttttcaaccttctgagtcctttcatgcaaacaacaataattgttttctcttgataacaaagcatgaactcctggttatcggtctgtaccttgttcagtgcctttcataattagtttaagaatttctaatacactggatgttttagaaccttccattactgggagttgcaaaagttaattggagataatctaaatgaatccctttattagtgttgttctgaaaatagaaatgataggccattttcttttctgcagtttcctaccaaagaaaggtgcttaacaatttgttgtcacaaaccagaatggccccaggcacatcaggtagtatgcccacctcttaaatatactgcatattttttaatgtcttagtattagtatgtacctttgcatttttgtgcagcacaaatggtgataatttaagcttccattagtgaaaatttcttgttttagagaattagctcgtatagaaaattataatgacttggttgtcattgaaactgaagttcttttaaaatttactttaggtcagccggagagcaaggggcagaaaaaaacggtacaagtctaattctacctcttttttcatataaaactttcactgaatatttttatctagcaagaaagtatgaatttgcagattaacattggttatgaactggcgcatcaagcatgggacttcaaaatacaacaaggaagttgcagggcaaaaattccttcaaatataccgcggcagtatgatcctatacagaaccttgattctgtgttaatttttgatttgatggataattcaaatgggcttcactgcttggagattatgacaaactgcctgcataagaacatattgcatgctccaattgttcagaagaaggaggatgttgactgcatttctgtatggcatgagccttacacaggcaatcttcttgcatatttggaatctactttgttaggggccaaacatatggttggggaaaaggttgtgctcccaacacctgtgctacagaatcttataaggtgtgtctttgttgccagctttacgtaatgcattaagatatataaagtcatgtaatagtattgttgttttagtcaagtttttgatggattgaagatgctgaggctctgtgggaaataccatggaaactttacacttgagaagacatactattacaagaagaatggaaatgaaatcattgtgaaacttgctaattttgaagttaaaggtaatgcaacctatcgaccgttgagatacaagatcaccatttagggtagaaacaagtagagatatgtaagcacattatttagatgacgttttcaatataattaatgtttcaatttcagatcaggtgaagtctactccagtattgcaagctaaggactgccaggctgttggtgatgcactcagaaagatctcaaagatggctaaagatcgaaaagatcttgattttgattgcagtcaaattgatagccttgctgaagaacttagggagttttccttgtaagtataccgtgattttctagagagttaatatcagtatatgttccttgtaagtatatgttctgatgtgtggttaacttgttctataatcgcaaatctttaaatttcaaagttagctatgcctattgtgaactgatgcttgagtacctgtctatagtttatctactaaacttttgctttgatttgaatcatggctgcttttggttagtcaatgctcttttatctgaggaatcaattgatgattgtgtaatttggatggtcttgagtgttcctaattttggctaagcagttcatattcagcaatagcatcttgctgtaaaaccaagaacaatgtaaatgatcattgtttcgtactttaggtagctaactgcatgccaaggaaagcaggttcctcacaaggatatctccgaacttaattcctaagtttgtgaatagtagattttagtcgtttattttaaaggaggttggtcaatctagtttagagcgtggaatgtttcaatgtcaatggtttttgtttatttccttcaataccgctcatggatcaagaaggcttatcttaccgactttagtgacttaacaatgttttctgcagtggttgtttacctgctgtaaatattgctgatagcttaagtataggatagagacctagatttcatgattgaattgtaagaaatctgtgcttgaattaagtgatgccaatgtgttggaatggccctggcttgaattaatatgggccatgagaaggaacttgcagctcttcagtgtagctttcatacgcttcaagtttgtttccaagtatattgtgagtttgattgtgacaaaacaattggtattctaaaaccaatagcctctaggtgaaagcgaaatacttgatagttgaagtgaaacactgatgacataaatagcttaacaatatatttttttatgcgtgcattcgtaatgagagcactctctagcaattaagagtttaatgactatctaaaaagctatattcatgaatggtggtgctagactaatgatatattgtttattttatagcggggatttatgcaatattgagaagaagattggaggccatcctttcttttgggtttttgatgataggaagttccttttgacttgctcgattcctttggccatgaacaaacgcgcatttcgacaaaagattgagggcaatgaagatttgattgctcttccttgggacaaagaggactatgatggattaattaatttgatgatgaagtacagggcagatcatatgattaaaaagtttgatattaacagcagagttgactatgtgctgtgtgtaagtggaatgtatgctcatgaaaaggagctgaaggtattacatgttttaagcaaataaattaacttactttaattaccttctggttacatgcttgcagtaaataaaatgaacttactgttgtaaattatagaccaacattcaggtcgatagagtcatcatggagagaaaccccggcctttgctgtcgactataatatatgttaacatgactgggaggacttcagcagacatgataatccacactgaaggtaatgttttcaggtttctttcccaaacttgtaaaactgtagtggtagatgttcttaaaaaattcattatcagagcattgctcgattagtttgtttagcgggcatgggaactttgtttcacctatactttgtttctttcaaaagataaatatgatgggatcatttgcagctttgttgtttgcttgatatttgttgtgtaaaataacgtctgttgttgaagaaacgtcttgtttgtcttattctcaatggctcgagtgtcctgaggttatgggcatgcacattattttattttagtaacatatctcttcaacacagatataaccctgggagctgtgcgagaggtaggcatgaagtctggaacaatgggaaacagtggcttttggttcctacttgtctttgatagagctagcaggaggcgaagagaaacatagttaagttattgataatttagtatttgcaaaagagggagatgcaccactaaagatcttataaagattggtactgttatatttggtgctttcaatattttcttggtaatctatagtacaatgtccgtgcgttgcaacgaatgaattggc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0967600, RefSeq:Os01g0967600