Os01g0968600
| Gene Name |
Os01g0968600 |
|---|---|
| Description |
Conserved hypothetical protein |
| Version |
NM_001052054.1 GI:115442478 GeneID:4324017 |
| Length |
5839 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0968600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:44510570..44516408 |
| Sequence Coding Region |
44510570..44510812,44510847..44510897,44511475..44511610,44511714..44511763,44512466..44512554 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:44510570..44516408 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:44510570..44516408 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgcacggcggcgcgtccttcgccgccgccggcgaagacgccggcgacgcggttctcctggagatcaccgacgcgtccttcatcgccggggaagctgacccctcgcctccacctcccgtctccgtcgacgacctcgccggcctagaccccctgccgtacccgaccatctgggttcgcgccgaccgcaccaggcaagccctcgccgcgccctcttctccggattcaccggccaatgagctgcttgctaatcgagagctcctcctacttccgcgccctcctcggcggcagcttcagggtggcttgtttctggctgctgagaatcttctaacagaatgtgaaaggtggttccgcaccatgagctctcaaagttcctcgctattggccccattagatttcttaattgacacctggtactttgctcaagagcatgggattaattatgttcaagatatatgcccaggatatttagctcagaattttgtgcaggttatctccaggaggtcgtttgttaaacttccctatgatttgttatattctacaatcgagtgcccctttctgaccgtggatagatttaagtctatctttctgtttaaacctgttctgcaggtgaggatatgcctcttacctttagaatttgcagcaggaacaaagagaaactgggctgagttcggaagcaaagtagagagtaggattcttaatctgctcaaggatagtttgcgaacagtattggatgcaattgctgatgacaacttggagagttaccgtgttcgaattacagaatattctaagatcatgcacttcgttgcacttctcactgatgaagattttgttttgcagaaaatagtgctttctggttgtccacaaataactactgaaatcttgtacatatcagtgctcccccctactaatgtgggtgcctcattgaataaaagttatggatttggttataagaaatcttgtaaccattcgattcaaactctatgcaattccaatcctctggacagcatggatgagtgtaggcatgtaatggcatttagaatgcaagaattgcacctggatgggtgcaaaggtattggttatgccgctatgtctcagctaatgagtaatgtgaatataacaaacttcctatgtttaagggagacaacacttaccgatggcgctctctgcaactttgttggctcttcacttgagtttcttgatatttccgagaccgtggtttccatggtatcattagcaccagttataagaagaaattctaacttgagatgtctgaaagcagctggatgccgtaacttgctatttgaacatggtgaagtagaagcgatgagtggtggtaatatatacggagattttctacaagaaataaccagtacttgctgcttagaggatgttgaaatgggatgggcattttgccctattcgagttacaacccttattccttcttttagtaaagtaagaaagatgactattggacttggcacaacattaccagagaatatattgtgtgctcttcctgatatttgtccattcctagagtctttggttcttaggtttcagatgatctctgacaaagttgtaagaaatctgttgaaatcctcaacgaagcttcgggtgctttgcctgtactcttgtcttggcaatttaacttcatttagcttccaaatcaaggcaccattgctaagaatcttaaggcttgagtggattactccatggatgacaaatgatgacttggcagttcttatacagaactataacttagttgaactttcactgtctggttgcaaactccttgactccaactctcaagagttaatctcgtctgggtggccaaacttgacttgtttacaccttgagtttttatttaagccaaaatttcaaggtttcagtgctgttatatctgtagccaccctcttaaataagtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MHGGASFAAAGEDAGDAVLLEITDASFIAGEADPSPPPPVSVDD LAGLDPLPYPTIWVRADRTRQALAAPSSPDSPANELLANRELLLLPRPPRRQLQGGLF LAAENLLTECERWFRTMSSQSSSLLAPLDFLIDTWYFAQEHGINYVQDICPGYLAQNF VQVISRRSFVKLPYDLLYSTIECPFLTVDRFKSIFLFKPVLQVRICLLPLEFAAGTKR NWAEFGSKVESRILNLLKDSLRTVLDAIADDNLESYRVRITEYSKIMHFVALLTDEDF VLQKIVLSGCPQITTEILYISVLPPTNVGASLNKSYGFGYKKSCNHSIQTLCNSNPLD SMDECRHVMAFRMQELHLDGCKGIGYAAMSQLMSNVNITNFLCLRETTLTDGALCNFV GSSLEFLDISETVVSMVSLAPVIRRNSNLRCLKAAGCRNLLFEHGEVEAMSGGNIYGD FLQEITSTCCLEDVEMGWAFCPIRVTTLIPSFSKVRKMTIGLGTTLPENILCALPDIC PFLESLVLRFQMISDKVVRNLLKSSTKLRVLCLYSCLGNLTSFSFQIKAPLLRILRLE WITPWMTNDDLAVLIQNYNLVELSLSGCKLLDSNSQELISSGWPNLTCLHLEFLFKPK FQGFSAVISVATLLNK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..243#278..328#906..1041#1145..1194#1897..1985#2317..2390#2507..2652#3018..3160#3654..3687#3881..3983#4155..4300#4901..5242#5335..5575#5652..5707#5771..5839#atgcacggcggcgcgtccttcgccgccgccggcgaagacgccggcgacgcggttctcctggagatcaccgacgcgtccttcatcgccggggaagctgacccctcgcctccacctcccgtctccgtcgacgacctcgccggcctagaccccctgccgtacccgaccatctgggttcgcgccgaccgcaccaggcaagccctcgccgcgccctcttctccggattcaccggccaatgagctgcttgtattctaatcccgcgtcgcgtgattctggccaggctaatcgagagctcctcctacttccgcgccctcctcggcggcagcttcaggtcagtaatctagtcgccccgacgcgatcgagctctcaatctctcaaacctatcaacagcaaatcctaagtaattgtctgacattttcccgcggctcctgtgggcagtgaatctgggagagcgcatgtgcagatcagctgcaacctcgaggcggccgtgcaagtcctcatctatctgtttgagccttctgggagtttgacgattacgcaccacacctttctaccgctaatggaggtattcagtcttgggttagctttttaatggctttggtgcagaagttgttgaccggcatttgtgtacatatgaaatcacagctgctaatcaacacaattactagtaattggtcagttagctcaatttgagtaaacataccatgttttggaaattttgtgttatgtgaaatgtgagcaaaaatgccatgtatttgtgtctccatgaactgttgcttaactgggttcgagctcgaaggttcagattgtggtcattatgcacctttataatttgaggctagtgctattaagttttggtgtatggtcagtgatgctcactggtggtattatgaacttaatatttgcagggtggcttgtttctggctgctgagaatcttctaacagaatgtgaaaggtggttccgcaccatgagctctcaaagttcctcgctattggccccattagatttcttaattgacacctggtactttgctcaagagcatggtgagccatattttgttgccgctttgttctaatggttcttatacttttgcataacgaaatctattcaaagatctaattcttgttgacatttgtatgattgcagggattaattatgttcaagatatatgcccaggatatttagctcagaattttgtaggtacaatatactaagttgcaatgctgccatacctttctgcatactatcaatttgtttcctaacaatatcttccttcagtttgaaaagtttatgtgtgactgattctacaagcagttagttttgttccactcatggtcctttcggagattctagaacattaaggacccgcagtcaccatatttgactcacataaaccatgtttgtagcctacaattgacattaatatttcacattttcagataggaaaattctagaaactgtagaggctggatgaattttcatgtgctctatttatggttgatgaaccggtgcatgttggcatttatgaatgatgattactgcttgaattgaagaaaagggtttgtctagattcagaggaaaagctcactgattttttactttttatggagaaaataaagatattctctttgttagcagcgtcatgtcgtttatagccttatagtgttttagaccatattttttccccttcttgtaataattaaatagactatgcctttcttattcagacactgctttaaccaagaaagcttatgatattctataaaaaagaaaaaaaaagttatgatgttaaaatgatgataggccaacttaccagttgaatatatatgcagtggggctacctttatttggcatgaaatgtattcatgtataattaccactgggtgaatcccatacaggtgcaggttatctccaggaggtcgtttgttaaacttccctatgatttgttatattctacaatcgagtgcccctttctgaccgtggataggtttgttttaatttttcagcgcttttccataatcaaatcgctgtgctttcatctcgatgctaaaatttgatctactgaccttgtccagtgaaaaacaattatgcgaagcaatcctatgctggattactgaaaatatgctatgctgtgaagaactacctcccaactcagtagatcaccagctgtaccttcttaataaagtacacctctctgtgacccatctatacaatgttacatgacttataccatcatatatgtgttgcctccttggtttgttcattgactacatttatgtatgttttctaccacttcactgaatattttggccacacagatttaagtctatctttctgtttaaacctgttctgcaggtgaggatatgcctcttacctttagaatttgcagcaggtatgattccttgatcatgagtttttaattgataataacattatgttatgcggttctcttgtttgatcttttgctatgtcaagacataatccatgctttttgattcatttttgtaggaacaaagagaaactgggctgagttcggaagcaaagtagagagtaggattcttaatctgctcaaggatagtttgcgaacagtattggatgcaattgctgatgacaacttggagagttaccgtgttcgaattacagaatattctaaggtttttatttttgccacctctgttgtaataatgttgttttgatatatttgaattgtctagaattcttttctttttggtgtttcttaaaaatataatacttttttagtgactacataaattggtcgcaaccacttcatgtataccttgtttgaatgactacatattgcttttattttatcaattgttgtaaaaataggtaaattatgctttactttgtatataaaaaatcttcttataaaacctacaaaatattataggctcaataactctttttacatgcttcgtgtgaagatatccttctgttatgacaaagtgctatcctgcattatcaaaagagattctggtcctttcattgtctattgcagatcatgcacttcgttgcacttctcactgatgaagattttgttttgcagaaaatagtgctttctggttgtccacaaataactactgaaatcttgtacatatcagtgctcccccctactaatgtgggtgcctcattgaataaaaggttagaaagttcatgggcccaagttgattaccgaaatatcatcctttacaatgagctggaggaggctgttaaaagctcatcatttggaaatgtgcacatggtggatctctcaaaatgtccaaatgcacattttagcactgcaattgactggttgaagttggcatttccagaattgaggatattcagagcttccttttgtttgacatttcagttcgaagacttgttatatctgctactgacttgtccatggattaatgaaattgatttgtctattgatacgagcattatagcacaaatgcattcagttatctcttccagatttgaaggacggggcgcagtgaagccaaagctcacaagatattatgcacaggatccgctatgtgataccacaatgaactcatatatctcaaatatatcaaaattgatattggaaggcagaaatgatattactggttggaaatatgttctgttcctactattgatttctttatagttatggatttggttataagaaatcttgtaaccatgtatgtgccttttctttttgcgtgtgtgtatgcagatgtggacctgttgaagatatccattctgaagaactctctttgttatataaacattaaaaattgcaccctattgacagatgatggtatttctaaattattactcaagtgtacgaagattcattcaatggttctttcttatacttcttttggaaatcagtcgattcaaactctatgcaattccaatcctctggacagcatggatgagtgtaggcatgtaatggcatttagaatgcaagaattgcacctggatgggtgcaaaggtaaacatggcttttgtttcatgtcaaaactttctccacaactaagcagatcataacttcctaggacagcagaagtggcattcttatttctatgttctattaactttacgctccattagcctagcatgggggaatctgggtaatataaatttatctacgtgcactgtgcaggtattggttatgccgctatgtctcagctaatgagtaatgtgaatataacaaacttcctatgtttaagggagacaacacttaccgatggcgctctctgcaactttgttggctcttcacttgagtttcttgatatttccgagaccgtggtatggttttctgtttcaaattatatgcatatggtcacctttttatatatcagaatatcagatgattttcctattctttgaaccaaagtacttgtgatgctaagcaaatattcttcagttttgaactttataagaatcaaacactgcaattgactagttgaagaaatgcttagactgagacttgcagtgaatttgctcagttggagactatagataaacaatatttttacaattaacttaggtaagggtaacatgtactggactatagattgtgatttatctttctgtagctttcagcgatatgcaatattgaattatggaacaaagtctgcaatgttttgatgatcacacaaaccaagctctactcgtccaacattgaatagaagtatatgattgaaatgatctttcttattgtacatctgaaaagggggcccatcacattttctacttttgtgtctgcaaaggacagagacagactacagcagtgcagtcatggttcatgattactgtcttttatcgttatgctgccataaaagaaccattactatggtctgttttgatatatatagtcttaaaagttttgtcgcctcaaaattacaggtttccatggtatcattagcaccagttataagaagaaattctaacttgagatgtctgaaagcagctggatgccgtaacttgctatttgaacatggtgaagtagaagcgatgagtggtggtaatatatacggagattttctacaagaaataaccagtacttgctgcttagaggatgttgaaatgggatgggcattttgccctattcgagttacaacccttattccttcttttagtaaagtaagaaagatgactattggacttggcacaacattaccagagaatatattgtgtgctcttcctgatatttgtccattcctagagtctttggttcttaggtttcaggtgtgtctctggctcttctccctactatttgttcaataataaaactaattgtgcctttaattcttttaataaccggatgatgtacataccagatgatctctgacaaagttgtaagaaatctgttgaaatcctcaacgaagcttcgggtgctttgcctgtactcttgtcttggcaatttaacttcatttagcttccaaatcaaggcaccattgctaagaatcttaaggcttgagtggattactccatggatgacaaatgatgacttggcagttcttatacagaactataacttagttgaactttcactgtctggttgcaaactccttgactccagtaagttctactttcggattcagtatgtggaccactcgtgatgctgttgggttgagtttttttttgtgatcaacagactctcaagagttaatctcgtctgggtggccaaacttgacttgtttacaccttgaggtatattataactacaattttttacatggggcatttgattaaaaattatctttatctttgcagtttttatttaagccaaaatttcaaggtttcagtgctgttatatctgtagccaccctcttaaataagtaa</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
