Os01g0973300
| Gene Name |
Os01g0973300 |
|---|---|
| Description |
Adaptin, N-terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001052081.1 GI:115442532 GeneID:4326400 |
| Length |
5457 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0973300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:44766266..44771722 |
| Sequence Coding Region |
44766267..44766305,44766395..44766964,44767486..44767659,44768002..44768128,44768207..44768316 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>cacgacttacttccagatgaaactacatctttggaggacacggtagatgttttgttcagtgacaattccccgggagtagtgggagctactgctgttgcctttaactcagtttgcccaaattgtttacccttgatatcaaagcatttccaaaggctatgtgagacactcccagatattgaagaatgggctcagattcttctaatcgatatcatcttgcgatatgtaatagctagacatggattggtgaaggattcttcaatttttgcttcaaatttgactttgaagagccagggcagtggagattcagcccttattggcaatgaaacttgtggcactacatcaaccatcacattgttccgacattacattgaagaatattcggaatgtttagaaggtgacataatcaactgttcatccgtgaccagtagcacaaacaatgatgttgcactacttttgaaatgtacatcgcctcttctgtggagccgaaacagtggagtcatacttgcagcagcaagtgttcattggatcatggctccagttgaccaactgaatagagttgttgggccaattttatttactctacgctcatctcctgatgcaacatatgtgatgcttggcaacatactagtttttgccaagacagccccacaattgtttgctccgttctatgaagatttcttcatatgcacttcagatccatatcaaactaaggctttgaagcttgaaatactgaccaccatagccacagagtcctctattccagcaatttttgaagaatttcaggattatattaaagaaccggataggagatttgtggcagatacagttgctgctattgcgctgtgtgcccagaagcttccctctatcactaccagttgccttggtgggcttttggcactagtattttatgaatcatctataagtgattctgctaactttgatggagaagctgctgttttagttcaagcaattttgtctatcaaagcaatagtgagaacagatccagcatctcatgaaaaggtgattgtacgcttggtccacagcctggacaaaattaaggagcctgcagcacgatccctgattatttggatatttggagagtatagttccataggaaatatcattccaaagataactcctgctgttctcaagtatcttgcatggtcctttgctgctgaaatgcttgagacaaagcttcagatcttaaatgctgctgcaaaggttatcatacattctcctgaagaacacttagaagaattcaaaaagataatggcccatgtcattaagctggctacatgtgatttgagttatgacgtccgtgatcgtgcccgttttatatcaagacttttgccatacagcacaacctatttaaatggaaacaactcctcatgtcaatcacataatgaagatatgtttaaggaactggctaatcatatatttgatgggaagatgccatcaacattccatccaaccaataactaccggatttatcttcctggttccttgtcacaggtgattcttcatgcagctcctggttacgcaccacttccaaagcctcagagtatggaattaattcataagaccatggaaccaaccagaggagtaggcaattcttctgaaagcattaattctgatgctgaatctggatcttcaacatatgatggtggttctgtttatgattcagagagtgaagttgatggctcatctgacaggaatgctgctgattctaacacaaaagataatcaagaagatcccctggtccatgtttatgatgcaagtgtagatcaaggtcagacggctagggatgtcgaggataattttgcatctctcatcactactgatttgactgaattaatgtctaagtcagccttggaaacatggcttgatgaagctcctgctgaaccagttcaggtttctacacaagcatcctctgctagagtgtcttttaccaatcggagctttgagcgaaaacctaaattgcacatgttgttagacccatctaatagtaatggtctaagtgttctttatgccttttcatctgaggtttcacccgtatcacgcttgctagtgtgtgtagacttgttatttgagaatgtttcaacaaaccaactggcagatataacaattaaatccgaggaggcttctggtagtgaggatggcttggaccaaacattacaaggatctgcaagtgttccaactattgttcttgataaagagatacaattattggctcccgaacaaacggaaaagatggttcttcaggttcacttccatcaccatctattgccccttaagttgtctgtgctctgcaatgggaaaaggcatccagcaaaacttcatcctgacattgcttattttgtgcggccactgcccatggacctaaatgcttttctatgcaaggaaaaccaactgaggggaatgtttgagtatgctagaaggtgcactttcaaagatcatcttcagaagcttgagcacaacgatgatagtgaagagcacactgataagaaccttctgatagcccagagcctcgcgtcaaaaatactcagcaatgccaacttccacttggtttcaatggatatgccagtgaccttcagcattgaggatgcttctggcttatgctggcgattcagcagtgagatcctgagcacttcaaacccttgcctaattaccatcctcgcggaagggcatatctcggaaccacttgacctcactgctaaggtgaactctgaagatacagcgtttggcctaaacctcctaaacagagttgtagcaatcatagaatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>HDLLPDETTSLEDTVDVLFSDNSPGVVGATAVAFNSVCPNCLPL ISKHFQRLCETLPDIEEWAQILLIDIILRYVIARHGLVKDSSIFASNLTLKSQGSGDS ALIGNETCGTTSTITLFRHYIEEYSECLEGDIINCSSVTSSTNNDVALLLKCTSPLLW SRNSGVILAAASVHWIMAPVDQLNRVVGPILFTLRSSPDATYVMLGNILVFAKTAPQL FAPFYEDFFICTSDPYQTKALKLEILTTIATESSIPAIFEEFQDYIKEPDRRFVADTV AAIALCAQKLPSITTSCLGGLLALVFYESSISDSANFDGEAAVLVQAILSIKAIVRTD PASHEKVIVRLVHSLDKIKEPAARSLIIWIFGEYSSIGNIIPKITPAVLKYLAWSFAA EMLETKLQILNAAAKVIIHSPEEHLEEFKKIMAHVIKLATCDLSYDVRDRARFISRLL PYSTTYLNGNNSSCQSHNEDMFKELANHIFDGKMPSTFHPTNNYRIYLPGSLSQVILH AAPGYAPLPKPQSMELIHKTMEPTRGVGNSSESINSDAESGSSTYDGGSVYDSESEVD GSSDRNAADSNTKDNQEDPLVHVYDASVDQGQTARDVEDNFASLITTDLTELMSKSAL ETWLDEAPAEPVQVSTQASSARVSFTNRSFERKPKLHMLLDPSNSNGLSVLYAFSSEV SPVSRLLVCVDLLFENVSTNQLADITIKSEEASGSEDGLDQTLQGSASVPTIVLDKEI QLLAPEQTEKMVLQVHFHHHLLPLKLSVLCNGKRHPAKLHPDIAYFVRPLPMDLNAFL CKENQLRGMFEYARRCTFKDHLQKLEHNDDSEEHTDKNLLIAQSLASKILSNANFHLV SMDMPVTFSIEDASGLCWRFSSEILSTSNPCLITILAEGHISEPLDLTAKVNSEDTAF GLNLLNRVVAIIE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2..40#130..699#1221..1394#1737..1863#1942..2051#2930..3130#3222..4189#4333..4581#4983..5328#gcacgacttacttccagatgaaactacatctttggaggacgtatgtctagtatgacctttttttcctcgtgcattgatgttgaagattcatatgtatctgaattatgaagtatgctaatatggttgcagacggtagatgttttgttcagtgacaattccccgggagtagtgggagctactgctgttgcctttaactcagtttgcccaaattgtttacccttgatatcaaagcatttccaaaggctatgtgagacactcccagatattgaagaatgggctcagattcttctaatcgatatcatcttgcgatatgtaatagctagacatggattggtgaaggattcttcaatttttgcttcaaatttgactttgaagagccagggcagtggagattcagcccttattggcaatgaaacttgtggcactacatcaaccatcacattgttccgacattacattgaagaatattcggaatgtttagaaggtgacataatcaactgttcatccgtgaccagtagcacaaacaatgatgttgcactacttttgaaatgtacatcgcctcttctgtggagccgaaacagtggagtcatacttgcagcagcaagtgttcattggatcatggctccagttgaccaactgaatagagttgttgggccaattttatttactctacgctcatctcctgatgcaacatatgtggtaatcccaaaatttctttttcctggtccattggtactgtatcctggatttcaactaagaagaaatatggagccaaagcatgttttacacttttactcacttgatccgttgtaaatactcccatagacttttgataatgtcatttcaacaatttttaggtgtaggcttgatgtgcttgactgcttttataactttatgtaaataaatattctattcaaaccaacttttgaccatgctatgtctttctggtgccaaattaaatccttcagagcccaaatgcttctgggacactgtcagccttgctttctgtttgtactgatgtttgaactcaataactcattatagaagacaagcctatggtgcataagcattcacaactttgtgttggatgaagctagcaagttgatcgttaattttaattttattttgagaatcaaatattgagatatatttctttgaaatgttcatgttctctcacttaaatttttacttgatctgacaatcctttttaattcttgcagatgcttggcaacatactagtttttgccaagacagccccacaattgtttgctccgttctatgaagatttcttcatatgcacttcagatccatatcaaactaaggctttgaagcttgaaatactgaccaccatagccacagagtcctctattccagcaatttttgaagaatttcaggtacttgtttgtaaaagcaatgtacactctatatttgacttgtctcagtgacctgataatgttctatatgattctcaaatgaaggttcatttgaagttcatcttgtgattattggtaaccatattcataatatactgaggcaatatattttttgaaaacaaattacctttgctttgttgaattttatgcataacaaacagcatctttctgaatttcttcttgacattgttgtccactccctaatgtgataagtaatatctatcttaaacaaaaactggtatagttagttgttgttaactcatcctgtttgtgcatgtttattgtacttcttattcctgccaggattatattaaagaaccggataggagatttgtggcagatacagttgctgctattgcgctgtgtgcccagaagcttccctctatcactaccagttgccttggtgggcttttggcactagtattttatggtaatactgctacttctgcatatttttgcagtaaatgattcttcttgaatataaagtttgattctaattattttacagaatcatctataagtgattctgctaactttgatggagaagctgctgttttagttcaagcaattttgtctatcaaagcaatagtgagaacagatccagcatctcatgaaaaggtatttgttttaaataagcttagcaatcttgtaactccataggtgtgtctcatttgtatacttctcaatatatggatgatgcatacttgatttgacctcatgatgcccaaccagtaatttagtacgaaatgcatgaaacctctgttgtattatacaacttatggtttttccttcatctccttggattgaaacagtttgttttgctcttttgttagtcataactcataacttggctactgaagggtgcaagaattttaagatgatacaatgtagtttattttattctctcattttaaatagaaaaggatagtccatcagactccctttatgtcacctttcaatgtgcctcccatatttcatttttgtttacttaggccccccataagttaaccagtcttgaaaatacccctcaatgaggcatgttacactatttctggtagttctattatcttttctatttattaacttatgtaagtgcatgtttaattatttcaatagttgtttcaacggtttgagtgcctttggtacttgtcagttctagcacagaatttcttgaacttacagaggtactgaaatcgtgtgataagccacacattctagtaagaatttagttttttttggggagcaggggtgtattacacaaatatgaacatatatgtgcaaagtaaatgaaaatgggatattgggaacaatttgaacaattgtttgacattcagtgtttctttttctgtttgcagtctggttgtgtatttattgaaaacatgtgcaatagtaaatattgaatattgtgtgctactttgctctattgtttgaatgtatttgttccttaattatacattaatttgatattttgctattttgctattcttttcctgaaggtgattgtacgcttggtccacagcctggacaaaattaaggagcctgcagcacgatccctgattatttggatatttggagagtatagttccataggaaatatcattccaaagataactcctgctgttctcaagtatcttgcatggtcctttgctgctgaaatgcttgagacaaagcttcagatcttaaatgctgctgcaaaggtccctccatcctccatctctccctctctgtaagaattcaaaaggttccttttctcttctgtggggatcactaattgttcttcctttacaggttatcatacattctcctgaagaacacttagaagaattcaaaaagataatggcccatgtcattaagctggctacatgtgatttgagttatgacgtccgtgatcgtgcccgttttatatcaagacttttgccatacagcacaacctatttaaatggaaacaactcctcatgtcaatcacataatgaagatatgtttaaggaactggctaatcatatatttgatgggaagatgccatcaacattccatccaaccaataactaccggatttatcttcctggttccttgtcacaggtgattcttcatgcagctcctggttacgcaccacttccaaagcctcagagtatggaattaattcataagaccatggaaccaaccagaggagtaggcaattcttctgaaagcattaattctgatgctgaatctggatcttcaacatatgatggtggttctgtttatgattcagagagtgaagttgatggctcatctgacaggaatgctgctgattctaacacaaaagataatcaagaagatcccctggtccatgtttatgatgcaagtgtagatcaaggtcagacggctagggatgtcgaggataattttgcatctctcatcactactgatttgactgaattaatgtctaagtcagccttggaaacatggcttgatgaagctcctgctgaaccagttcaggtttctacacaagcatcctctgctagagtgtcttttaccaatcggagctttgagcgaaaacctaaattgcacatgttgttagacccatctaatagtaatggtctaagtgttctttatgccttttcatctgaggtttcacccgtatcacgcttgctagtgtgtgtagacttgttatttgagaatgtttcaacaaaccaactggcagatataacaattaaatccgaggaggcttctggtagtgaggatggcttggaccaaacattacaaggatctgcaaggtactatccatctttaattggttcattttaatgtcatttcatttgtgtcgtcagaatgcttgcagtggcattctgttatctgtttgtgtttattaacttattttaattactgtctcatttattgtaatcattttggcctgcagtgttccaactattgttcttgataaagagatacaattattggctcccgaacaaacggaaaagatggttcttcaggttcacttccatcaccatctattgccccttaagttgtctgtgctctgcaatgggaaaaggcatccagcaaaacttcatcctgacattgcttattttgtgcggccactgcccatggacctaaatgcttttctatgcaaggaaaaccaactgaggggaatgtttgagtatgctagaaggtcagtaaatccccaccagtctccactatgttatacttctggtcgtgttacggacttccaccagtctccactatgttatacttctggtcatgttacgagacttccaccagtctccactatgttataatgctagctttatttgcacatattggtttctctgaagtttcagcatttagggcttatcctaataatgccataacaccaccttaagcttttcatatttgcatatttgcaatttcttgctattgcttatgggttttattacttaccaaaaaggcaatcagaacaaaaaaaaacaaaggaagagtttctt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