BGIOSGA029464
| Gene Name |
BGIOSGA029464 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:001-044-E12, full insert sequencecDNA |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA029464, complete gene. |
| LocusTag |
P0470A03.28 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA029464-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA029464-PA |
| Length |
4318 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:18445629..18449946 |
| Sequence Coding Region |
18449866..18449946,18449678..18449773,18449520..18449594,18449241..18449371,18448652..18448706 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:18445629..18449946 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:18445629..18449946 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGAGTGCGGCGGTGAATGGATTGGCTGGTGCCGGTGGTGGCATCATCGCCCAGATCATCACCTACCCCCTCCAGACTGTGAACACCCGGCAGCAGACAGAGAGGTCAGCAAAAAAGAAGAAGGCCAATGGCGCAGCCATCGCCAATACTTCCACCCTCTTCCAGATGCTCCAGCTGTTCCAAACAGAAGGATGGGGAGGGTTGTATAGCGGCCTTAAACCCTCTCTTATTGGCACCGCTGCTTCACAGGGAATCTATTACTACTTTTACCAAATTCTCAAAAACAAGGTGGAAGATCTAGCAGTTGCTCGCGGTAAGAAGGGTCTAGGGGATGGTACTGTTGGGATGTTCTCCTGGCTTGGTATTGCAGCTGTTGCTGGGTCAATCAATGTTCTTCTTACCAATCCAATATGGGTTCTCGTGACTCGTATGCAGACACATACGCAAGCAGAAAAGAAGATCATGGAGTCTAAAAAGGAGCTTTTGCTGAAGGATGTTGCTAGGGCCAATTCAATAGAGGTCTCAATTCTTAAGGACAGGTTGTATAAACTTGATTCTGAAAAGCCTCGTCCATATGGGACAATTCAAGCGGTCCGGGAGGTCTACCGTGAATCAGGCATAAGAGGATTCTGGAAAGGACTTATTCCAACACTAATTATGGTATGTAATCCATCAATTCAATTTATGATCTATGAAACATTGGCAAAGCGTCTCCGGTCAAAGAGATCTGGAAAGGAACTCCCAAAAAAGAACCTTACTGCTATGGAGGTATTCTTATTAGGTGCAATAGCAAAGCTCGGAGCTACTGTTGTGACATACCCATTGCTAGTGGTTAAGTCTAGGTTGCAAGCAAAACAAGAAATTGGCAGGAATGTGATGTCCAGATACACAGGTACGATTGACGCGATCATAAAGATGATCCGGTATGAAGGATTGCACGGGTTTTACAAAGGAATGGGTACGAAGATTGTACAGAGCGTCTTTGCCGCCTCAGTTCTTTTTATGGTAAAAGAAGAGTTGGTAAAATTCGTAGTTATGTTAATTGCTAGGAGTAGGACTGTGCTCGGTCCTAGCTCTAAGAAACGATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSSAAVNGLAGAGGGIIAQIITYPLQTVNTRQQTERSAKKKKANGAAIANTSTLFQMLQLFQTEGWGGLYSGLKPSLIGTAASQGIYYYFYQILKNKVEDLAVARGKKGLGDGTVGMFSWLGIAAVAGSINVLLTNPIWVLVTRMQTHTQAEKKIMESKKELLLKDVARANSIEVSILKDRLYKLDSEKPRPYGTIQAVREVYRESGIRGFWKGLIPTLIMVCNPSIQFMIYETLAKRLRSKRSGKELPKKNLTAMEVFLLGAIAKLGATVVTYPLLVVKSRLQAKQEIGRNVMSRYTGTIDAIIKMIRYEGLHGFYKGMGTKIVQSVFAASVLFMVKEELVKFVVMLIARSRTVLGPSSKKR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..81#174..269#353..427#576..706#1241..1295#1771..1926#2347..2415#2502..2609#3232..3300#3830..3884#4122..4318#ATGTCGAGTGCGGCGGTGAATGGATTGGCTGGTGCCGGTGGTGGCATCATCGCCCAGATCATCACCTACCCCCTCCAGACTGTACAATCATTCTCCCCCTACCATCTTATGTAGCTCTGCTGTTCCTTTATAGTCTGCTCAATCCTTCCTCATCATGATGATGGCCTGAGCAGGTGAACACCCGGCAGCAGACAGAGAGGTCAGCAAAAAAGAAGAAGGCCAATGGCGCAGCCATCGCCAATACTTCCACCCTCTTCCAGATGCTCCAGGTAGTTCCTCCTGGACTTTTAGTTTATTTGGAATTGCCTCCTCTAATGTTATAATGGCCAAGTGTGGAATCGAGTTACTGCAGCTGTTCCAAACAGAAGGATGGGGAGGGTTGTATAGCGGCCTTAAACCCTCTCTTATTGGCACCGCTGCTTCACAGGTAAATTCCACTGGTTTAGTAATTTGGTGCTACTCACATCATTTTTTTCTGTAACAATTGTATTTCCCTGTTTGTCAATGTGATGATACTTGGATGAGTCCGTACGGTGGTATTCAGGATTTATGGTTCATCCTGTTTGTGGTTGTAGGGAATCTATTACTACTTTTACCAAATTCTCAAAAACAAGGTGGAAGATCTAGCAGTTGCTCGCGGTAAGAAGGGTCTAGGGGATGGTACTGTTGGGATGTTCTCCTGGCTTGGTATTGCAGCTGTTGCTGGGTAAGCCATCTACTCTCGCACTGAAATTGCTAAACATCATTTATATGTCAAGTCAACCTGGAGCCCCAACATTCACCCAAAACAAATCGAATGCTTGTCTCCATTTAATGCTGGAATGAACAATTCAGTCTGGACAACCGGGACATTATCAGTTGGTAGTGGTCCAATAGGGCATCTCCATAGTATCCTGTCAAACGAATTGTAATAGAGTTCTGATGAATTTGACTGAGCTTGCAAAGGCTAACAGAGCATTGAAACCTTAAATTGTTTCGGAAAGGGAGATAAGAAAATGTAATTCATGGTAATGTATGGTTGCCATGATTGTTCATATGGCCTTGCCTCCTTAGAACTGACTGAAGGCGGTGATTAACTTTGAATTTGAAGCGTGCAATCCTTTCCAGTTAAGATGGTTTTTGTTCTGGAAAACCATAGCGCTGTGAAATAGAGTCACCAGTATGGCGAAGATTGCACTTTGAATGTAATATTGCAACATTGATCCTCAGGCATTCTGATGGACACTTTTCTCTGCTGCAGGTCAATCAATGTTCTTCTTACCAATCCAATATGGGTTCTCGTGACTCGTATGCAGGTAAATTTTGTTTAACAGTCTATATTTTAAAATGACATATAACACCAAAAAAGATCATCGATGATGGGGTTAATGAGTTACTATACTGTATGTCCTGTCAAAATTCAAAAAAAGAGAAGAAATCTTCTAATATGTTAGAATATTAACATTGGTATTGCACCCATTGAATTTAATTACTGTTGCTTTTGCCCCCACTTTCTGGTAGCATACTTACCTTCTTTGTACCTGCCTGACTCCAAGCATTAGCTTTGTTTTTATGATGACAATGATCCATGAAACTTCAGGAGGCGCCGAATCACAAGGATTATTGGTCCATGACATCCTTTGTGAAATTAGTTGGAAGACCATGGTCGGTTGTAACCAAGCTTGTATTAACTATGCAACTACTATTAAATTGGAACATTCTAATATTATTCAAAATATCTGTAAGTTTTTTTATCATCAGTTTGGAAATTAACTTTATTCCATTTTTCAGACACATACGCAAGCAGAAAAGAAGATCATGGAGTCTAAAAAGGAGCTTTTGCTGAAGGATGTTGCTAGGGCCAATTCAATAGAGGTCTCAATTCTTAAGGACAGGTTGTATAAACTTGATTCTGAAAAGCCTCGTCCATATGGGACAATTCAAGCGGTGAGTAATTGAGCACACTCACATTCCTTAAGTTGCTATACATTATTTTGTATATATAATCCATTTCTTAACAATTATGCAGCACATAAAATAAGATAGTACGTGAATCCCCCACACCCAACCCTGCCCCTCTCTATTTTTTGTTGAGAGTTGTGACCACATCTAGATATTTAGATAGATTTCTCACTTGTACTATTTAGATAGTACAAGAATTCTTGATTTTTTTATCGAATTGCTTTCTTCCTTCTAGGACTAATTGCTGCACTTACAGATTTTAAAATTCTGTTTGCAAAAAACTACAATGAATAGTAGCTGCAATTGCATTTCAAGTTTTGGGCTCTACAAACTTGCTTTTAACTAATCAAATGTATTTGTCACTGGTCAGACATGATTTTTCTTACTTTTATCAGTAGTATGTAGGTCCGGGAGGTCTACCGTGAATCAGGCATAAGAGGATTCTGGAAAGGACTTATTCCAACACTAATTATGGTTAGTTTATGTTTCTCAAAACATTTGAGCTGAAATTAGTGGTTATGTAAGAGTGACTATAGAGAATGAACCATTTAAATTGTTAGGTATGTAATCCATCAATTCAATTTATGATCTATGAAACATTGGCAAAGCGTCTCCGGTCAAAGAGATCTGGAAAGGAACTCCCAAAAAAGAACCTTACTGCTATGGAGGTATGGATTTGTTTTTTCGATTTAGCTCTGCATTAGAAATTTGCATGTATCTGTGTCTGTGGATATATGAGTTTTTAACAGTTAGATGGCATCAGCTATTTGCATGTGCTGCCTTCCTAGGAACTTCATGTTTCTTTTTTATTTCTAGAAATTTGTATTGTATCTTTCAATCATATAAACCTGTTCACCGTTTATCCGCTTTGATGCAAATAAAGCTACATTGATCATGATCAATAATATTTGGTTCAATGTAAAAAGAATCATCGTTGGGATTGCTATAATTACCTTCAAATCATTCGTCTATAATTCTTGTACTCCATAAATTATTATATTTAAAGATGCATGCTACGGTTATTTGAGCAAACCAGATAATTTGGCCACATAAAGCGCCAGGACAGAGTAATTTCATACTACAATTAGCTATGCAGTCAATTTATGATTCTATGAATGCACTAAAGAATATTCATCATTATTACTTCCCTTTGTTTAATTATGTCCATAGCACAGACCATATATTTGTTTCTTTATTCTTCAGATCCAGAGCTAAATAACATCTTAAGCTCTTTGAAATTTCCTTTGATGCATTTATATGTCCTATCCTTACCATTTTCTCTTTGAGCAGGTATTCTTATTAGGTGCAATAGCAAAGCTCGGAGCTACTGTTGTGACATACCCATTGCTAGTGGTTAAGGTAAACTTAATATTATATACATGTAAATCATCTTATCTTGTGCAAAGTGTTAAAACTGATGCATTTCTCACTTGTACATCTGTTTAAGCTCAATTTTTTTAAGAAATGAGGAATTACTGGCTTGTCAGATCAGCCAGTGATGGGCCACTCAGGATTGCCAAAATAGGCCTGAATAGAAACCCGGAAGTCCACATCGATGCTAGAGATTTCTTTTCCATTTCTCTACTCTGTTTCTCTGATGTTGTTAAAACAAATGCTTTCAGCAAAACAACTACAGTACTAATAGCTGTCCTGCATTGTTGCATACAACAACCCCATGAATATGCTGCACCACATTTTTGCTCTCCTTCAGAATATAATTTAATCTTGTGAGACTTTACTCAACAACGACAATATCTAGACCTGCCACGGGTGCAAGTAGTTGCAGGCAATGCCAGTCTATCTGGGTTGAGTGTATGAATGGTTTACATTATCAAAATAGTGTCATGTTTGTTTGTGCTATCCTGATTGTTGTATTGAACTAATGCAGTCTAGGTTGCAAGCAAAACAAGAAATTGGCAGGAATGTGATGTCCAGATACACAGGTAAATCATTTCCTACCATTTTAACTTACTAGCAGAAAACACTGTTTCATTTCCATATTTGTTGGGATCATTGTTTTTCCGCGCTGCTCCTATGTCTTGTGTGTCAGACATTTAGCTATACCTCTTCCGTTATAAAATGTAGCTACTTTTAGCTACGGATATGGATATTTTGGGACGGAGGGAATATTTGCTACTCATTGTGCAAGTAATATAATGCTGACTGCCTGTTTTCTCCAGGTACGATTGACGCGATCATAAAGATGATCCGGTATGAAGGATTGCACGGGTTTTACAAAGGAATGGGTACGAAGATTGTACAGAGCGTCTTTGCCGCCTCAGTTCTTTTTATGGTAAAAGAAGAGTTGGTAAAATTCGTAGTTATGTTAATTGCTAGGAGTAGGACTGTGCTCGGTCCTAGCTCTAAGAAACGATAG</dnaseqindica> |
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