BGIOSGA029739

From RiceWiki
Revision as of 09:31, 25 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA029739| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA029739, complete gene.| tag = OsI_314...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA029739

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA029739, complete gene.

LocusTag

OsI_31415

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA029739-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA029739-PA

Length

3635

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:13844273..13847907

Sequence Coding Region

13847770..13847907,13846303..13846397,13846046..13846187,13845720..13845944,13845285..13845347
,13845103..13845177,13844273..13844509

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:13844273..13847907 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:13844273..13847907 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCCATTCAACCAACTACCCAGGAGCTACAGTTTCTTGGTGAAACATGGACCCTTGTGGAAGATGACATACTATGGTACTGCACCACGAGTAGTTCATCAGCCACATTTTGCTGCAACATCGACATTCATAGCAAGCATGTCCCACTCCGAATCCTAAGGTCAAAAGGTTTACTGGATAAGATTCCGTTCACAACAGTTGTCACAGATCTGAGTACTTGTCACCCAACATGGTTTCACAAGCTTGTTACTAGATGTTACTGTCCATCAGCTGAAGTGTCAAAGAGAGCACTAAAAGCTGGATTGCAGCCCTCGCAAATTAAAGTCTATGGCCTCCCAGTACGTCCATCTTTTGTCAAACCTATTCGGCCAGAGGATGAACTGCGAAGGGAGTTAGGTATGGATGAATATTTGCCTGCTGTTCTACTAATGGGTGGGGGGGAAGGGATGGGTCCTATTGAAGCCACTGCTAGAGCACTTGGTGATGCTCTATATGACGAAGTCCTTGGTGAACCCACTGGTCAAATACTTGTGATTTGTGGCCGTAATAAGAAGCTGACTAGCCGATTGCAGTCAATCAATTGGAAAGTTCCAGTTCAGGTTAAGGGTTTCGTTACAAAGATGGAAGAATGCATGGGTGCTTGTGACTGTATAATTACAAAGGCGGGGCCTGGTACAATTGCAGAGGCCATGATTCGTGGCCTGCCCATTATACTAAATGGATATATTGCTGGTCAGGAAGCTGGCAATGTTCCATATGTTGTTGATAATGGATGTGGGAAGTTCTCAAAATCTCCAGAACAAATTGCAAAGATTGTAGCCGATTGGTTTGGCCCTAGGTCAGACGAGCTCAAAATGATGTCTCAAAATGCCTTGAAACTAGCGCGACCGGATGCAGTGTTTAAAATTGTCCACGATCTGCATGAGTTAGTCAGGCAAAAATGTTTTGTACCCCAATATGCGTGTGCATCATAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAIQPTTQELQFLGETWTLVEDDILWYCTTSSSSATFCCNIDIHSKHVPLRILRSKGLLDKIPFTTVVTDLSTCHPTWFHKLVTRCYCPSAEVSKRALKAGLQPSQIKVYGLPVRPSFVKPIRPEDELRRELGMDEYLPAVLLMGGGEGMGPIEATARALGDALYDEVLGEPTGQILVICGRNKKLTSRLQSINWKVPVQVKGFVTKMEECMGACDCIITKAGPGTIAEAMIRGLPIILNGYIAGQEAGNVPYVVDNGCGKFSKSPEQIAKIVADWFGPRSDELKMMSQNALKLARPDAVFKIVHDLHELVRQKCFVPQYACAS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..138#1511..1605#1721..1862#1964..2188#2561..2623#2731..2805#3399..3635#ATGGCCATTCAACCAACTACCCAGGAGCTACAGTTTCTTGGTGAAACATGGACCCTTGTGGAAGATGACATACTATGGTACTGCACCACGAGTAGTTCATCAGCCACATTTTGCTGCAACATCGACATTCATAGCAAGGTAGTCCTTGTATGGTCTGGCTTTTTTCTCTTGTTATCTAAATTTCACAAAACTACAGATACTTTGATCAAACTATCACAAAACTACAGATTTAAGAATGTATTTCACAAAACTACAGATTTAGAGTTAAATTTATCATGGAACTACAGATTTAAGGTATTATATCACAAAACTATTGATTTAACAACTATTTTATTACAAAACTACACATTTAAAAACTATTTTATCACAAAACTACAAATTTTATAACTTTAAATAAATAATAGTGCTATGATCTAAACTCTAGAATATGTAGTTCTTTGATAACTTAATCACTAAATCTGTAGTTTTGTGATATGGTGCATTAAATCTGTAGTTCCGTGAAAAGTTTAACGCTAAATCTGTAGTTTTGTGATACACATTCTTAAATATGTAGTTTTGTGATAATTTGACACAAGTATCTGTAGTTTTGTGAAATTTACTCTTAGTTTAATATATTTTTAATTTTAATTATCTTAGGATTTCTTTGTTATTCTGACACAATTCATACATAACTCAAATTGCAACTTGTATTGCCAGATAAGTTACAGAGTCTGATTTCTAACTCACGAAGATGCTTTCCTTGTGTGGTTTATGGCAGTGAATAACTTCTGAACAATACATGTTAAGAATTTTTGGTATCTACCATTCATGTCATTCTTGCTCATTTCCAAACATATTGTGAGTTTTTGTTTTTTCACCTCAAATTTTGTTAATATCAGGCCAGCCACTCTTATGGTCATGATTGAATTAAAAATATATTATGTCGCCTTATCTAAATTAAGCGGTTTTTTTATGATTAAAGAACATTAGTTAGGACCACTGCCAGGGATGTGGGTTTATATACCCAATGCCTCAATTCTATGGTTTCCCATGAGCCTGTGATGATGTTCTAAAGTTTAGCTTTTCGACAACACTCCGCGGTGGCTAGCTTTCTTTACTTTGATCTCTTTAGTTATTTTCCTGTTAATATTAAAGTGATTCACATGTAGACCCTTATTGTCTTGTTAAATACTCCCTTCATCCCAAAATACAGCAACTTCTCCCTACTCCCTGATCTCAACCAATCACAACTCTCTCATTTAATTTCTCAACCTACTTCCTCATCTCAACCAATCACAACCATCCCCCATTTAATTTTACCTCTCTCAATCCCCGTGAAAAACTCCAGAAGTGCTTATACTTTGGATGGAGTGAGTATGTGCTATACTTTAGCTGTGGTCCTTGCCTATATTTGTGAATAACATGGTATATAATATCGAAATTGCCTCTCTTATTTTCCTGCAGAGAGGTTGCAAAAGGTCTCATGAAATACCAACCAGATGTAATTATCAGTGTCCATCCTTTAATGCAGCATGTCCCACTCCGAATCCTAAGGTCAAAAGGTTTACTGGATAAGATTCCGTTCACAACAGTTGTCACAGATCTGAGTACTTGTCACCCAACATGGTATGCCGGTTTCAATGTTCATGTAACTTAATACCAGTTCAGGTCACTTATCAAGTTTAAGATACACATGTTATTGCCCTTACAGTGAAATAGTTATTTTACTGCTATCCCGTAGGTTTCACAAGCTTGTTACTAGATGTTACTGTCCATCAGCTGAAGTGTCAAAGAGAGCACTAAAAGCTGGATTGCAGCCCTCGCAAATTAAAGTCTATGGCCTCCCAGTACGTCCATCTTTTGTCAAACCTATTCGGCCAGAGGTAAACAATTTATTCAACTATCAGCACCTTACTGCCTTTTGGATCTTTTGTCATCTGCACAAGTTCCTGAGTTTTCTACATGTTCTTATCTTCTTTGATAGGATGAACTGCGAAGGGAGTTAGGTATGGATGAATATTTGCCTGCTGTTCTACTAATGGGTGGGGGGGAAGGGATGGGTCCTATTGAAGCCACTGCTAGAGCACTTGGTGATGCTCTATATGACGAAGTCCTTGGTGAACCCACTGGTCAAATACTTGTGATTTGTGGCCGTAATAAGAAGCTGACTAGCCGATTGCAGTCAATCAATTGGAAAGTTCCAGTTCAGGTGCATTCTTAAAGCTGATCCAGATTTGTATCTTCCAAGCATTTGGAAATTGCAACAACTCTGGCTTACCAGTTTTTGATATTGCTCTTTCCTGCGCAAGGATATGTTTTCTTCAACCTTTGCAAAACCCAAAGTATACAGCACATGTCTTCATCTGTTAAGTGCAGAAAGAACTTAAACCAAACTACCATATTGATTGTAGAATTCGATTTATGGTGGATTCAGGATACATCGAGTGAGTCATAAGCGTAGACTGTAGCATAGGCTTTCTTCATCTGTTGCGCAGAATCTTTTACTAAAGGAATTATTTGCTGGCTGCACCAAAGTTATACACTCCAGTGCTTAAGTCTTCTTTTGTTTTTGAAATCTTAGGTTAAGGGTTTCGTTACAAAGATGGAAGAATGCATGGGTGCTTGTGACTGTATAATTACAAAGGTATGCTGTACATTAGCTTCACCTTTTCAGATCATGTTCTTCGCTATCTGATATATATTACACAATTAGTGATGAACTTATGATACATGATTTATGGTGATCTTCAGGCGGGGCCTGGTACAATTGCAGAGGCCATGATTCGTGGCCTGCCCATTATACTAAATGGATATATTGCTGGTCAGGTAATTCTCCAGTCAGTCAATGTAGTGATTGCTTGATTTCATCATTTTCGCTGAGAAATGACACTGATTTATATGTTGTTGGGTAGTTGGCACATCGTTTCACCCCTCACTATAAGCTTTCATAATATTACAGCATTAATGCACCCATTTATCCTTTTTCTGAATCTAGATTGAATATGTTTGAGTAGTGGTAAATAAAGATCGCAACAATATCTGTAGAATACAATCATAGATCGAATACCACCCAGCTCAAGCCAAGTTCCAAACTATGCTCAACATTTATTTTGATGGATTCTTAGTTTACCGAAGTTGGCTTTTATACCCACATGCCATTCTTATACACACCTGGCATCTTTGGTTTACACCATCCATTTTTGCTCTATCATCAGGGTTCATGCAGCTATTCTCGCCATATTTATTCCAAAAGTTATCCTGATAATATGTCTTTATGTTAAATTAAAGATGGCATTAGATCCCATCAATTCCTTAAAAGTTTTTTTTTTCCATGGACGAGGTGTATTATATCTATAAGTATCGATGTGGTGTACAACATGATTTGTTTATCTTTCTAAAATATTTTATTCACACGACAGGAAGCTGGCAATGTTCCATATGTTGTTGATAATGGATGTGGGAAGTTCTCAAAATCTCCAGAACAAATTGCAAAGATTGTAGCCGATTGGTTTGGCCCTAGGTCAGACGAGCTCAAAATGATGTCTCAAAATGCCTTGAAACTAGCGCGACCGGATGCAGTGTTTAAAATTGTCCACGATCTGCATGAGTTAGTCAGGCAAAAATGTTTTGTACCCCAATATGCGTGTGCATCATAA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA029739