BGIOSGA030162
| Gene Name |
BGIOSGA030162 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030162, complete gene. |
| LocusTag |
RPA |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA030162-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA030162-PA |
| Length |
4922 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:3406901..3411822 |
| Sequence Coding Region |
3411430..3411822,3410822..3411068),complement(3410228..3410340,3409979..3410058),complement(3409677..3409818 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:3406901..3411822 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:3406901..3411822 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTTCGATGGATGAGCCTCTTTATCCCATCGCTATACTGATAGATGAGCTCAAAAACGAAGATATTCAATTGCGTCTGAACTCCATTAGGAGGCTCTCCACAATTGCACGAGCACTTGGAGAAGAAAGAACCCGGAAGGAGTTAATTCCTTTTCTCAGTGAAAATAATGACGATGAAGATGAGGTGCTTCTTGCTATGGCTGAAGAATTGGGCGTGTTCATTCCTTACGTTGGGGGTGTAGAACATGCTCATGTTTTGCTACCACCATTGGAGACATTGTGTACAGTGGAGGAAACCTGTGTCCGAGACAAGGCAGTTGAATCTCTGTGCCGTATTGGAGCACAGATGAAGGAAAGTGACATTGTAGACTGGTTCGTTCCAGTAGTAAAGAGGCTAGCAGCTGGTGAGTGGTTTACAGCTCGAGTATCGTCTTGTGGACTTTTCCATATAGCATATCCAAGTGCTCCTGATCAATTGAAGGCAGAATTGAGGACCATTTATGGTCAGCTATGCCAAGATGACATGCCTATGGTCCGAAGGGCAGCTGCATCAAATCTCGGAAAGTTTGCAGCCACAGTTGAACAGAACTATCTAAAGACAGAAGTCATGTCGATATTTGATGATCTAACCCAAGATGATCAAGATTCCGTACGCTTGTTGGCAGTTGAAGGCTGTGCTGCTCTTGGGAAATTGTTGGAACCACAAGATTGTGTAGCACATATCCTTCCAGTTATTGTCAATTTCTCCCAGGACAAATCATGGCGAGTTCGTTATATGGTTGCCAATCAATTGTATGAGCTCTGCGAGGCAGTTGGTCCTGAACATTCTAGGGAGCAGTTGGTGCCGGCATATGTTCGTCTCCTTCGTGACAATGAGGCTGAAGTGCGGATAGCGGCTGCAGGGAAAGTTACTAAGTTCTGTAGGATTTTAAGTCCTCAGCTTGCAATTCAGCATATTCTTCCTTGTGTCAAGGAATTGTCATCAGATTCATCTCAGCATGTTCGTTCAGCTTTGGCTTCAGTTATTATGGGAATGGCCCCGGTCTTGGGAAAGGAGGCTACAATCGAACAACTTCTTCCTATTTTCCTTTCTTTGCTCAAGGATGAATTTCCTGATGTTCGGCTCAATATAATCAGCAAGCTCGATCAAGTTAATCAGGTTATTGGAATTGATTTGCTGTCACAATCACTGTTACCGGCGATCGTAGAACTTGCAGAGGATAGGCACTGGAGGGTTCGGCTTGCAATAATTGAGTACATTCCTTTATTGGCTAGTCAATTAGGCGTTGGATTTTTCGATGACAAGCTGGGGGCACTTTGCATGCAATGGTTGGAAGATAAGGTCTTCTCAATCAGAGATGCTGCTGCAAACAACTTGAAGCGCCTAGCTGAGGAGTTTGGTCCAGAATGGGCGATGCAGCATATAATCCCTCAGGTGCTGGAGAAGATAAACAACCCGCATTATCTCTACCGCATGACCATCCTGCAAGCTATTTCATTGCTGGCCCCTGTCATGGGTGCCGAAATCACTTGTCAACAGCTGCTCCCTGTTGTGATTAATTCCTCAAAGGACAGAGTGCCAAACATCAAATTCAATGTTGCGAAGGTTCTGCAGGCACTTATACCGATCCTTGATCAATCTGTTGTGGAGAAGAACGTGAAACCATGCCTCGTTGAACTCAGTGAGGACCCTGATGTGGATGTAAGATACTATGCAAACCAGGCCCTTCAGGCATGCGATCAAATCATGATGTCAAGCTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASMDEPLYPIAILIDELKNEDIQLRLNSIRRLSTIARALGEERTRKELIPFLSENNDDEDEVLLAMAEELGVFIPYVGGVEHAHVLLPPLETLCTVEETCVRDKAVESLCRIGAQMKESDIVDWFVPVVKRLAAGEWFTARVSSCGLFHIAYPSAPDQLKAELRTIYGQLCQDDMPMVRRAAASNLGKFAATVEQNYLKTEVMSIFDDLTQDDQDSVRLLAVEGCAALGKLLEPQDCVAHILPVIVNFSQDKSWRVRYMVANQLYELCEAVGPEHSREQLVPAYVRLLRDNEAEVRIAAAGKVTKFCRILSPQLAIQHILPCVKELSSDSSQHVRSALASVIMGMAPVLGKEATIEQLLPIFLSLLKDEFPDVRLNIISKLDQVNQVIGIDLLSQSLLPAIVELAEDRHWRVRLAIIEYIPLLASQLGVGFFDDKLGALCMQWLEDKVFSIRDAAANNLKRLAEEFGPEWAMQHIIPQVLEKINNPHYLYRMTILQAISLLAPVMGAEITCQQLLPVVINSSKDRVPNIKFNVAKVLQALIPILDQSVVEKNVKPCLVELSEDPDVDVRYYANQALQACDQIMMSS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..393#755..1001#1483..1595#1765..1844#2005..2146#2233..2313#2456..2560#2942..3124#3627..3719#4419..4558#4639..4705#4803..4922#ATGGCTTCGATGGATGAGCCTCTTTATCCCATCGCTATACTGATAGATGAGCTCAAAAACGAAGATATTCAATTGCGTCTGAACTCCATTAGGAGGCTCTCCACAATTGCACGAGCACTTGGAGAAGAAAGAACCCGGAAGGAGTTAATTCCTTTTCTCAGTGAAAATAATGACGATGAAGATGAGGTGCTTCTTGCTATGGCTGAAGAATTGGGCGTGTTCATTCCTTACGTTGGGGGTGTAGAACATGCTCATGTTTTGCTACCACCATTGGAGACATTGTGTACAGTGGAGGAAACCTGTGTCCGAGACAAGGCAGTTGAATCTCTGTGCCGTATTGGAGCACAGATGAAGGAAAGTGACATTGTAGACTGGTTCGTTCCAGTAGTAAAGGTAAGAAGCTTATTAATATTTAATTGTTTTTTTTCTGTAGAGTTGCCAGATTTATCAGTTCGCTGCCAACTTCACTATGTTGGTTTCTTGTTACTTTGGCATACAATTGTGTGATATTTGTGTTTGTTTCTTGCCTGTCAATTGCAATTTTGTTATATATTGTTGATTGTTCTCCATAGAAGCTATTTTAACACATTGCAATTGTTGACTGGAAACAGTGCCACAATGGCATTAGTTATCATGCTTTCATTTTCCTTTTCCTTAGTCCATTCCATCTAGCACCACTAATGAATTCTTTATGGACAGACTATTTTACACTACATCGTGTTGTATTCAGCTAACCATGCATTACTCTTTTCAGAGGCTAGCAGCTGGTGAGTGGTTTACAGCTCGAGTATCGTCTTGTGGACTTTTCCATATAGCATATCCAAGTGCTCCTGATCAATTGAAGGCAGAATTGAGGACCATTTATGGTCAGCTATGCCAAGATGACATGCCTATGGTCCGAAGGGCAGCTGCATCAAATCTCGGAAAGTTTGCAGCCACAGTTGAACAGAACTATCTAAAGACAGAAGTCATGTCGATATTTGATGATCTAACCCAAGATGGTACCATGCACCTCTCACATAATATTTTGTGCTATTTCATACTTCTTTACATTCATGACATAATAGTCTTTAATAATCCTATTAGTAACTAATAAAAAACTGTACCCATTTACTGCATTGCTGATTCTAATTCTGTTGAATTTACCACTCCCAGTTCATTTGCTGCTTCAGTTTTGTACCAAGAACTAGCATAAAGAGCTATTTGTATGCATCCATTATTCAATTTGTACAATTGTTTATGCTAGTCCAATGTTAGTCCATTAGTGCCTGAAGATAACAAATATCAACACAAACTCTCAGAAATCATAGTACTAGCCTTTCAATGGAATTCTGTCATGGAGCAAATAGTGCATGATTGAGCCAGTTGGGACAATTCAGTCATGGAGCAAATAGTGCATGATTGAGCCAGTTGGATATTTACTATACATGTTCTGCAGCCTAAATAATGCATCTAACAATATTGCTGGCCTTTTATTACCAGATCAAGATTCCGTACGCTTGTTGGCAGTTGAAGGCTGTGCTGCTCTTGGGAAATTGTTGGAACCACAAGATTGTGTAGCACATATCCTTCCAGTTATTGTCAATTTCTCCCAGGTAAATTACACCCCTACTTGGTACCTCAGTGTCATCTACTTGATATCACATATAATATTTATTTGCAGACATTCATTAGTTGCTAGAGGTTCCTGATGCTCCGAGTTGCTTCTGTTGTATGTGTTACCATAATTATGACTTCTTTTACTCTCTGTAACTCATTAAATAGGACAAATCATGGCGAGTTCGTTATATGGTTGCCAATCAATTGTATGAGCTCTGCGAGGCAGTTGGTCCTGAACATTCTAGGTATTATGCGCCTTATGTCCTAAATCTTTTCTGTCAAAACCAATCATAAATACTTTGGTCCTTAAATGGTGCAAGTTATTATTTATTTCTTATCTAAATACATAATTTTGTAATCTGATTCCAATATTCATCTATGGTATGTTCATGTGTTTGGTAATAGGGAGCAGTTGGTGCCGGCATATGTTCGTCTCCTTCGTGACAATGAGGCTGAAGTGCGGATAGCGGCTGCAGGGAAAGTTACTAAGTTCTGTAGGATTTTAAGTCCTCAGCTTGCAATTCAGCATATTCTTCCTTGTGTCAAGGTGGGCCAACGCTTAACCAAATATTATTAACTGGTTTTCTGCTGCTGTTTATTCCCAGCAAACTAACTTGCCAACTGCATCTGCAGGAATTGTCATCAGATTCATCTCAGCATGTTCGTTCAGCTTTGGCTTCAGTTATTATGGGAATGGCCCCGGTCTTGGGAAAGGTCACAAGCAAAATATCTTCATAAAATTTTACTTGAAATAATTCAAATTATTTGTTTGCAACAGCTTTACTGTTCAGTTGTTTACTACCATTGCTTCACGATTGTTGGAAACCTGACTTGCTTTGTTTCTGGCATTCTGTAGGAGGCTACAATCGAACAACTTCTTCCTATTTTCCTTTCTTTGCTCAAGGATGAATTTCCTGATGTTCGGCTCAATATAATCAGCAAGCTCGATCAAGTTAATCAGGTGATGTTCATGTTTTTTTCTTATTGAAATGAATTTATCTTATCTTTTGTGATGTTCATGCTGTTTTTATTAGCGTGAAGTCTAATTTACTCCACCTCAACAATTATTTTAGTCTAGAAATCAACCCTCAACTATGACACCAGACATTTTATACACACTTCGACTATCAAAACTGGCTAGAATACCCCTCAAGGGCAAACCTGGTTATTTTTTTAAAGGATTCTCACTCGCTACCAGCCTAACCTTGAGGTATCGACTACCTGCAGTGTTTAGAAAACATCAGTCCCACAGCTCAATATAACATTTCAATTTTGCTTCCCTAATGACTGATTAATTCCTTGGTCATAGAAAATTCATTACTGAGTCCTTTTGATCTTTCAGGTTATTGGAATTGATTTGCTGTCACAATCACTGTTACCGGCGATCGTAGAACTTGCAGAGGATAGGCACTGGAGGGTTCGGCTTGCAATAATTGAGTACATTCCTTTATTGGCTAGTCAATTAGGCGTTGGATTTTTCGATGACAAGCTGGGGGCACTTTGCATGCAATGGTTGGAAGATAAGGTATTTACCAGGCTGTCATTCTAAGTCTCTCGATCATCTATATATTGTGCACAAAGGCACTCTAATATTATCAACATATGTGAGTGTAGCAACTGTTTTTTGCAAGCAAATGACCTGACTTCACTTCTATTGTGGCACCAGCAGTCCAGCACAATACAGCCTGAAAGACTAACATTCAGACATGTCCAATATTTTTTTTCAAACTATTAACAGAAAATTCGGGCACACTGATATTTTTCGCTACTAACGAAAAATGCTGTGACAATTATGGTAGTTGCAAACGTCAGTAGGCACACATTTGAATATCTCCGACATTTATGACTTACTAAAATAGGTTTGTCATTGTTCTGAAAGACAAGTTTTGTTATTGTTCATTTAGTTCATAGAAACTATATCATGCTTTTGTGTTCAGTGATTATATAGTTTTTTTTTAATGCAGAATGGACAAGTGGTATTTATAACCTGCTATTTAAGATGTTTTTAACTGGATCTTTAATTTTAGGTCTTCTCAATCAGAGATGCTGCTGCAAACAACTTGAAGCGCCTAGCTGAGGAGTTTGGTCCAGAATGGGCGATGCAGCATATAATCCCTCAGGTTATTTATAAAATATTTGAACCCTAGACAGTATTTGCATTTGTGAAATCCTTAAGCAAGCTGCATGACTTTTTTGTAATGTCGCTCTACTGGAAGTCTGGAACTCAACTGTATTATTATCATTTTTTTGTATTGTTATCTTATGTTTATTGCATGTGAACTAGAAAAGCATGTCTAAATTTTATAGAGCTTCACATTGAAGCTTATCTAGTGTTGCAATGCCACTGATAGCATAATCTCAAGTTAACCCCTCTGGTTTTTATATAATGTCTGAACCAAAGTGTATTTGCATCTATGAAATCCTTATCGCAACAAGCAAGCCACCTGATTCTTTTTTTTTAATGTAGCCTAGTGGAAGCCAGTTTGTCATTGTTATTTCATGGAAGGTAGAAAATCATGTCTAAATATTTAGAGGTCAACTATGAAACTAATCTACTGTGGGCGTGTTGACTGATGATAAATCTAATGCAATGGTGCTGATAACATATTGTCAAGTTAATGTGGTTTGTTAATTTAAGGTTAACTTGTTGGTTCAGAAAGTACAGGATAATCTGTTCAAACAAAGCTTGTTATTCCAAAGTTTACTTTTGCTTGAGTCTAGTTCTGTCCAAATTAATACAGTGAAGTACTGCATATATATGCTTGTTGTAATAGCTTGTAATTTCTAGTCTTGTTAACTTAACATGTTTCATTTTCTAGGTGCTGGAGAAGATAAACAACCCGCATTATCTCTACCGCATGACCATCCTGCAAGCTATTTCATTGCTGGCCCCTGTCATGGGTGCCGAAATCACTTGTCAACAGCTGCTCCCTGTTGTGATTAATTCCTCAAAGGACAGGTGAAAAATTTGTAATTTGTAAATGTATAGTTTACCCATCTGATCAAGGCCTTATTAACAAATATTTTTCTAAATTTCAGAGTGCCAAACATCAAATTCAATGTTGCGAAGGTTCTGCAGGCACTTATACCGATCCTTGATCAATCTGTGAGTTGCAGTATTTTTTTTGCCTTGATTCCTTTCTTCGTAATGCTATAGGACATTTACAGGTTATTGGGGTATATTATGAATACTTACTTTGTAGGTTGTGGAGAAGAACGTGAAACCATGCCTCGTTGAACTCAGTGAGGACCCTGATGTGGATGTAAGATACTATGCAAACCAGGCCCTTCAGGCATGCGATCAAATCATGATGTCAAGCTAA</dnaseqindica> 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| External Link(s) |
