BGIOSGA030166

From RiceWiki
Revision as of 09:37, 25 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA030166| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030166, complete gene.| tag = OS09G02...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA030166

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030166, complete gene.

LocusTag

OS09G0248900

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA030166-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA030166-PA

Length

7975

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:3361123..3369097

Sequence Coding Region

3369064..3369097,3366834..3366949),complement(3366546..3366664,3366369..3366432),complement(3366220..3366287
,3365159..3365217),complement(3364914..3365073,3364779..3364798),complement(3364564..3364610
,3361530..3361610),complement(3361351..3361440,3361123..3361251

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:3361123..3369097 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:3361123..3369097 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCTTCTGACTTCAAGGCAATCCCCTTGATCGACATTAGCCCACTTGTTGAAAAGATCGATGATCCAAATATGGCCAATGACAAGGATTTGCTGCAAGTTGTCCGATTGTTGGACGATGCATGTAGGGAGGCTGGATTCTTTTATGTGAAAGGCCATGGGATTGCTGAGTCGCTAATGAAGGAAGTTAGGGACGTCACACACAAGTTCTTCCAACTTCCTTATGAAGAAAAACTAAAGATTAAAATGACACCTCAGAATGGATATAGAGGATACCAAAGACTGGGCGAAAATATTACCAACGGTAAACCTGACATGCAGGAAGCAATTGATTATTATGCGCCTATTGAACCTGGTAAATATGGAGATCTTGCCAAACCAATGGAAGGAACTAATTTGTGGCCAAAATATCCATCAAATTTTGATGCACTACTAAAAAACTATATCAGCCTTCTAAGAGATCTTTCCAGAAAGATCATGCAAGGTATAGCCTTGGCATTGGGTGGGCCAGTTGATGCTTTTGAAGGTAGAACCGCAGGAGATCCTTTTTGGGTTTGCAGGTTGATTGGTTATCCTGTATCAACCGATATTGTAGAAGAGCATCGCACTGACATTGGCTGTGGAGCTCACACAGACTATGGCCTTCTGACATTGGTTAACCAAGATGATGACATATGTGCCCTTGAGGTCAAAAACCAATCAGGTGAGTGGATTTATGCCAAACCAATCCCGGGAACCTTCGTCTGCAACATTGGTGACATGCTGAAGGTTTGGTCAAATGGAATATATCAACCAACACTTCATCGAGTTGTTAACAATTCCCCTCGTTACCGTGTATCTGTTGCCTTTTTCTATGAGTCAAACTTCGATGCTGCCATAGAGCCTGTTGAGTTCTGCCGGGAGAGAACAGGTGGTGTCGCCAAGTATGAAAAGGTTGTATACGGGGAGCATTTAATTAAAAAAGTCTTGAATAATTTCATCAAATAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MASDFKAIPLIDISPLVEKIDDPNMANDKDLLQVVRLLDDACREAGFFYVKGHGIAESLMKEVRDVTHKFFQLPYEEKLKIKMTPQNGYRGYQRLGENITNGKPDMQEAIDYYAPIEPGKYGDLAKPMEGTNLWPKYPSNFDALLKNYISLLRDLSRKIMQGIALALGGPVDAFEGRTAGDPFWVCRLIGYPVSTDIVEEHRTDIGCGAHTDYGLLTLVNQDDDICALEVKNQSGEWIYAKPIPGTFVCNIGDMLKVWSNGIYQPTLHRVVNNSPRYRVSVAFFYESNFDAAIEPVEFCRERTGGVAKYEKVVYGEHLIKKVLNNFIK</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..34#2149..2264#2434..2552#2666..2729#2811..2878#3881..3939#4025..4184#4300..4319#4488..4534#7488..7568#7658..7747#7847..7975#ATGGCTTCTGACTTCAAGGCAATCCCCTTGATCGGTAAGCTATGTCTGTCTTTTCCAGGTTTTTTTTTCTTTTGAGCTAAAGAGAGAATTTATATTAATGACTGATGACTGACTAGGGGGTTACACTCCTGACTTGACAAGTCAACGATCCTTATTGCCAGTTAAGCAAGCCTATTTTTTACTATGGCCGTGTTTAGTTCCAAAGTTTTTCTTCAAACTTCCAACTTTTTCATCACATCAAAACTTTCCTATACACGTAAACTTCCAACTTTTCCATCACATCGTCCAATTTCAACTAAACTTTTAATTTTAGTGTGTACTAAATACAGCCTATGTCTTTTTCTTGTGCACCTGCACACTCTGCAAGCACTACACTCTGCAAGTACTTTAGAAATCAGCATTATCCATGAGGATCCTTATGGACTCCTTATCAAGTTAAAACAACCACTAAAACTAGCACAGTTTTTATGGCACTTTTAATGTTGCCTATAATACTTTGCTATATAGACATTTTTAGGCATATTTTGTTAAATCTATCTTGTAGAGGTATACTTTTGGTACTTCAAAATTTTTCTCATATGTAAAGTCATTTTCTCAAGACATCTAAACCTCGGTTGAGTCACTTTCTAAATATTAATATGTGCATATATAGAATTAACACAACACATACATTTACAAGTAATGATATAAGGTTCAGATAATTAGTGCATTGAAGATAAAAATAATATACTCACGAGTTTAAGGATTGGTAATACTTCCTCCGTTTCACAATGTAAGTCATTCTAGCATTTTCCACATTCATATTGTTGTTAATGAATCTAAATAGATATATATATATATCTAGATTCATTAACATCAATATGAATGTGAGAAATGCTAGAATGACTTACATTGTGAAACGGAGGGAGTAGCAAGGAAATATATTTTTTTCTATTTTCACATTGCTTTGCTATAGGTATGGCAAAATTTAATGCCTGTACAGACATTAAAAAAATACATATTCTTTTCTAAAGATAATTTATCAAAATACATTTATTAGACATATTTTTAAAAGGTCTCTGCTGCATTGTAAAGGCATGTTTGCCTCTATATAGTACTAGAAAAATATCTCCACAAACGCAGGCTGTGTTTCTAAAAAAAAACTCCACAAAATATTTTTTTTGTAGTGGTTGTTTCTAAGATAATCAGCATGCGCACCAATTTAATCGTCACTGGCGTATATCTAAACAACTTGCTTCAACCTACCCTGCATAACTGCACTGATACCGTTTTGTATGCACTGATAATTCTTTGATTATCATTCCTGTACTTGCTTCACATGTTTCTTTTCTGAATCCAATATCAACATTAACCTTTGCGTAGCCTTCTGTCGGGGCTTGCCATTTATTATTTGCATAGCAACATTATATTCTTCAAATTTCACTATCTTTGTCCACATACAGAGGCCCCATACTGTTAACATCATCAGTCCATTGTCGGACAGGCAATATGTTACCTTCAAATTGACTGAATCTGAAATTGTGGCCCTTCCATACTATAGTAGAATTCTTGCTTCACTGCAAGATTCAGATTATGAAATCCTGGTCTGGTTATGCTTCACCGCAATAATTCTTTTGCCTACTTTGTGACCACCATTTTCAGTTACTTCAATTAAGGCGTGTTCGGTTAGTTCCTCCACAAGAGGATTGAAGAGGAATCGGAGACGATTTATTTCACACCTTTTGAGGGGATTTATTTCTCGATGGGGAATTCCATGTTGTCATCTCTAATTAAGCTCACAGTAGCAGTGGCACAATGCAAAAGATTAGTACCACCATCGCCAGCTTGTTTGCTGTTTAAAAGGATGAAAAGCCCAATTACAGTACAAAGTATTGCAGTCTTAACAACTTGATTTGCATCTGAACCCTTTTTAAACCTTGAACATTACAATTAAGGCTGAAAAAGAACTCGAGTCTCACATGCTACTCGTGCTCCAGACGATCAAGCCGAGCTCGGGCTGCCTATGCCAAAGCTCGTGAGCTTTGTCAAGCCTCCTAATCGTTACATGTTACAGCTCTCAGTAACTAAAACATGCTGGAGCTGATATATCTTATATATTGATACATTGAAATCTTCATCTGAAAATTTCACCCTTTTTTTCATTCTCAGACATTAGCCCACTTGTTGAAAAGATCGATGATCCAAATATGGCCAATGACAAGGATTTGCTGCAAGTTGTCCGATTGTTGGACGATGCATGTAGGGAGGCTGGATTCTTTTATGTGGTAATTACACGTTTACTTACCTTTTTAGCATCACTTTATAGTACAATGGGTACAGATCAACAAGAATATTTTGATGTAGCTGTGTCCTTGCGTTGCAAGCTATGATTTTTATATCACTACCGAAGCTAAGTAATGCAAATGTTCATCTGTATGTTATTATTATTAACAGAAAGGCCATGGGATTGCTGAGTCGCTAATGAAGGAAGTTAGGGACGTCACACACAAGTTCTTCCAACTTCCTTATGAAGAAAAACTAAAGATTAAAATGACACCTCAGAATGGATATAGGTGTGATTTCTTATAGTACCATTTTAAGTTCCAACATTGATTTTTCCGTGCTCCGTTTTGGGTCGTTCAAAGCGTCCTTTCTCTATGAGTAACTTTGTTCTCTTGATCATCAGAGGATACCAAAGACTGGGCGAAAATATTACCAACGGTAAACCTGACATGCAGGAAGCAATTGATGTAAGTTTATTTTTCTTTCTTTATTTTTAGTGACCCATTAACTTGTTACTAGTTAATCGCTGAGAAGAAAAAACATCACAGTATTATGCGCCTATTGAACCTGGTAAATATGGAGATCTTGCCAAACCAATGGAAGGAACTAATTTGTGGTATGTTTCCAACCTTTCATCTTTGTTTGTTTTCATTTTATACCTTGGCGCTATATTATTTGGAGCCCTTTATGGAGGTAAGAGGTACTGTTATTTAGGTTATGTTGTGTTATAAAATATATATTTGCTTATCTTTAGTAATAAAATGACAGTAAAGAGGAAAACATTAATGACAATATATAGAAATTATTATTGCCATACATCCACTAGAAGAAACAAAATTAATTCAGGCAACCATGAAAAGTGTCTATAATAGAAATTTTACTTGAAATATACTAGCACCATTGTTTTCAAAACTCAAAAGAAAATCTTAAAATTTGAAGTGGTTCATATGTTTAAAGAATTACTTAAAATTACATAACAAATGATTGAAAGTTTGAAAGTGAATAGTGTCTAGTGACAATTATTATCAAAACGGGTGGAGTAGCAAGTGAAAAATACTTTTTTCTTCATACTTCAAGATCTATTACCTCTAAATGAGGAAAGAGAAATATCAATATGAAATGAATGGCCTAAAATAATCCGGGAGTACTATAACAAAAGCTCATGTTATTTAACATATGTGAGAGATATTGCTTGCTTGACTTTCATATAAAATGGTACCACAATTCTACTTATTGATCACTTACTATGCATTGATAATAATTATGATAATATAATTAATTTAGCTTATAGCACACCTCTATTTGGAAGAATGAAGGAAATGAATTTCTAATTTACAATATATTAATAATAACAATATGTATCATGTTATGCAATATGGCTACAATTGTGAATTATTTGTTGTTGCATATGTTGCTTCAATATAATGTATTGTTGTTACTAGAAGCATTTTGAATAGTTGAATTATAGCATTCCATGTTATATATTTTGATACTGCTAGTTGAATTACTTTGCTATTACTGAAGAGTTGTTTTGAACTTAATTTGGTACCCTTCCCTTGAGTACTTTTGGTTAGAAATATTTCAAATTCAATTAACCATATCATTTACTTTGATGCAGGCCAAAATATCCATCAAATTTTGATGCACTACTAAAAAACTATATCAGCCTTCTAAGAGGTTCACTTTTGAACTTAGTTTAGATCTTAGCTATGCATCTATGTTATTTATCCATTTTTTTGTCTGATGGAAATTTTACTTATAGATCTTTCCAGAAAGATCATGCAAGGTATAGCCTTGGCATTGGGTGGGCCAGTTGATGCTTTTGAAGGTAGAACCGCAGGAGATCCTTTTTGGGTTTGCAGGTTGATTGGTTATCCTGTATCAACCGATATTGTAGAAGAGCATCGCACTGACATTGGCTGGTAAGCAAAATGTATCTATGTATTTATTTGGTAGTATATTGTGCTAGAATGTACTTACTAGATTCATCTGACACCGTTTTTCTCTTATGTCACATCCGTTCTGCGATCAATTCAGTGGAGCTCACACAGACTATGGTTAGTACTTAGTACATATCTTTCAGAAGTTCCTTTCGAAATAGACTTTTATATATGGACAACACATACATAAGGTGCTTTGATGCATTGTAAAAAGTTTCACGTGTTTTCTGTATTTCTGTTTATCAAACTCATGAAGATCATCTTTGTCATTTGATTATATTACAGGCCTTCTGACATTGGTTAACCAAGATGATGACATATGTGCCCTTGAGGTACTTGTTTCTTCACCATCCATATATCTTATAGGAATACATGCTTTCTTTGTGTTTGAATATTACTCAAGTTCCACTTTTTACCCTGGACTTAAAACTAATCGTTTTTACTAGAAACCTAGACTAATATCATCCTTGACCCTGTTTAGATATTGTTTCTATCAAAAAATTGGTGGTTTTACTTTATGTAGACTCTTATTTTGCACATTATATCTAATACTATATAACTATATAGTTGATCCTCACTAAGTGTAGTTAATGCTATATATTTTCTATCATGTAGTTAATGCTATATATCTTCTCTCATTAAACCACATTACCTCAATTGTTTTTAACCACTTGACCATTAACCTATGGTACTATGACTATATGGTTTATCCCCACTAAATCTAGTTAATGATGTTTCTCTTCTCTCTCATTAAGTCACATTACCTTAATTGTTTTTAGCCATTGGATTAATCTATGGTCCAAATTGTCTCCTTTCTTTTTCTTCACTCATGATGCTTCACCTTAGGTTTTGCCTTAACTCATTGAATGATCAGTATATATTCAATCTAAATTATCATAACGCACAGCATCTCAATTGTTTATAGCTCTTTTCAGAGATTGATTAGAGATGAAGTTATACAAAGTATATAAACTTATACATTTTGCTACAAAATAAATTAAACCTATACTTTATTTCTATCATTATAGCATAATATTTCCATAGCAAAGCACGGGATTTCATCTAGTTGGCATAATGGTTGTGTACATCGATGTGGATTTTAGGGACTGGATTTTTATCCTTTATCTTAAAAATGTTGGGGAAAGTCATCTTATAGGGGACCAGGCATTGATAGGATCAGAAATAGTATTTGTGTGGATCTGGAAAATGTGTAGTAAAAAACAATTATTTTACGGAGCAAGGAGAAAATGGGACTACAAGAAAATTAATGGGCCACCCAAAATGGACTTTATCCTATCTTATACTTACTCATCCATGTCGTGCTCTCTGTTTTATGTGTCCCTCAAATTTGTTGAACTAATCTTTTTAGTCTCCCTATTCCTTGTGATATTTGTTGTACACAATTAACATTTCAACTAAACATGTTCTTCTATCCCATTGTGCAATTCACGAATGAGATCTTGGAAGCCACTTAATCTTGCACCGGAATTTGATCTCATAGTAGTAACCAAGGTCTAGTTTCATGGCCGCAAACCAGAAACCATAAATTCGGATCCATGCCATACTTTATATCCCGATCTTCACTAGGAGTTTGTTTACTCGATGATTCTCATCTTTGAACCATTGTGTTTTTCTCTATTCTAATAAGGAAAAAGTATGAATTACCTCCCCTCAACTATTGCGGTCGGCCGAATTATACCCCCAAATTAAAATATCAGACATTATAAACCCTCAACTATTCATACAGGACAAATAACCCTCCTCAACACTGTTTTGAGCGGTTTTGACTTAAGCTTGCACATATGGTGCCAACGTGGCAATCTAGTCAGCAAAAAAATAAAAAAAAACTCCATGGGGCCCACCTGTCATACCCCTCCCTCAATCCAATCCTTCCCTAGTGGTTCTCTCTCTCGCACACGCGCTCGAGCAGCCGGCTACAGAGCCCATGAAGGAGGAGGCGGACCGGATGGCTGGTGACGGAGGCGGAGCATGCCCGGGTGGCAGGCAACTGAGGCGGAGCTCTTTCAGGTGACTAGCCACAGAGACGGAGATTGCCCACACGGCGGGGGCTTGAGGCGGAGGTCACTCGTGCAGCCGGCCGGAGGCGGTGATTGCCCGCACAGAAGAGGAGACGGAACAGGTGACCGGCGGCAGAGGCGGAGCATGCTCGGGTAGCGAGCGGCTGAGGCAGAGCTCGCCTGTCTGGCAGAGGAGGCGGACCGGGTGGCCGGCGGTGGAGGCGGAGCACGCCCGGTCAACGAGCGATTGAGGCAGAGCTCGTTCTGGAGGTTGGCGGTGGAGGCACAGATCGCCCGGGTGGCGAGCGGCTGAGGCTTAGCTCGCCTGGGCGGCCGGTGCCGGATCGGGTGGCCGGCAGCGAAAGCGGAGCTGGTGCCACGCGTGATAGAGAACTTACGCTCCAGCGAGGATGCCCCCCCGGGGCCCGCCGTTTGCCCAACCCCTCCGCGACCTTCTTCATCCAGATCACCGCCTTCTCCGCCCGGACCACCACCGCCACCGCACTGGGGAGTGAGTCGGAAGAGAAGGAGAGGGGAAAGGGAGGAGCGGCGGTGCCGGCCCTCCTTGCTGCTATTCGCCTCCTGCACAGCTCCATCTCGTGCATCGCCGCCGTGGACGCGGCCACCGACACCCGTCACTCGTACGTCACGTCCGCAGTCGCCTCCTGTCCTCCGATCCCCGCCCCGCCCACCAACAGCAAAGAGAGAGGGGTGAGGTAGGAGTAATTGACAAGTGGGCCCATAGTTTTTTATTACTTTTTTTATGATTGGATTGCCAAATTGGCACCACATAGGATCAAAATCGCTCCAGATTGAGCCAAGGGGGGTAATTTATCCGGTTTCAATACTTTAGGGGTATCAAATGTCCGATTTTGTGGGTTTGGGGGGGGGGGGAGTGGTAATTCGGTCAACCACGATAGTTGAGGGGAGTAATTCATAGTTTTTCCTTCTAATAATAAAGAAGAGGGGAACTAAAACAGATCAAAGATGAGAACTTGATTTTAGTTTCTTTTTAATTATTTTAAAGATCAGTATTTTTTTTCATGGCAGAGCACATCTGAGCTGTGCATGGTTATATAGAATTTCTCACTGGATGATCTAGCATGAGATGCTTCTACACTTCTGTAACATTCTAAGCATGTTCTAAGATGCATAAGTAATTATGTAATTACCATATTACAGTTGCTGCCCACTGTTCATATTTAGCCTTAACTGGGTGAAGCAAACAATTTTGATTTGAGTGAAATATCTGGTGAATATATTTCAGGTCAAAAACCAATCAGGTGAGTGGATTTATGCCAAACCAATCCCGGGAACCTTCGTCTGCAACATTGGTGACATGCTGAAGGTCTTTTTTTTTCTTCGTTTGCACCTTCATTGTCATCTTTTTATTGTCATCAAACTTGTGACACTTATCACATGTCATATTTGGGTTAGGTTTGGTCAAATGGAATATATCAACCAACACTTCATCGAGTTGTTAACAATTCCCCTCGTTACCGTGTATCTGTTGCCTTTTTCTATGAGGTATATTACTTGCTTAATCCCCTAGCTCATCTTAATACTACACATCATTTATGTGAAGTTGCTCTCTCATTGTTCTTTCTTTCTGAATTCATGCCACAGTCAAACTTCGATGCTGCCATAGAGCCTGTTGAGTTCTGCCGGGAGAGAACAGGTGGTGTCGCCAAGTATGAAAAGGTTGTATACGGGGAGCATTTAATTAAAAAAGTCTTGAATAATTTCATCAAATAA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA030166