BGIOSGA030211

From RiceWiki
Revision as of 09:38, 25 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA030211| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030211, complete gene.| tag = P0415D0...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA030211

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030211, complete gene.

LocusTag

P0415D04.50

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA030211-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA030211-PA

Length

7987

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:1498474..1506460

Sequence Coding Region

1506391..1506460,1506116..1506289),complement(1503313..1503438,1502347..1502486),complement(1501701..1501787
,1501441..1501569),complement(1500533..1500685,1499256..1499357),complement(1498874..1499053
,1498713..1498792),complement(1498474..1498519

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:1498474..1506460 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:1498474..1506460 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGGGAAGCAGGAGCAGGAGAAGATGCTCCTCCAGGCCGCCTACGATGACAACCTCCGCCTCCTCAGGAAGATGGCGCGAGGGCTGGACACCGGGCAGGGCGAGGCTGCCGTCGTGGCGGCGGTGGCGGGCAGGGCCGACGGGAACCGCGCTCTCCACCTGGCGGCCGCCCGAGGAAGCATGGATGTCCTCAGGTACCTCGTGGAGGACCTCCACCTCAGCGTCAACCAGTTCAATGCCAAAGGTGAAACACCACTGTGCCTTTCTTCAATTCATGGGAGAGCTGCTGCTACAAGATATCTTCTCGATCACGGTTCTGATCCTACGATTGATAAATCAGTGTTACCTTTTCATGCTGCTGCAACGAAAGGACACTGCGAAATAGTAGAGTTGTTTCTTTCAAGAGGAGTTGATGTGGATTTAGATTCTATCACTGGGACCCCATTGCTGACAGCTGCGATGAATGGCCAATATAGCACGATGAAGATTTTATTGGAGCATCACGCTGATCCTAACAGGGTTGTCAATCATAATGGTACCCCATTGATTATGTCCATAGTTTCTGGATCATTGGAATGCGTGAAGCTATTAATCAAAGTTGGTGCGGATGTGAATTTTAGAGACCCCAATGGTGTTACTTGTGTGATGGTCGCAGCAAATCATGGCTCTCCTGTCATCATGAAGTGCTTACTAGATGCTGGTGCTAATCCAAATATTCCAGATGAATTTAATAGGACTCCAATTGAAGTTGCCGCTAATCGAGGCAGAAGGGACATTGTTAAAATGTTGTTTCCTTTAACTTCACCAATTTCAACACTGCCTGATTGGAGTATCGATGGAGTTATTTCTCATGTGCAAACTTTTGGTTTGAAGCCAAGGGATAATGATCTGTCTAAAAGGAAAAGTGCTGAACTGAAATTACAAGCTAGAGAGGCTTTCGAGAGAGAGGAATATATGCTTGCAGGACAACACTACACTAATGCAATAGAACTTACCACTAATGCCCATGATAAGGCAACCCTGCTAGCAAACAGGAGCCTGTGCTGGTTGCGTTTGTCAACCGGCAATGGGGCTCTTGCTGATGCTAACATGTGCAGAATGTTGCGGCCCAGTTGGCCCAAAGCATGCTATCGACAAGGGGCAGCTTTCATGTTTCTAAAGGACTATGGAAAAGCTTGTGAAGCTTTTGCAGATGGCTTGAAGTTGGACCCTGCAAATGAAGATATAGCGAAAGCTTTAAGGGATGCCCAGGAGGCCATGAAGGACCAAATGGAGCACAGAGGTTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGKQEQEKMLLQAAYDDNLRLLRKMARGLDTGQGEAAVVAAVAGRADGNRALHLAAARGSMDVLRYLVEDLHLSVNQFNAKGETPLCLSSIHGRAAATRYLLDHGSDPTIDKSVLPFHAAATKGHCEIVELFLSRGVDVDLDSITGTPLLTAAMNGQYSTMKILLEHHADPNRVVNHNGTPLIMSIVSGSLECVKLLIKVGADVNFRDPNGVTCVMVAANHGSPVIMKCLLDAGANPNIPDEFNRTPIEVAANRGRRDIVKMLFPLTSPISTLPDWSIDGVISHVQTFGLKPRDNDLSKRKSAELKLQAREAFEREEYMLAGQHYTNAIELTTNAHDKATLLANRSLCWLRLSTGNGALADANMCRMLRPSWPKACYRQGAAFMFLKDYGKACEAFADGLKLDPANEDIAKALRDAQEAMKDQMEHRG</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..70#172..345#3023..3148#3975..4114#4674..4760#4892..5020#5776..5928#7104..7205#7408..7587#7669..7748#7942..7987#ATGGGGAAGCAGGAGCAGGAGAAGATGCTCCTCCAGGCCGCCTACGATGACAACCTCCGCCTCCTCAGGAGTGAGTATTGTATCGTATATTTCCTAGCCCTTTCTCTCTTAGGGTTTAATTGCTTATTATGCTTTTCCGATCGAAACTCACCGTTCTTTCCGTTGATATAGAGATGGCGCGAGGGCTGGACACCGGGCAGGGCGAGGCTGCCGTCGTGGCGGCGGTGGCGGGCAGGGCCGACGGGAACCGCGCTCTCCACCTGGCGGCCGCCCGAGGAAGCATGGATGTCCTCAGGTACCTCGTGGAGGACCTCCACCTCAGCGTCAACCAGTTCAATGCCAAAGGTCTTGCATTGCCTCTCTTCCGTTCTATTTTTTCAGTTTGATTTATTCTACTAGTTTGTTCACAAAATGGTATAATTAGTTATGGTTTAAGCTTAGTCAACATAACCTAATTTTAGTCCTTGTGCAAGCATTGCATATCTCCTTTTCTGAGTGCATTGAAAACCCACAGTTTGCATTGAAATCACACTCCAAAACTATCGTGAACCCAAGTATCAAATTTGGTAACATCATTTTTTTATTACTCAGAAAGATTCTCGGCCGAATTTTTGGGTTTTTCTCAAATTTCTGTGAATTTGGTCAAAACTTAGTCAAATTCAGTTAAAATTTCAAGTCCGAAAAGTGCCAATAATACCAAAATTTCAGGAATTTTGGTAGAACCGAAATGGCTGAAATCTATATTGGAAGCCCTGGTCCCTACTAAACTATATATATGTCTTGCGAAAGAAAAAATGTCACAACAATTAACAGATTAACCAAAACCGAAACAAATTGCTTGACCCCTCACCCCCACTCAATCCCACAAATCCACAATCATCACAAAGAAAGAGAGACCAAATATATCACCTAATTAAGCAATGCGGAGAGCCTTGTCATCATGTGTGCTGGAGGCTGCCACTTTGTGGACCAGAGGAGTTGTTAGGGTGACTGGGGAGGCCAGGTCTTGCACATACAGTAGTTGGAGAAGTAGTGGTACCATTGCAGAGATGCGTGAGAGGCGAGAGAGTTGACGTGGGTTGGAATTCAACTGAGTTACAGTGTCCGTGATTGTGTAGCAGCAGATAACTGGTTTCATATTTATACACAGTACCTTGTCTCATAATTGGACTTGAATTGTCAATTCCAATTCCTAATGGCATACAACAACCTCTTCAATGGAATTGGAATGTGTTCCTTGGAACTGGAAGTATTCTGAGCAGTAATTGTGCATTCTTATTTCCTTGCATGCCATACTTTTTACGGTAATCATTAATCATGTGGAGTCACTGGTACTAACATTAGAACTACTGAGGCCAGGTGCACCCCATCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTGAAAAGGAGAAGCCTACTTAACCTCATGCAGAAGAAAAACCGGTATCATGCGTCCTGAAATGCTTATAAACTAGTCGGTACCCCGCGCCGTGCCACATGTTTTGTTAGTTTTATCGTCAAACAAAATCAAAATTTTAAATGGTTGGGTGCAACTCTACATATATACAGAATATATGATAATGTGGCTTTATATATATCCTCTGGTATTATGATACAATTCATGCTTTATTTTTCAAAGCATCATTGTGTATTTTTACGATATATGAATATTATTTTCATGCACAATCTAGGTATCATTGCAATTAGATTGTTTGCACATCTCTACTTCTCTCAAAGCATATGAAAATGGGTTCGGGAATGATGCCTAATAATTGTATGCTATCTAATGCATGCATAATAAAACAAAACTCACATCTTAAACAATAATTTGAGTTGTATTCGAAAAAAATAAGTTAGCATTATCTTTCAGGACTTGGGTGGAAAAAACATGGTGTTATGTGCAAAAGTAGGTAACAATGTTATGTGTGCCTTTGAGGTGGAGCAAAGGGAGGTGAATGGACGACTAATAAATGATTGAGTTAGATGGATAATAAGTAGCTTCTTTATCCAATGGCTATTATCTTTGTACTAATGCAATTTGATGGCTTAAAATTGCTGATGATGTGGCTTTTGGCATATCTTGCTTTATAGGAGTAAATGCCCCTTAGTGGGTACCAACTATATAGGAAGATGGCATAGGATGTCAAAATAATCCCTGAGGTGGTTTTGCCACGGTAAACAACATGACTAGTGAGTAGTGAGACTTAGCAGATGAATATAAAATCAGTAATAAAATGCCCCACTTCTTAAAACAATGTTTCATGCCGGTACATAAATTTAACTTTGGAAGCAAAAGATAAACTTGACCCTCGCATGAGTGGATTCACCACATAAAATATTTTTAGGATGCAGACCATCGCTACATTGTTGTCCGCGACTCCACGTCATTTGGTATATTGGCATCTCAGGGGTTTTTTTAGATGGCTTTCAATACCTACTAGGGATACGGTACCAAATTTTATACTTAAAGGCGTAAGGGGTTAATGACCTAGGTTTGAGAAGTGGGATGATGATGAATTCACCACTTGATCCTTGATGACATTATTTGATTTGAGGAATGGAATGGGCCATCACCACCTCAATCTAAAAAGTACATGCTAAGCTATTGGGGAAAATATGTAGTGCAAACCTGGAAACTAACGTAGGATCAAAATATGGACATCTGAGATTTGTCTATCACACTCTGAGGATGACGTGGACAAATCTCAGACGTCCCTTTTTTATCCTACAGTAGTTTCCAGGTTTGCACTGCATAATGTCCCAAGCTATTGGATGAAGAATTAATGGAGTCATTTTCAAATTTTGTGGGATGATCATGTGATCGATAACCCGTCCTAGATGTGTTGGTTAGTCAAACTAAACAGCCTGTAAGTAGATGAGCTCCCATACGTCTAAGTGGTAAAATAGATTTTTTTTTTTGTTTAGACAATACCATTTTACATTATGCACCTTTGTAGTTTGTATTGTTGAAGGCTCGATCCATATGACCATACGGGTTCCCTATGGTCCTTATGCCATATTTTTCTTGGCAGGTGAAACACCACTGTGCCTTTCTTCAATTCATGGGAGAGCTGCTGCTACAAGATATCTTCTCGATCACGGTTCTGATCCTACGATTGATAAATCAGTGTTACCTTTTCATGCTGCTGCAACGAAAGGTCTATCTATCTCTTTCTCACACACCGCGCACACAGAGTCCAACATATATTTTGAACAAAATATTTGATACATATGCAAGTGAATTCTTTCTTCACTTGGATTCACCATTATTTTCTTCTAACATTTCTATCAAAATTTGAACTATTGTTTGAACTCAAAACTTAAAATGGATAAGCACAGACTATTGGCCAGTAGCTAGATGAAACCAGAGAATGTTTTCCCCTCATGTGCAAGGTTGTTTCGGGAGAGGCACTCCTTGTAATAAAATACTGATCACTATATTATAGTCATGACTCTGGATTTCTGTCATTTTGTGGAAAAAATTGCAACAAGTTCTCACAACTAATGGCAAATTGCACATAGAGACTAACTCCTTGCATCAGTCTTTTGTCATTAGTAAGTTTTTTTTTCATAGTTTGTTACTAAAAATTGTTGACAAATATAGAATTCTGACAAAGGCATGAAGTCTTGAACAATGCTTCTCTCTTGGGTGATTGCTTGGCTCTGATTCACATTTTATTGATGATTTGGATGAAAAAGAAACAACTAAAAGTTTCTGGACAACAACTTTTGTTCCTACACTTCATTATTATTGTCCTTTATTATAAGCATATTTGCTGTTAATATGTTGAATTTTGCTCAAGCCAAGCTTTAGATATTAAATTTATGAAAACTTAAATCCAAATTTTATTGTTTTCCAACAGACTGCTGTTGAAGGAAACTCTGTTCCTGTCCAGGAATCACTGTTAACACTGTTTCTAGGGTGTTCCTGATTGAGCTGAACCTTTTGTTCTTATTAATTATTTAGAAATTCTTCTTTTGCAGGACACTGCGAAATAGTAGAGTTGTTTCTTTCAAGAGGAGTTGATGTGGATTTAGATTCTATCACTGGGACCCCATTGCTGACAGCTGCGATGAATGGCCAATATAGCACGATGAAGATTTTATTGGAGCATCACGCTGATGTAAGACATCAAATTTTTTTGTTGCTCCCTCATCTGTGCAAAAGAAATGCCTGACTTGTTAAGCTTTTAAGGATAGTATCACTGATTTCAGACCATGACACATTAGAATTAATAATTGAAATAATTTTCCTCCAGCACCTATGCCCCATCTTTTTTTTAATTGTCAAACACACATCTTTATTACTCAATTGGCTCAGTGGAATCATGAGCCACCAGGCAATTTACTTACTCCGGGAGGGGATCAGTCCAAACAACAGACTGACCCGGGTCCCATCTTACCGCAATTTGAGCTAGTTCATAAGCAGAAGTATTACAATACCGAGGAGCATAGGTGAAATCTACTTTGGCAAATTCGCTGAATAAGCTGTTGGTCTGGAGCAATGCACACAACTAATGTTGGATTATAATTGGTTCTCTCAATGCGCAACATCCTCACTTTCTCAGGAGTGCTATAAATGCAATTTATTTCCTGTATAAGCACACCATGTACTGATATTAATTTTCTTTTTTTCCCTTTTATTTAAACAATTTCAAGATCTTGATTATTCCACTTTCGCAGCCTAACAGGGTTGTCAATCATAATGGTACCCCATTGATTATGTCCATAGTTTCTGGATCATTGGAATGCGTGAAGCTATTAATCAAAGTCAGTTACCTTTTTCTTGATGTTGATATTCATGTTTGTAAATTGTAGTAGGCTAGTAGCACCTTGTTTATTTTCCTTTTCGTTTCTTGGTGGATGACAACTGAGATCAAACAACAATTTCATTTACACAGGTTGGTGCGGATGTGAATTTTAGAGACCCCAATGGTGTTACTTGTGTGATGGTCGCAGCAAATCATGGCTCTCCTGTCATCATGAAGTGCTTACTAGATGCTGGTGCTAATCCAAATATTCCAGATGAAGTGAGTAATATTCTTTCCTCTATAGCCTGTGACTGGATGTTGTTGCATTAGGCTGTAGTGATCTTGAGAGATTAGGATAATCTGCTCACTTATTCTTTTTATCAAGTGCGCACCAATGGATAAGTCTGCATCAGAAGAAGACAAAGACATATGGCTTTAGTGAAGCATACTTCATAGTATGTGACACATGATGGAACCATTGCTTCCATGCTGCTTTATAGGAATGCAATTGTTGAGTGCTCACATTCCACTCCAAAGGGTGGATATAAGTTTTGATTTTCACTACTGTCTGAGCCTGTTTGGCGATGCTTAATACAGGGAATGATGAGAAAATACTAAGGTTTACGGTTTACCAATGTCTGAGTGGAGAAATATTTAGGTCCCCTATAACTGATCGAACAAACTAATGTCCTATTCTGTATAGTTCTTTGGCTGTGTACCCTTTGAACCTTCATCCTATCCTGTTTTGACAAATATCAGTATGATATAAAAAACCTGTTTTTCTGACCCTTGGTTTAACCTTACTATATTATTAAACCTAATGTTTATTTTACAAGCTTGGCTCAGAAAGTTGTACGAGGTTACCTTATTCTTTTTTCCACTTGGACTTTCTGAAGTCCATCCAGACATTGGGTTCAAATTTTCTAACTTGGAATCCTAGCTGTTAATGTTGAAATTGTTAAATTCTTTGCAATATATGTGATATTTGCATTGTTGATGAAGAATTAAATCAACCAGTTCTTTTACTCCTGCAGTTTAATAGGACTCCAATTGAAGTTGCCGCTAATCGAGGCAGAAGGGACATTGTTAAAATGTTGTTTCCTTTAACTTCACCAATTTCAACACTGCCTGATTGGAGTATCGATGGAGTTATTTCTCATGTGCAAACTTTTGGTTTGAAGCCAAGGGTATTTGTTCCTTTACATGCCACCTGTAATTGCATATCATTGTTTATCATCATTCTTAGTTTCCCTTACCAGTTACCACCCATGCTTGCTATTGATAAAGATAATAACCGTATCCAAGTGCATCTAGACTTGATGCTATGGTGGAGCCATATTGTTTCTACTAAGGCTTATTTTACTTTTTGTTTTTACTAAGGATTATTTTACTGGATAACTGGAGCAGAGCAGAGTCTGCTGCTTAAACTTGTCTCCAGTCCACCTATCCATCTTCTCCTTCTCAATATACAAGCACTCAAGAAAATAAAGAAAATATTAGGATCCACATGCCTCCTATATATTTTCTAAAATTTTGATTTGTCTATTAGGACGCCACATGCAGCGCAGTGGATGATTTAGATGACGTATGGTCTGCTAGCTAGCTAGCTAGCAAATCAAGATAACATAGGTGTAAGCGAGATAGAAAAGGAAGTGTTTCTGGTTATTTATTATTGATCAGTAATTCAGTATGGTGATGTCATCACTCTTTGCCCAAGTAGGTTCCGTGTGGATGCCACGTGACTAAAAACCACTTTACTTTAGGTTCATGGACAATGTGTGATTTTGAATGGATAGTCATTGTTGATAGATGAAAATTGGACCGAGGCCATAGCTGAGGGTCCAAATGTTAACTTTCTTTTCCTTTTTTATATTTTCTCATGATATCCTGTCAATTAAACATTATTGGTTATTGGCATATCTGATGAACTGAATAATCATCTATCAGTATGTAGTATTAACTAAAAAGATCCATGGATATGTAGTATTAGGTTATTGATCACTATTTATCATTGAATTCGTGAAGATTGGCATCTAATCAGCAAAATTTATGTTGTTTCGCATCCATATTCTGGTGCGTAAGCTAATCATGCTGATTTGCTGTGCTACTTGATCTTATAGTATTTTTATAGTATTTAAAAGTAATATGGAATGCACTGCACAGATATTTATTAGCTCGTAGTTGAGTCAACTAATTTCAAAAGCGGTAGTACTGGAATATCCAACTGGCTATTTTGACAGGTTATGCAAGATATGTAAATCATTGACAGTGATGTGTTAACCAATCGTTTCAAAGATGCAGCTTCATATCGTTATTAATTCTGCATATTTTTTGTAACTGCAATTCCTTTTTTTTTCCTCAGGATAATGATCTGTCTAAAAGGAAAAGTGCTGAACTGAAATTACAAGCTAGAGAGGCTTTCGAGAGAGAGGAATATATGCTTGCAGGACAACACTACACTAATGTAAGAACGTTGTAGCTCTGCACCCTGACAAAAAGTTGTTTCAGTACTAGTAGTATACTACCTCTATTTGACAAACCTATGCTTTGTTGGATTACTTAATTAATTAGAAGGCATCATATGGCTGCAGTTGAGGTGAGTCATATAGACAAACAGTACATTCCATGTTATGTATTTCTAAAATTTTCATGCACTTCTACTTCAGGCAATAGAACTTACCACTAATGCCCATGATAAGGCAACCCTGCTAGCAAACAGGAGCCTGTGCTGGTTGCGTTTGTCAACCGGCAATGGGGCTCTTGCTGATGCTAACATGTGCAGAATGTTGCGGCCCAGTTGGCCCAAAGCATGCTATCGACAAGGGGCAGCTTTCATGTTTCTAAAGGTAAAAAAGATAAAAGAGCACGTTTTTTTAAAAAAATTCGATTTTATTTGTCGAAAAATTGATCTGTTCTTTTGTGTATAGGACTATGGAAAAGCTTGTGAAGCTTTTGCAGATGGCTTGAAGTTGGACCCTGCAAATGAAGATATAGCGAAAGCTTTAAGGTAACTATTCTGTATTTTTCATCCCGTGAGCATCTTGTGATCTCCCTGGTGCCCTTGTGCATGCGTAGTTATCGTTATTAGAAAATTTCTTGCGTACCATTTGAATGCTTCTCTTGCTATAAAGTTGAAAGAAGGATCCGTGTAGAGATTTCTCCGTTTCTGTAGTACAGTTCTTTTTTTTTTCACCCTGCAGGGATGCCCAGGAGGCCATGAAGGACCAAATGGAGCACAGAGGTTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA030211