BGIOSGA030967

From RiceWiki
Revision as of 09:50, 25 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA030967| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030967, complete gene.| tag = P0556A0...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA030967

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030967, complete gene.

LocusTag

P0556A05.29

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA030967-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA030967-PA

Length

7181

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:16957242..16964422

Sequence Coding Region

16957242..16957353,16957467..16957517,16957652..16957705,16958535..16958585,16958653..16958703
,16958864..16959018,16959358..16959471,16959681..16959746,16960286..16960369
,16960448..16960534,16960783..16960874,16960971..16961031,16961283..16961339
,16961956..16962016,16962277..16962384,16963003..16963121,16963318..16963389
,16963499..16963584,16963666..16963762,16964288..16964422

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:16957242..16964422 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:16957242..16964422 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAGGGAGGAGCCCTCGCACTCCCGCACTTCCGCTCGCGCGTCGGCATCGGCTCGCCCATCCTGCTCTCCGCCGACCCCGGCGCCGCCCGCAGGAGCTCCGGCGCCTCCGGGAGGAGTAGGGTTTCGAGGGTTAATCCAGGAGCGTATCCGAGAAGTGCAGGGAGAGGTAGGACTTGGAAGCGTGACAGCCCGGAGGCTCCACCTCGCCGATCAGGAATTACTAGAGTTCCAAATCATAGTCCTGAGATGCCTACTGAAAGAGCAGGGAGGACTAAGGTTTCAAATGTAAATTTGGAGGTATCTCATCACAGAGCAGTTGCAGCAGTGAGGTTGCTAAGGATTGAGAAGGGGAAGGCATTTGTGGACCTTTTGAATGAGAAAGGAAACAGTTCTGGAGAGAATGAGATGAGCTATGTCGAAAGGACACTAGGGTTCAGCATACGGTGTTTGGATAACAGGGATATAAGATTGGTTACTGTCATAGTCGCTGGAACTGTGCGTTGGAAACGGTACCTTGATTATCTGATCATGTCACTCTGTAGTGAGGAGAAGGTGTTCAGGGAGATGGAACCACTACTTCTGCAGATATTACGAATTGGTTTCTTTGAAATTCTCAAGCTCAATGTGCCAGCTTATGCTGCTGTTGATGAGAATGTAAGGCTTGCTAAAGTAGCTCTAAGGCCTGGTGCTGGGAACCTGGTGAATGCAATTCTGCGTAAACTTCTACTGCTAAAGGAGGCAAACTCTCTTCCTCTTCCAAAGATAGAAGGTGATGATCGTGCCCAAGCTCGCGCACTTTCCATTATTTATTCTCATCCTGTCTGGATGGTGAGAAGATGGATTCGTTTTCTGGGCAAAGAAGAAGCTCTAAAATTAATGAAATGGAATAACAGTGATCCTCATTTCAGTATAAGGGTCAACACAGCAAATGGGTATACAAGGGCTGATCTTATAGATCGATTGGAAAGTTTGCAGGTTCATTATGAGAAGTCAACTATGGATGAATTTGTCCGTATTCAGGAGGGTATGCAGACTGTCCTGCAAGCTGGACTACTGAAAGAAGGCATGTGTGCTGTGCAGGATGAGAGTGCAGGTCTTGTGGTGTCTGTGGTCGATCCACAACCTGGGGAAACAATCATTGATTGTTGTGCTGCACCTGGTGGCAAAACTTTGTTCATGGCAGCCCGTTTATCGGGACAAGGGAAGATATGGGCACTTGACATAAACAAAGGTCGGTTGAGAATTCTCATGGAGGCAGCAAAGTTACACAATCTTGATGCTATGATCAGTGACATCCATGCTGATCTTCGACTATATGCTAAGGAAACCACTGCAACATTTGACAAGGTACTGTTGGATGCTCCATGCTCTGGGTTAGGAGTTCTTTCCAAGAGGGCAGACTTGCGGTGGAATAGACAATTCGAAGATTTGGAGGAGCTAATGTGTTTGCAAGATGAGCTTCTTGATTCTGCATCAATGTTAGTAAAGCCTGGTGGTATATTAGTCTACAGTACATGTTCCATTGACCCTGAAGAAAACGAGCACAGAATTGCTGCTTTTGTTCAGAGGCATCCGGACTTTGTCCTACAGAGCGTGCATGGATATGTTCCTGCTGAATTTGTCACAGATGAGGGTTTCTATTCCTCAAGTCCAACTAAGCACTCTATTGATGGGGCATTTGCTGCTCGTCTTGTTCGGTCCGTCCTCTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEGGALALPHFRSRVGIGSPILLSADPGAARRSSGASGRSRVSRVNPGAYPRSAGRGRTWKRDSPEAPPRRSGITRVPNHSPEMPTERAGRTKVSNVNLEVSHHRAVAAVRLLRIEKGKAFVDLLNEKGNSSGENEMSYVERTLGFSIRCLDNRDIRLVTVIVAGTVRWKRYLDYLIMSLCSEEKVFREMEPLLLQILRIGFFEILKLNVPAYAAVDENVRLAKVALRPGAGNLVNAILRKLLLLKEANSLPLPKIEGDDRAQARALSIIYSHPVWMVRRWIRFLGKEEALKLMKWNNSDPHFSIRVNTANGYTRADLIDRLESLQVHYEKSTMDEFVRIQEGMQTVLQAGLLKEGMCAVQDESAGLVVSVVDPQPGETIIDCCAAPGGKTLFMAARLSGQGKIWALDINKGRLRILMEAAKLHNLDAMISDIHADLRLYAKETTATFDKVLLDAPCSGLGVLSKRADLRWNRQFEDLEELMCLQDELLDSASMLVKPGGILVYSTCSIDPEENEHRIAAFVQRHPDFVLQSVHGYVPAEFVTDEGFYSSSPTKHSIDGAFAARLVRSVL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..112#226..276#411..464#1294..1344#1412..1462#1623..1777#2117..2230#2440..2505#3045..3128#3207..3293#3542..3633#3730..3790#4042..4098#4715..4775#5036..5143#5762..5880#6077..6148#6258..6343#6425..6521#7047..7181#ATGGAGGGAGGAGCCCTCGCACTCCCGCACTTCCGCTCGCGCGTCGGCATCGGCTCGCCCATCCTGCTCTCCGCCGACCCCGGCGCCGCCCGCAGGAGCTCCGGCGCCTCCGGTAGTACCCCGCATTTCCACGGGATTGCTCATTGTTTGGTTAATCGGGGCTGTCATTTGTAGCTTGCCTCTCATGGGGGATTTGGTTGGTTGTTGTTTTTTTTTATGTGGAAGGGAGGAGTAGGGTTTCGAGGGTTAATCCAGGAGCGTATCCGAGAAGTGCAGGTAAATTGAGGGGAGTTGGAGGTTGCTGCAGGCTGCAGCTTCGTCGTGCTGTTTGATTGGTTAATTATGGCTTTGCCGCTGATTTACCTGATGGATAAACTGTAAATTTGGTCTATTCCATTTGTTCTGCGAAGGGAGAGGTAGGACTTGGAAGCGTGACAGCCCGGAGGCTCCACCTCGCCGATCAGGTAAAAATGCTGCTTGGTACTGAGAATCACTCGTGTAGCAAAGCATGTTTGGTTGACTGATTAGGCACTAGGACAGTGTTTTCCTATATGAAATTGAACCGTGCCACTGGCTGCATGACATTCAACTGCCTTATGTCACATGTGGCAAACTGGCAATTAATGGAATGAAGATATACTCACCTAAATTCAAAACTAGTTGCACAGCGGTAAACTTCACATGTTTGATTATGTGTACAGAAGGGCTGATGGCCTGATGCATTTTGTAAAGTCGGCAATTCTTGCACCTGGAAGTCACTTTTACAAACTTTTGGAATAGTATTTGCATGTGTTATACAAAAGTCACACATATGCTTATTGGAGTAACTAAGGTGGACTTGCTGCCTCTAGACTCATTTTCTGGTAAAAGAACAAAAATAGTAAAGGAAATCCATGCTTGGGGAAAGTTAGGTGAACTAGCAATCCCTTCTGTCATGTATTCTCGACTGACGCCACCTCAGATACTTCAGTTGTAGATTTGAGTACTGAGCAAAAGGTTACACTTACACAGTGAGATAGTTGCCACTTTCATGACCTTAAACTTTAGAACATTGTCATGTGTGTCTGGAAGTGATGAATTGTATCTTTCTAATCTCAATCCAGGAACCAGGATTGCTACATCTTACATACTGAACGTACTGTGCTAAACTTGTGTATTGTTTGTTTGCTTGTCTACCTGCAAGCACTTGTATTCGTCGCATCTTGAAAGCATTGTTGTTTGTTGTTGGTGTCTGCTGACTTATCGTGCAAGTGATGTGAGTCTTTACTAATCCAAACATTCTATCTTTTTCAGGAATTACTAGAGTTCCAAATCATAGTCCTGAGATGCCTACTGAAAGAGCAGGTATCTCATCACTACTTGAATAACGAGAGCTATTCACTTCTTTAACCCAATTCGTTTTTTCTCTTAGGGAGGACTAAGGTTTCAAATGTAAATTTGGAGGTATCTCATCACAGAGCAGGTAAAACATTAATGATATGGTACTATGTTAGCAAGAAAATTTAATGGTTCTTTGTTGTATCTATTATTCATTAGTTTACTATCTAATTCTTTGGCCATGCTTTAATTTTTCATGGTTTTATTTGTCTTTATCATTTGCATTGTTTGTGTCGTTGGAGCAGTTGCAGCAGTGAGGTTGCTAAGGATTGAGAAGGGGAAGGCATTTGTGGACCTTTTGAATGAGAAAGGAAACAGTTCTGGAGAGAATGAGATGAGCTATGTCGAAAGGACACTAGGGTTCAGCATACGGTGTTTGGATAACAGGGATATAAGATTGGTAAAATTACATATTCCGCATGTTACTTTGTTATTCTATTCACCAACTTCGATTTGTTCAAGAAGGTTTGCACCATGATGGTTATAGCTATCAAACGGCAATTGTTGAGTTCTGAGTAAAAGATAAAGTAGGAGGCGGCCTGCAGAATGACCATATGTGATATTGTCCTTTCTTTATTTGATAACATGTACCTAACTAATTGTCAGTGTTGTTTTCTTCACTTATGTCTACTCGTACGTCATATGATATAATGTGTGAATGATGCTGAAATAATGTGTTCATGGGTTGACAACATTCCTTAGAAGACTTGTGTATGACTCTGTTATACTTGGATTGTAGGTTACTGTCATAGTCGCTGGAACTGTGCGTTGGAAACGGTACCTTGATTATCTGATCATGTCACTCTGTAGTGAGGAGAAGGTGTTCAGGGAGATGGAACCACTACTTCTGCAGGTTTCTTCTATATCTCTTACAGTATACTATATTCTTTATTGACAACCTATATTGAGAAAATTAGGTAAGTACCATCACAAAGCTGTGGAAATTGGAAAATACTATTGCATGTTAGATGACATGTGGAAAATACCAAACAATTTGGCCTGCAACTACAGTAGTTAACTCCACACTGTAGAATCTCTGAAGTTTAGCATTTTTGGTTTCAGATATTACGAATTGGTTTCTTTGAAATTCTCAAGCTCAATGTGCCAGCTTATGCTGCTGTTGATGAGGTATGTTGATTTTTTATATGTCCTTGGGAGCTCCCAAGGGCCTTAAAAAGCTCATGTCTATGCCAACCATATCAAATTTTGTATCAAAAAGCAAAATAATGTGGAAACGTATATCTCTTTCTCTGTATGCTTTGTTCCATAACGGAGTTTGTATGAATGCTGTTGTTTCATGGTAATGATAATACATTTAAACATGATTTCTCCACAGTTTTTGTACTTTTCCTTTTCATTTCCTGTAGTACTATTATGAGTTTTATGGATGGTGGCGATAAAAGGGCTTTTGAGGATGATTATGTTCCTGGACATGCTACATTTTTGTTAAATTATGATATTTGCCAGTATACTATATCTAACCTAATAAAGTGAATTTTGTTGATACTGCTGTTATAATATTCTGAAGCTGATTCACCTGTTTCACTGATCTTTTGCATTTTGTCCTTTCTTTGAGATAGGCATGTCATACTGTTACCATTTGTATTTCTAACGTACCTGACAAATGTAAAGAATCTAGTAATGCTTCTTTCAAATCACAATTTTAGAATGTAAGGCTTGCTAAAGTAGCTCTAAGGCCTGGTGCTGGGAACCTGGTGAATGCAATTCTGCGTAAACTTCTACTGCTAAAGGTATGAATTAGAATTAATCTAGCCAGCCTGATCAGTAGGATTGCACTGTAGTATCGTTATTTTGTTTTTTCAATTCAGGAGGCAAACTCTCTTCCTCTTCCAAAGATAGAAGGTGATGATCGTGCCCAAGCTCGCGCACTTTCCATTATTTATTCTCATCCTGTCGTAAGTTTCGTTTACCCTCTAAACTTTAGTTTGCTTCTGTTTCTTAGTTTTCTGTGTGCTAGATTATTCATTAATCAACATACCAATTCCACTTGACCAATTATCAATCAATGCCCTTGATAACTAGGATTGTGGACTCATGTGGAATTCAATCTACTAGTTCTATCTGGCAAATATTTGTTAAGAACACAACAGAATATCTGTAGAAATTTCATTTTTTAATCTATAATTTGTTTTCTTCTCTGCAGTGGATGGTGAGAAGATGGATTCGTTTTCTGGGCAAAGAAGAAGCTCTAAAATTAATGAAATGGAATAACAGTGATCCTCATTTCAGTATAAGGTTTTAAGCCAAATGATGTACTGTAATATACAGTCACCTGCTCTGTTTATGCATGTCCATATGGTTGATTCGTCTTTTTTATGCCTTATATCATAGGGTCAACACAGCAAATGGGTATACAAGGGCTGATCTTATAGATCGATTGGAAAGTTTGCAGGTGCTTCCATTAAGCTTTAGTACCTTCTGCTTGATCAATATAAGGCTTAATAAAGTTCATAAGGAAGCAAGAATGAATATAACATGTACCTTGTGCTATATTATGCAATGGCATTTAATTATGTCATTCGGCTCGCTGCGGGGTATATAAATTCATTATATAGAGCTATTCAGGACTCTAATACCTTATCCATATTGATGTCACATTCTGCCTTGATTATTTGCTAGATAATTTGATTTCCTTTTATGTAGGTTCATTATGAGAAGTCAACTATGGATGAATTTGTCCGTATTCAGGAGGGTATGCAGGTAAATAAACTGATAGTTGGTTTTCAATCAACGACTAGTCACTAGTGCTGTGTTAAACTTAAATCAATATGATGTATTGACATCCTTGTATTTTTTTCTACAACGCAATATGTTCAGTATACTTACAAAATAGCACTGTTTCAAAACCTAAATTTGTTCGTGCACATAAGATATCGACATTGATTGCAGTTCTAAGAAAGTGAGGCTGAGAGGCAGATGATCTAAAAAGAACTTATAAGAAATAATCCTGAAATAATGTTTGTGCAGTAGCAAGAAAGGGGAGATAATTTTATACTTGTGATGCCTTAGATGTTTAATGATTATTATTTCTTTTACTGTTCAGAGTATAAGTATTGATCACCACATGTATTGGATCAGTCAAGTTGTGTATCTCAGTAGCTGTACAAGTTCGTTTATTTTGAAAGAAACAACTTTTTTGAAGCCTTTGTGGTTTGCAACTTTGGAGATGGAGCACCACCATTGTGCCCTTTATACATAACAAAATATCTGCATTCTTTTATATTTGCATACTTTTATATGAACATTACTTTTACTGTTCTTATTTTCTTGATAATACCTCTTGGGATATTATTATCTTAATTTGTTCCATGTACAGACTGTCCTGCAAGCTGGACTACTGAAAGAAGGCATGTGTGCTGTGCAGGATGAGAGTGCAGGCAAGTTATGATAGTTATTTCTTGACCGCTAAGCATATGCCTTAATTAGTACAATAAGATTACTATATTGAAGTGATGTTGACTGCAAATAACTGTACATGGCTTATGACTATGGAAATCGTTTCAGTTTTACTGTCCGTCACTTCCATTAACCTGAGTTTTTCCTTTATCCTTGAGGTTTCCATGTCTAAGTGATAGTGGTACTTCTCATTTGAGTAAGCACTTGATACTTATGCTAAGACATGAAGAATCTATTGTAGGTCTTGTGGTGTCTGTGGTCGATCCACAACCTGGGGAAACAATCATTGATTGTTGTGCTGCACCTGGTGGCAAAACTTTGTTCATGGCAGCCCGTTTATCGGGACAAGGTAAGAAGATGGAATTGAGAGAGGGTTCAATCATCTGTTGATATCACACTCATAACAAGGTAGTTGTAGGAAACTTATTTTTTTATGAACATGGCACATATAAATAGACAATGTATTTAGCATGTTATGTCCATAAAAAATGACGCACACCTTCTTAATGAAATGAAGCACAGTTCTCATGCGTTTCCGAGAAAAAGAATGACACACTGAAATGAATTACTTTTCACATCTTACTGCTTTTATTAACTTATTATAATATTGAGCACCTGCAGACATTGGTTGTTGAGATCTAGTTAATTTGTCAGATATAAAATTAGTGAGTGCAGTATGTCCATGGAGTTAAAATGAAGAATGTGGTGGCTTTCTTAATGTTTAATTGCTATAAGTAACTGTTCACGAGTTCATCCTTTTGCATCAGCAACGCGAACCAGCATTTGTAATTTTTAGAGCAAATTCCAGGAAACCTCGCATTTTATTACAAGCAAATATAACTCACATGTCCAAAATAGTTTTATGAGAACTCATTTTGACGTTCCATCCAGAGGTAGTTCCAAGTCATCATGGATGATAGTAGCTTAGAGATTTGATATTGTGGACTTACCATGTAGTCTGATTCAGGGAAGATATGGGCACTTGACATAAACAAAGGTCGGTTGAGAATTCTCATGGAGGCAGCAAAGTTACACAATCTTGATGCTATGATCAGTGACATCCATGCTGATCTTCGACTATATGCTGTAAGTTTAAGAGGAAATCCCTTGTTTCTAAACCAGAAAATGGGGAACAAGAATATAGAAAGTCCCCATAAATCTAAGGATACTGCACTCCAATGGAAGTATTTATTAGGAATATGACTAGTGGCTGTTATGAGCTTATTACTAATCGTTATCCAAATGTATGATGTGGAGGCTTATACATATGAAAAAATTGCAGAAGGAAACCACTGCAACATTTGACAAGGTACTGTTGGATGCTCCATGCTCTGGGTTAGGAGTTCTTTCCAAGGTATCTTTGTTAAGCAAGTTCATTATTTTGCTTTCACTGAACTAATCTAAATCTTGAATAACAAATGATTGATGAACTGATAATCCTTAATCCTTTTTCCGTTCCCAAGAGGGCAGACTTGCGGTGGAATAGACAATTCGAAGATTTGGAGGAGCTAATGTGTTTGCAAGATGAGCTTCTTGATTCTGCATCAATGTGGGATTCCTTCTCCTGCAAATCTGTGAAAGAAAATTTATATGGCTAACATCTGATATTACTTTCTGGTTTTGCCTGTAGGTTAGTAAAGCCTGGTGGTATATTAGTCTACAGTACATGTTCCATTGACCCTGAAGAAAACGAGCACAGAATTGCTGCTTTTGTTCAGAGGCATCCGGTACTAGTTCGTCTTAACATCAAACGTGGATCATTTACTGGAAGTTAATAAACTCAATATTAAGTTTGATTTGAGAAAATAAGTCCCTTATGGTTTACAGTGTTGTTGGTAATATTGAGCATGCTAGTAAAACACGTGCTAAAAGCACATGATCTCTGGTGCAACTTAGACTGACTTATCTCAACTAACGAGGTAATAATCACAAATTCAGTTGCTGTTGGCACATGTTAATCCAGCTTTTGGAAGACCCCATCATTCACACTACATTTTAATATTGTTAATCCTGATAGTTCAGATGTGAGTTTAACAGTAATATAGCTTTCAAGCATATTAAGTCTCCACGAAATGTAAACATTTAAGCATGTTTTACCACTTTTTTAGTGAACCATCTCTATAACCTTGACATCATTTATATACTAAAATGGAGTTGCCACATAATGTTGTATTTTTTCGCACTAATAATTTCGCTTTTGACAATATTTTATGCTATGCATGGATATGTTGTAAATCAATTTTATGCTGTAGGACTTTGTCCTACAGAGCGTGCATGGATATGTTCCTGCTGAATTTGTCACAGATGAGGGTTTCTATTCCTCAAGTCCAACTAAGCACTCTATTGATGGGGCATTTGCTGCTCGTCTTGTTCGGTCCGTCCTCTAG</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA030967