Os10g0563000
| Gene Name |
Os10g0563000 |
|---|---|
| Description |
Similar to Palmitoyl-protein thioesterase-like |
| Version |
NM_001071929.2 GI:297610932 GeneID:4349396 |
| Length |
5845 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0563000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:22671684..22677528 |
| Sequence Coding Region |
22671793..22671904,22672026..22672110,22673261..22673312,22673408..22673428,22673515..22673568 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:22671684..22677528 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008403:22671684..22677528 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgatggcctacgcgctgcgcggtgccgccctcgtcggcgtcctcctcctcgtcgtggcctccccggcgctcgtcccggtggcctccgccgtgcccttcatcgtcctgcacgggatcggcgaccagtgcgagaacggtgggatggcgtccttcaccgaaatgcttggggaatggtccggctccaagggatactgcattgaaattggaagaggagcatgggactcttggctgatgccacttcaagagcaggcagacactgtttgcaagaaggtgaagaaaatgaaagaactccgtaaaggttacagcatagttggcctttctcaggggaacttaattggtcgggcagtaattgagtactgcgatggtggaccaccggtaaagaatttcatctcgattggtggtcctcatgctggtacggcatcagtaccactttgcggttctggcatcgtttgtgttcttattgatgctctgattaaattggagatatattcaaactatgtacaggcacaccttgctcctagtggttacctaaagatacccactgatatgacagattatttgaagggttgcaagtttcttccaaagcttaacaatgagataccaagtgaaagaaatgctacgtataaacaaagattcagcagcctggaaaatctagtattgattatgtttgaggacgacgcagtgttaataccccgggaaacggcatggttcgggtactatcccgatggcgccttcagtccagtgcagccacctcaaaagacaaagttgtacacggaggactggatcggcttgaaggctttggaggaggctgggcgtgttaagttcgtatcagtgccaggaggtcacctgagcatctccagaagtgacacgaagaagtacatagtgccatacttgaaaccggacggatcatccaggttcggcattcgtcgcatcttgtcggattga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MMAYALRGAALVGVLLLVVASPALVPVASAVPFIVLHGIGDQCE NGGMASFTEMLGEWSGSKGYCIEIGRGAWDSWLMPLQEQADTVCKKVKKMKELRKGYS IVGLSQGNLIGRAVIEYCDGGPPVKNFISIGGPHAGTASVPLCGSGIVCVLIDALIKL EIYSNYVQAHLAPSGYLKIPTDMTDYLKGCKFLPKLNNEIPSERNATYKQRFSSLENL VLIMFEDDAVLIPRETAWFGYYPDGAFSPVQPPQKTKLYTEDWIGLKALEEAGRVKFV SVPGGHLSISRSDTKKYIVPYLKPDGSSRFGIRRILSD</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>110..221#343..427#1578..1629#1725..1745#1832..1885#2368..2418#2613..2675#3625..3690#3797..3835#4521..4643#5163..5255#5362..5547#aagcacaagaggcgaaagcgcggcgccgtcgcggagaggagaggagggcgacgagggggaggcgattcccaaaccctagctaccctcaccgccgccgccgccagcagcgatgatggcctacgcgctgcgcggtgccgccctcgtcggcgtcctcctcctcgtcgtggcctccccggcgctcgtcccggtggcctccgccgtgcccttcatcgtcctgcacggttagggtttttttttttctctcgcttgtttgcccccctaggttttgtgctctgctggtgcttggatttcgtctgaggttttgctggtcgtgtgtacttgtctgtgtccgggcgcacgcagggatcggcgaccagtgcgagaacggtgggatggcgtccttcaccgaaatgcttggggaatggtccggctccaagggatactgcatgtaatggcgccttatctccccccatctctctctcccttgtgttctggaagtggagactgttcgagctgtgatatttgtgaattgtgatgttgccttttgttatgacgagaaattagttgctgtttcaagtgcaatactagtgctctggtttccattaatatatatgtacaggctattaattaattatttctttgtttttccatgtgaaattgttaatgcgaataaatatagatgcccaaattagatatggtagccttaattatatatccttggggttggggaggtttaaaaaggaatagattgaaatactccacacatatttagcaaatcacgaggataatgaagtatgatgagacgattactgtcaagttccatttgttaacttgtccctgcaattttgtgaggaggatctgggagtaacatatacagttttatacatttgcaaagtcaaccacagtttctgttatggtatgtacacccaatgtgtgatctcacaaccaaaccaattgatgtcccaacttcttttttgagagtttagcccatgctgcatttgtttcagtcaaccacaataactgtttctgttgttggatgcctggagattttatcgcgacattcacctctttcttacacgtttgggtattcacgtaatctgttgtttcagtatcttatttttcgtaccttaccatcctgctctctatttttagttaaatgtcaactgttgtatgaagccaagtttgggcaattcaatacatcttagaagtctcctgactttatgccatgttgaggaactaatatgttgtctgttccaattgcttttacattacttagtatggccttcctggctgttggaagtgaatttaacctgtcgcagtccatagtggggataatgaagattctgatatgcttcataattttgtatttgttcctgtggaatgggccttaacaaaatatgcagaaacaactattgttgaaaaattcatctagtattatggtatgtacaccctagtgggtgaccttacaaccaattgatgccacaactttgtttcttgagatgtgttacatcatatatcagtacaaattttaaaaagtttggcacatgctgcatttgtttgctagtttacttatggagattaaatgtattcctcctcagtgaaattggaagaggagcatgggactcttggctgatgccacttcaagagcaggttgatttcttgcccttgataatttcctttttttaaaaaaaaaatcaaatagactgttcttgtacaagtttctgagattatgtattcatctacaggcagacactgtttgcaagaaggtgattcagaacctccatcacttctatttatgtactgtatgctgaattctcaaggtactatatcattgctggaattgattttccaggtgaagaaaatgaaagaactccgtaaaggttacagcatagttggcctttctcaggtgtgttcatgctattatgctattttatgttcatgacaatagctttattgtaacatgcagatctgttctttgcttcttgtacctctatgcattgctgttcttttgttatgtcttcttttagtcctaagcctatttgatcagtcttggttaacccaaaaccaaaaaataataataaaataaaaataaaaataaatcaaacgaggcctgtgtggaaaaaaaaaaagtgattttcctctctttgtgctgctgccgaacgcaaccttaggcctgtgcggacatgtctcgcttttgttctatgtggacctcttgagtataaaacgtaggagtgtgctatgtgacccttcgatagatttttatttgggttattgacttagtgggagttttgttttcaatgccatgtatttcactagagaatcaccttattgtttcttgttgcatgtcaaaatttccctcatatgtaccctttttgttaccttttacaggggaacttaattggtcgggcagtaattgagtactgcgatggtggaccaccggtaggtgaatctagttcgcttcctgatgttacaataataatatattttatatggtttgttattaacataacaacaccaaggtgagaaatttgatgtacttgtggtttaccatatgcgtcccaacctttcttgatccaaatgatgccttggacctctcttatgtacagttatagtttatttgctgactgtaacaggtaaagaatttcatctcgattggtggtcctcatgctggtacggcatcagtaccactttgcggtgtaagctcactctatcctcccctggtctccttcttttgcatatgcgtatagaccagtatttaagagtagactgcttggtatgaatgactgaaggtttttcatgcatataaatttacacactcttaatgtttagtagccaatggttactaataagcaacaggtagctatttgtagaatgacctatagttaaaacattactccctctggtttaagatatatgttattttagctctatccaacactgaaaaaaaactaggaaaagctaatgtcatagatcttgacatagagcaaggaacgctaatgtgagggggaaaaagttatataaaaaagaagttttttcccaaagaaatctttgctagaatggcataaaaaaatggaccggagacacttattgatagaacatgaatatgtcatataacataaaattttcggggatgatctgtagcattggccaaaacatgttggatgcagtttatgcttgctaaccatccatttgcacagctatcttgactcactggagaaaaacagcaatgcattacaagtgaatagtgataacttctttcaatttgccagatttcaagggagggagaaagcatgctttgagtcctgtatgaatatgtttttgttcgtttctttgttaacctagatcactaattgactgtaatttcaaacagattgaggttgtatgttaatttgtaaattagcatgaggccttgagactgctcccttacttttgtgcattcatatgaatgagcatgcctccaagttttccgtggggtttacttcatgcaatgttttctctagtatctgaataatgtagtttctggtaaactcatcttctgtcatttatagctgcactaggaacttcaattctcaggctagtgacgttgctatctaacagttaaacaagtactgttgcgctactaaccctttcttcttttttttgcagtctggcatcgtttgtgttcttattgatgctctgattaaattggagatatattcaaactatgtacaggtgtttatgacttgtctttttttgccatgtcttaattgttagtatcactgttaggcattacacacatcatttctctttaagtaacttgaaattggtggtattgcaggcacaccttgctcctagtggttacctaaagatacccactgtgagttttctattctatattttccttttaattccatagtaccagaacctctgttcttcatttcccactcctgtttctattacccagccatctcttaggctgtgttcgggaggaggggttgggaacccctcctccccggcacgcaaaacgaagctcgtattattgcatgattaattaagtattaacttttttttttgaaaaatagattaatatgtttttttaaaacaactttcatatagaaagtttttgcatgaatcacaccatttagcagtttgaaaaacgtgcgcgcggaaaacgagagaggtgggttgggaaaatgggggaaggacacagcctagtgttttaactaactcagaattcttattggcttgtatggctgtacattggtatctaatgtgcaatagaaggttgagtcccaatatattcattaacgtgcatggttatcctgcatgggctattcattagtacaggttcttgtggactgcaaatctgtctgtaacaagatacaacttacagctgtaaaaataccactgtaccagttaattaactactcaatatatgtaaccattaactgtgaagcccattttgacctttccaccttgtttcaggataaaactgagctattttgatttacatgcatgaacaaaccttttagttagtttaacccatcttcttaattctccaggatatgacagattatttgaagggttgcaagtttcttccaaagcttaacaatgagataccaagtgaaagaaatgctacgtataaacaaagattcagcagcctggaaaatctagtattgattatggtaagatgaacacgtaattgttgctatttgacatactctgggttgggtacttgtatgtggtgtagatggaatatgctgtgtgcagtccttgttaactttatatatatagcattatgcattcaaacgatcatatcgaacaagataatgaattaaaagttgttctacacaaaaacaaaagaaaacaaatagaacatctatttattttttgaaggcacaatacatctatttatgatcgcgatgtgtaaaacaatatgcttttagtaagctacataaaccttttagttcattaagtcacacatgcattttgtctcgtgttttgtataaatgttgttgatttatataatcttactgaactcaaatgccatttatgcatgcccaaagcaaatggatttaagttgcaacacattcagcttagtttttgtatctcaaatagctgatttttaagataaaggattacaagaaacatgaaaccatactggaccaatccatctgctgatacccttttgaactgctaaacagtttgaggacgacgcagtgttaataccccgggaaacggcatggttcgggtactatcccgatggcgccttcagtccagtgcagccacctcaaaaggtatatgtatatcttgagttgttgtacagaagacatagcatgctttttgttttaaactactgttatttaggggtgtgtattaagtaaggccatttttgtgtgatagacaaagttgtacacggaggactggatcggcttgaaggctttggaggaggctgggcgtgttaagttcgtatcagtgccaggaggtcacctgagcatctccagaagtgacacgaagaagtacatagtgccatacttgaaaccggacggatcatccaggttcggcattcgtcgcatcttgtcggattgattcacgagaagaaggcgttccgagtgaccagttctaacgtcacatggacatggattgtatgtaagctctgaattgtggacttaattgttgatgccatgtaaataccttggtaaaggtaatggggtaatggaatacgtcgtgtactgtagggcaggtggttagcgtacctgaactgcagaactggcgatgctagaattgtgctgcctattagcaaaacgcaattgtgggcttttatgtagcagacctcactaggaaaaagtccaattcgacaatctcgtatatagttcggatttaattc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
