Os11g0109933

From RiceWiki
Revision as of 08:57, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os11g0109933| Description = Conserved hypothetical protein| Version = NM_001189379.1 GI:297727888 GeneID:9266997| Length = 4786 bp| Definition ...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os11g0109933

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001189379.1 GI:297727888 GeneID:9266997

Length

4786 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os11g0109933, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:461878..466663

Sequence Coding Region

464193..464684

Expression

GEO Profiles:Os11g0109933

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008404:461878..466663 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008404:461878..466663 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>attcagctctttcaatattttgtaggaaatttctcgatggcctttaggactcctcctgttagtccccctcagcatgactacctcacaggattgcgccgagtgtgctcgatggagttcagaccacatgttttgaactcacctgatggcttagctgatcctcttttaagctccagtgcagcccccagcaacatggggctcgatatacttccccaatcattaatttacagatggagttgtggtcacttttctaggccacttctaactggttctgatgataacgaggaagcaaatgctagaagagaagagcgagaacgaattgcaatggattgcattgctaaatgccaacgatcttgtatgtggcctagcaacactattttacattatatttttgctattggagttctatttatttatctgattaatgatatgcttccccttcttctgtgtgttggtggcattagcagcttgcaagatgaccagccaaattgctag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>IQLFQYFVGNFSMAFRTPPVSPPQHDYLTGLRRVCSMEFRPHVL NSPDGLADPLLSSSAAPSNMGLDILPQSLIYRWSCGHFSRPLLTGSDDNEEANARREE RERIAMDCIAKCQRSCMWPSNTILHYIFAIGVLFIYLINDMLPLLLCVGGISSLQDDQ PNC</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1980..2471#aaaatgcccttgttacttatttgtgaactttgttaaatacatggttgcccatctcttatctgctttcagtatttatgctggaaatttgctacatgggttccctttaattatcaattgttttactttgctctaatacacttatgttatgtgtaggttttgcttagtcagtcacacagatttagagcacttgttctgcttggaagatttcttgacatgggaccttgggcagttgatttggtatggagttgaccgttctgcgtgcccttttttgggggtagaactgtagaagtgttgttgtatattatcttacccgtatttcaaattctggaactttttttaggctttgtccgttggcatcttcccttatgtacttaaactgcttcaaacaagtgcaatggagttgcgccaaattcttgtgttcatatggacaaaaattctctctcttgataaggtggtgttctatgttgaaaacttgaaatctctgacagttcattttatttctcaagattcaggtatttacttagttgctctgtttttcaaatgacagtcatgccaggttgacttggtgaaagatggagggcatgcatactttatcaggtttcttgacagtttggatgcttacccagagcagcgtgcaatggctgctttcgttttagccgttattgtggatgggcatagggttggtcaagaggcttgtgctaatgcagggcttatatatgtctgcctgagacatctgcaacctgaaaatccgaatgatgctcagacagagcctttgctcttgcaatggctttgtttatgccttggcaaactttgggaagatttccctgaggctcagttacttggtctgcaatcaaacgcaccggaaattgttatatgcttattgtcagagcctcaacctgaagtatggctgctgtcattttgtgttaattcttccttatacctgcttcacaacatacgtgttaaatatttgatcttaccaggtcagagcttctgctgtttttgcacttggaaatcttgtggatattggatctccatcactgaatggagctgacgacgattctgatgatgatgaaaaggtgagagctgaaataaatgttgtccgaagccttctgcagatctcttcagatggtagccctcttgttagatctgaggttgccgtaggtacgtgaatttgcctaatacattggacttacactcatttagtaatgtgtcaagcctatagattcctcttgattttgtggcgataattttgagttgatctgatgtgttgcagcgcttacccgctttgcaatggggcacaataaacatatcaaatctgttgccgccgagtactggaaacctcaaaccaattcactgctcaagtcattaccatcgttggctaatattaattcgagcaatgtttacagtcccagcagcttaatacaaggtagcagtggccttgcctcacatattggtcccgttttaagggttggcagtgataacagtgccactgctcgtgatggaagaatctctacgagcagcccgattgcaacaaatagcatcatgcatggttctccacagtcagatgattcttcccaacactctgattcaggcatattactgagagagaatgcaagtaatggtggtctcaactactcaagatcgaggcctattgataatgggatctattcccaatttatagcaactatgtgcaatgttgctaaagatccttacccaagaattgcaagtattgggaaaagggcattgtccctcataggtgttgagcaagtaagcatgagaaacagtagacttagcaatggaggtgcacacccaggagagacatctgtgcccccttcatcaaactttggaatggcacgctcctcttcctggtttgatatgaactctggtaggttaataatttctatccttgccaagtgcttggaggatgcctgcctttttgcatgcactacattattgtgtggggtgtaaatgattattgaattcagctctttcaatattttgtaggaaatttctcgatggcctttaggactcctcctgttagtccccctcagcatgactacctcacaggattgcgccgagtgtgctcgatggagttcagaccacatgttttgaactcacctgatggcttagctgatcctcttttaagctccagtgcagcccccagcaacatggggctcgatatacttccccaatcattaatttacagatggagttgtggtcacttttctaggccacttctaactggttctgatgataacgaggaagcaaatgctagaagagaagagcgagaacgaattgcaatggattgcattgctaaatgccaacgatcttgtatgtggcctagcaacactattttacattatatttttgctattggagttctatttatttatctgattaatgatatgcttccccttcttctgtgtgttggtggcattagcagcttgcaagatgaccagccaaattgctagctgggatacgaggtttgagttgggtacaaaagcatcattgttgttgccattttctcctattgttgttgctgcggatgaaaatgagcaaatacggtaaacagattatactggaatctcttgttaaaatcgattttttttttgtgcttcagatacactagtgcagttgcgctaaagtttggtctcatttcagagtatggaactatgatgatgcgctgccagtgaatacttttgaaaaccacaagttatctgacagaggcctatctaaacttttgctgatcaatgagcttgatgatagcttgttgttagttggctcaagtatatctcttatctttatgttttttctgttctcatttgttttgtaccattttgatatgtattttttttttcatattgtaggtgatggaaatgtccgcatatggagaaactatactcaaaagggaggacaaaaacttgtaactgctttctcatcagttcaaggctatcgaagtgctggtcgcagtattgtatttgattggcagcaacagtcgggttatctggtgaaactctaaagccttttcccgatgttttgcaaattgcaatgtctcattaatcaaggctattgtaatatggaacttactccttttgttgtaaaacagtatgcatctggtgacatgtcctctatccttgtatgggatcttgacaaggaacaacttgtcaacaccatccagtcaactgctgatagcgggatttcagctcttgtgagttctttgttactgtgtgcatatgtgctatttgagtgtgaaaaatttaaaataatgattttagcttcttttttcagtctgcatctcaggttcgatgtggccaattcgctgctggttttcttgatgcatctgtcaggatatttgacgtgcgtacacctgataggtaagtagatgtttgatgagatatcaaccacatgttccattgcagagatttcgcttcatgtgcatcctccgcccacaacacacatatgcatgcttatttgcgcgcacacatttatgctacttcctaagttcaatttttcccattgctgtaggctagtatatacagcaagaccacatgccccaagatcagaaaaggttgttggtataggatttcagcctgggtttgatccctacaaggtaaatcctccctctttgtgcacatcttctgtatttcttgtagttttaattgttagagcagccaattttttagaactttatgggattatttgagctttacagagctccctttttgttatttatgcaattacagattgtaagtgcatctcaagctggagacattcagttccttgatgttagaagggcatctgaaccctacctcactattgaagcacataggggttcattaatggcattagctgttcatcggcatgccccagttattgcaagcggctcagccaagcagatgatcaaagtgtttagtcttgaaggagaacagttgacaataattcgctaccagccatcttttatgggtcaacgaataggcagcgtaaactgcctttctttccaccgatacaaatcactccttgccgctggtgctggtgataatgctcttgtttctatctacgcggaggacaattaccaagtacaatgaggtttacagcttgttccatgatgcaatgatgatgcattcagttggcctcatgtatggccaagcgttgatccacaccaatggtacagctacaagatacaagatgttatggagagcctggtcagtgacatggtggtggtggtatagaagtgccacagcttctggtgcattgcttcttgggcatatctacatctctgatctgacctgcagtttgtaagatacaaaacagggttcattagcctcccttgcagaaggtcgcgaaagtggcatcttgccctggtcccatcattacacttggaggcttcccaaataactaggttaaccaaactgtaaatagtcatcctatttggattgttgttctccttagccagcttcctttcccaaatgtaaaaaggtttggaggtgcttccatatgataaatcaggttagtggggactgcctgggcaagtggttgtttatatgggcccagggagaatgcatgcgcatgtctctcatagatgttgttcaatagatagatgcatttgtccagctaacacaatattacatggcttgatgaatcaatgccttcttttaagtctttcattgtaagcactggacagtcatccagtgcatcaaggtagggcgtcattgtccttttgtatatatgaattgtacttgtacagttgcccactttgatgcaatgcgtccaaagatgttttgaggtc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os11g0109933, RefSeq:Os11g0109933