BGIOSGA033023

From RiceWiki
Revision as of 05:04, 26 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA033023| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA033023, complete gene.| tag = OS10G04...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA033023

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA033023, complete gene.

LocusTag

OS10G0439600

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA033023-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA033023-PA

Length

7126

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 10

Location

Chromosome 10:14231823..14238948

Sequence Coding Region

14231823..14232346,14233142..14233214,14233287..14233343,14233642..14233697,14234981..14235194
,14235894..14235935,14236058..14236132,14236217..14236300,14237275..14237339
,14237831..14238050,14238215..14238303,14238721..14238835,14238913..14238948

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome10:14231823..14238948 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome10:14231823..14238948 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAGTTCGACGAGTACGAGTACCTAGAGAAGACGGTCGAGCCCTCCGCGCCGTCGACCAACGGCTCCGGCGAGAAGGACCGCGCCGGCTCCCGCCGGCGCTCCTCCGGCGGCGGCCGCGACGACGAGGAGCGCGGGTCGAAGCGCTCACGCTCCGGGGAGGACCGGGACCGGGACCGTGACCGGCACCGAGGCGGCGGCGGCGGCCGGGAGCACCGGGATCGGGATGACGGGAAGGAGAAGGAGAGGAGCAGCCGCAGCCGCGTCAAGGATGGGGAGAAGGATAGGGGCAAGGATGGGGAGAAGGATAGGAGCAAGGAAGCGGAGAAGGATAGGAGCAGGGACAGGGACAGGGACAGGGACAGCGAGAGGGACAGGCGCAGGGAGAGGGATAGCGGGAGGGAACGAAGAAGCAGCAGCCGCCCTGAGCGTCGCCGCACGGAGGAGGAGGAGATGGTGAGGGAGCTCCAGAAGGAGCGCGAACGCAGCGACCGCAACCGTGACTACCGTGACCGCGATGTTAGACGTAGGAAAGATGACGGTGCAGAGCCAGAAGCTGATCCAGAAAGAGATCAAAGGACTGTATTTGCCTTCCAGCTATCTTTGAAGGCAGATGAAAGAGACGTCTATGAGTTCTTCTCAAGAGCAGGGAAGGTCCGTGATGTTCGCCTTATTATGGACAGGAACTCGCGGCGTTCCAAAGGAGTTGGGTACATTGAGTTCTATGATGCTATGTCTGTTCCAATGGCGATAGCTCTAACTGGTCAGGTGCTTCTTGGGCAACAAGTGATGGTTAAGCCCTCAGAGGCTGAAAAGAATCTAGTTCAGTCAAACGTGGCATCAGGTGGAATAGCTTCAGGTGGAGCAAGAAAGTTGTATGTTGGCAACCTACATTCCAATATCACTGAGGATCAATTGAGACAGGTATTCGAACCATTTGGGCAAGTGGAGCTTGTCCAGCTGCCGTTCGCACGGCTTGAAGATGCAAAAGCTGCTCAGAGTTTAAATGGTCAGCTTGATATTGCTGGAAGAGTAATTAAGGTCTCGGCTGTTACTGAGCAAGCTGGTTTGCAAGTTGGGGGTGCAACTACGGGAGATTTAGATGATGATGAAGGTGGAGGTTTGGCATTAAATGCAAGCTCTAGAGCTATGCTGATGCGTAAATTGGACCGGAGTGGCACTGCAACCAGCATAACTGGTGGTATTGGTATTCCTGGTGTGAACACATCTGTTGAGTTACCGTCTGCATCGGTTACTGGTGCTCCTCTGCCAACCACTTCACTCATACAACCAACAATACCTGCTATTGGAACAGTTCCTGGCATACAAATTCCTGGTACTCAATCTGCAGATATTGGTTCACCTACTGAGTTTCTATTGCTGAAGAACATGTTTGACCCTGCAGTGGAGACAGATCCTGATTTTGATTTGGATATTAAAGATGATGTCCAGGATGAATGCTCAAAGTTTGGTGCAGTAAATCACATTTTTGTTGACAAAAATACTGCTGGCTTTGTGTACCTTCATTTCGACAGTGTAGCAGCTGCGACAGCTGCTCAACGCGCACTGCATGGTAGATGGTTCGCAGGAAAGATGATTACAGCGACCTTTATGACTGCTCAGCAGTACAAAATGAAGTTCCCAAACTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEFDEYEYLEKTVEPSAPSTNGSGEKDRAGSRRRSSGGGRDDEERGSKRSRSGEDRDRDRDRHRGGGGGREHRDRDDGKEKERSSRSRVKDGEKDRGKDGEKDRSKEAEKDRSRDRDRDRDSERDRRRERDSGRERRSSSRPERRRTEEEEMVRELQKERERSDRNRDYRDRDVRRRKDDGAEPEADPERDQRTVFAFQLSLKADERDVYEFFSRAGKVRDVRLIMDRNSRRSKGVGYIEFYDAMSVPMAIALTGQVLLGQQVMVKPSEAEKNLVQSNVASGGIASGGARKLYVGNLHSNITEDQLRQVFEPFGQVELVQLPFARLEDAKAAQSLNGQLDIAGRVIKVSAVTEQAGLQVGGATTGDLDDDEGGGLALNASSRAMLMRKLDRSGTATSITGGIGIPGVNTSVELPSASVTGAPLPTTSLIQPTIPAIGTVPGIQIPGTQSADIGSPTEFLLLKNMFDPAVETDPDFDLDIKDDVQDECSKFGAVNHIFVDKNTAGFVYLHFDSVAAATAAQRALHGRWFAGKMITATFMTAQQYKMKFPN</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..524#1320..1392#1465..1521#1820..1875#3159..3372#4072..4113#4236..4310#4395..4478#5453..5517#6009..6228#6393..6481#6899..7013#7091..7126#ATGGAGTTCGACGAGTACGAGTACCTAGAGAAGACGGTCGAGCCCTCCGCGCCGTCGACCAACGGCTCCGGCGAGAAGGACCGCGCCGGCTCCCGCCGGCGCTCCTCCGGCGGCGGCCGCGACGACGAGGAGCGCGGGTCGAAGCGCTCACGCTCCGGGGAGGACCGGGACCGGGACCGTGACCGGCACCGAGGCGGCGGCGGCGGCCGGGAGCACCGGGATCGGGATGACGGGAAGGAGAAGGAGAGGAGCAGCCGCAGCCGCGTCAAGGATGGGGAGAAGGATAGGGGCAAGGATGGGGAGAAGGATAGGAGCAAGGAAGCGGAGAAGGATAGGAGCAGGGACAGGGACAGGGACAGGGACAGCGAGAGGGACAGGCGCAGGGAGAGGGATAGCGGGAGGGAACGAAGAAGCAGCAGCCGCCCTGAGCGTCGCCGCACGGAGGAGGAGGAGATGGTGAGGGAGCTCCAGAAGGAGCGCGAACGCAGCGACCGCAACCGTGACTACCGTGACCGCGATGTTAGGTGAGAATTTCTCAACTCCCCAACCTCTCTATTGCAACACCTCTATTGCAACATCTGGAATATCTATTGCAACACCTGGAATATGATAGAATCGTTGATGTGATTTGCTTTAGTAGAAACCCCTAGGCCCTTGTGTAATTTAATGGTTTTTATCGAATTCCTGTGAAATTTATGTGTTTCAATAGGGGTTTTATCTTGTGTTAGCTATGGATTGCATTATCAAATAGTTAATTTTTCTTGGGGATACTTAAAGTGATTAAAGTTGTGTGAGATGGGTATAGGATGTTACTTATTGAATGCACACAATTTTTTTATCGAAAAAGTTAGTGATTATGTGTTGAATTTGGTTTTGCCTGTTCTTTGTGTACACATGGAACATAGCGATGGTTCTATCTTTGGTGATCTGCATAGCTTCTAAATGTCTGTTGTAGCTTACTGTCATTATATCATCTAGGTTTGTCAAACTTGAATATTGAACATGAATGTGGGACTCGCAGATACAATTCGCTAGGGCAGTCTTCAGATGGTCTTGGCAATTGGTCCTGACTAAGGATATCAGGTCATGAATCTTCAATTTTTCTTTCTTGTGATGCATTTATAAGCTAGCAACTGGGCCTGGCTGCTAGCCTACTACGTTGAGAGATTTTTAGATAACTGATTTTTTTTTGTGCTTATCAAGGGTTTCTGATAGGCAATGATTATGCCATCTGTAATTTTGATATTTTTTATTCATCATCCTTTGATGTGTTGATTATGCTGCTTTTCTCTTTTCTCAAGTTCCTTTTTTATATGCAGACGTAGGAAAGATGACGGTGCAGAGCCAGAAGCTGATCCAGAAAGAGATCAAAGGACTGTATTTGCCTTCCAGGTTGGTTTCACAAGTAACTTTTTTATTTTTCTTCTTTATGCATTATGCTAATGTTCATCGGCATTACTGTAGCTATCTTTGAAGGCAGATGAAAGAGACGTCTATGAGTTCTTCTCAAGAGCAGGGAAGGTGAGAACATGTTTACATCACACTGCTCTGATTTGAAACTGTTCCCATCTTACAATATTTTTATCTATGTGCATAGCATTGATGAACACCGAAACTTCAAATTTATGACATAGGCTTGGACTGATTAATTATTTTGTTAATATAGTTACATTACATATGAGAAATTGACAGACATTGTGTTTTTCACTTGTTTATTATTGACTCATCACTTGTGTTGAAATTATGTGATTGTTAAGATTTCTGGTTGTATTAAACTTTTATCCAAGCATCTAATGATTGCTCTTACTCTTCTGTGAAGGTCCGTGATGTTCGCCTTATTATGGACAGGAACTCGCGGCGTTCCAAAGGAGTTGGGTGAGTTCTTGGTACCCCTTTATTTGCTCTGATGTACAATTGTACATTCCTTTCACTGGATGTTTTTTCTAGAATGTACATGTGTTCTTTGACTTTAACAATTCGACTTCCAGAATATGTGGGCTAAAATTTTGACCCGGCCATAGGATTGTTGTTAGTCATGGATGACTCCTTGCTTCCATAACACATGCAAAATACTTTGAACATAGCAAATATGACATTAGAAAAGACAATAATCAAACAGTTTAAGCACACAATATCACCAATTTGTCGTTTGATGGAACTTTTGGGGAGTATCAGGAGCTTTCGAATAAGCATGTTACAATCGTGATGCATGTTTTCTTGTAAAAGCTCAGAAGCATATTGAAGCCACCAGCAGTGGTAGATACATGTTTCATGCTTAAGTGTGCTAATTTGGAACAAGTGCACACTTGCAAACAAATATCATTACACAAGCAACAGTAGCATTGCTATGTCAACTAGGATTACCCAGATCTATGCCTGCTCTTGGCAAGAGAACCATAACTCAAAAAAAAAAAACAAGTGTGCTTCAATCAAAATCTACTTGTAGCCTGGGCACGTGCCAGTTCAACTTCCAAATGGTATGCCTTGCTTGAGTATACATTAAATTGCAATTTTGTACACGCTTTGTCTAGTCTGGTTTAGCTTCTTATTAGAGTTAATGCTATAGGATAAATTTGGTTACTACGACAAATGTCTCCTGAAAAGCTTTTTATAGACAATTTATTTTGTTTAAATTTCTCTTTGGAAATCTAATTGATTGGTAGTTTTTTTTGTTTTGAATATTACTTATCAGACTCTACTACATTTTGTTTTTTGATCTATTTCTGGTTGTATAATTGCATAAACACTTATATAGTTCGTAATTGATTTTTTTTCTTGGGGAACATTTTTCATCAGTTTGTCATACTCAACAGGATTGCACACTGAAATATTTATAATTTGGTCTACCTGCTGGGATTGTCGACAGTTACAAGTAAGATGGAATATTAGATCATTCTGATGCCGTCAGCAATCTTGGACAGTTTGATTCCAGATTATTTGACAAAACAATTGGTGCAGGTTTTTAGGAAATAACGAGGATGCCCAAGAACGAAATTTAAAAGTTTGCTGCACACAAAAGTTTAATCCAAATTTCAAAGTTTCTGCGAGCTTATGAAAAAAAGACTAACATATATGAGACTACTTATAAAATGTACTTCCTTGACAGTTTTTAGTTGGATACTCTGATACGAGTACTAAAGATCTATATAACATGGCAGGTACATTGAGTTCTATGATGCTATGTCTGTTCCAATGGCGATAGCTCTAACTGGTCAGGTGCTTCTTGGGCAACAAGTGATGGTTAAGCCCTCAGAGGCTGAAAAGAATCTAGTTCAGTCAAACGTGGCATCAGGTGGAATAGCTTCAGGTGGAGCAAGAAAGTTGTATGTTGGCAACCTACATTCCAATATCACTGAGGATCAATTGAGACAGGTGAACCACTGAATCTTTTAGCACAAACAGTGATACATTGCTTTCCCAGTTTGTAGATGAGAAAACATAGTAAAATAATGACAAAATTGAATTAATGTGCGTGGTTTCTTTTGTGTCATTGCTATCTCATTTAGGTGTACGTGGTTTCTTTGGTTATTCATTTTAATATAGGCACAGCTTAAGTACTTAATGTCTAACTTGCTTATAACACTAGTTTGAAATAACATTGCTGTGCCACTGAAAAGTGATCCTAGAGCCATTTTGTCTTCCTCAAACTGGTTGCTGTTCCCCAAATTATTCACCAAAATTGTCCTGAAATAAATAACTTGTGATAAAGTACCTCATGTTGAGAAAACAATCTTCTAAAATTTTCATTCAATTGCTAGTTGCAACAAGTTTGCAATGTATGCAAATTTTGTTTCTTCTTTTCACCTCGAATAAAACAATTCTATGTAAATAATTGTTGGCTCTGAGATAAAAGGTGGTATTTTTGTCAACCAATTGTACATGAAGTATTGAAGTGGGACTTATTTGAAGTTCCTTAGTGAACAACAGTAGTTGGACGTCCTGAATATTAATATTATCCTTTGAGAAAGATGCTGCTAGATTTTGACTTTTTGTCTGAAGTACCATAGCTGATGCTTGTACACTTTTTTAATGTGCATCTTGTTATATGTGGTAATGAATACTCCATTTCAGGTATTCGAACCATTTGGGCAAGTGGAGCTTGTCCAGCTGCCGGTAGATCCACTAACCGGGCTATGTAAAGGTTTCGGTTTCATCCAGGCAAGTTTCCATATATGCCTTGAAGCTCTGAACATCTGACCATGAAACCCTGTAATGCTAATTATTTTGTTTTGCAGTTCGCACGGCTTGAAGATGCAAAAGCTGCTCAGAGTTTAAATGGTCAGCTTGATATTGCTGGAAGAGTAATTAAGGTAAATTTCTTAATATGTATATAGTATAGCTCAAAGATTTGGAACATGCTAAGAATCCATCTGACAAGTATTTGTTTCAATCAGGTCTCGGCTGTTACTGAGCAAGCTGGTTTGCAAGTTGGGGGTGCAACTACGGGAGATTTAGATGATGATGAAGGTGGAGGTTTGGTATGTTTTCCAATCCTTTCCACTTCTTTCCTCTTGTACAGTCTTTTGTAAATGGATTTATCATATTTTATAGCTCCTTTCTTTTGAAAATTTGGGAGTATGCAGAGAATTTTTAACTACAATTTTATGGTTTGGGCTCACACTTGCTAAGTTTATTTTACCTAATACAAATATTTCCATGGAGTTAAAAATTGCTCAGAGTTTAAACTGTCTGCAATTTTATATCTTTTGCTCATATATTACACTTTACACCAAATAGTACTTGCTCTACAATAAGAATGGGTTAGTGTGGCAAAAATATAGAGCTGAGACGGATGAGGCATTTTGTGGTTAAAAGTGTTTTATATTGCACATTCTACCAAATGCTAATTCTACAATGGGTGTCATGAAAAAAAATATTTATTGAGTAACTCTTTCCTGGAAGTATTTTTTTTTGTTGTGCAATAGCTATTCTCATTTCGACATAAACAGTAATTTACATGAACTATGTTTTTCTTGATGTTTATCCTTTTGGGAAGTACAACATTATTAATAATTGTGGCATGGCATCTTTGCTTTTTTATGGAAGTATAACTGTACTAATAACAGCATGGCATCTTTGCTTAGGTTGTCAATATGTACCAGTTCAGATCACTTACTGATATTAGTCTCCTAGAATATGATTGTGATGCCCCTTCTTTGTTCTCTGCTTATACCTACCAGTGTTTTTGAAACAATAACATGCTAATATAGTGATGGTTTAACTTTTAAGTCTCTTCAAATGCTTATTTTGAGTTTTTGACCATAGGAAGGTGGGTTGCCAGCTGTATGTTTAGGTTATCCCTTGGTCACTATAATTTTGAGGTTGCAGCCACATCTTTTTATTGCTGCTAACTGTGTACTCATTATGTTGTATGGGAAAACCAGGAAATATGCTGGGCTATACACATCACATTTTTTATTTGCGTATTCATATTTTAATTAAATATGTGCAGGCATTAAATGCAAGCTCTAGAGCTATGCTGATGCGTAAATTGGACCGGAGTGGCACTGCAACCAGGTATCTTATTTGTTACTACGCGCTTTTCCTGCTTTTGCTATCCTTGTGATATGTTTTTTCATTTTTCATGAGGGGACCAGCTGCTGTCTTGATTCATCTTATCATGTCTAAAACTCTATGGGGTATCTGATTTGAGGAATGGGTTGATCCTAAAGCTGATCTTATGTGAACTAAGCCCAATATTTTAAAATTCTGTGAAAAATGTTGAGTAGATTAGGATAAAAATTGAGACACGTGCAGATTGAGATGGTGAGATCCTAGATCTCTCTGCTGGAGTTATATGTGCAATCATGAATGTTGAATCATAAATGTCAATACTTGATAGCACCTACTGCCCTATCGGCAGGATTCATGTATAGTAGTTTTGTCAAGACCATTCTTCATGGTTTAATGGAAACATTCTTATTTTTGTAGTACTGTTATACCTCACATTCATTGAAAATTCCATTCACTGAATCTCCTTTGATAATTTCTTTTGTGTTTATCTGCAGCATAACTGGTGGTATTGGTATTCCTGGTGTGAACACATCTGTTGAGTTACCGTCTGCATCGGTTACTGGTGCTCCTCTGCCAACCACTTCACTCATACAACCAACAATACCTGCTATTGGAACAGTTCCTGGCATACAAATTCCTGGTACTCAATCTGCAGATATTGGTTCACCTACTGAGTTTCTATTGCTGAAGAACATGTTTGACCCTGCAGTGGAGGTATTTATATATTTATGTTTTAGTTTATCGCTCTGTTCCTTCAATTTAGATGGCCACTTTACATTTCTTTATTGTATGATTCAAAATGTTATTTGTTTTAGTTTCAGTTCATCAATTGTATATGTTCGCATCTGACCGACTAATTGAATGTTCATTTTTAACAGACAGATCCTGATTTTGATTTGGATATTAAAGATGATGTCCAGGATGAATGCTCAAAGTTTGGTGCAGTAAATCACATTTTTGTTGACAAGTAAGTAATTGGTTTACTTTTTTTGGCGAATCTTAATCGTATTAGGATAAGCATACCATGTTTATCTTTAACACCTATGATTTGACTAATATGACCATTTATTTTGCACAAATGCTCACATGTCATCCATGCCACCCAAGGGTTCCTGTAATCTTGTTAGATTTATCAATTTACTAAGCTTTTTGTGGGCTCTGTGCTTTCTCTAATATACTTGGAAGGCTGTCTATAGTTTGTAAAGGTTCATTTTTATTGCACTAAAACTGTGGTAGATTCAATCACTTTGGGTACAAATGGGCAATGCCTATCAACAAGCCTACAGAATGGTTCATATTGTGCTGGCTGTTCGTTTCCAACTTGGAATCGTCTAACCTTGTTTTTTTAAAAAAAGAAAATCTAACATCGGCTATTATTGCACAGAAATACTGCTGGCTTTGTGTACCTTCATTTCGACAGTGTAGCAGCTGCGACAGCTGCTCAACGCGCACTGCATGGTAGATGGTTCGCAGGAAAGATGATTACAGCGACCTTTATGGTAAGGGGATAACATCATCCTGGTATTGTTTTTGCATATCGTGTTGCTTATTTTGATTGAGATCTTTTTGCTTTCAGACTGCTCAGCAGTACAAAATGAAGTTCCCAAACTAG</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA033023