Os11g0132000
| Gene Name |
Os11g0132000 |
|---|---|
| Description |
Similar to Arabinoxylan arabinofuranohydrolase isoenzyme AXAH-II |
| Version |
NM_001189405.1 GI:297727940 GeneID:9268316 |
| Length |
5420 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0132000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:1444033..1449452 |
| Sequence Coding Region |
1446624..1446837,1447439..1447464 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008404:1444033..1449452 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ggcattgcatttattgtcatcccatgtttattatttcgaaatactttgattttcttgctacaggatgcaatagacagtcttgagtttgcaagagggagtaaagaatcaacatggggctctgttagagccgcgatgggacaccctgaaccattcccactgaagtatgttgcactcgggaatgaagattgtgaaatattcaagccgacataccaaggtatttgtaagcgagtatgctgttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>GIAFIVIPCLLFRNTLIFLLQDAIDSLEFARGSKESTWGSVRAA MGHPEPFPLKYVALGNEDCEIFKPTYQGICKRVCC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2592..2805#3407..3432#tcatctcttgtgaacgattccctcctgcctcctccctccccgcacctgcacctgcacctgcaccatctccggcgtctctcgcggccggatccgccgcctcctcacccaccgcaccggcggcgccaccccaccgcctcgccctaccgcccaaggcctcccctccctgaatacgcagccccgatgaactgctcctccctccacaaaccccctaccccgccagatccactccacggccccaccccaacacaataccctaatccattcgccctctgtcgcgccggggaggaaagccaaaaggaggaggaggaggaggaggctcatcggcgcagggatgctcgagattcaccggcgacctcgttttggttgggggtggtgtgtgtctgtgtgcgagaaggctggaggttgaagaagcaacatggatggttggatttgtgaattgtgatcttactgccaagaatatttggggagaaatcaatcacctcatgtatagcaatgttgaataagaaaacattttccccctcaataaataaataaataaataataatatttgaagtttaactttaactgaacttttgtctaatttcttgctttaggttttgaagctggagccaacacatcaaacattgacccatggtccatcattggagatgaatcctctgtgcacgtcacaactgatcgctcatcctgtttcagtcaaaatccggttgctgtaaggatagaggttgtctgtgacgattgtccagctggtggtgttggaatatacaatccaggattctggggcatggtataagttctctctcagcatatagcagctcattcccatatgaatatgcaaaatagatcttgtaatcgaaagaatcttttttctgatgatagtttaaagtatacggtgctgccaccgaaggtaattatagcaaagttattattcttatcaaaatactgaagctaacagataactaagctaacctattttttgtttgctttcaatttgcattgatcgcataatgctggttttctatcttattgccgtgcatcacttgcttggaaagtgtaatcagtgttatagcttttcgtcaaaccattttcacttttaccttctgatattttaatgtgattatgatcatttcaattttcagaatgtagaagaaaggaagacatataatctagtcatgcatatcagatcattagaatcggtggagttgacggcttcactcacatgctcaaatggatcgcaaaatctggcatcaaattttgttcggtatatattttttttccttagcactgagattaagaaaaagctttctcaatttctcgctctctctctctctctctctctctctctcttgttcgctagctaactcataggattgtacatcaaatttttcagagaaactgatttgttaaattggacaaagatagagctgcagttactagctcatgggacatgcagaacttcaagacttgaactgacaactaggagaaggggagtgatatggcttgatcaggtgtcactcatgccttcagaaacatacaaggtgcattgccttttatcttcttattgctattgtcatcatagcttgatccggaatctgctatcatcttatgaagaatggagaataatattcatgtactgaccccaaagatttagtcactagtataagcatgccaggttcaatgggcaccctcttcaaatcatgtatgctatttgacatttttcaagaatattcgaaaaaagtcatcataaaaatggtcagttgttctcatttctatctgacaaaaaaaaaaaattaacttatctgtaatcggtagtcctgtagagatgtgagatcaacttattgttccttaatctagccatgcttactattagttcacaggagttgttgataggcatttttcttccatgtatgcagggccatggttttcgccaggaactcatgtacatgcttttggacttaaaaccacggtttctacggtttcctggtattatgattgttttccaactggtaatcaattttggttgccctgtaatttaatcgctggcattacatttggcagggggttgctttgttgaaggcaattggttaaaaaatgcgttcaggtggaaggaaactattggtccatgggaagagagacctgggcactatggagatgtttggcactactggaccgatgatggccttgggtattatgactttctccaggtatggattgattaatgtcaaatgagttctctcttggtctcatcatatctgatcatttgtttacttcgaactgttcatgtcttcataaatcttgctgaagacttgggtgctgctccagtcgggtgctcaacattggtaaatattctgcatctactttgtcttgttttactttttttttaatcttttctcctcgcataccaatgaactgctcggagtttttatcttgtgatttagggatgagtcacagtgatgtagttaatggaactatgcttacaccttttgtaaaggtatgttttcgataccctacaattttttgaagtatggttgagatgaagattggcttctcatgatgtaacagaaaacagttataacttgtgaatattacataaggcattgcatttattgtcatcccatgtttattatttcgaaatactttgattttcttgctacaggatgcaatagacagtcttgagtttgcaagagggagtaaagaatcaacatggggctctgttagagccgcgatgggacaccctgaaccattcccactgaagtatgttgcactcgggaatgaagattgtgaaatattcaagccgacataccaaggtaaattttgactaaaacaaaatagtatgtttatggtccttcatgtcaatgctgtgataattaccaaaattcattattctgttctctattgatctgcaacaaaagcgctatttcatttacctgcaactcttttgactctgagtactataatggaagtattctaggaaaaacaaatgaaaataggttaattgtctagcctgttgttatgttttgaaacagacacactttactagttgcatgtgaacaaagctaaattgactatcaattataattaatgttgtttcagtacacttcaatgctctactgctatcaccaatatcctaattttcctgtgatatcatataaccatataattatgctgaacagaaaattaccccaagttctacaatgctatacgagaggcttatcctgacattcaaataatttcgaactgtgatggctcgtctaggccacttgatcatcctgctgatctgtatgacttccatgtaaaatactaaccgaagctaatttggttgtatcattctccctgttttaaaattatgtcttactgttttctcagacagtcaaaataaccattgattatgctattgtttcactccaggtatttgtaagcgagtatgctgttaataatgacaaagggggtgatgctggcaatggaagcctccttgcatcgttggcagaagctgctttcctcactggtttagagaaaaacaggtgatccctttagttcctctcaggatactctctcctttatcttgggtttagagcattagagtatattggcaatttggcatatctctgtatttggaagtttagtatttgtcatcccgatactgacttatccctaagaggcttttcttatctcgaagatagtttcttaacctccaagccatgcatgctatataaacagcccttgaagcttaatacaataattattcatcttatttcgccaatccctctcgtttacacagaggaaatataaaatcatgcatataatgttgtctccagattatgcatgaacataaaagatctttgaagggattcctagacaaatggttaatttgtctctacaattattatctcattcttctacttcaccacagaaggaaaataactatttcagaaattataggaaaactagtatgtataaatttctaatttgtaaatatttctttttgcggggaagaggaagctttattaaaaaaacaaatatttacactgaattggactttgcttgcttctttgcagcgatgtcattcagatggcaagctatgcaccactcttcgtgaatgaaaatgatcgcacgttagtattcatggtttagtactttactttgtttaggattctagcatctgttctctctttgacaattaatgtgtaaatctaaaaaccagctggaacccagatgcaattgtcttcaactcctggcaacagtatggaactcctagttattggatgcaaacatatttccgtgaatcaagtggttctgtgattcatccagtcactatcagctccagctactttgatttactggcagcatctgcaatcacctggcaggacaatgaggatatctttctgagggtaaaggtaaaccaaccattccagtttctccaaacttgtataccattgcttgaaatcattgatcgacaagcgccttagtgtttagaataatgtagtttcaacaatataaaattgattgaagcaccggttacttgcgtaacatctgtcttatttgttctactgctggagtaatatgctcatatatattagaacatactgattctatctgcagatagtaaactttgggccaagtgctgtgaaccttacaatatcttcaagtggacttcaagctggtgtaaatgcggcaaaatcaactgtgactgttctcacatccagcaacttactggatgagaattcatttagtgaaccaaacaaggtaagatagtcgttatttgatcactatttgtttcataattatgcactgaaatttagcagaggacagcttttccattacaacattatagtctgttaggacatatgcccttatttttgaagtaaaactgtgggagctgtatgtctcctatttgtagtactcaaagtagtggtgtgtggtacataagcatataccctttgtagatctatcttctctgttcttcctt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