BGIOSGA027088

From RiceWiki
Revision as of 07:37, 26 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA027088| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027088, complete gene.| tag = OsI_289...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA027088

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027088, complete gene.

LocusTag

OsI_28994

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA027088-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA027088-PA

Length

5713

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:18032843..18038555

Sequence Coding Region

18038348..18038555,18037867..18038075,18035903..18036003,18035237..18035318,18034806..18034870
,18032843..18032957

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:18032843..18038555 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:18032843..18038555 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGACCTAAATTGCATAAAAGCTTATAAGCTTGATGCACTCAAATCTGTACGGAAGACCAATGAAGCAAAATATATTGGCGAAGCAGGCAGCTGCACTGATGCAATTGTGACACTGGCAGAGGACTCTGAGCCTTGTATTAATAAAGTCGATGCTGGGACTACTAATGCCAGTGAAGACAGTTCTACTACATCAGTTGTTCAGACTGATAACAAAAAAACAGATGATAAAAGATATGTGAGCAAGGCAGACCTCAGGAAGAACTTAAGGCGAATGAGGAATGGACCAGGAAGAAATAACTGCTCAGGTGGTAGAGTTGAAAATTCTAAAGGATTTTTGCCCAATAGCTTTGATCGTGTCCTCCTTGATGCTCCATGTTCTGCACTTGGCTTAAGGCCTCGCCTCTTTGCTGGTGAGGAAACGCTGGAATCACTGAGAAATCATGCGACGTACCAGAGAAGAATGTTTGATCAAGCTGTCAAGCTAGTTCGCCCTGGTGGGGTGATTGTTTATTCCACGTGTACTATAAATCCAGGAGAAAATGAAGCTTTGGTCAGATATGCATTGGATAAGTACAAGTTTTTGTCGCTCGGATCACAGCACCCAAAAGTTGGAGGACCTGGTATTGTTGGTTCATTTGAGCTATCAACTAAGAAATATACTGAGGAGTGGTTGACAAAGCATGAATCACAACTTGTCCAGAGATTCGATCCATCATCAACTCTGGATACAATTGGTTTCTTCATTGCAAAGTTTGATGTTGGGCAGAAAGACGACTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDLNCIKAYKLDALKSVRKTNEAKYIGEAGSCTDAIVTLAEDSEPCINKVDAGTTNASEDSSTTSVVQTDNKKTDDKRYVSKADLRKNLRRMRNGPGRNNCSGGRVENSKGFLPNSFDRVLLDAPCSALGLRPRLFAGEETLESLRNHATYQRRMFDQAVKLVRPGGVIVYSTCTINPGENEALVRYALDKYKFLSLGSQHPKVGGPGIVGSFELSTKKYTEEWLTKHESQLVQRFDPSSTLDTIGFFIAKFDVGQKDD</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..208#481..689#2553..2653#3238..3319#3686..3750#5599..5713#ATGGACCTAAATTGCATAAAAGCTTATAAGCTTGATGCACTCAAATCTGTACGGAAGACCAATGAAGCAAAATATATTGGCGAAGCAGGCAGCTGCACTGATGCAATTGTGACACTGGCAGAGGACTCTGAGCCTTGTATTAATAAAGTCGATGCTGGGACTACTAATGCCAGTGAAGACAGTTCTACTACATCAGTTGTTCAGACTGGTAAGGGACATGCAAATTTGTACCCATTTCTCTTCATTTTTTATTATTTAATTTTATAATGGTGGGTGAATGCGCATGACACACCCTGGGATCACTTATATTTAATTTTATTATTTATTATTTAAATCTAACCTTTTTTTATTACTTTGCACTTTGCGGAGACCAACTAAACACTCAGAACATAATTTTCCCTAATAGATATATGCACCTGTGCCTTAAGTATATGTCGTTCTTAAGCTGAATTCAGAAATTTGATAATTTTGTTTTGTTAGATAACAAAAAAACAGATGATAAAAGATATGTGAGCAAGGCAGACCTCAGGAAGAACTTAAGGCGAATGAGGAATGGACCAGGAAGAAATAACTGCTCAGGTGGTAGAGTTGAAAATTCTAAAGGATTTTTGCCCAATAGCTTTGATCGTGTCCTCCTTGATGCTCCATGTTCTGCACTTGGCTTAAGGCCTCGCCTCTTTGCTGGTGAGGTAAGGGTATTGCTAGTTTGGCTCACCATATTTAGAGATGCGGTTGGTCATAAATTGAGAATGGCTTTTAGAATTGGCCTTTTACTTTGTCTGTACTCGTTCCAATTCTAAATGTAGATTGTGTTTAGCCTTCTTAACTCTTTCCTAATATAGGTCATTTTAAAACTTGTATGCGACCTTGTTCACATTTTCTTGTTTTGGCTTGGCAAATAAATGGTACTACTCCCGGAAATTAATTGACTCATCTTTTTCCCACGTAAATATAAGTGATGGACAACAAAATCTTTTCAGTTACTTTCTTAATCCTGGGGCACAAGTAAAAGGACTTACAATGGGAACAAGATGGAGGACCACTTTTCTTTTATTTGTAGAAAAGGTGCAATGCAAATGATAAACCTATCTTTAGCAAGTAAACCTACATGTTCAGGATCTGTTTCTACTGACTGTTAGCATAATCCTTGCTACTGTAGGTTCCTTAGCTAGTAAGAATGTACAGCTGCTTACAGCTGGTAGTAGTAGTAAATTTAGACTTTACTTTAGCTGTAAACAGCAAGATGAATAGTATGTCGGTTACTGTAGCATACTGTAGCACCGACTTAAAGTCCTATAAAAGGACATATACCCCTCTTGAGTTAGTAAGCTTTTCAGCTCATTTTCAGTTTCAGTTTCAGCTAGACTATTGAGTGTAGTTCAGAAGTGATCCTACCAACACTGACAATGGGTATTTATGTTTAGTGTCCATACTCTTAGCTATGCATCAGCACGCACACCTACAATGGTACATTGGGAAATGGGTTATTTTATCATGTGTAATTCTTTTAACAAAAAATGGATGTTTTTAGTAAATTAAAATATTGGACATCCAGGCCAATTATGTTCATTCATAATTTGTAATCAATATTGAAAATGTTAACCAAAGATTCGAGTTTACCATATTTTATAATAAAAGAATGGTATGTGTGGCATTATATGTATTTGAGGTATTTTAAAGAGTAAATTGCATTGGTGGTACACGAACTTATTAGGTGGGTGCAATTTAGTACATGAATTTGTAAAATGCACGTTTTGGCACACGGACTTATCTAATCCGTGCGAACTAGGTCCAAAATGGTTTAGCAAGGTTAATTTTACCTAGCTGATGTTAATTAGGATGTGGCATGCATACGTCTAGTGAGTATGCATAAAACATGCTATATTTATAAATTTATTCTCTACTTTATCTTGAATTTCGTATGTTTCTAACCCATGCATCATTGCTCATTTGCCCGGTATTTTATATCTTTCTCTACAATCACTATATCTCATTATATCTTTTTATTGAACAGGTGCATGTCTAAGTAGCAACCTTCTCATATATATGTTTACATAGTATCCTAATCAGCACCTAAAGCAACAAAATTAGTCATGTAATGTCCTTTTGACCTTAGTTCGCACACGCAAGATAAGTTCATGTACCAAAACGGGCATTTTACAAGTTCATGTATTAGATTGCACCCACCTAACAAGTTCGTGTACCGCTGATGCAATTTACTCTATTTTAAAAGTTGAAATTACATATTTTAATATGTTGGTTAAAATTATCTTTGGAATGCTTATTCTGATTAAGGAAACATTTTTATACTGTAATGATATGCTAGGTACATGAAATTCATTAATAAGTTGAAATTTATCAGCCTATGGCATCTCATATTCTGTAAGCCTGTACCTTGCCATGTTATTGGAATTTCCAAATATGTCATGTTGTAATAATCTTCTAATTGTTATAGAAGTTTGATTTGCATCTTTGCATTCCACCAAGCTCAAGTATTTATCATTTTATGAGTTGCTACAACTTCTAATATTTAGTGCATTTCAATGTGGCAGGAAACGCTGGAATCACTGAGAAATCATGCGACGTACCAGAGAAGAATGTTTGATCAAGCTGTCAAGCTAGTTCGCCCTGGTGGGGTGATTGTTTATTCCACGTGAGTGTTCAACATTTTATGTTATTACTGTGTATGAGAACAAAAATTATGTTACTAAGAAAGATGTTAAACACACACATGTGTGTGGTAATCAGATATCCATTCTATTTGTACTTGAAATTGCGATAAACTACAGAGCTCTAGACAAACTTAGTGTTGGATCCAGAAGAGTAGTGTTCAACGGCTATAGACGTATCAGTCGAGGATATTACTTACTGAGCATAGCTTTAAAATTAGATACCTTCTGTATTCCCTAAACCCAATAGTAGGTCTCCCCTTTCCTCTGTTTATAGATTGTACATAAATAACATAATCCAGATTTCGTGTACAGTACAGTTAGCTAGCTGATGTACCAGTACTAAAGAAAACATAATAATGTTGGGCATGACATTCTAGTCATACATGCACATTTTGTTGGTATTCAGGTAGTGAAACAGTCAAATTTGTCCCATCTATATGTATTGATCGGTATTTGGTGGAAGCTTTTTATGTGGTCATTCCAAAAAACACATAACTTACACAGTTATTCTATCTGGAATCTACAATTCTACATACCATTTATCCTAGTTGTTTCTGCTTTGTAGGTGTACTATAAATCCAGGAGAAAATGAAGCTTTGGTCAGATATGCATTGGATAAGTACAAGTTTTTGTCGCTCGGATCACAGGTAAGTTCCATGATGTAATTTGCTAAATTGCTATGGTGAGGATTTTTAATTAGTAATTTATTAGATGGAGAACTTGAAATGTACCAGCCAAATTGTATGTTTTACAAATTATAATTTTGTTCAGTTTCGTTACAGATATGATGACTAATGGATTGATTTGAAACTGATAGATCTCACTTTAGACAAAGTTGAACCAAATTAAAGTCTGCACATATTTAATCTTGCTCATGCACTTCTGTGACAAACATGCCTTTCTTTTTCCTAACTTAGGATAGTAAATAGTTGCCCTATCTCTGCAGTTACAATCAATTATATTTGTTACTTTTGTATGCTCTATAATTTCATTGTCATTGTTAATCTTTTCAGCACCCAAAAGTTGGAGGACCTGGTATTGTTGGTTCATTTGAGCTATCAACTAAGAAATATACTGAGTAAGATTCTGCTATATATTTCTTGGAACATGGGACCTGATCCTATCCAATTTCTGTGATTATGTTATTGCACACCTATCTGAAAACACTGAAATACGGTATTATGCCATAATTTAGGAAAACTTGTATGTAACGGAATACGGTAGATTTGGATTGCATCACAAAGTAATGTAGTTTTGTAGGACCGATATCTGCTATAGAGGTGGGTGAATATAAAAGTTCTTCCCCAAAATAATCGTTCAAAAACCTCTCTGAAATATCACCCTTAGACCATAGTTACGTGACAAGCTAGATCTAGGAGGAGGTGAAGAAAAGTTGCAAAGAACCCTGCTCAGATGAGGGCTTTACCCTCTCAAAAACTTCTCTGAAATATTTCCCTCAAGACTATATATGACAAGATAGATTTAGGAGGAGCTTAAAAAAGCTGCAAAGAATCAAAGGGCCTTTTTGGGGAGCTTTAAGATTCTGAGAAGCAGCTGGTTGATAGCCAGCTTCTGAGAATCTAATTCATTTTCTGGATTCTATAACTACAGCTTCTCAGAATTTAGACCAAAAGTTGGACTGTTTGGGGGGAGCTTCTGATTCTGGGAGAAGCTCTAGTAGCTAGAAGCTCCCCAAACAGGCCCAAAGTATCTCGCTTAAACCCACAAAATCCCCAAATCCTTCGCCTCCCTCGTTGCTATTCCGTACTTCATCACCACCCACCGCTCCCTCGTCACTACCTCGTACTTCACCGCCTCAGTCGCTAACCTAAGCCATCGGGGGAGAAAGGCGAGGGATTTTGTGGGTTTCAGGGTGGTATTGTAGTGCGAAGGGGCAAATTGTAATTCTTCCACCACTCTTCTCTGCGGAGGGGCTAGCTGTAAATGTGTTGCCTACGTGGAATGCCACGTCGGTGGTTAGCTTTGGTCAAACGAGATTTGGTCGGCTATGGTTCATTAAACCAAGATGGTGGACCTGGATGTGCAATTTTCAAGTTTACGGACCTAAGTGACACCCGCTCTCAAGTTTAAGGACTGGCCATATATTTTACTCATTTGAATTTATTTATGCAGTTTAAATTCCCGTCATTTAAATTCCGCGGAGGTTTCTGCTTCTCTTCCTTCCTGTTTCTTCGTGAACCCTATGCTTGCACACCAAACCTTGTGAAGCCCGTTGCAAAGATCGCCCTACACAGTGTACGTCCATCGTGTGCCACCTTGTGTCCAATCTTGTCACCCGGCGTACTGATCGTTTTGGACCCCAACTCCTCTCTATGTTTAGTCCCGATCCCCGCCACTGACCAAGATTGACCTCTAAGGATCTTAACTTCAGTCACACCTTGTCACATGGCATCCCGACCGTGCTAGACCTCTGCTCCTCCCTTAGCATAATTCTGGTCCTCACCATTGACCAAGGTTGACCTAAATCACCTGCACACACATAGACTAAACAACTGATTTTGGGCACAGGGGAACCTGACCCACGTTAGTCGCACGCAAGTCCATAATCGCCAACATTCCAAACTAAATTTCCAACCAAAACCAACTCGTGGTGTTCCCAAATTCCTTGCCAATTTTCCACCACAAGTAAACCAAAACAACACTTGGTTTCACAAGTTCCTGATGAGAATACCATTTTGCATGCCTAGGCATTAGCAATCTTTGTTAGCTTGATGTGTTGTCCTTGTACAAGAGAACTGTTTTTGCCAAATGAGCTGATGGGTCAATCAAACTGATGGATGGGCCATTTTAATAATCCTATCGTTATGTGCTATATGGATCATAATCTCCTTGCTATTTGCTACTGAAACTATGTTTTTACTTTTTCCCCCCAACAGTATGTTGAACTGATAGAATGCTTATGCAGGGAGTGGTTGACAAAGCATGAATCACAACTTGTCCAGAGATTCGATCCATCATCAACTCTGGATACAATTGGTTTCTTCATTGCAAAGTTTGATGTTGGGCAGAAAGACGACTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA027088