BGIOSGA027109

From RiceWiki
Revision as of 07:37, 26 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA027109| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027109, complete gene.| tag = P0488B0...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA027109

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027109, complete gene.

LocusTag

P0488B06.37

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA027109-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA027109-PA

Length

8098

Source

Oryza sativa Indica Group 

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:17525881..17533978

Sequence Coding Region

17533763..17533978,17533209..17533302,17532186..17532374,17532028..17532087,17531782..17531943
,17529629..17529717,17528011..17528232,17527817..17527904,17527624..17527733
,17527238..17527331,17526293..17526481,17526143..17526202,17525881..17526056

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:17525881..17533978 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:17525881..17533978 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCCTGATATCCAGTTAGGGTGCCACACTATAAGGTCCCATGGAACCAGTGTGGCAAGACTCCACATGTATGACTGGATAATACTTCTCTTTCTTGCTGTTGTTGATGGGCTGCTAAACATAATTGAGCCTTTTCACCGCTTTGTTGGACGTGACATGATGACAGACTTGAGATATCCACTAAAGGGCAACACAATTCCATTTTGGGCCGTTCCAAAGTTTGATAATGTCACTACAAATGTCATATGCCATGGAGAAAAGAGTGTTATCAAGGAAGGCCACAAGAGCTTTCCAAGTGGGCATTCTTCATGGTCTTTTGCTGGTCTAGGTTTTCTTGCGTGGTACTTGGCTGTTAAACTTAAGGCTTTTGATCGCAAAGGCCACATTGCAAAGTTATGCATAGTATTTCTGCCTCTACTTGTTGCGTCCCTTGTGGCAGTCTCTCGAGTTGATGATTACTGGCATCACTGGCAAGACGTATTTGCAGGTGGCATTATAGGTCTTACGGTTTCTTCGTTTTGTTATCTGCAGTTCTTCCCATATCCATTTGATGCTGATGCTGTATGGCCCCATGCATACTTCCAACAGCTAGCTGACACACAAAGCAACGGCATTGCAAACTCATACAACATGGGACCAACAGACATTGAGATTGCTGACGAAGGCCATGGTGCCATTTCCCTGAGAGACACCAGTCCTATTTTAGACACGATGGAGTCTGCATCGTCTCCATCCATCCATTCGCTTTCGCGGCCGCGCGGCAAGCCGGGGAATGCGACGCTGCGGGCGACTCCGGCGCCGAGATCCCAGGGCATAATGGCTGATACCCAGTTAGGTTGCCATACTATAGGATCTCATGGCATTAAAGTGGCAAAATTCCATTTGTATGATTGGATGATACTTATCTTTCTAGCTGTTGTTTATGGGCTGTTCAACATAATTGAGCCTTTTCACCGCTTCGTTGGAAGTGACATGCTGACAGACTTGAGATATCCACTGAAGGGCAATACAGTTCCATTTTGGGCTGTTCCACTGATTGCAATTGTGCTGCCCTGGGCCATCTTTGGTGGAATTTACTTCAAAAAGAAAAATGTCTATGATTTGCACCATGGCATTCTGGGGATTCTATATTCGGTGCTTATAACTGCTGTGATTACTGATGCAATTAAGAATGGTGTTGGTCGCCCACGCCCAGATTTCTTTTGGCGTTGTTTCCCTGATGGAAAGCCTAATTTCAATAATGTCACTGGTGATGTCATATGCCATGGAGAAAGGAGTGTCATCAAGGAAGGCTACAAGAGCTTCCCAAGTGGGCATTCTTCAGGGGCTTTTGCTGGTCTGGGTTTTCTTGCGTGGTACTTAGCAGGCAAACTTAAAGCTTTTAATCGTGAAGGGCATATTGCAAAACTATGCCTAGTCTTTCTGCCTCTACTTGTTGCATCACTTGTGGCAGTCTCTCGGGTTGACGATTACTGGCATCACTGGCAAGATGTATTTGCAGGCGGCATTATAGGTCTCACAGTTGCTTCGTTTTGTTACCTGCAATTTTTCCCATATCCATTTGATGCTGATGCTATATGGCCTCATGCTCACTTCCAACAGCTAGCCGAGTCACGAAGCAACGGTAATGAAAACTCACACAACATGGGATGGACAGAGACCGACGCTTTCCATGAAGGCGCTGGTGCTGTTGCGCTGAGAGACACAAGCCTGGTTCTAGACTCGATGGAGTCTGGCAGGAGGTTTTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPDIQLGCHTIRSHGTSVARLHMYDWIILLFLAVVDGLLNIIEPFHRFVGRDMMTDLRYPLKGNTIPFWAVPKFDNVTTNVICHGEKSVIKEGHKSFPSGHSSWSFAGLGFLAWYLAVKLKAFDRKGHIAKLCIVFLPLLVASLVAVSRVDDYWHHWQDVFAGGIIGLTVSSFCYLQFFPYPFDADAVWPHAYFQQLADTQSNGIANSYNMGPTDIEIADEGHGAISLRDTSPILDTMESASSPSIHSLSRPRGKPGNATLRATPAPRSQGIMADTQLGCHTIGSHGIKVAKFHLYDWMILIFLAVVYGLFNIIEPFHRFVGSDMLTDLRYPLKGNTVPFWAVPLIAIVLPWAIFGGIYFKKKNVYDLHHGILGILYSVLITAVITDAIKNGVGRPRPDFFWRCFPDGKPNFNNVTGDVICHGERSVIKEGYKSFPSGHSSGAFAGLGFLAWYLAGKLKAFNREGHIAKLCLVFLPLLVASLVAVSRVDDYWHHWQDVFAGGIIGLTVASFCYLQFFPYPFDADAIWPHAHFQQLAESRSNGNENSHNMGWTETDAFHEGAGAVALRDTSLVLDSMESGRRF</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..216#677..770#1605..1793#1892..1951#2036..2197#4262..4350#5747..5968#6075..6162#6246..6355#6648..6741#7498..7686#7777..7836#7923..8098#ATGCCTGATATCCAGTTAGGGTGCCACACTATAAGGTCCCATGGAACCAGTGTGGCAAGACTCCACATGTATGACTGGATAATACTTCTCTTTCTTGCTGTTGTTGATGGGCTGCTAAACATAATTGAGCCTTTTCACCGCTTTGTTGGACGTGACATGATGACAGACTTGAGATATCCACTAAAGGGCAACACAATTCCATTTTGGGCCGTTCCAGTATGTTCTCGTTATGCCAGATAAAATTTTCTTATGGTTTCATCTATCGTTTGAGGCATGCAATTCTTTCTTGACTTGCAGCTTATTGCAATTGTGCTGCCCTGGGTTGTCTTTGGTGGAATTTACTTCAAAAAGAAAAATGTCTATGATTTACACCATGGCATACTGGGTATACGATGCTCTCATTTGTAGATATCTATTGAAGTTACATCTTTGGTTCATGCTGAACCATATAATTTAACCATAGAGTTTGTGCAGGGATTCTATATTCGGTACTTATAACTGCTGTGATTACTGATGCAATTAAGGATGGTGTTGGTCGTCCTCGCCCAGATTTCTTTTGGCGTTGTTTCCCTGATGGAATACCTGTAATCTCCTTGTGCTAGTGTCCTGATCTCAGATATTAAACTTCATGTAGTCTGCAGGTTATATTGAAGTAACAAATCGTTTCATTTTTCAGAAGTTTGATAATGTCACTACAAATGTCATATGCCATGGAGAAAAGAGTGTTATCAAGGAAGGCCACAAGAGCTTTCCAAGTGGGCATTCTTCATGTAAGATATGCAACGCATCGGTACTTTTAAGTTTTGAAGTACCGTTGTATGTTTCTGAGTTGATATCGAGCTTTACATGCCTTGCAACATGCATTTTTTACATCTGTTTCTCCACATTCTCTACATACATTTCCAAGGATTTTTCTCCAATTTTTTCTTTTGCAACAGTTCCGAGTATTTTAGTAGTTGCCTCAGCCTTCATGTAGGGCATTGTTCGGAGTACTGCTCTCCAATCTGATGTGCTCCTGGTAACTATGCAGGACATTTATGAATAAATGAAATTCTTGACTAGTTTAAATTCAATGCTATATTCTCTTGGTAACTATGTAGGACATTTATTGAAAAATTGAATTTATTCATGTTGGTACCCTTAACACCTATATGTTGTATCTATGATTAAGACTCCGAGGCTATCAAATAAATGGTGTAGCTCATCTTTTTCTTATAATTGTTTATACTTCCTCCTGTACAGAAAAATGTGTTTCTGGACATCCTCATGATATCTGACATACAACTTTGACCACTGATTTTATAGTAAATTATTTGTATAATCAGATTAAAGTATAGTGCTATAAAATTGTCAAACAAATCTATGAATATAGTTTTCATTTATCTAATAATAATTAAAGAGATTTGATGTTGAAGTTTTGAAAGTTTTGCTAGAGGGGTGTTCAAAACGCTTTTCATGACCAGAGGAGAGGGAGTATATAATTTTTTCCTGGCATGTAGCACCATATACAGTTTGTTCTCCATATATTTTCGAATTTCATTACTTGGTGGATCTGTTGTCTGTAATCTGACGTATGTGTTGTGGTTCTCACTCACCTTCTGCAGGGTCTTTTGCTGGTCTAGGTTTTCTTGCGTGGTACTTGGCTGTTAAACTTAAGGCTTTTGATCGCAAAGGCCACATTGCAAAGTTATGCATAGTATTTCTGCCTCTACTTGTTGCGTCCCTTGTGGCAGTCTCTCGAGTTGATGATTACTGGCATCACTGGCAAGACGTATTTGCAGGTGGCATTATAGGTTTGTTATTTTGAAGCCTTTCTCTCAACCATTTAGAACACTCTCGTTGTCAGAAAGTATGCATGGATCTCGTCTCATTCTTCTTTCCCCTTTTTCAGGTCTTACGGTTTCTTCGTTTTGTTATCTGCAGTTCTTCCCATATCCATTTGATGCTGATGGTACGTTTCCCTTCTGATATAGATGATATGTTGGACCTTGATCGACATATTTTACAGTATATTCATGTTCCTTTGCATTTGCAGCTGTATGGCCCCATGCATACTTCCAACAGCTAGCTGACACACAAAGCAACGGCATTGCAAACTCATACAACATGGGACCAACAGACATTGAGATTGCTGACGAAGGCCATGGTGCCATTTCCCTGAGAGACACCAGTCCTATTTTAGACACGATGGAGTCTGGTAGGAGAGGCTGAAACATGCGGCGACAAGTATCTTGATGTTGTGTGGATTCTTCGCCTTTCTGAGTTTTAAGTTCTACAACATGACTAGTTCGTACGGTTCCCCCATTTCCATGTACATTGCGCAAGAATAGGTAGAGTTTTGCCAGGTAGAATTGTGCTTGTCATCTCAGGTGATCGTCTCATCATTGAGAGTTCCTTGCAACTCGGTGCTGGCCGTTATATGCTGACTTAAACTCGTTGTGGGTGTTGGCTGTAAATTACAGTGGGAGTTTGCACTCTAATCATATTCCACAGTCCTCTTTGTTACCCTGCTGATGTACCTATCCTACGCTCTGGTTGTGCTGAAATTGGTCCCAATGTAAATTACAAATGTTGCTGATTTGTCTGATCCAGTTTATTGCAGTTTTAGTTGCTCCATTGTGTAAATGCTCATAGTTATTTTTTGTTTTGTTTTTGAAGGCTGCTCATAGTTATTGTATTGTATTGAAGCAAGATATTGGTTACAAAACAGAACAAATGAGGTGCGGTTTGGAGGGTCAATTTGTCTTGATTTTTACATGAGCATATTGGTTTCCTTGAAATCTGAGAATGTGATACCTGACTTCCACATTTCCATAACATCTACTAGTTATACGAGGAAGAAAATTGACCATCATAGGATTTCCAATCATGAAATAGAAAAAGTAAAGATTATAATGCCATATCACTATACTCCCTCCGTCCCAAAAAATGTTACTCCCTCCGTCCGAAATAATGCTAACCTAGGTGGGGAGGTAAAATCTCCATCCCAAAAAGTGCTAACCTAGGTGGGGACGTGATTTTACCTAGGACGACGAATTTGGATAACCTTTTATCTAGATTCGTTGTTCTAAGTGGAATCACATCCAACCTAGGTTTTTGAGATGGAGGGAGTATTTGTTACAAAACTTTTGAAGTGCAAGACTGAGGTATTTGGTTAGCTTTCCCAACTCACCTCTCTCGTTAACTGTCCACACGCTTTCTAAACCGCTCAACGGTGTGATTTTTTTTAAAAAAATTTCTATACAAAAGTTGCTTTATAAAATCATATAGATCAATTTTTTTAAAAAAACTGATACTTAATTAATTACACGCTAATGAACAGCTTTATTTTATATGTTTGAGTTGCCAACTCCCACTAAAGAACACAGCCTAAAGTTGTTTTAAGACTACCGAAATTCGATACGATCTATTCCTATGAAACAAATGATGCATATATGAAAAAAATTCTAAGATTTAAATTATACTATAACCCTATAAAAATTATTAAAACCGAATAAGCCTTACTCCTATTGCTTAGGATCTTATTCACTCTTAGTACCAGCGAATCCATTAGACTGGAAGGGGAAACTATTTCGATCCCTCGAGGGGATGCCTCCTTGTTTTGTTAAAAAAAGTTATGAAAAATTCTGAAAAAATTAGGTCCAAACTCAAATCACACGTTGAGATATAAAAAGGACAAATTTAGCGCAGGAATAGTAACGTACTATTTACATCTAAATTTGTCATTTTTGTTTCTCGATGTGTTAGTCGAATTTAAACTTGAATAGATATCACGAATCTCAACATTTTCAATTTTTTCGTAATTCTTCACAACTACTCCCTCCGTCCCAAAATAAGTGCAGTTTTGCACTATTCACGTTCAACGTTTGATCTCGTCTTATTTGAAATTTTTTTTATGATTAGTATTTTTATTGCTATTAGATGATAAAACATGAATAGTACTTTATGTGTGACTAAATATTTTCAATTTTTTCACAAATTTTTTAAATAAGACGGACGGTCAAACGTTGGGCACAAATATCCACAGCTGCACTTATTTTGGTACGGAGATAATATTTATGTCAAACTTTTTAAAAAAATCCACTCCCGACTAGAAGTCCTGTCCAAACAAGGCCTTTTAAGAAGAGAGAATGGCTTTTATCATATTCGGCGGTGGACACGTGTCCATCAGAGAAGAGAAGGACTTTTCTCCCCTCATCTTCTGCTGCGGGATGCTGCTTCCGCGTTGCCTCCTCTCTCCTGCACTCCTGCTGCTACTCAGCATCGTCTCCATCCATCCATTCGCTTTCGCGGCCGCGCGGCAAGCCGGGGAATGCGACGCTGCGGGCGACTCCGGCGCCGAGATCCCAGGTGAGCACCCTGTGCAGTCTGCAGCACGCATTTTCTTCTTCTTTTTTACATTCTCATTTCCAATCTATTTCATGTATGGATTCTCAGATTAGATTCTCCTGCCGACCACTTGGGTTGGGGGGGTGACCGTGTTCTTTACTTCTTGATTTTATTTTTCTTTATCTGGCAGAACTGTAACATATCTCGTCGGTGCGAGCTGGAGGAGGAGGAGCCATTGGTATCTCGCCAGCGGGGCAGTGAGCCTGTCAGTTATTCTTTTCTTCCTGTGAAATTCATTAGAAAGAACCTGTTGTGCTCTCCGTGTGGAGTTCTCGATAATTTGAGATTTTTTTTTCTTAGTTTTTCCCTTTCCAAAGATTGTTAAGGTGCTTTAGGGGTAGTTTGTACTTCATTATGTTGTTACTTTTGTTTTATTAATAACATGATAAGGCTTTTGTTTAGATCTGTTATCATTTTTTAGTGATATGAGGTTTGGACTTATGTGGGGTGGTCAACTCTATTAGTATTATGGAAGTTTAACAACAAGTACAACCAAACGAATTATAATCAGACAATTTAAAAAATTACTGATGGTGAAAGTTTGAATATTAATTGTCATGTTAAGTATTGTCATACTGAATACTTCATACTCTGTAAATACTGGACTCAGGGATTGCATGAATATTGTTTCCAAGCAAAGTCCAAAGTGGCCACATGACAGTGATGAAATTTTAATATCGGGCCATGAGTATAATCTTATCAATAAAACACTCATACTTCAGTACTCAATCAGGTGGCTGGTTCAGGACTTCAGCTTAGATTGAATGAATTGTTGCTACTGAAATGGGTGATTATTGTGAATTGCTGGCTACATTGAAGTGTTTGACCACAGCCTTGGAACTTCTACCTTTTGTAGGCTATCGATATCGTAAATTGTTTATATTATTCTGAATTTTCAAATAGTACATGCCCTTCGAAGTGCCAAGTAAATTGGATCCCACAGAATAAGATGATCTCACTTGTGTGGTGTATGCCTTTTGTAAATACAGTTATACGTTAGAATTTACATGAGTTCTGATGCCACTTTTTTCCACCCTATACTGCAATTTCATTAACTGTTTTCTGATTGCTGCAAACATGTAGTTTTCATTTTTTTTCAATACTTTATACTTTTGATCAAACAGCATCTACGTTCTATATATTCTAGAGAACCCCAACTGAAAAGTTTTATTGCTTTGTCAAGACAGAAAATAGCAACTCGGAACACATTTATGATTATGATCTATCATGACATCCTTTGTTGTTCCTTATTCATTTCCATGTTCCTAACACCACTGGATTACATCCATCACCTTCATGTTATTTACAATTTTCCTTCTCTGACTATGAACTCATTTCTGTTTATTTTCAATTTTAGGGCATAATGGCTGATACCCAGTTAGGTTGCCATACTATAGGATCTCATGGCATTAAAGTGGCAAAATTCCATTTGTATGATTGGATGATACTTATCTTTCTAGCTGTTGTTTATGGGCTGTTCAACATAATTGAGCCTTTTCACCGCTTCGTTGGAAGTGACATGCTGACAGACTTGAGATATCCACTGAAGGGCAATACAGTTCCATTTTGGGCTGTTCCAGTATGTTCTTGCTTTGTGAGACTTAATTTTCTTATAAGATCATCTATTGACTTGTCTGTGGTGCATGACATGTCTCTGAGGAAGTTTGGTTTTTCTTGATTTCCAGCTGATTGCAATTGTGCTGCCCTGGGCCATCTTTGGTGGAATTTACTTCAAAAAGAAAAATGTCTATGATTTGCACCATGGCATTCTGGGTATATGGTACTCTCATATGTAGATATCTATCAAATTACACTTTCACTTTTTTAGTTCATGCTGAACTGGACAGTTTGTACAGGGATTCTATATTCGGTGCTTATAACTGCTGTGATTACTGATGCAATTAAGAATGGTGTTGGTCGCCCACGCCCAGATTTCTTTTGGCGTTGTTTCCCTGATGGAAAGCCTGTAATATCCTTTTGTAAATTCTGATTTCTCTCCTTAAGCAATTTCATTCCTATCGACATGTACTTGGTTTAGTTCTGTTTATTTCTTTTTTTTTTTACAGAAGTTATGGAAAATAAAACCTTTCATGTTAAGGACATGCAGATTAATATGACCTGTACAGGGATTCCATTTACTTCTATGATTTACTTGCTTAAAGAATTATTTTTTGTGCCATAGATTAAGCAAATTGTACAGAAACAAGGTAAACATCCTTTACCTTATTAAAAGTAATCAATTATTTTTGTTTTTGTAGAATTTCAATAATGTCACTGGTGATGTCATATGCCATGGAGAAAGGAGTGTCATCAAGGAAGGCTACAAGAGCTTCCCAAGTGGGCATTCTTCAGGTAATAAACAGTGCACAGTTGTACTCTAGATATGATGTCTTATGCTTTAGGTTTTTTTTTTTTTTTAAGTTGTAACTTAACTGTAAGTAATTTTCTCATTGGTTCAAATTTCATTATGATTTATGCCTTATGTTTTTGTGGTGCTCCTCATTATTTTTGAGTACTTGTGAGTTGTGACATGCATTTATTTACATCAGTTTATCCCACACTCTCTACATCATGTACGTTTCCACGGATTTTCTCCAATGGTTATTTTGCATCACTGCTGTTTAGTCTAGTGGTTGTTTCAGGTTTTATACCTGAGCATTATTTGATACTGCTCTTGCAATATTAATATCTCATGTATATATGTGCTCCTGGCTTCCTGGGAACTATGTAGGAAAGCTGGGAAGAAGGTTTAACTATGAACTGTTTCTCCACTAGTTTAAATCCCATGCTATTGAGCAGTTAGTTTTTTTTTTTTAACAATTGAAATTGTATTTGAATGCATCTCTTAATGCATATAGGTTGTATTTGCGAGTTCAGGTGCCAGGAGCCAGCAGATTAATTTTTTTAATCTCATTCTTGTTTTCTTCCAAATTGTTTGTATTTTGGTTTTTTTGTTCTATCATGCATCCCCATATCAGCAGTTTGTTCTCTATAAAGTAATGGTTTGGAGATTGCTATTTCATGGCCATACCCATAACATGTTATCCTTCCCTATGTGTTGGTAGATAATCTGATGTATCTGTTTCGATACTTTCTTCATTACTTTAGGGGCTTTTGCTGGTCTGGGTTTTCTTGCGTGGTACTTAGCAGGCAAACTTAAAGCTTTTAATCGTGAAGGGCATATTGCAAAACTATGCCTAGTCTTTCTGCCTCTACTTGTTGCATCACTTGTGGCAGTCTCTCGGGTTGACGATTACTGGCATCACTGGCAAGATGTATTTGCAGGCGGCATTATAGGTCTGTAGTTTCAACGCTTCTGTACCACTTTAAACATTCTTGCTCTCAAGATAAGTACATGTAATTCATCTCATTCTCTACCTTATTCAGGTCTCACAGTTGCTTCGTTTTGTTACCTGCAATTTTTCCCATATCCATTTGATGCTGATGGTACATTCCCCTCCTATATATCGATGATGATTTAGACGTTGATCGACAACATTTTACTAAAGTGTTATGTTTCTCTTCATCCGCAGCTATATGGCCTCATGCTCACTTCCAACAGCTAGCCGAGTCACGAAGCAACGGTAATGAAAACTCACACAACATGGGATGGACAGAGACCGACGCTTTCCATGAAGGCGCTGGTGCTGTTGCGCTGAGAGACACAAGCCTGGTTCTAGACTCGATGGAGTCTGGCAGGAGGTTTTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA027109

Retrieved from "https://ngdc.cncb.ac.cn/ricewiki/index.php?title=BGIOSGA027109&oldid=33366"