Os11g0139850

From RiceWiki
Revision as of 08:59, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os11g0139850| Description = Protein of unknown function UPF0131containing protein| Version = NM_001189412.1 GI:297727954 GeneID:9267466| Length ...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os11g0139850

Description

Protein of unknown function UPF0131containing protein

Version

NM_001189412.1 GI:297727954 GeneID:9267466

Length

5318 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os11g0139850, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:1824423..1829740

Sequence Coding Region

1824627..1824896,1824988..1825293

Expression

GEO Profiles:Os11g0139850

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008404:1824423..1829740 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008404:1824423..1829740 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgaggagcgtccaaactccagtggagcagaaattgagcaatggagggggaggagtggaggcggcgacaatggtgttcgtgtacggcaccctgaagcgtggtttccccaaccaccctctcctcgccgcctccggttcccccttggttggtgctgcctccaccgccaccccggcctcgcttgttgtggggccctactctgttccgttcctcctccccaggccaagttcatcctccggtagccatctcgtctccggcgagctctacgccgtgtccccccgcgccctagttgacctcgatgccctcgagggcacccacctgggtgtgtatgagcggcgcaaagtgaccgtggtagttgagggaggatcaggagaggtagtggaggcggaggcctatttcgcacacacgagctacatggaggccctgtggctgcgctgcggtggcgaggcagctgagatcggcgagtataccatggaacacgcggccaagtacgtccctcctagctgccgatctcccgatgcctctggtcttatgcatgccatccatgtcttcctcctcgccacctctccatctccctga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MRSVQTPVEQKLSNGGGGVEAATMVFVYGTLKRGFPNHPLLAAS GSPLVGAASTATPASLVVGPYSVPFLLPRPSSSSGSHLVSGELYAVSPRALVDLDALE GTHLGVYERRKVTVVVEGGSGEVVEAEAYFAHTSYMEALWLRCGGEAAEIGEYTMEHA AKYVPPSCRSPDASGLMHAIHVFLLATSPSP</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>4845..5114#4448..4753#gaaccatacgacgtcttccgtcttgaccgagcgagcgagaaggtgaagggagggacgactggcgaccaagccgccgccgtctctcccctcgccatccgcgtcgccgtctcccccgccatccgcgccgccgtcgccatccgccggcgccgcccagacgcgccgccgcctctccccgccatctcccctcgccatccgcgccgccgtctctccccgccatccgcgccgccgtctcccctcaccatccgccaccgccggccagacgcgccgccgcctctccccgccatccgtgcagccgtcttccccagagcgtcgcggcgctctcctcgctgagcacgcagccgaaggagccgaaggcttcactcgctccaccggcgccgcccctcgccaccaccggcgccgcccgactcttcctcctcggttggctctcctctcttctccgcaagcccgttgccccgttcccctttgcctctcgtcgctgtggattgctcgatggcttttattcttcccctttccccccaccgccgcgggtgggctggtaagtcggtaggtaaaggaatccatcggtttcgatctcacctcgttcgctgcccttttgttgattgatcatcagatggtgctttgatcggttcggtccggtttctagtttaggcgactgcttgatccgttcggtttgggggtctagtttgggcgattcgtctcttgctgttgcgttagttctctgaacggcccttctttcgattggattatggctaattgtgatttgctatttaagattgcgaggtcggttggtttgcttcagtttctgttcggtgagatggattatcagctcaattaagctgtaccgtggatattttgggtatgatcaagcctagataaaatgaagtttgtgctctgaaattgtcatggttaggattgctcactgggctaagattatacttctgttcatttcaaggttgtgatgcttgtagttagtgacaattcggttgcttgcaattctgtgctctgcggtttttccttcaggtctggtaattttatgggaaggtaagtcatatcagaacatttaaacatgatgggagatggttttcttgggtctgctcagagctttcaaatcaccgatgttaatttgttcaattccgacaagactaaactgatgttaatttgcttaattctgacaagactaaagattatttgaagatggttgagtgttattgaaattctaaacggcgtcatgtattgctttttggaatttaaaaattggcaatatgtgctaaagtttaagttaaactagggcgttggaatgattcttctgtgtcagttcttagttaaagtttaacttcaggatttctttcacgaggatttaaggagctctttttgactgccttcactgtggattaatttgtcctagtacaggaactaaagattacttgctgcttgacctgctcagtttgaggtacagatctcgtgattttcctgtttactagtgttagttttaggaaccttgatgctctggtttagggctatggttaattgcaatttttgaaatttcaatatgtcaataatgtgcagtttgtttgcttccattacaagcgactatccaagaacattttatctgtaatacgaacatttaaaccagagaaattgaagcttgtggtatggattggtcactattaggaatagtcattgactcattggtgtataagatggtttctccattccattcaagattgctgctatgttttttggtcaaatataacaagtgattgatgttatttggaggcaatttgtctgcttggaactctgtggttattaagtccatcctgctgcgcttttatggttaaattgtcttgtcagaacatttacatggccatagttctcagagaattttgatgttaacttgtttagagcaaagctatatcagtcggttgttaacttgttatgaaggtggttatgtagtactaactaaaaaggcacatcctaaagtttctgtggtagatgattcctttggcagttacttctttcaaacaatattacaaggttgtgaaggtgattctgaaatattttgactactgctggtgaaattaatttgaagatttgtttcaagaacaatttatggacctcaacattataaagccatctgtttgaaggttcttccgagtagaaacaattgctttatgaactatggagttgttctcagtagcagtatttgctttctacttggtccagtttgcatctccagtagtatactttacatttgggcttgtcctgttccataactagctcggctctgggttcatttcaatatatgttggtttggtgtcatcttgtaatttttgtgttcaagattccttctgatgttacaaattgtaattatcaaatgatatagacgttagtctgtataatagttgtaacatggtaatttgttttgataatcctgaggttgattaacttatattaccttgatctctatggaacaatagaacgaaactctatggctcttgtggcattgttctctcttgctttcattttgtgtgtgttgaatgtaccaccccattcaggaactaggatatttccaggaatattttagatcgtcttgctgcatccacagttttaaaagttgttcatcttctactaacttggtagataactgtagtttacagtgttgagatatctcttgaacttagtaggaattgtcctaaattatatgcttttgaattgaggtgaatctcttgaacttagttgctaatcactcggacaatatattccgaagtatatcgtacattatcgctgacttgtttcttcttacagtttgtctggtacatttctttctttataattattaatttattatttcttattcagcatagtgtccccaattaagatttgccaagaaaggaccttaaacaagagcatattattgcttgccaatgagaatgttttgactgttgactgttgtgaggtagtgggaataattaactatttgccactcttaggagtggttctaaaggatttgccactcttgtgtgaaataagctagagcattgattgtccaccagcagttttatttgtgcatcaactttgtgtgcatggttttaatttgaaccaaccttaaatctcttcatacattatctggtggttttaagtaatccctttttggttgaatgtgtaggtgctttagtttttgtggcattaatttattctaggcaaatagttttattttatggtttaaaattgatgctctctgtttactaaatatgtcatatatccagctaacaccttaatatttcatttcttcttgctaattattaattcccatattgtttgttttccatctgcatattgttccaaatgctagaaatatcatatcaatgttctatggttgcttttcgatattcgtttgatgtcaatatataatgctgcgattactgtgtgaatacttgtgtctatgtctagtaatgcatgagatacaagttcaaataaataatagtactgtgtgtgtgttttatgggcattactgagctagtaattgccattttgtgttgctattgaaagctttgatgctttttgactttttgcatttttataaataaggctgttaatttggttgaattagaattttttttttacttcagcagttctgctcctgcaagaattttgtttaattatatcgcatgtgccaatgctttttggttattcgttgatttacatccgtgtagtgacttaaattttactctgaattttgaatctatacaacatgttttaagtgcataaagtacatattagaagatgtcttcaaaatggtgtaagtgtgatatactcctaaagtgcttatatgatgtcattttgattatgagttcttccctgaccaagtttcttctgatttcatcgtgtttcctcattagctgtttcatttgatgcggtacagttttaataatctttatagttactttaacagtatgatggatatggaattaattaaatatagtgcacataatattgactcctgaatctatatagctattattttaacctatccttcccaccacgggttgatatgatctttaacaggatgatgaacatgcagttaaattaaatattattaaaaaaaatgataacttgttcttttagtgcttacccttttgtgtgtgttggcctgtacgttctgtcagtttgtgtacatgacctagtaacatttatttagggaaatctaatcctaaccatttttttactgtgttaataatgttgctagtatgctcaattcaaattctgttgctttgcttaataaggtgtgtctgcactaatgtttgagtcgtatgtgttagaatgtactaaattatgtgtttaaaaaaatagataattttatatgggtgttagccacgcaattgcgcgggacacctatctacttgaaataataataacactagttataataatgaacaggtgagtaaagatgaggagcgtccaaactccagtggagcagaaattgagcaatggagggggaggagtggaggcggcgacaatggtgttcgtgtacggcaccctgaagcgtggtttccccaaccaccctctcctcgccgcctccggttcccccttggttggtgctgcctccaccgccaccccggcctcgcttgttgtggggccctactctgttccgttcctcctccccaggccaagttcatcctccggtagccatctcgtctccggcgagctctacgccgtgtccccccgcgccctagttgacctcgatgccctcgaggtacgtacatatattcctgatcagtcctcgatcacctattcacctagatggctagatgcatgatttggatggagcggaattgcatctgcagggcacccacctgggtgtgtatgagcggcgcaaagtgaccgtggtagttgagggaggatcaggagaggtagtggaggcggaggcctatttcgcacacacgagctacatggaggccctgtggctgcgctgcggtggcgaggcagctgagatcggcgagtataccatggaacacgcggccaagtacgtccctcctagctgccgatctcccgatgcctctggtcttatgcatgccatccatgtcttcctcctcgccacctctccatctccctgaaccatatcaaatcaaatcctttcatctcattgagtaccggtcggtatcttgaattgaatttgcttattgttcgctgcctattaccagcacattaatttgagtcagttactctggctcattttctgtcataagtctgttgtgtcatgtactggtatgcaacataaaaaaacatgaatattagggaaggacctaatatcaaataaa</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os11g0139850, RefSeq:Os11g0139850