BGIOSGA027715
| Gene Name |
BGIOSGA027715 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027715, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_27678 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA027715-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA027715-PA |
| Length |
4494 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:1658102..1662595 |
| Sequence Coding Region |
1662549..1662595,1661569..1661803),complement(1661223..1661477,1660425..1660571),complement(1660066..1660158 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:1658102..1662595 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:1658102..1662595 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGATGCCGCCACGCGCCCCGCCGTCGTCATCGACAACGGCACAGGGTATAGCAAACTTGGATTCTCTGGTAACTCTGAGCCATGTTTCACCATCCCTACTGTAGTAGCTGTGAATGAGTCTTTTCTGGACCAGTCAGAGATGTGCAGTAGTGCAAATTGGATAGCACAGTACAATGCAGGTGTCATGGCTGACCTAGATTTTTTTATTGGAGATGAGGCTCTATCACTATTTAAATCTAGTGGGCTGTACACTAGAAAACACCCAATTAATCATGGTCAGGTTGATGACTGGGATACAATGGAAAGATTTTGGCAACAGTGCATTTTCAACTATCTACGGTGCAATCCTGAAGAGCACTACTTCCTTCTTACCGATAGTCCTGTCAGTACACCTGAAAGTCGTGAATGTGCAGGGGAAATTATGTTTGAGACTTTCAATGTTCCTGCACTATATATTTCTGTTCAATCTGTTCTCAGTCTTTCTGCTGGATATGCCTTTCTGAAAAGTATTTCTGATGAGGACTCGGTTTCTGTGTCTGATATGACAGGTGTAGTAGTTGATATTGGGGATGGAGCTCCACATGTGGTGCCGGTTGTAAACGGCTACGTAATTGGGAGTAGCATCAAGTCTTTTCCATTTTCAGGAAGTGACGTTACACAGTTTGTTTTGCAGCTTTTACAGGAAAGAGGTGAACTTATTGCACCTGAGGATTCTTTGGATATAGCTCGTAGGGTGAAAGAAATGTATTGCTACACTTCTTCAGACATTGTCAAGTATCTGTATATCGACTATCGAGTCAACACAACAAATTCCATGAAAGGAACGGAGTTCAAGAAGCATGACAAAAAGCCTGATAAGTATATCAAACACTGGTCTGCTATTAAGCCCAAGACTGGAGTCCCATACACAATTGATATTGGATATGAGCGTTTTCTTGGACCAGAGATCTTCTTCCATCCCGAGATTTACTCTGCCGACTTCTCCACTCCTCTACCTGAACTAATTGATAGCTGTGTTCAATCTGCGCCAATTGACACAAGGAGAGATCTGTATAAGAATATAGTATTGTCTGGTGGATCTACAATGTTTAAGGACTTCCACAAGAGACTTCAGAATGACATAAAGAAGATAGTAGATGAGCGTGTTGCCGCAACTAATGCCCGTCACCATGTGGAGGTGAAACCTGTTGAAGTCAATGTGGTCGCCCATCCTATACAGAGTTATGCAGCTTGGTTCGGGGGTTCAGTAGCTGCTTCTAACCCTGAATTTTATGAGAGTTGCCACACAAAGGAAGAATACGAGGAGCATGGAGCAAGCATCTGCCGGACCAGCACCGTTTTCAAAGGGATGTACTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDAATRPAVVIDNGTGYSKLGFSGNSEPCFTIPTVVAVNESFLDQSEMCSSANWIAQYNAGVMADLDFFIGDEALSLFKSSGLYTRKHPINHGQVDDWDTMERFWQQCIFNYLRCNPEEHYFLLTDSPVSTPESRECAGEIMFETFNVPALYISVQSVLSLSAGYAFLKSISDEDSVSVSDMTGVVVDIGDGAPHVVPVVNGYVIGSSIKSFPFSGSDVTQFVLQLLQERGELIAPEDSLDIARRVKEMYCYTSSDIVKYLYIDYRVNTTNSMKGTEFKKHDKKPDKYIKHWSAIKPKTGVPYTIDIGYERFLGPEIFFHPEIYSADFSTPLPELIDSCVQSAPIDTRRDLYKNIVLSGGSTMFKDFHKRLQNDIKKIVDERVAATNARHHVEVKPVEVNVVAHPIQSYAAWFGGSVAASNPEFYESCHTKEEYEEHGASICRTSTVFKGMY</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..47#793..1027#1119..1373#2025..2171#2438..2530#2667..2717#3087..3206#3683..3793#3868..3993#4134..4226#4414..4494#ATGGATGCCGCCACGCGCCCCGCCGTCGTCATCGACAACGGCACAGGGTAAGGCGGTTGTTGGTTGGTTCGTTTGTTTGTTTGTTTGCCCCCTCGCGCGTTGTGCTCTCCTCCGGTTGTTAGCTTCGCTGCGTGATCCGTGCGCGGCGTGCGCCTAGCTAGGGTTTTTCCGCGATGGGATTGGCTGTGCTGTGGATTCGGCGAGGCGAGCGTATGTCCCTTGTGTGTTATGGCGATGGATTGCCTGTACCGTTGCGTGTATCTGTGGCTTGGATTATTCAGTCGTTCAGAGGTTTCCCATTTCGCGTCCTTGAGGTTCTAGTCAATCAGTAGGAACTCCACTTCATATAGTTCAGAACTTCGGATCATTGGATTTCCGAGTGATGCTGTGTTGGATTGGAGTGCCTTTTTTGTTTAGTTGCATTAGTTGCAAATGGAATAGGATTGGGTTCATGTTTGGGGTGTGGGGATGGAACATTTGAGGTTAACTCCCTAATTAGCCAGGACATGATGCAGCTCTCATGACTGACGGGTTTGATTTAGTGTCTGAAAATATGTCTTACTTGAAGCATCCTGATTCCTGAAAAGCTAAAAATGGTAGATACCAGAATCGGGCAATACCTGAAGATACTGAAATAGAGTAAAACATATATAAATAGTTTGTAGGATAAAGATGTTTCCCCTGAAGCTGTGTCTTGATTTATCTGCAATTGCTTGAAGGCTGCACACTGTCACCCCAGTAAGGTTATGTTTGATTGTTTTCTTACACCATCTTGCATGATCTTATGTTTAGGTATAGCAAACTTGGATTCTCTGGTAACTCTGAGCCATGTTTCACCATCCCTACTGTAGTAGCTGTGAATGAGTCTTTTCTGGACCAGTCAGAGATGTGCAGTAGTGCAAATTGGATAGCACAGTACAATGCAGGTGTCATGGCTGACCTAGATTTTTTTATTGGAGATGAGGCTCTATCACTATTTAAATCTAGTGGGCTGTACACTAGAAAACACCCAATTAATCATGGTCAGGTATGTTTATGTGTTTTCTGTTTGTAATAACAACAATTGTTTATATTTCTATGTTATACGACTATAGTATGTCCCTTTTACCCTTTTGCAGGTTGATGACTGGGATACAATGGAAAGATTTTGGCAACAGTGCATTTTCAACTATCTACGGTGCAATCCTGAAGAGCACTACTTCCTTCTTACCGATAGTCCTGTCAGTACACCTGAAAGTCGTGAATGTGCAGGGGAAATTATGTTTGAGACTTTCAATGTTCCTGCACTATATATTTCTGTTCAATCTGTTCTCAGTCTTTCTGCTGGATATGCCTTTCTGAAAAGTATTTCTGATGAGGACTCGGTTTCTGTGGTAGGTTCTGTAAACATCTGCTTTTCATGCTTTTTATTTGCTCCAGTGAGACATTTGTTTCCACATGGACTGCATCTCCTTGACTGAAAAGAATTTTCTGTATTACAAAATTAATGTAAACTTGTTTTAATGACATGTAGCCCTGCTATGACAAACTCTGTTTTTGCTCCCTTTCTTTAAGATATTTAAATAGCCACATTTCAAAAAAAAAAAGGCCAGTCTGTTCCTGCCATATTATCCATAGATATTTGTTGCCTGTGTTGTTCCTAGAATTCCTATTCTTGTATGCAGTTTTGTTTTGCTATTCCCTTGTATACTGGTATGCAAATAAACATGTTCTGCATATTGTGTTATATGCGAAGAGAAGTATATATTTAAGCAATATGAAAGACAGATAATACTGATTGAAGCACTATGAGAAATCAACATTAATACAATATGACTGTGTAAATTTAGTCTTTTAGTTGCCAGTTTGGTTGAGGATAAAGATCTGTAGTTCCTAGCAAGCCAGTACCAACCTTGCAAAAGTTTGAACACCCATAATTCATATCTGTTGGGTCTATTCATGCTCCCTTTTAATTACATGCCCTTAAAATTTCTGGTACACCATGCTACTTATTATTGTTAAGTTTGACCAGTATATTTTGTCAGTCTGATATGACAGGTGTAGTAGTTGATATTGGGGATGGAGCTCCACATGTGGTGCCGGTTGTAAACGGCTACGTAATTGGGAGTAGCATCAAGTCTTTTCCATTTTCAGGAAGTGACGTTACACAGTTTGTTTTGCAGCTTTTACAGGTATTTCATCTTCTCCTCATAAGTCATGTTGTTCATAAACAGGATGTGTGTGTGTATCTAGCATTCATATAGTGCAAATACATTGAAAGGAGCATCGAGTAGTTTTTACAGTACTAAATTAGAACAATTGATACTATTCTCAATGTTCTACTCAGTTTTCATCTGTAATTTGAGTTATGCTGCTCCCAGATCTTTATTGCCTCTATAATTAGTTGTGGCCTGTCACATAATGTTTTTAGTGATTAATGGCATCTTTTGTTGTGCAGGAAAGAGGTGAACTTATTGCACCTGAGGATTCTTTGGATATAGCTCGTAGGGTGAAAGAAATGTATTGCTACACTTCTTCAGACATTGTCAAGGTATTATGCTGCTTGGTTTCGGAGCTACTTACTCAATAATACCTTATGTTTTTTAGGGTACCTTGTTGTAATTTTCCAACGGTGTACATAAATACATTCTTTGATGAAATAGTTGAAAGTGATGTTTCTGTTGAAGTATCTGTATATCGACTATCGAGTCAACACAACAAATTCCATGAAAGGAACGGTGTGCTGTATTTTTTTTTCAGAATACGCAGGAGATAATGGCGTGCTGTATCATCCTTTGAATTTTAAATGCGAAATAATTATGTTTGAAGAAACAAAAAAAATGCCAACTTTGTTGTGAATTGTAATTTGTTTTGTTATGATTATCACGGATTAGTTAATGCCTGGAGAATAGCCCATGGGCAAGTTGCAGCATGATTCGGATGGCAGAGATTAAATTTTTTGTGATGTTACTTTTGTCATGGATTTATCTGCTGGCTAATATGTACTACATATGATATTATTATTCTGGTTCTACCAGCAAGATTGAACTGTAGTTTAGACTTATCTTGAACAGATAGGTTATTATGTGTTTCCATTACAATTTCAGGAGTTCAAGAAGCATGACAAAAAGCCTGATAAGTATATCAAACACTGGTCTGCTATTAAGCCCAAGACTGGAGTCCCATACACAATTGATATTGGATATGAGCGTTTTCTTGGACCAGAGGTTTGTTCCCATTTCTATCATCTAGTTTCCATGTTCTTTTAGTAGTGTTGCTACAATTGACATGATACCAATCATGCTTTGAACAGGCGTGCTACCCTACTGACGTGATAACATTTTTACAGCTTTTGATGTTATAATTGATTGTGTCCTGTTTGTTTGTCTAATGTGCTACTCCATGAAATCATGTGCATTGTTGGAATGAACTGAAAGCCCCATGTTATGATTGAACATGTATGATTAGTTGGAAGAGTAATTCTGTTCTCTAGGGCATTCAGTATTAGTGAAAGTCCAGGGGCTTCAACACAAAAAGGACTAATAAGAACTATGGGTCAAATGTAAATTTTGTGTTGATCTGATAAATGCTTCCTCCAGAAGTCATTTTATTGACATTTGGACTCTTCACCTTGAAATGACATTAAAAGGAGAAAAACATGAATTTGATGTAATTTTCTAACCTTCTACTAGCGCAAATGCAGATCTTCTTCCATCCCGAGATTTACTCTGCCGACTTCTCCACTCCTCTACCTGAACTAATTGATAGCTGTGTTCAATCTGCGCCAATTGACACAAGGAGAGATCTGTATAAGGTGCTTTGTTTGAACTCTGGGACACATCTAAGAATGTGACATATATTGATTATGTGATATTTGACTATTTGCAGAATATAGTATTGTCTGGTGGATCTACAATGTTTAAGGACTTCCACAAGAGACTTCAGAATGACATAAAGAAGATAGTAGATGAGCGTGTTGCCGCAACTAATGCCCGTCACCATGTGGAGGTGAAAGTAAGTACAACGATGATTGGTTTTGAGTTCATACGGCAATACTTGAACTATTCCATTTGTGTTTTGTCTCAACCTGTTGTCTCAGGAGTCTTTGTTGACAATTAATTGAGTGTTTCGTTCGTCTAATGTTTTGGTTCCAGCCTGTTGAAGTCAATGTGGTCGCCCATCCTATACAGAGTTATGCAGCTTGGTTCGGGGGTTCAGTAGCTGCTTCTAACCCTGAATTTTATGAGGTGCCTTCCACTTTACACTCTTTGAGTCTTGACACCTCATTCTGCAAATTTAATAATATGACATATTCTGCCATATAACTTTGTTAATAAGTCAATAATATGCTTCAGGTCAATGCAAACCATATGCACTGCACACGTGAATAAAGTGATAAGATGGAATCTAAAGTGTTTGTATGTTCTCTTTCAGAGTTGCCACACAAAGGAAGAATACGAGGAGCATGGAGCAAGCATCTGCCGGACCAGCACCGTTTTCAAAGGGATGTACTGA</dnaseqindica> |
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