BGIOSGA028139
| Gene Name |
BGIOSGA028139 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA028139, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_28145 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA028139-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA028139-PA |
| Length |
4349 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:5908529..5912877 |
| Sequence Coding Region |
5908529..5908614,5909636..5909744,5910612..5910792,5911392..5912167,5912496..5912651 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:5908529..5912877 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGACGAGTTAGGGATCATCGAGCAAGGAGTCGACTGGAGGACTCGCCTTGGCCAAGACATTCGCGATTGCATGATAAATGATATATTGTTCAGCCTGCAAACGAAATTGCAAAGTACTTCTACAACATTGATTGATCTCCAGAAGGTTGCTGCCAGAATAGAGGAGAGGATCCATACGATAGCTAGTGACTATGGTGATTATCTACGGAGGATTTGTCTGACGAGAGGTGATTTGGACTCATATGATGTATTGTTGAACGATTGTCAGCGTCAGCAAGCTTCAATCCGTTCATCCATCTTGCTCCATCAGGAGAATAAGCAAGGTGATCAAATTGTCCAGGCAAAAAGAAATACTATGGGGACATCATCTAGCAGTGTGCTATCTAATCAAGTAGCCCTAAATGACCACAAGGAGCACTCACACCCCTACGAAAAAGATATGATCAGCAAACTCCCTAACGATTTGGTCCAACATATTATGTCATTCTTGTCAATGCGAGAGGCTGTGCGCACCAGTGTTTTGTCCCATTGGTGGGTCAACCAGTGGACCTTCTTGAAGTCCATTCAGCTTAATATATATTGGTTTCATATGGACAGAGAAAAATTCAGTAGTTTTCTTGACAAACTATTGCTAAGCCGTGTCCAAGCTGATGCTCCCATGGACACATTCGAGCTAAAATCTTTTGCAATTGACCGCGCCAATTGTTGGATTAATCATGCAATCAAGCACAATGCTAAAGTGCTTAAATTTGCTGAATATGGAAAATGGGAACCTTTCTACTTGGATCCAAATCTTGTGGAGTTAAGTTCTCGGTATCTAGAAACTTTGGAGCTGACTAATGTTGCTCTAGATGCGACGATATTCAGTCAGTTGGCCAATTCATGCCCAGCATTGCAAAATATGCTGCTGACAGACTGCTTACTGGAGGTAGAAGAAATTTCATCAAGCTCATTGAAGAATCTGGATATAATTGACTGCTATATTCTCAAGGACCTGAGCATTTGTACTCCTAGTTTGGTTTCATTGTGCATCAAGAATGAACGAACAGACAATTCTTCGTTCAGAAACTCTTACCTAATATTCGCAACGGTCATTATCATTGATGCTTCAAGTGTCAGTAGCATGGAGTTGTTAGCTATGGATAGACAGTTCACATTCGTGGAGAAAGACGGGGGCGAGCCAATGTTCAATAATCTCAGAAACTTGAGCCTAGGTCTATGGTGCATTAACAACATGTTTTCGCCTCTACGTCGATTCGTCCGGCATTCGCCTATGCTGAGGATGGTGACTCTGAGGATCAGTCCGCTGGATTGGAAGTCCCATCTCACGAAGGAACATCAGGAGATGCTGATCAGCATTCGTGATCGTCGTGGCCTGATTCTTTATATCGATTGGTATTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDELGIIEQGVDWRTRLGQDIRDCMINDILFSLQTKLQSTSTTLIDLQKVAARIEERIHTIASDYGDYLRRICLTRGDLDSYDVLLNDCQRQQASIRSSILLHQENKQGDQIVQAKRNTMGTSSSSVLSNQVALNDHKEHSHPYEKDMISKLPNDLVQHIMSFLSMREAVRTSVLSHWWVNQWTFLKSIQLNIYWFHMDREKFSSFLDKLLLSRVQADAPMDTFELKSFAIDRANCWINHAIKHNAKVLKFAEYGKWEPFYLDPNLVELSSRYLETLELTNVALDATIFSQLANSCPALQNMLLTDCLLEVEEISSSSLKNLDIIDCYILKDLSICTPSLVSLCIKNERTDNSSFRNSYLIFATVIIIDASSVSSMELLAMDRQFTFVEKDGGEPMFNNLRNLSLGLWCINNMFSPLRRFVRHSPMLRMVTLRISPLDWKSHLTKEHQEMLISIRDRRGLILYIDWY</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..86#1108..1216#2084..2264#2864..3639#3968..4123#4254..4349#ATGGACGAGTTAGGGATCATCGAGCAAGGAGTCGACTGGAGGACTCGCCTTGGCCAAGACATTCGCGATTGCATGATAAATGATATGTGAGTGCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACCTAATTCTTACTTTTTTTTGCCATGAGAAATTGATTGCAGAGTTTTGAATCGATGATAATTTATGAATATTGGATACCCTGCTCGATGCTATAGTACTTGTTTAGTGATCTAATTGAATCATGATATGTATCGGTAGTCAGATCTAATTTGACGTTTTCTAGATCCAAGAGTTGTGATAATTCTGTGGCTTGCTATCTAACCGTCACGATCACCTAAAAATTGGCATCGGTTTTGGTATAAAAAGTTGTTGGTGAGGTTCAAACCTTTGTGTATTGATCATACCCATGTTTAGAAAATGATCCCAATTAACGAACTAAGGTTGCATGTCGATAGTTCTTTACCGAGTTGCTTGGCCAGTTCTTTGCATGACTCTAAGCTTTATGGACTAGTATTTTAGTACTGAAACTTCAGCTGTCTGTCGATTTTTTGTTATATTATTTAACTAGTATTTTACTTCAGCGCCTATTCTTTCCCTGTTCCTACCATGAGGAGGAGGAAGAGGGAGAGACCTGGAGAAAGGATAGGTGATTGTTTATATGTATGGGTATATGTAATTGCTTTTAATGCAGGTGATAAAACTCACAAGAAAGATGATCCCATATGCATGTTCCCACATCATTTTCTCTTTTTCTTTTTGCATTATATATAGTTTCTCCTTATTATTGGTTATGAATGCTCTCTTGTAGACTCTTAGCATGTATAACGAATTGCTAAAATCTTGCTCACTTCTGGTTGGACAAATTATATTTCATTATTTATGAGAATGTATTTACAATTTTGAACATGTTACTATGCCACATGCATTGCCCAAATAGTGAACAGTTTGCATATGTATTTCTTGTACGAAACAACCCCTAAATCCTCAGTTGCCTGTTTCTTTTATTGCTTGTTATATTAGAACCACATTTTGAACTATTTAGGTTGGAAGTACCATATTGAAACAATAAATCTCTCATGTTACCATTCAACATTCTGTTTGCAGATTGTTCAGCCTGCAAACGAAATTGCAAAGTACTTCTACAACATTGATTGATCTCCAGAAGGTTGCTGCCAGAATAGAGGAGAGGATCCATACGATAGCTAGTGACTATGTATGATAGTTTCTTCTTACTAGATTTTTTTTGTAATATAATTTCCTTATATATTAATTATACAATACTTTATTTATCTTTGATGTGCGCATGATAGAGTATTAATCTTAATATAGCAACACTTCTGCTGATCTGCTAGTTATTGCAATGTCTCATAGCTTTTTGAGTAAGTACAATTTCTTGCTAGAAATCCTGAACTAGTTAACTAGAGCTATAACAATTGTGTGAAACCATGGGTACGATTGTCTTGCTTTATATTATGTAACATAATGCAATATAATGTATTGGTTGCAAGATGCTCTACACCAATTTTATCGATCTAATTAAAAATGTTTATTACTCCTTCATTTGGTATCGTGCACAAGACACTAGGACTGAGGCTGCATTCAATTAAAGTTTTTCATTTTACATAGTTCCAAATATTTATGTCCCCTTTTCAATTTATTGGCTTCAAGATGTAAATATCTAGATTAATTCTAGAATATATTGATTTTATCGTGTATACTGATTTTATTGTCATGCAATTAGTTGTTTTGGTGGTGTTCATATACTCCCTCCGTTTCACAATGTAAACCATTCTAGCATTTCCCACATTCATATTAATGTTAATGAATCTAGACATATATATATGTCTAGATTCATTAACATTAATATGAATGTGGGAAATGCTAGAATGGCTTACATTGTGAAACGGAGGAAGTACCATTTAATAATATATGCACTTATTCTTGGCTTGCTAGATTGTTGACATGTTCCTTTTGCTATATATCTTTGTATAATCTTTTTGAAACTCATATGGTTATGGTTCATCAATAGGATGTTCAGTTTTAAACGGAAGTTCTCATAATTTTTTTGTCTTACACTTAGGGTGATTATCTACGGAGGATTTGTCTGACGAGAGGTGATTTGGACTCATATGATGTATTGTTGAACGATTGTCAGCGTCAGCAAGCTTCAATCCGTTCATCCATCTTGCTCCATCAGGAGAATAAGCAAGGTGATCAAATTGTCCAGGCAAAAAGAAATACTATGGGGACATCATCTAGCAGTATGTTCTTGAGAATTTGAACACCAGTATACTAAGCAGATATATTGTTTTGATCTGTTTTTATGGTGCCTGTATGACAAAAGAATTGTTTGCTTAGTAAATATTCGAGAAAAGTGGTTTTTTTTACCTGAGTCTACACATGAATCTAATGTTCTGCACTAGTTTATACATGACAATACATGCAAAGACAATTTTCAACGTCTACAACCTGATCCCGTTTGATTAAACAAGCATTGTAATGTTTTTCTTCTTTAGACATTGGAAATTTGGGTGCAAAACGATGAATATTAATTATTCTTATGCAACGGATGATTCAAGTGTGTACATTGCCTCCTAATTATGTGCCCCCTTTTTTTTTTCAAAAGATAAATTGGAGCTAGCCCACCGTACTGACTTATCATCTATGTAAAATGAATTACAGATGACAATATCTCTGTGAAATTAGAGTTAAGCAAGCATAAAAACTACAAATTTGTTGTAAGTTGTTTAGGTGGTTCTCCAAGATCATGTATCAACACTAAGGAGCATGTGTTAGAGTCAATGTCAGTAATTGTTCTCCACTAAAATAATGTAACACAATATCCACTTTTATATTGCAGGTGTGCTATCTAATCAAGTAGCCCTAAATGACCACAAGGAGCACTCACACCCCTACGAAAAAGATATGATCAGCAAACTCCCTAACGATTTGGTCCAACATATTATGTCATTCTTGTCAATGCGAGAGGCTGTGCGCACCAGTGTTTTGTCCCATTGGTGGGTCAACCAGTGGACCTTCTTGAAGTCCATTCAGCTTAATATATATTGGTTTCATATGGACAGAGAAAAATTCAGTAGTTTTCTTGACAAACTATTGCTAAGCCGTGTCCAAGCTGATGCTCCCATGGACACATTCGAGCTAAAATCTTTTGCAATTGACCGCGCCAATTGTTGGATTAATCATGCAATCAAGCACAATGCTAAAGTGCTTAAATTTGCTGAATATGGAAAATGGGAACCTTTCTACTTGGATCCAAATCTTGTGGAGTTAAGTTCTCGGTATCTAGAAACTTTGGAGCTGACTAATGTTGCTCTAGATGCGACGATATTCAGTCAGTTGGCCAATTCATGCCCAGCATTGCAAAATATGCTGCTGACAGACTGCTTACTGGAGGTAGAAGAAATTTCATCAAGCTCATTGAAGAATCTGGATATAATTGACTGCTATATTCTCAAGGACCTGAGCATTTGTACTCCTAGTTTGGTTTCATTGTGCATCAAGAATGAACGAACAGACAATTCTTCGTTCAGAAACTCTTACCTAATATTCGCAACGGTCATTATCATTGATGCTTCAAGTGTCAGTAGCATGGAGTTGTTAGCTATGGATAGACAGGTACGGTACTGTATTGCTTGCCCTGTAGCACTGATCCTTTCTCCCAAACACTCTGTACATTACTATTTGTTTCATAGTTTTACTATTTGTTTAGTATATGCATTTGTACATCACTATCATACATTTTCATGTGAATATATTTATGCAAATGAATTTTCTTTCATAACAAGGACACAACATAAAACATTCATTTTGCACGGTATGTATATACCCGATTTCAACTCGACACATATTTCTCTGACCACCTATTTTACCACAATTTTTTTTTATTTCATAGCATTAACAGTATTTAAGACTTAAGACATTTTTTTTCTATGTACATATGAAGTTCACATTCGTGGAGAAAGACGGGGGCGAGCCAATGTTCAATAATCTCAGAAACTTGAGCCTAGGTCTATGGTGCATTAACAACATGTTTTCGCCTCTACGTCGATTCGTCCGGCATTCGCCTATGCTGAGGATGGTGACTCTGAGGATCAGTCCGGTCAGTGCCATCCATTGCATTGCATCATCCCCATGCTTCCTGTGTCCAGCTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTGGTTACCATCATTGTTGAAAGCCTAGAGCTCTAATGATGCTGCAAACCTTTCAACTTCAGCTGGATTGGAAGTCCCATCTCACGAAGGAACATCAGGAGATGCTGATCAGCATTCGTGATCGTCGTGGCCTGATTCTTTATATCGATTGGTATTGA</dnaseqindica> |
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