BGIOSGA028176
| Gene Name |
BGIOSGA028176 |
|---|---|
| Description |
BGIOSGA028176 |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA028176, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA028176-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA028176-PA |
| Length |
7889 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:6575109..6582997 |
| Sequence Coding Region |
6575109..6575306,6575360..6575895,6576442..6576535,6576771..6577229,6577497..6578166 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:6575109..6582997 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:6575109..6582997 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGGGTGATGAAACCCCTGCTTGCAAAGCTAACCACTCTGATGGGCGACGAGTACAAGAAACTCAAGGGGGTCAGGAATCAGGTGTCCTTCCTTAAGGATGAGCTCACCACCATGAGTGCTTTTCTTGAGAAGCTAGCTTTCATGGATGATGATGGTGGTGAGCTCGATCCGCTGGTGAAGGACTGGAGGAACCATCTTGGTGGTGGTGCTGATGCATCTGGTTTCCTCCAGAAGACGGCTCGCCGTCTCAAGACGCTGCGCGTGCGCCATCAGATTGCCAACCAGATCGACGAGATCAAGGCTCGTGTGATCGAGGTAAATCAGCGCCGCAAGAGGTATGAGCTTGATGGATGCAGCAATTCCAGAGCTTCTGACCCTGTGGTTGTAGATCCTCGCTTAACATCGCTCTACCAAAAGGCTGATAATCTTGTGGGTATTGATGGCCCAACAGAAGAGCTAATCCAATTGTTGACAGATGCAGGGCAGCAGAAGCTCATGGTGGTGTCCATTGTGGGATTTGGGGGTCTTGGTAAAACAACACTTGCCAAACAGGTTTATGATAAGATCGGACAGCAATTTGACTGCAAGGCGTTCGTTTCCGTTTCCCAAAGACCTGATATTGCAAGACTACTCAGCACCATACAGTCAAAACTTAACATACAGGAGTCTTCCCAAGCTCATGAGGTGCAAGACATCATCGACGGCATTAGATACTATTTGGGAAATAAGAGGTATCTTATCGTAGTTGATGACTTGTGGAAACGAGAAGCATGGGATATTATTAGCTGTGCTTTTCCAGAAAATGCTAATGGTAGCAGAGTGATACCAAGAATAATGCAAGAATGGGAGAGTATACGGAATTCTTTGGGCACCCCATTTGGCACAAATCCAAGCTTGGAAGGAATGAGGCAAATTCTAAACCTGAGCTACAAGAATCTTCCTCTTCATCTTAGAACATGCCTCTTGTATCTCGCCAAATACCCAGAGGACTCCAGTATCGACAGGGATGATGTGGTTAGACAGTGGATAGCCGAAGGCTTTGTTAGAAGCTCTCCCGGGCAAGATTTGGAGGATGTTGGCAAGAGCTATTTCAATGAGCTNATCAATAGGGGTTTGATTCAGCCAGAGCAAAATAATTATGGAGTGGTGATGGGTTGCAGGGTGCATGATATGATGCTTGATCTGATCCTGAGCAGGTGCAAGGAGGATAATTTTATCAGTGTTGCGTACAGCTGTGAAGAGTATATGCTCATAGCCGGGCAGCATGGGTACAACTACAATAAGGTAGAGCTCCCTAGTAGAATATGTGGCCTTGTGCATTTGGAGACGCTGGAAATAGTTGCGTATCATGCTGTAAGCTTCCCATCAGATATTGTTAGTTTGGCCTGCTTGTCCCACTTGAGGCTTCCACGGGGTGGGCTGCCCAATGGGATACCCAAGATCAAGTCTCTACGCACTCTGGAAATGTTCCATCCCCCAGATATGGATATCAAGGCCCTTGGTGAGTTGACCAATTTAAGGAAACTGAGTCTCTTCTTTGACCTAGAGGCAACAATGGGAACGGCTAGTAACCTTAATGCTCTCGGGTCTTCCATTGGAAAACTCCAAAACCTCAGATACTTGGAATTTACAGTCCCGACTGTTAAATTTGATGATGATGGCCTGCTGGGTTCATTGTCTGCTTTTCCTTGCAGTATTGAGATACTGAAACTGGAAACTTGGCGCTTCTCCAGAATTCCCACATGGATCAACGCTGATCTCTGTCACCTCCACCTCCTGGAGCTGCTGGTGTCAGAGACGTGCACCGATGAGGTTGGTGTTGTTGGAGAGTTGCCCTCCCTCATCCACCTCCATTTGCAAGTGGAGCTGAAGATGAAGGGTACCGTCGTGTTCGGAGCTAGTGGGGCAGCTGGGCTTCCAGGCAGGTGTAATGCCCAAGCTCCAGATGCTCGATTGTTGAGGCTCAGCTCGTCTGTTCTCACTCTTTCAGCTCCTCTCCCAGTCTCCCCGTCTACCTCGCATCCAATCCAGAGAGCTGCGGCAGCCGCCTCGTCTGTTGGGAGGCGGCATCTCGAGCAGTGTCGAGCTCCGGCGCTGGGACGGCGTGGGCAGCAGCTCGCGCTCCAGCTTGGCGACGGCGGTGACGGCGGCAGCAGGCTCGCGGACTCCGGCGCACGGCGGCATGAGCTTTTTGTTCAGCTGATGTTTGCTTTCCTGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGVMKPLLAKLTTLMGDEYKKLKGVRNQVSFLKDELTTMSAFLEKLAFMDDDGGELDPLVKDWRNHLGGGADASGFLQKTARRLKTLRVRHQIANQIDEIKARVIEVNQRRKRYELDGCSNSRASDPVVVDPRLTSLYQKADNLVGIDGPTEELIQLLTDAGQQKLMVVSIVGFGGLGKTTLAKQVYDKIGQQFDCKAFVSVSQRPDIARLLSTIQSKLNIQESSQAHEVQDIIDGIRYYLGNKRYLIVVDDLWKREAWDIISCAFPENANGSRVIPRIMQEWESIRNSLGTPFGTNPSLEGMRQILNLSYKNLPLHLRTCLLYLAKYPEDSSIDRDDVVRQWIAEGFVRSSPGQDLEDVGKSYFNELINRGLIQPEQNNYGVVMGCRVHDMMLDLILSRCKEDNFISVAYSCEEYMLIAGQHGYNYNKVELPSRICGLVHLETLEIVAYHAVSFPSDIVSLACLSHLRLPRGGLPNGIPKIKSLRTLEMFHPPDMDIKALGELTNLRKLSLFFDLEATMGTASNLNALGSSIGKLQNLRYLEFTVPTVKFDDDGLLGSLSAFPCSIEILKLETWRFSRIPTWINADLCHLHLLELLVSETCTDEVGVVGELPSLIHLHLQVELKMKGTVVFGASGAAGLPGRCNAQAPDARLLRLSSSVLTLSAPLPVSPSTSHPIQRAAAAASSVGRRHLEQCRAPALGRRGQQLALQLGDGGDGGSRLADSGARRHELFVQLMFAFL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..198#252..787#1334..1427#1663..2121#2389..3058#7624..7889#ATGGGGGTGATGAAACCCCTGCTTGCAAAGCTAACCACTCTGATGGGCGACGAGTACAAGAAACTCAAGGGGGTCAGGAATCAGGTGTCCTTCCTTAAGGATGAGCTCACCACCATGAGTGCTTTTCTTGAGAAGCTAGCTTTCATGGATGATGATGGTGGTGAGCTCGATCCGCTGGTGAAGGACTGGAGGAACCATGTCAGAGAGATGACCTTGACATCGAGGACTGCATCGATGACTTCATGCATCAGCTTGGTGGTGGTGCTGATGCATCTGGTTTCCTCCAGAAGACGGCTCGCCGTCTCAAGACGCTGCGCGTGCGCCATCAGATTGCCAACCAGATCGACGAGATCAAGGCTCGTGTGATCGAGGTAAATCAGCGCCGCAAGAGGTATGAGCTTGATGGATGCAGCAATTCCAGAGCTTCTGACCCTGTGGTTGTAGATCCTCGCTTAACATCGCTCTACCAAAAGGCTGATAATCTTGTGGGTATTGATGGCCCAACAGAAGAGCTAATCCAATTGTTGACAGATGCAGGGCAGCAGAAGCTCATGGTGGTGTCCATTGTGGGATTTGGGGGTCTTGGTAAAACAACACTTGCCAAACAGGTTTATGATAAGATCGGACAGCAATTTGACTGCAAGGCGTTCGTTTCCGTTTCCCAAAGACCTGATATTGCAAGACTACTCAGCACCATACAGTCAAAACTTAACATACAGGAGTCTTCCCAAGCTCATGAGGTGCAAGACATCATCGACGGCATTAGATACTATTTGGGAAATAAGAGGTAATTAACTAGAGTCTTCTTTTCTAGTCTTTGAGAACTATATACTTGGTATCAATACCTCTGAACAAAGACAATATACTTCATGATTAACACTAAAAGGTATTATACCTATCAAGGTGTGCACTAGATGTGTGGGATGTTGATGACTCTGTGCCTTCATCTATGCTTATTTTTTTTTATACTAAAACTCATTTTGCATTGTTCTGTGTAATACCTGGCCCATTACTCCATTAGTAGATTTCTTTAAAAAAATTGGAACCATTTCAAGTCTCTTGATGAACCTGCCAATGACAAAATATAAGTTAGTTGCTTTTCACTTGGTGTTACCAAACTTGATTATCATCAATCTGCTAATTTAGCCATGGTATTCACGGATTCGCCTAAATGGATTTACCTAGTTTTGTTAAATCATGTTGTACTGAGTTGTTTCATTTGTAGTTTTAAACTTTCAATCATACATTATGATGATGCACGTAAATATAGCATGTGCAAACAATAGGTTATATTTACATGTAAATATAACATTTGCAAAAAATAATTTGACAGGTATCTTATCGTAGTTGATGACTTGTGGAAACGAGAAGCATGGGATATTATTAGCTGTGCTTTTCCAGAAAATGCTAATGGTAGCAGAGTGATAGTAACCACCCGTGTTGAAGATGTGGCTTGTTGGGCATGTAGCAACCATCAATACATTCACAGAATGAAGCCCCTCAATAGTGAGGACTCAAAAAGATTGTTCTTTAAAAGAGTAATTCGATCCAAGGATGGTTGCCCCTCACAGTATGAAGAAGTTTCAGCCGAAATCTTAAAAAAGTGTGGAGGTTTGCCACTCGCAATGATTACTATACCCACCTTATTAGCCTTGTGAACAGCCAAGAATAATGCAAGAATGGGAGAGTATACGGAATTCTTTGGGCACCCCATTTGGCACAAATCCAAGCTTGGAAGGAATGAGGCAAATTCTAAACCTGAGCTACAAGAATCTTCCTCTTCATCTTAGAACATGCCTCTTGTATCTCGCCAAATACCCAGAGGACTCCAGTATCGACAGGGATGATGTGGTTAGACAGTGGATAGCCGAAGGCTTTGTTAGAAGCTCTCCCGGGCAAGATTTGGAGGATGTTGGCAAGAGCTATTTCAATGAGCTNATCAATAGGGGTTTGATTCAGCCAGAGCAAAATAATTATGGAGTGGTGATGGGTTGCAGGGTGCATGATATGATGCTTGATCTGATCCTGAGCAGGTGCAAGGAGGATAATTTTATCAGTGTTGCGTACAGCTGTGAAGAGTATATGCTCATAGCCGGGCAGCATGGGTACAACTACAATAAGGTCCATCGACTGTCCGTGCAGTCAATGGATTCAGAATCAGATTGCACAATATTAATGGAGGGTGGGGTCATTCCTGCTCGCCTGGCTCACGTTCGATCAGTTTCTCTGTTTGGAAAGCATCCAAGAGAGCTCCCATTGCTGCTGCCGTTGTTTAAATATCTCCGGGTACTGCATATAACGTTCTATCTCCTCGATCAAGCCGATCTCACTGCCATCAGACATCTGGTTCAACTAAGGTATTTGTTGTTTGTGTCACATTGTTTCAAGGTAGAGCTCCCTAGTAGAATATGTGGCCTTGTGCATTTGGAGACGCTGGAAATAGTTGCGTATCATGCTGTAAGCTTCCCATCAGATATTGTTAGTTTGGCCTGCTTGTCCCACTTGAGGCTTCCACGGGGTGGGCTGCCCAATGGGATACCCAAGATCAAGTCTCTACGCACTCTGGAAATGTTCCATCCCCCAGATATGGATATCAAGGCCCTTGGTGAGTTGACCAATTTAAGGAAACTGAGTCTCTTCTTTGACCTAGAGGCAACAATGGGAACGGCTAGTAACCTTAATGCTCTCGGGTCTTCCATTGGAAAACTCCAAAACCTCAGATACTTGGAATTTACAGTCCCGACTGTTAAATTTGATGATGATGGCCTGCTGGGTTCATTGTCTGCTTTTCCTTGCAGTATTGAGATACTGAAACTGGAAACTTGGCGCTTCTCCAGAATTCCCACATGGATCAACGCTGATCTCTGTCACCTCCACCTCCTGGAGCTGCTGGTGTCAGAGACGTGCACCGATGAGGTTGGTGTTGTTGGAGAGTTGCCCTCCCTCATCCACCTCCATTTGCAAGTGGAGCTGAAGATGAAGGGTACCGTCGTGTTCGGAGCTAGTGGGGCAGCTGGGCTTCCAGGCAGGTGTAATGCCCAAGCTCCAGATGCTCGATGTACGATTCGAACGTTGTGATTCGGGCATTGATACACCACCTGTTGGCATGGAGCATCTCTTGAGCCTCCAACACATCCGTGTCGAGATCAATGTTGAGCTGGAGGACAGAAAAATTTATCCTCGGGACACCGCTGAGCATGTTCTCAGGGAAGCCGCACAAGCGCACCCCAACAAGCCCGCCTTCAATTTCTATTTCTTCTCGTAATTGATTGATCCTCTGTCTGAGTTCTTATCCTATGTGTGTATCAGTGTATGTGCTAATAAGTATTGGAAACAGCAACAACGTTGTGATTTCTGCGACAGCAAATGGTGAGTGTGCAAAGCCTACCGCCTGTAGGACAATACATTATCATAGCCAGCATTTTAAAAATGTTTCTCCTGTTTGTTCTACAAACGTTATTAAAAGTGTACTATACAGAGCATTTCAGCATTATCATATCCTGTTTGTTTTACTTACAAAAATTGTCAGCATTATCATATCCTGTTTGTTATGCTTATACATTTCCTTCATTAAAGCTGTGGTACCGTACTGACTCCACCGGTCTCAACACTAATGGTTCCAATATGCATGATCCCTTCTAGCAAGCCTGGAAAGAGGATCTCATACAAATCAATTTGAAGCAATTCACGGAACACGGTGGAAATCACAACATGAATACTGCTACTCATTAGTTCCAAAAAAATTTCAAGAAACACACGTCTATGGAAAGGTGGTACTATTAGACAACTATACAAAATTTCAATATTAAACTCATACTTCATTTCTTCAGATTAAAAGTTTATAGACAACAGAGTACATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGCCACGCCGCCAGTTAGACCACCCAATGAACTCTGATCAAACCATCGGATCAAAAAAAACACGTATCAACGAAACTAAAGTAGATCAACTTTATTACATCAATATGTGTTTACAAAGTGCATTTAATTAAAGCACTTCTCCCTCAACTCTAATACTAGGATTGAAACCTCGAAGCAAATTTTAAATTTTCTCTCCCAACATGTCGATATCTTCTAGCCTCAACCTCTTATCTATTTATACTCACAACGTGGCTGCCCCTTAGCTACGAATCCAATAAGAGCTAGGACTCCTAATCACATGGAAACCTACTAAAAACAACAGTGTAGTACAAGTTTGTGATGCTACAGTCCTACTAAACCAGGGAAACCTACTAATCACATAGGCGGTAGTAATGTGTGATGCTACAGTTCCACGAACTATGCTGCTGCTGCTGCTACTGCCTCTCTGTTGATTTTGCTGCTGGGCTGCACGCAAAATGGGCCAAGGCATGTCCTGCTTGCTGCTGCTTGCAGGCATGGGCCAAAGGCCCCAGGCCTACTGATGCTAGGCTGTGCAGCTAGCTAGCTTTCCTGCTTAGCGGTTGCGGGGCGTTACATCATCACATATATTGGGTAATTTGGAACCATGCCATTATAATTTTGTAAAGTTTGATATATACTATCGGTATCTCAATGACATATAGAACCCACATGAGTCAATGACATGTGGGTCAGGATGGCATATCTTAATTTTTGCAAAATTATAATGGCATAGTTCCAATTTTCCCTATATTTATTAAATCAACCCATTGATTTCACAGAAAATGGTTCGGAAAGTTTCCTGTTTTCGGACGTGGTTTCGGACCGGAAAGGGTCGATCGAATTTATCTTCGAAAAGTTTGAGAAACGGAAAGGAATTTTGAATTTTGAATTTTGCTCAGAAACAAAAATGAATACGGTATCGAAATTGGTCGGAAATTTCCGA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| External Link(s) |
