BGIOSGA028478
| Gene Name |
BGIOSGA028478 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA028478, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_28843 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA028478-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA028478-PA |
| Length |
6149 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:16082251..16088399 |
| Sequence Coding Region |
16082251..16082669,16082759..16082858,16083923..16083964,16084117..16084313,16085794..16085890 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:16082251..16088399 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGTTGTTTGATGACGACGACGACGAGTTCCCGCAGTTGAAGGACGTAGACCAATATGCTTGTAAGGATAGCCATGAAGACCTTGTTTGTTTCAGCATCCTGCCGTTTTGGTTTGATGAAGAACATCGACTGCCGGGTTCTGAAAAGGGTGCATACATTCGTGGAATTGACTGTGAAGGCCGTCAGCCTGTGTATAAGCGTATCGAAGCTTGGAGGGTGGAACTTGACTGTGAGAAACCTATGATCTCAGTGCTTTCAAGTGAGGGCAATTGGATAAGACTGTTAAATCCACATCCAGGCTATGCAGAAGATATTGCCCGGTCAGTATTGATCACTATACAAATGATCCACTTTGTTAGAAAGCATCCTGCTAAAGATGAGAGAACTCTTTCGAAACACCTCTGCGAAGTTTTCAGGAAATTTTTTACTAAACCACCTGAGGTTGATGACTTGCGGAAGAGTTATTCCCTTATCAAATATTTCATGAAAATGGATCAAACTCTAGTGAAGTCAAAGATTCTGAGAAGACCTCTCGAGGATACTTGGATCATCATTGAGACTGAATTGAGGAAAGCCAGCCTGAATGAATCATTCATTGTGAGCAATGAGTCATCTACAAACTGTGATGACTACACTGAAGATGGCAGCAGTGGCAGTAGTGATGATAATGGTGATAATTATACTGATGGTAATGCCAGTGATGATGGTACTGAGGCAGTGTGCGCAATATGTGATCAAGGAGGAATTCTACTTGGCTGTAAAGGTGAATGCAAGAGGTCTTTCCATCCCACGCTAGAAGATGGCACAAAATCTTTTTGCAAAACTCTTGGTTACACTTCTCGTGAAGTAGAGGAAATACCTATCTTTATTTGCTCGAACTGCCAACATAAGCAACACCAGTGTTTCAAATGTGGACAGCTTGATTCTTCGCATGAGACAAATCCAAAGGTATTCCAGTGTTGTAATGCATCTTGTGGGCGCTTCTACCATCCCAAGTGTGTGGCAGGATTACTTGAGCCTGATGGAGCTTGTGGATTGGAGAAACGTATTGCAGATGGAATGACATTTACATGTCCGGTGCATTGGTGCTTTGAATGTAAACAAATCGAGGACAGGGAAATTTCTTTTAAAAAGAAGGATGTCACAGCACGTGTTTGGGAGGTTCCCAAAGGAGATCCTAAAATATTCATCTACTGCCTGGACCATGACATTGATGCTACTTTTAGAACACCTTGTAGGGATCATATAAAGTTCCCTTCAGCCCCACAAATTGAGAGAGTAAAAGATCTTGCTAGGAAAAAGGTTAAAGTTACTGATATAAGGAACACCGATGAGGTTTCACCAGAATCTGCTGAGCTGTCAACAAAACCAAGTAGGGAAGAAGGTGATCAAAATCAAGAAGTACCTATTAGTAATAAGCAAATGGATCATAATCTTCTAGAGCACGAGTGTGCAACAAATAACTTGAGAGTGGATCTGCAATATGAATCACCTATTGTTAGGGCTGCTGCTTCTGTTTTAATCAGTTCAGAAGCTGCGAAATTGCAAGAAAATCAACTGGGCTCTTCTATTCTTATGGAAAAAACATCAAAGAGCTCTCCTTGCCCTGTGAATAGTGGGGCAGAAAAGAGGTTAGTAAGTATTGCTGGAAAGGGAGGATCCCTAGGGACATGTGAAGATATTGTTATTCAGACTAGGATTAGAAACCTTGCTTTTAACACAAGGAAGGACAATATTTCACCCATGGGTGATATGAGGTCGGGGGAACAAATCCACCCAAGGGGGACCCTATGGGTCGCCGAAAATCTATATCAAGGAAGGTGGCCCATAAAAAAAGCGCATTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MALFDDDDDEFPQLKDVDQYACKDSHEDLVCFSILPFWFDEEHRLPGSEKGAYIRGIDCEGRQPVYKRIEAWRVELDCEKPMISVLSSEGNWIRLLNPHPGYAEDIARSVLITIQMIHFVRKHPAKDERTLSKHLCEVFRKFFTKPPEVDDLRKSYSLIKYFMKMDQTLVKSKILRRPLEDTWIIIETELRKASLNESFIVSNESSTNCDDYTEDGSSGSSDDNGDNYTDGNASDDGTEAVCAICDQGGILLGCKGECKRSFHPTLEDGTKSFCKTLGYTSREVEEIPIFICSNCQHKQHQCFKCGQLDSSHETNPKVFQCCNASCGRFYHPKCVAGLLEPDGACGLEKRIADGMTFTCPVHWCFECKQIEDREISFKKKDVTARVWEVPKGDPKIFIYCLDHDIDATFRTPCRDHIKFPSAPQIERVKDLARKKVKVTDIRNTDEVSPESAELSTKPSREEGDQNQEVPISNKQMDHNLLEHECATNNLRVDLQYESPIVRAAASVLISSEAAKLQENQLGSSILMEKTSKSSPCPVNSGAEKRLVSIAGKGGSLGTCEDIVIQTRIRNLAFNTRKDNISPMGDMRSGEQIHPRGTLWVAENLYQGRWPIKKAH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..419#509..608#1673..1714#1867..2063#3544..3640#3736..3831#4527..4693#4860..4943#5030..5461#5751..5811#5997..6149#ATGGCGTTGTTTGATGACGACGACGACGAGTTCCCGCAGTTGAAGGACGTAGACCAATATGCTTGTAAGGATAGCCATGAAGACCTTGTTTGTTTCAGCATCCTGCCGTTTTGGTTTGATGAAGAACATCGACTGCCGGGTTCTGAAAAGGGTGCATACATTCGTGGAATTGACTGTGAAGGCCGTCAGCCTGTGTATAAGCGTATCGAAGCTTGGAGGGTGGAACTTGACTGTGAGAAACCTATGATCTCAGTGCTTTCAAGTGAGGGCAATTGGATAAGACTGTTAAATCCACATCCAGGCTATGCAGAAGATATTGCCCGGTCAGTATTGATCACTATACAAATGATCCACTTTGTTAGAAAGCATCCTGCTAAAGATGAGAGAACTCTTTCGAAACACCTCTGCGAAGTTTTCAGGTATCTTTGCCATATCCTTTTGTTTGTCCTTTTCTTATCTCACCTGGCTATCAGGTCATAAGTTTGACATTCTGATTGTTTTTATATAGGAAATTTTTTACTAAACCACCTGAGGTTGATGACTTGCGGAAGAGTTATTCCCTTATCAAATATTTCATGAAAATGGATCAAACTCTAGTGAAGTCAAAGGTATTAATAATTGAATCTTGACGTAGGATATGCATGAGCTCTTCTAGCTGCAATTGTAAACTCTGATTATATTTACATGCTGAGTTTTAAAAAAGAAATTCCACCTTCTCAATGTTAAGACAGAATGACAGATTAAAATGTGGTGTTAAGAACCTTGTTGTCAGCCTTGTTTTAGAGGTTGCTTGTGCATTGAGGATGAGAAGCCACTTTTTTGTGAGATATGCTTATGTTTTGTTACTATGCTGCAGAATGTAAAGAAATGGTTGATTACTAACACCGTTTAGAAGGTGGCTGGTTGGCTTAACCATGAAAGTAAAGTAGTTGGTTTTTAATGCAACTAGTACCATGTTAGTCCATCTTAACGGATCCCAACTAAATTTGGTACAAATTGAAAATATACATACAATCGATAATTGAACATAAATTTAAAACATATATACATGATTATCTTTACCCTTTTAAAAGGTTGCAATGGCCTTGGAACAAGGTGGGGCACCTTTCCCCACTACAGTTTTTTTTGAGGGGATCCTCACTGCAATTTTTATAAATTGGCCTAAAATGTTATAATATTTTTCAATATTACTGAAAAGGGGTTGCATATATATGATGAAGGTGGACTCTCGCTCAAACACATGTATCACATATTTTTGCAAAGATATATTTATATTTATTTTTTGTACTCTTTTTATTTTTATAAGACAAATTCTCCTCTATTTAAATATAATATAAAATAATTCAATATAAATCGCTTGCCATATAGCAAAGTATTGAGTAAAAATATAACTGATCTATTTTCGACAATATGATTACATATTTCTTTTATCAGTAGCGAATCATTGGCATTTTTGCTAGTTTTCTGTTAAAGTCTTACAAATACTAAATACATGACTACATATTTGCCACCACAAAAGATCTGGGGATGGGCTTTGGTGCAAAACCTACCATCACCAACTTCCTCTCTCAAAGAGTAACAACGACATACTTATATATCATTTTCTTAATATCATTTCTACTATAATGAAACCAATGGGTAGCTTCTCACAAAGATGGTCTTTTGTACACAGATTCTGAGAAGACCTCTCGAGGATACTTGGATCATCATTGAGGTAAATTAGATGTTAGAGACTCAGAAAGAAGGCTAAATTTGTATTAATTGAAATCCTTTTGAAGTTTGTTATTTCTTGGTAAAACATAGCAATGCTTGTTTTGAAATTTGTTGCGTCGTATTTGAATTTTGTTACTTATCGCTTGACTTCAGACTGAATTGAGGAAAGCCAGCCTGAATGAATCATTCATTGTGAGCAATGAGTCATCTACAAACTGTGATGACTACACTGAAGATGGCAGCAGTGGCAGTAGTGATGATAATGGTGATAATTATACTGATGGTAATGCCAGTGATGATGGTACTGAGGCAGTGTGCGCAATATGTGATCAAGGAGGAATTCTACTTGGGTATGGGCAGTTCTGTATTTTGTTTAAATTGACCAAACAATTTCTATATTATTTTACTGTTACTTGGACACTTGCACGGGACTTAGTATCTGAGTCATATTCAGATATCTGATTCTGTGGGCTTTTAAAAGAAAAACAGATTCAATGATATGCCTGAATTAATGCAGAACTAAATAAAACATGTACCTAATATGTCATTCCCGTAGTCAACCAAGTAAATATTACATTTTTCACTTTACGCTTAAAATTTCCTCATTTTCTTCCTAGAAAAAGCGTTGGTATCCGAGAAAACTTCTTCTATGAAAAAGTATAATACCTCGCTGGTAGTTTCATAAAATAATCTTATGTGATAATCCAGAATACGTCGTGGTAGTATTCTGGCACAAAAATGGGCCTTTCACCCTATCAAATGCAGATTGACTACCTCTTGATTACTTACGACAGCGTTTAAGAAAATGAGTTACTGGTAGCATATTGTAGTTCTAGACTTCATGGTGGCATTATTGTAGATTGGAGCTTTGTCAATCAAATATATTGGTTTGATCTGAATTTATTATTCCTACTCTATTTAGAAGTGATTAATGGAAGTTGTACTCTTCATTATGGTCACATAATTTAGTACACGACAAACTTTTTCTCCAAAGTCATCTGATGAACAAAAGCTATTAAATGGAGTTACGCATCAGATGACTTTGGAGAAACATATAGAAGTTATAACAAGCATAGGTCAAGAAAAAGTATTCGGGTTGTCCTGCAAGCACAAACTTGTTTATGTATGGTTCCCCTAACCTTATTGTGTGTAATGCAGGTGCTTTTATTGCAATAGGATAAACATTTCTTAATGTCACTCAACTCTGCTGCTTATTGAAAGTATTTTTAGATGACAAGTAGATAGATATAAACATAGGTACTAAGTGCTATATATCACAATTACTAGCATCATGTCCATGTGTTGCAATGGAACCTAATTACCTAACTAAATATTGATCAGTCTACAATATAAAATGAAACTAATAAATTATTTTATATGGAGAATCTAAAACTTTCTTCTTGTGATATAGCTTGCTCATCTTATTTTCCGTTCTCATTTAGAGCAGTTCTTATTTTTGATCTGTCTCCTAAAAATCTTTTTTTTTGCCAAGCTATAAAATGTAGAACCATGGTATTTTTCTCTCAAAAAGAACTGTATTTGATCTGTTCCATACAAATTGAAACTTGAACAAGACTTTTTGCAACATTTATGGTTGGGAGTTTCCATTCATGCTTACCTTAGATACTGATGGGGATGGAATGAAAGTTTGTAATTTTCATGTTGCAGCTTCCTCTTAACCATAACTTTGTTTATTTTTCCCTTTCTTTCTAAAGAATCCGTTGAATCAGCTGCTTTTGAACTTCCTTTATGTGCCATGGGACCACTATATAACCATTGGCATGAAATTTTCTGAGTGCTTCCATTCCTCACCATAATGGTTTCATGCAGCTGTAAAGGTGAATGCAAGAGGTCTTTCCATCCCACGCTAGAAGATGGCACAAAATCTTTTTGCAAAACTCTTGGTTACACTTCTCGTGAAGTAGAGGTAGATTTTCAAAGTATCTATGACTATTGCTGCACTTTTATTGTTTCCACTTCCTTTCTCAAGTTGGTGATAATGGCATTTATGCATATTAATAGGAAATACCTATCTTTATTTGCTCGAACTGCCAACATAAGCAACACCAGTGTTTCAAATGTGGACAGCTTGATTCTTCGCATGAGACAAATCCAAAGGTAACATATCTAATCCTCCTTGCATGATTGTGGAACTGTGGTATGTTGAGCCCATTTGTTGTAGCAAATGCAGTTCCCTTTCGGAAGCAATGCTTGCTTTCTTCCAAGTTTGTTTGTTGTTTATTTCATATTTCCTTTCTTACTACAGTATCTGTTTCTTCATGCCTTGAGGTTCCCTAGATGATGTATGTCTTTTATTCAAATATTACATACATATGATGCCTTGTTTTAATTGTAAAAGGAATTTTATATCTTATTCTTCCTTGATGTCTTCATCTGGTATTATTTTGTGAGCAACTGCTGCTGTTTTTCTTCGTTTCTTCTCCTCTTTGCACTCTTGTGCATGTCATTGTTGCTCGTGAGCTGCATGGCCCTTCGGTGTCAAGAATAATGGTGTATAATGATTGAATGACTCTTGGCAAGAAAAGCTTCGTCTAACCCTATTTTCTGAGGCTTCCCTTACAAGTTACTCATTATATATAAATCTAACTAGATGAAAACCCCTTGTGTTGTGGGAAATTTGCATGACAAAATAGTGTATATGAGTTGTGTAGTTCCTTGTTTTATGATTTCATTCATGTGCTTTCTATATCGTGCACCTTTGGTCGATTATCCAATTATTTAAGGTGTAATGCACATGGACTATCTTACTCTTGCCTCTTAGTCTTATGTTTCTTATCTCTGCATCGCTTCAGGTATTCCAGTGTTGTAATGCATCTTGTGGGCGCTTCTACCATCCCAAGTGTGTGGCAGGATTACTTGAGCCTGATGGAGCTTGTGGATTGGAGAAACGTATTGCAGATGGAATGACATTTACATGTCCGGTGCATTGGTGCTTTGAATGTAAACAAATCGAGGACAGGTCCCAAACACAACTGTGGCTTGCAGTCTGTAGACGTTGTGTAAGGTCATATCACAAAAAATGTTTGCCAAGGTACATTACAATATCCAGACTGGTTCCTTTTGGTTCATTAGTTTGTATGGCTGTTGTCTTCTCATTTTATCATGATATTCGTTGTATTACTTAGGGAAATTTCTTT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