BGIOSGA028878
| Gene Name |
BGIOSGA028878 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA028878, complete gene. |
| LocusTag |
P0481F05.12 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA028878-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA028878-PA |
| Length |
5062 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:25649362..25654423 |
| Sequence Coding Region |
25649362..25649556,25649627..25650045,25651461..25651602,25651676..25652920,25653836..25654423 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:25649362..25654423 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGACGGAGGTGTTCCCCGTGGTTGACCTCCGCGTGCTCTCGCAGTCCGACCTGGAAGCGCTCGCCGCCGCCTCAGCCCACGCGGTGGCCCCGGGGGGCAGCTGCCCCGACGCCGACCAACTCCCGCCGCTGAAGATCGACCGCGCCGTCTTCAACGAGAGCGCCGGCTCGCGCAAGCAGACCTTCTCCCGCCTGCCCAGGGGCAACGACAAGGAGGACAGCTTCATCGCCTACCACCTCCGCCGCCTCTTCGCGCCCGACGACCCCTCCTCTCCCCAAATCCAAACCCTAGCTCTACCCGCGCCGCCGTCTCCCGACCCCGACCAGTTGACCACCAACTCCAAGGGGGTCTCCGTTGATCTGGTGAGCCTCTCACGGCTTGCCGACCCGTACGACGCGGAGCTCGGGAAGCGGACTGCGGGGATGACCACGGAGGAGGAGCTGATGGGCTTCATCTCTAGCCTCGCGGGTCAGTGGGTGAGCCAGAGGATGCGGAGGAAGTTAGTTGATGCGTCCTTCTTCGGGGATCACCTCCCCAGCGGGTGGAGGCTGCAGCTTGGGATCAAGCGGAAGGACCGCAAGGCCTGGGTGAACTGCTTCAGTTATGTGAGCCCCAAGGGACAGAGTTTTGCTACTTGCCAAGAGGTTTCTGCATACCTCATGTCCCTTCTTGGGTATCCGGAGTTCAAAACGGATAATATTGAGTATGGTAGCACACAACAACATGGCTTGTGTGCTGACGATGGTGTTAATGTTTTAGGTGTTCAACACCAAATTGGTACAGGTATGGACAGTCAAAGTATTTTGCCAGTTGCTTCTATTACCTTTTCTAGTCATTCAAGAGATCAAGACGAAACAGATGCAGATGATATAAATTCTTATGAATGTCAACAATGCAATTTAACTTTTCATGGTCAGAGTGCCTATGCGCATCACCTGATCACTTTTCACAAAATGGGTTCTAAAAGGCGTAAGATTAACAAGGTTGGCAAATTTGGTGAGCCAGTGATAGGCAAAGATGGGAAATTTGAATGCCCAGTATGTAATAAGACGTTTGAGGAACAGTCACGGTACTTTGGTCACGTTGGATCCCATGCAAAGTATCACGGGCTGACTCCTGAAGCATTCCTACAAACCTTGTCAGGAAAGGTTGGTAACGATTCTTTTGCAGGTTTGTCATGTAGCCTTCAAGATTTGGTCGGATCACCACAACTGAATGAGAAGACTACTGCTAGTGAAGCACGATCACAGCATCACAATTGTTCAACTAAACATGGAGGCAATAGTACAAGAGGTATAGACCTTTTTAACTCAAATTGTCCAGCTAACTTCAATGGGCATAATCAAACTTGGTGTAGACCTGATGAAATTCCTCCCACCACAGATGCTCCAAGCACATGGACTTATAGAAATAATGTGACGAACTGTGCTGATAGAACTGTTCCGAGAACAGCACCTCAGCCCAATGATCACATGGATTGCAGGGTTAGTGGCTTTGCTGAAGCAACTAATTTTAACGATCAAGCAGGAAGACACCAAGGTTTTAGACCTTCCTCCTTTGGAACTACCAACCATTGTCAAGGCCAGATAATTGATCATGCAGTAGCTGCTTCCAAGCATGCTGAGGTTAATAATAGTATGAAATCAAGAGATGTCAACCTCAATTCACGCCTGAACACAATATCCTTTCCTATTGCAACTGCGAACAATGAAACATCGACTGCCCTTAATGACGTGAATCGGTCATGCATTACTGGAAAAGGTTTTAGTGGAAGTTTCAGTAACAATGATGGTGCTGCATCTATCGTGTTGCCCAGTTCTGGATTAAACAATAAAATTCCTAGCTCCCTCGGTGTAGCTGACAGATCATCTATTGCTGCAAGATCTTTCAATGCTGGTTATGTTAATGAAAATGGTGCTTCTGAAGCTAACAATATTGGCAACAAAAACAATACCATGGTGTATCAGACAAGTTTGGCCATGCGCCCAGTCTCTCCTTGTGATCTGCAACTTGGATTTAGTGGTCAGAAGCAGCAGATATTGCCTGGTTATGGAGAACTTAGACCAGCTGCGTCTGGGTCCCCTCAGCTTGGGGGCATGGCAGCAAACAGTTCAATTCCCACCAGACCCTCTCAGCCGCAGTTTGGGAGTATGGCCAGAACCGATGCTTTGCCTACTGGACCCTCTCAACCAGGGAGCTTGGCCAGACCTAATTTTGTGCCCACAGGATTTTCTCAGTTTGCAAGCAGGCCACCTACTTCTGTACCACCAGCCGATTCCTCTCAGTTTGCAGGGGGCATGGCCAGGCAAAACATTCCGACCACGTCTGAACCAACTCTAGTATTGGGCTATACTCCTCAGATGGTCAATGGCCCTCCAGCCCAGCTAGGATGGGATCTATCTTTGTCAAGGATGGTCAGTGAAGGCATGCTCCCAGTGTTATGTATATGGTGCAACAGCCAATTCCACCATTTTGGCCCCATTGATGCACAGCAATCTGGTTCGTTTGGTTTCATTTGCCCAGCTTGCAAGGAGAAGATGTCAGGCAATCCTAATGCGCCCAATAACGGTCCATGGCAACCATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>METEVFPVVDLRVLSQSDLEALAAASAHAVAPGGSCPDADQLPPLKIDRAVFNESAGSRKQTFSRLPRGNDKEDSFIAYHLRRLFAPDDPSSPQIQTLALPAPPSPDPDQLTTNSKGVSVDLVSLSRLADPYDAELGKRTAGMTTEEELMGFISSLAGQWVSQRMRRKLVDASFFGDHLPSGWRLQLGIKRKDRKAWVNCFSYVSPKGQSFATCQEVSAYLMSLLGYPEFKTDNIEYGSTQQHGLCADDGVNVLGVQHQIGTGMDSQSILPVASITFSSHSRDQDETDADDINSYECQQCNLTFHGQSAYAHHLITFHKMGSKRRKINKVGKFGEPVIGKDGKFECPVCNKTFEEQSRYFGHVGSHAKYHGLTPEAFLQTLSGKVGNDSFAGLSCSLQDLVGSPQLNEKTTASEARSQHHNCSTKHGGNSTRGIDLFNSNCPANFNGHNQTWCRPDEIPPTTDAPSTWTYRNNVTNCADRTVPRTAPQPNDHMDCRVSGFAEATNFNDQAGRHQGFRPSSFGTTNHCQGQIIDHAVAASKHAEVNNSMKSRDVNLNSRLNTISFPIATANNETSTALNDVNRSCITGKGFSGSFSNNDGAASIVLPSSGLNNKIPSSLGVADRSSIAARSFNAGYVNENGASEANNIGNKNNTMVYQTSLAMRPVSPCDLQLGFSGQKQQILPGYGELRPAASGSPQLGGMAANSSIPTRPSQPQFGSMARTDALPTGPSQPGSLARPNFVPTGFSQFASRPPTSVPPADSSQFAGGMARQNIPTTSEPTLVLGYTPQMVNGPPAQLGWDLSLSRMVSEGMLPVLCIWCNSQFHHFGPIDAQQSGSFGFICPACKEKMSGNPNAPNNGPWQP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..195#266..684#2100..2241#2315..3559#4475..5062#ATGGAGACGGAGGTGTTCCCCGTGGTTGACCTCCGCGTGCTCTCGCAGTCCGACCTGGAAGCGCTCGCCGCCGCCTCAGCCCACGCGGTGGCCCCGGGGGGCAGCTGCCCCGACGCCGACCAACTCCCGCCGCTGAAGATCGACCGCGCCGTCTTCAACGAGAGCGCCGGCTCGCGCAAGCAGACCTTCTCCCGCGTCCGCTTCGGCGCCGCCGCCGCCGTCGCCGCCTCCCCTTCCTCCCCCTACCCCCTCCGACGACGGCAAGCTGCCCAGGGGCAACGACAAGGAGGACAGCTTCATCGCCTACCACCTCCGCCGCCTCTTCGCGCCCGACGACCCCTCCTCTCCCCAAATCCAAACCCTAGCTCTACCCGCGCCGCCGTCTCCCGACCCCGACCAGTTGACCACCAACTCCAAGGGGGTCTCCGTTGATCTGGTGAGCCTCTCACGGCTTGCCGACCCGTACGACGCGGAGCTCGGGAAGCGGACTGCGGGGATGACCACGGAGGAGGAGCTGATGGGCTTCATCTCTAGCCTCGCGGGTCAGTGGGTGAGCCAGAGGATGCGGAGGAAGTTAGTTGATGCGTCCTTCTTCGGGGATCACCTCCCCAGCGGGTGGAGGCTGCAGCTTGGGATCAAGCGGAAGGACCGCAAGGCCTGGGTGAACTGCTTCAGTTATGTGAGGTGAGCCTCATCATCCTTTACTGACAAATGCTGCAATGTTAGGGGATCTGTTGTTAGTAACTGGAATGGGGGTTATAAATTGCAATAAGCTAGCTGCCTGGATGCTTGCTATGATGTTTAGAGATGCGGTTATGTGTGACTATAGATGCAAACTTGCAAAGGATGTGTGGTGGATTTGGTTTGTGAAGATTGTTTTATACTCTTCTAGCGTAGTCAACTGATGCTAATCAATCCGTGCACAAGTTTATCAGATCAGTTCTTGACAGTTTTGAATGATTGATTTTTTTTTCAACATGGCCTTCTTGCTGTCATTCTGTGGATTGCCTACTTTCTAAGGAAGAATAAATCTTATTGGTTAACAATAACTGAACACCCCCTAGGATGAGCTGTTTCATGACGAGGGGGAAATGCTATGGCTGGCCTCAGGATTAGCATGTGCTGCAGCAATTGGAGAATCATAGTAGACAAATAGATATTCTACTCCTTATTTCTCCATTAGAGTTTCCTAGTTTTGTCATTGGAGTCCTAGTAGTATTAGATACTAGTTTGTTTCCTTTGCCTTATCTAGAGGCACCTCAATATACAAAGGTAGCCTAGTACTGGATTATGCCTTAAGCAATAAGAAATATCTAAAGGGGATTGACCCAAAAGCCCAGTCGTTTCAATGACATACTAGTTAAATGATAATTCTGAATATTCTGGGGGGCAAAGACATGACTTTTGCCTACCATAGTATAAGAGCAGCGTGGAGTGTTATTGCTTTAAGATAATGAGTTTTGTTTTATTCCTTTGATATTTGTTTTTCGGCACTTCATTTGATCTGTGCTTTTAAGGCATGCATGTTATGCGATTGCAGCAGCATTATCTAGCAATGGCTTGATTGATGCTTACTATATCATAGGTTAAACATTAAGATAGATTCGTATGGCACATATGATATCTCAAGTACATAACATAACACATGTATGTGTAAATTTGCTTCTCCTGCCGAGTTCTCACTGATACACAGGTCCTAATCCAACTTGTCAATGAGAACCAGTGGATAAAGTGAATTAAGGCCATGGCATGGTGTCTAAAACAATCATTAATTTTCATTTGCTTTATTTAACTGCAATGCCTATTTGAAGTAGTGACTAGAGCACATGAGCATTTCAATCATTATCTCGAATGTTCCACAGAACTCAGGTGTTCCACCATATATGCTCAGATTTATCATCTGTCGTTGATGAATAATTTTGTTGTAATAATAGTAAAGATCACTTCTCATCACTATTAGTTTGAAAGTACGTGTTAAGATACATGCCTATTTATCTGCTCAGTGAACATATGTTGTGAATGGCTGCATCATTTCAGCGCAATAATTTTGTTTGTCGCATTTTTTCCCCTGTACTAAATGGGCATATTGTACTTTCCAGCCCCAAGGGACAGAGTTTTGCTACTTGCCAAGAGGTTTCTGCATACCTCATGTCCCTTCTTGGGTATCCGGAGTTCAAAACGGATAATATTGAGTATGGTAGCACACAACAACATGGCTTGTGTGCTGACGATGGTGTTAATGTAAGTTGAAAGTGTATGTCACTTTATCTTGTGAACTTGAGTTTGTCTAGTTTAATTTTTGGGTTTGTGGCAGGTTTTAGGTGTTCAACACCAAATTGGTACAGGTATGGACAGTCAAAGTATTTTGCCAGTTGCTTCTATTACCTTTTCTAGTCATTCAAGAGATCAAGACGAAACAGATGCAGATGATATAAATTCTTATGAATGTCAACAATGCAATTTAACTTTTCATGGTCAGAGTGCCTATGCGCATCACCTGATCACTTTTCACAAAATGGGTTCTAAAAGGCGTAAGATTAACAAGGTTGGCAAATTTGGTGAGCCAGTGATAGGCAAAGATGGGAAATTTGAATGCCCAGTATGTAATAAGACGTTTGAGGAACAGTCACGGTACTTTGGTCACGTTGGATCCCATGCAAAGTATCACGGGCTGACTCCTGAAGCATTCCTACAAACCTTGTCAGGAAAGGTTGGTAACGATTCTTTTGCAGGTTTGTCATGTAGCCTTCAAGATTTGGTCGGATCACCACAACTGAATGAGAAGACTACTGCTAGTGAAGCACGATCACAGCATCACAATTGTTCAACTAAACATGGAGGCAATAGTACAAGAGGTATAGACCTTTTTAACTCAAATTGTCCAGCTAACTTCAATGGGCATAATCAAACTTGGTGTAGACCTGATGAAATTCCTCCCACCACAGATGCTCCAAGCACATGGACTTATAGAAATAATGTGACGAACTGTGCTGATAGAACTGTTCCGAGAACAGCACCTCAGCCCAATGATCACATGGATTGCAGGGTTAGTGGCTTTGCTGAAGCAACTAATTTTAACGATCAAGCAGGAAGACACCAAGGTTTTAGACCTTCCTCCTTTGGAACTACCAACCATTGTCAAGGCCAGATAATTGATCATGCAGTAGCTGCTTCCAAGCATGCTGAGGTTAATAATAGTATGAAATCAAGAGATGTCAACCTCAATTCACGCCTGAACACAATATCCTTTCCTATTGCAACTGCGAACAATGAAACATCGACTGCCCTTAATGACGTGAATCGGTCATGCATTACTGGAAAAGGTTTTAGTGGAAGTTTCAGTAACAATGATGGTGCTGCATCTATCGTGTTGCCCAGTTCTGGATTAAACAATAAAATTCCTAGCTCCCTCGGTGTAGCTGACAGATCATCTATTGCTGCAAGATCTTTCAATGCTGGTTATGTTAATGAAAATGGTGCTTCTGAAGCTAACAATATTGGCAACAAAAACAATACCATGGTGTATCAGACAAGTTTGGCCATGCGCCCAGTCTCTCCTGTAAGTAACATGGATTGCTTCATTTCCTGTTCAGTGCATTTAAAAATAGCAACAGACATCTGTATGATACAAATGAATGAATGGATAGCATACAAAACAAAACTAGTAACTAAGCTAGATTTTCTGTTGATGCTTATAATAATAAAATCTTGACTGGCAGTGTCACTGAAAGGAGTCTACCCAGTGTAATAGAAACTCCAGTCACGTAGGACCTAATATTTCAAGCCACGATTCATCACTTCCTAAATCAAGCACACTAGCAGCCAGTAACTTAAGCAAGGGGAGTGATGTCAACTGGAAGGTTTCTTTTGTTAATAGAAGCAATTCCAACTGCATAATGGGCTCTTTTGTTACCCACTAGTTTCTGCTTGAGGTTTTGGGAAGGACTAGTAGTGTTATGCAAAATCGATACAATGATTGTGCCACTGCTTGTAACTTGCTCGCTTCAGCAAGTACTAGCCAGAATGCCAACAATCTTATGCCTATGTAGGACAATTTTGGTCATGTGTAGTTTACGCTCTGGTTTGTTCTGTTGGTGATGTTCCAATCAGCAGCACAACCAGAGATCAGGTAGACTGCATCAAACATTCTTTTTAGTCTGATCACTCCTGTGATGTTTAAAAATGCTTTCGATATTTTATTTTTGTAAATCTAGTGGAACCCAGTAATATAATGCCTCTTTAGGTCAGTTCATTTGACATAAATCAACCAGTATAATTAGACTATGCAATAGGAAAGGAGGAAATGAACATTGTGTTTCTCAAGACTATTGCTTATAAGTTGTTTTGCTTTTGTCATTGTTACCAGTTTTGTTAAAGTGTGCATAGAGTGAATGGTTTTTTCCTCTCATGAACGACTATGACATTTCATGCTGAGTGTCCTACATGCTGATTTGATCTTATTTTTCCTACACAGTGTGATCTGCAACTTGGATTTAGTGGTCAGAAGCAGCAGATATTGCCTGGTTATGGAGAACTTAGACCAGCTGCGTCTGGGTCCCCTCAGCTTGGGGGCATGGCAGCAAACAGTTCAATTCCCACCAGACCCTCTCAGCCGCAGTTTGGGAGTATGGCCAGAACCGATGCTTTGCCTACTGGACCCTCTCAACCAGGGAGCTTGGCCAGACCTAATTTTGTGCCCACAGGATTTTCTCAGTTTGCAAGCAGGCCACCTACTTCTGTACCACCAGCCGATTCCTCTCAGTTTGCAGGGGGCATGGCCAGGCAAAACATTCCGACCACGTCTGAACCAACTCTAGTATTGGGCTATACTCCTCAGATGGTCAATGGCCCTCCAGCCCAGCTAGGATGGGATCTATCTTTGTCAAGGATGGTCAGTGAAGGCATGCTCCCAGTGTTATGTATATGGTGCAACAGCC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