BGIOSGA029135

From RiceWiki
Revision as of 08:09, 26 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA029135| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA029135, complete gene.| tag = OsI_301...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA029135

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA029135, complete gene.

LocusTag

OsI_30178

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA029135-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA029135-PA

Length

5078

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:29473456..29478533

Sequence Coding Region

29473456..29473530,29473626..29473747,29476842..29476895,29477013..29477132,29477794..29477935
,29478076..29478246,29478342..29478533

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:29473456..29478533 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:29473456..29478533 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGGCCATCCACCGGCGACCTCCTCACCGGCCGGCGCCACCGCCGGCGTCAGCGTTATGGTCAGCGACCGATATGTTGAGATTAAAAATGGCATCTTTGAGGTTACACTGTCCAACCCCGACGGGATCGTGACCGGCGTCCGGTATAATGGTGTGGACAACTTGATGGAGATTCTTAACAAAGAAGACAAGAGAGGGTACTGGGACCTTGTTTGGAGTAAACTGGGAGAAAGAACTGGCATATTTGATGTAATAAAAGGGACAGAGTTCCGAATCATATATCAGGATGAAAACCAGGCAGAGGTCTCGTTCGTCAGAACATGGGATCCTTCTCTGGAAGGCAAAGCTGTTCCCTTGAACATTGATAAGAGGTTTCATTACATGGCATTGGCCGACGACAGGAAGAGAATAATGCCGATGCCTGAAGACCGAGTGTCGCCCCGGGGACAGCAATTAGCATACCCTGAAGCTGTCCTTCTTGTGGACCCAATAAATCCTGACCTAAAAGGACAGGTTGATGATAAATACCAATACTCGTGTGAAAACCAGTATAACAATGTCCATGGATGGATATCATTCGATCCTCCAATTGGCTTCTGGCAGATCACTCCGAGTGATGAGTTCCGGACAGGAGGTCCCGTCAAGCAGAACCTGACCTCTCATGTTGGGCCAACTATGCTGGCTATGTTCCTTAGCGGTCATTATGCTGGAGATGACCTTACACCCAAGTTCATGACTGGTGAATACTGGAAAAAGGTCCATGGGCCTGTCTTCATGTACCTTAATTCCAGTTGGGATGGAAGTAACCCAACTCTACTCTGGAAGGATGCAAAAGTTCAGGTGACAAATTGGATGCATATTTCTTCTCTACTTTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGHPPATSSPAGATAGVSVMVSDRYVEIKNGIFEVTLSNPDGIVTGVRYNGVDNLMEILNKEDKRGYWDLVWSKLGERTGIFDVIKGTEFRIIYQDENQAEVSFVRTWDPSLEGKAVPLNIDKRFHYMALADDRKRIMPMPEDRVSPRGQQLAYPEAVLLVDPINPDLKGQVDDKYQYSCENQYNNVHGWISFDPPIGFWQITPSDEFRTGGPVKQNLTSHVGPTMLAMFLSGHYAGDDLTPKFMTGEYWKKVHGPVFMYLNSSWDGSNPTLLWKDAKVQVTNWMHISSLL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..75#171..292#3387..3440#3558..3677#4339..4480#4621..4791#4887..5078#ATGGGCCATCCACCGGCGACCTCCTCACCGGCCGGCGCCACCGCCGGCGTCAGCGTTATGGTCAGCGACCGATATGTAAGTGTGCTGCTGCTGGTCAGCTCTGCCTGCATATGTTCGATCGATCGATTCATTGCTGACATGATTGATTGAATGATTGCATGCGCATGCAGGTTGAGATTAAAAATGGCATCTTTGAGGTTACACTGTCCAACCCCGACGGGATCGTGACCGGCGTCCGGTATAATGGTGTGGACAACTTGATGGAGATTCTTAACAAAGAAGACAAGAGAGGGTACCTACCTGACAATTTTGCTTACGCTTTTTATCCTCTCTTTGATATGTTTAACTTGGTGCCTCACGCAGATTACGTGGCTAGCATCGTTAGATTTTTTTTCTCATTTAATAGCTTAAATATTTTCACATTTTATTATTAAAATATATTAAAATGACAACGTAATTTTAAACTCTTGGTTGAACTAACAAATGTGTGATATTTTTATTGTATTGTATACGTGATAGTTATTTATAAATTATATTTATATATGGACTCAAGAATAATCTTTTAATATTCCTTAGTTTTTAAATTTCGAGTTTCCTTTGTTTATAAATTCTATTCCTATATGGATTCTAGACTACTCTTCCAATATTCATTTTTTTAAACTCTGAATTTTAGTTATTTATAAATTGTATTTCTATGTGGACTTTAAACTCTTCTTTCAATATTTATTTTTTTTAATTTTGAATTCCAATTATTGGTAAATTGTATTACTATATTGACTCTAGACTTCTTTTTTCAATAGTTTTTATTTTTTAAAATTCAGCTATTTCTAAATTGTATTCATATATGGACGCTAGACTTTTTTTCCCAATATTCCTTATTTGTTAATTTTAAATTTCAGTTATTTATAAATTGTATTCCTATAGACGCTAGTCTCTTCTCCCAATCTTGTTTATTTTAATTTTGATTTTTTGTAATTCTAAATTGTATTTCTATATGGACTCTAAACTCTACTTTTATTTTTTTTTATTTTTAAGTTCTAACTTTCATTTAGTTCTAAATTCCTATGTGTGGACCGTAGACTCCTCTTCCAATATTTCTACTTTTTTAATTCTCAACCTGTTATTTCTAATTGTATTTCTATATGGATTCTAAATTCATTTTTCAATATCTTGTTTTTTAATTTTTTTAATTTAAATTATTTATAAATTGTATGCCTATATAGAATCTAGACTCTTTTTTTAATATTTATTATTTTTTATTTCAAATTTCAGTTATTTATAAATTGTATTCATGTATGGACTCTGGACTCTTCTCCTAATCTTGCTTTTTTTTTTAAAAAAAATAATTTGAATTTTAGTTAATTCTAAATTGTATTTCTATATGGACTCTAACTTCTACTTTTAGTTTTCCTATTTTTTATTTCCAAATTTTAATTAATTCTAAATTGTATACTTGTATAGACTCCAGTCAACTCTTTCAATATTCCTTATTTTTAATTCTGAATTTCATCTATTTTTAAATTGTATTCCTATATGAACTCTACTTTTTTTTTCTTTTTCTCCGATTAATATGGGAATTTCTAGGCCGTGAGAGTAAACGTGGTGGACCGTAGACTCTTCTTACAATATTTCTACTTTTCTAATTCCCAATATGTTATTTCTAATTGTATTTCTATCTGGACTCTAGATTCATTTTTTAATATTTTGTTTTTTTAATTGTGAATTCAAATTATTTATAAATTGTATTCCTATATAGATTCTAGACTTTCTTTCTAAATATTTCTTGTTTTTTATTTTGAATTTCAGTTGTTTATAAATTATATTTATATATGGACTCTTGACTCTTCTCCCAATCTTGCTTTTTTATTTTGAATTTTAGTTATTTCTAAATTTTATTTCTACTAGAAAAAATGCCCGTGCGTTGCAACGGGTGAAATCTATTTTAATCTTATTGTTGCTATACTGTTTAGTTAAGGTGAGATTCACCGTGGGAATTTGCTTGAATTTATATATTTTAAAAAATCATGAGCTGCAATTAGGATTCTTGTGCACATAATATAATTAACTTTAATTTTTAAATTAAAAACTGGTTCATTATAAGATTTTATAATCAACAAAAAATTGTTGAAGAAAGAGGTACTATAGTTTTGATTTTTCATCAACCGGATGTGTATGGTCCGTGCTAGTGGTCGAGAAAAAAAAATTGCACGCAAATATGATTTGACAGGAGGGAGGGACAGTAGACTTATTCCAGGAGAGGCCCATAAAAAGTAGATTTATTCCAAGAGAGGCCCATTGACACAGTGCAAGTAATATAGGTGTAAAAAGGAGAGAGAGGTGATTATATGGAAGATACGTATACTATATCAACCGCGGTTTTGACCCGACAATTAAACGGATCCCCCGAAATCCTTACGTATTTTTTTAATTAGGTACAGAGGTATAGATTAGAATTAGAATTAAATAACATGTTATTATTAAAATAAAATACAATATACATTTTTTATTAAATTCTTCATGAATGAACCACACTATCTAGAATTGTTTTGAATTTTTCAAAGCTCATTTGCTAATTTTAATAATACAAATATAATTTTAATAATTAATTTAAAGTAAAAACAAACTAAAAGCCCTCTCCTAAGTCTGGGCCAAATCTGGCCCATTCTTCTTCTCCTCCCTCTTAGGCTGCCATCCCTCCCTATTGGGCCGTCATCCCTATCTCCACTTGGGCCCAGCAGCCACCTCTCTTCCTTTCCTCCTTCTTGGGCCACCATCCTCGGGCCCAACAGCCATGCCAACCCATGAAAAGAAGCGGATGGGAATAAAACCGAAAAAGACGACGGAAAAAAAAGGAAAACGGCGAAAAAAAACGCACGGACGAAAAAAAATTGTCGGAAACCTTATGTATTTTCTAATTATTAGGTGTGTGTGTGTGTATATATATATATGAACTCTAACTTCTACTTTTGATTCTCCTATTTTTTAATTCCGAATTTTAATTAATTCCCCATTGTATACTTGTATGGACTCTAGTCTACTCTTCTAGTTCTCCTTATTTTTCAATTCCGAATTTCATCTATTTTTAAATTGTATTCCTATATGGACTCTACCTTTCTTTTTTTTCCGATCAATGTGGGAATTTCTAGGCCGGAAGAGCAGACGTGGTGGCTTCTTTTTTATTACTTTAATAATATAATAGATAATTAGCAAGTACAATAGTTTGGTACTACTTGGATCTTGCCACATCCTACCAGTGTACATTTGTTAATTGTTATTGAGCTACTTTGCCTATTTAAAACTAAAGAAGAAATATTTTAGTCCTCATTCAAGTACAGGCTGCAACTGAGGTTATAGTCAATTGGTCATATGGTGTTGTATGTTGTCAGGTACTGGGACCTTGTTTGGAGTAAACTGGGAGAAAGAACTGGCATATTTGATGTGTAAGGGTTCTCAATTCACTCCTCAGATTTCAGGCATCAGTTCTGTGCCTCCATATGAATACACTTTTTGTGCTAGAGAGAGCCCAGATGTAGCTGACATTGAACGTTGTTACGCAGAATAAAAGGGACAGAGTTCCGAATCATATATCAGGATGAAAACCAGGCAGAGGTCTCGTTCGTCAGAACATGGGATCCTTCTCTGGAAGGCAAAGCTGTTCCCTTGAACATTGATAAGAGGTGATCCAATAGCACAGGCATACAATGGAGTTGTTCTCAGCAATTCATTTGGAAAAGGCAATCACGTTTAACAGAGCAAGTAATTGATATATTTTGACAGCGCAAGTATGTTTGTATAGGTTCATCGTACTCCGGGGCTGCTCAGGATTCTATACTTACGGAATCTATGAGCATCAGGAAGGGTGGCCTGGTTTTAGCATGGTAGAGACCAGGGTGGCCTTCAAGCTTCGGAAAGACAAGTTGTTCTAGTTCCTGAATTTAAGTTTTTTTTTCGATTTTGCTATATCTCACTCGAAAGTTTTTTTTCTTATCTCTCACTCGATTTTCTCACTCAAATTTATAGTGCATTTTCTTGTAAGTTACAATGTAATTTATGAAACTTACGCTGTAACTTTTACAATGTAATTTTGAATCTTAAGTTTTGAAATTTATATTGGATTTGGTCTTTTTCTTGCAGATATGGTAATTAGTGTCCATTATGGTGTTTCTTAGTTGTTTCTTGTCTTTTACTATGTTTATTGGATTTTAACCCAAAAATTAAAAATCTGTGTGATATGATCATAAAAATATTTCAAAAAACGCATAGATACTCCCTTTTTTTTTTAGTTTGCTGAATTATGCTACATCTTACACTGAATCCATTACTTTGGTGCAAATTCAGGTTTCATTACATGGCATTGGCCGACGACAGGAAGAGAATAATGCCGATGCCTGAAGACCGAGTGTCGCCCCGGGGACAGCAATTAGCATACCCTGAAGCTGTCCTTCTTGTGGACCCAATAAATCCTGACCTAAAAGGACAGGTAAGCTGAAAAAATAAGGATTTTTTTTAGAGAACGACGGCAGGAGATCTGCCGGAATTTTAATTATCACTTAAACACTATTCCTGGTAAATTTACAATATCATGAAGAATCTAAACACTGTTACTGGTAAATTGTCAAGGTTGATGATAAATACCAATACTCGTGTGAAAACCAGTATAACAATGTCCATGGATGGATATCATTCGATCCTCCAATTGGCTTCTGGCAGATCACTCCGAGTGATGAGTTCCGGACAGGAGGTCCCGTCAAGCAGAACCTGACCTCTCATGTTGGGCCAACTATGCTGGCTGTAAGTTCAGACATTATATTATATTGAAATAAAAAGTTCAGATTATTAAGTTCAGACATTCTTCTGAAACCCTTTTTCTTTAATCTGATTTTCAGATGTTCCTTAGCGGTCATTATGCTGGAGATGACCTTACACCCAAGTTCATGACTGGTGAATACTGGAAAAAGGTCCATGGGCCTGTCTTCATGTACCTTAATTCCAGTTGGGATGGAAGTAACCCAACTCTACTCTGGAAGGATGCAAAAGTTCAGGTGACAAATTGGATGCATATTTCTTCTCTACTTTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA029135