Os11g0175500
| Gene Name |
Os11g0175500 |
|---|---|
| Description |
Zinc finger, RING-type domain containing protein |
| Version |
NM_001072411.2 GI:297611340 GeneID:4349917 |
| Length |
5901 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0175500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:3732502..3738402 |
| Sequence Coding Region |
3732544..3732625,3732745..3732907,3733645..3733739,3734085..3734146,3734228..3734319 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008404:3732502..3738402 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008404:3732502..3738402 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggacgccggcgagtgctccagctcccagccctgcgcgtcctcctcgccggacgccgccggtggcgtttgggccaagctagtgccctccgattccgcgttcccggaggtggagctggccgaggacgacgccgtggtgtgctcccgggtcaccccggacggcggcggggaggtggccgcgtggtgcgagattaggcgcggcggcggcgatggcgacgcgtcgtcggcgacgattcggaatctgagctcggatgcaattattgtcgatggaagagtgatccagcaagaagcagttgacatcaaaccggggagtgaaattgtttcaggaccccagaaagatgggcatctgttgtacacctttgatataacaggcctgaatgaccaggacaaaactaatatcaagattgtgctggatattgagaatgcaaagtgcagcatatgcttaaatttgtggcatgatgttgttactgttgctccatgcctccacaacttctgcaacggttgcttctctgagtggttaagaaggtcttcagctaattcgcgtgataaaagtcagagtgctgcctgtccacaatgtaggacggcagtgcaatcagttggtaggaatcacttcctacataatattgaagaggctatactgcaagctttttcatcgctacagcggtctgatgaggagattgcattgttggagtcatatgcctcggtcaagacaaatattgcatggcatgcattcatcccttttccatggtcttatgctggtgcgatgattcttagatccaccatggggataaacatctgtcagagggaggttttggggaaacagaaaatccagtcaaggaagcgccgtttgccacgttcaaatgatgaagctaaccatactaaccatgctgattttctatgccctcaatgtggtgctgaatttggtggatttaggtgcagtccaggtgctccacacttgccgtgtaatggatgtggaggaatgatgccagccagacctgacaccagtataccacaaaaatgtttgggatgtgatagggcattttgtggagcttattggtgttcccaaggagtgaattcaagtcagcataatccaatctgtgatcaggaaactttcaagatgatctctcagcgccatatctctagtgttcctgacacagtacatggaggcaatcaatacgagaaagatattacagaaagatgtatacagcaatcaggcaaagcattgcaagctataatctcagagtggatagtgaagtttgacaataaggagcttgatcgctcaaggctgcagctgaaccatgttgatgcaattacttctaggacatacgtctgcaaccaatgctacagcaagttcatcgatttcctgctctactggttccgtgtatcaatgccaagaaatctccttccacctgatgctgctaacagggagagctgctggtatggtttcatgtgccgaacccagcaccaccggcctgaccatgctaagaagctcaaccatgtctgtcgtccaacaagaggcaacccctag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDAGECSSSQPCASSSPDAAGGVWAKLVPSDSAFPEVELAEDDA VVCSRVTPDGGGEVAAWCEIRRGGGDGDASSATIRNLSSDAIIVDGRVIQQEAVDIKP GSEIVSGPQKDGHLLYTFDITGLNDQDKTNIKIVLDIENAKCSICLNLWHDVVTVAPC LHNFCNGCFSEWLRRSSANSRDKSQSAACPQCRTAVQSVGRNHFLHNIEEAILQAFSS LQRSDEEIALLESYASVKTNIAWHAFIPFPWSYAGAMILRSTMGINICQREVLGKQKI QSRKRRLPRSNDEANHTNHADFLCPQCGAEFGGFRCSPGAPHLPCNGCGGMMPARPDT SIPQKCLGCDRAFCGAYWCSQGVNSSQHNPICDQETFKMISQRHISSVPDTVHGGNQY EKDITERCIQQSGKALQAIISEWIVKFDNKELDRSRLQLNHVDAITSRTYVCNQCYSK FIDFLLYWFRVSMPRNLLPPDAANRESCWYGFMCRTQHHRPDHAKKLNHVCRPTRGNP </aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>43..124#244..406#1144..1238#1584..1645#1727..1818#1898..2033#2129..2215#2741..2830#3280..3382#3461..3568#3927..4027#4148..4213#4317..4404#4795..4855#4937..5000#5530..5658#gcacgcctccacgcacccgtggccggagaagaagacgccgccatggacgccggcgagtgctccagctcccagccctgcgcgtcctcctcgccggacgccgccggtggcgtttgggccaagctaggtgcggccgccctcctcccccaccccacccttcctttttcttgggtttcttccgccgcacgggttcttgattcttgaccttttcgttggtcttgcccttggccattgcttgcactgcagtgccctccgattccgcgttcccggaggtggagctggccgaggacgacgccgtggtgtgctcccgggtcaccccggacggcggcggggaggtggccgcgtggtgcgagattaggcgcggcggcggcgatggcgacgcgtcgtcggcgacgattcggaatctgaggtatctccccttttctgctttgctcttctggactgtgcattgtaggcaagatacgctctttttctgcaatcttgttttatcggattgggggaacaaatgccattcattgatgatgcgtgtttggacgaaggttataaaatgcagaaaagttcgtactgattgcgattgaatgtgagttgttgtcgtttggattatgtgaatcgttgcggtgtggtagcatcgtgttcgtgttcttgatcacctcccaataccaaaattaaagaaaagtttcctgtggataaaaaagattcagatttgctaatgattctaaagcgccttgattttcttatccataactcactttccaaacttctgaacctgattgatcaaaccaaaaatgaacttttgaatcgtgctcatttgaaatcgatagaggcgagcccctggagacagggaagaggcagagtggtcatgggtgagttttttttttggggggtggagggtagaggagaagggaagttcacttctgtggccaaggtggcaggagggtcatgcaggttggaaatgaggaagtttttctatatttatataaatagtttctctatgtgcgtacatcatagccaacctgtgttgcaaccttctgttattccttttatcaaattctcgctgatgttagatgcctgtcttgtcatccttgtaatgtatgtttcattggacctctatcgtacgttaacattatccatgtgccattgagaaagctcggatgcaattattgtcgatggaagagtgatccagcaagaagcagttgacatcaaaccggggagtgaaattgtttcaggaccccagaaagatggtgagataactatgtattttgagtttggcatttcatgcatagattggtgattgtgtatatttaatggtcttctattttttttaagtggactattttatgcctttatgaagccaaatgagtgtttacacatgactctgaatatatgtactcattgagtcattttgaatgtttattgtttcctagacctttctgtttataaagtgaaaaatctatggttgcatgttcgtaattgtgcttccgaacaatttatcaaattacaaatgtttatccttttgtgattccgttatgttgaacaggtgaactgtaccactatgtaatgcatttatgctatccatcttcttgcagggcatctgttgtacacctttgatataacaggcctgaatgaccaggacaaaactaatatcaaggtattttgttgaaatgaatgttgatcaacaacaacctcggtgcataaacgtcactaacttttatttaaatgatgatgtcagattgtgctggatattgagaatgcaaagtgcagcatatgcttaaatttgtggcatgatgttgttactgttgctccatgcctccacaacttctggtacttttgccaattttcctagctatttttgatttatctcaaaattctgattggtgctcatttctgtattccttttaagcaacggttgcttctctgagtggttaagaaggtcttcagctaattcgcgtgataaaagtcagagtgctgcctgtccacaatgtaggacggcagtgcaatcagttggtaggaatcacttcctacataatattgaagaggtgtgatagttgtgtttagtgacttaactcctcaatactgtttaagtgctacctattgtacagctgagatgtttattatagttctgcttttgtaggctatactgcaagctttttcatcgctacagcggtctgatgaggagattgcattgttggagtcatatgcctcggtcaagacaaatattgtgagttaaaaatcttactaagaaattgttgatttccaccattttctcaatggattgtataaagtgttgcaccagtctcttatctgccagcactgatatttgtccctgttatctgccataaaatcgaatattgttttaaaatcatcacccttttttaacttgtttatatattgttgttcattttagagaagtgccttcctcagtcatttgttattagttgctgataaatatttagttttgctgttgatagcttttgaactttaaaaagcttgtagttagccttccctacaaataaaaaatggcagcttgtaattatggacaattcaaggcctttctcatgataatgtgatgttatatataaattgaaggttgcatgagttttgtcataaaatattgttggggctaattttaattactcaattcatatgaaatttaattgtgaaactttatctaagtaggcgcagcagttgtattttaacatttctgctattcagtctatgatgtattttaacctaaaattcacaggcatggcatgcattcatcccttttccatggtcttatgctggtgcgatgattcttagatccaccatggggataaacatctgtcagagggaggtcagatggcaacgactcaaagtagaacagagctaggtgaagtagggtacaattgagggagcaatagatctataatagcttgccatgagagagaccagagctgactagagacttgtttattcatcttagcttaacggaaatgtataatccccatccttgtgataatttgaccctgaagcttatctctaaaataaggaatagataccaacccaatctaatctgttaaaatcaactggcatgaacagtacccctgaacatgacaatttgtctgtctgatggataaaatgccttattattagagccagttgagtcacaggacaattaatacccgactcaccaaggttataggtgttttctatgctataatatatatgttgcaagtatatttgttttggtatttaaatgatcagtcccatgattctgagttgctgtcaatgttcataccttaggttttggggaaacagaaaatccagtcaaggaagcgccgtttgccacgttcaaatgatgaagctaaccatactaaccatgctgattttctatgccctcaatgtggtaagtgttgaaatttcatttttaatatttttattcttctttttagacatgttactcaaatgagaaaaataaatgcaggtgctgaatttggtggatttaggtgcagtccaggtgctccacacttgccgtgtaatggatgtggaggaatgatgccagccagacctgacaccagtataccacaaaaatgtaaccgataattctgaccatattacaagattgtaattctataattcagttgttatttgattgattattcaacgtaaccatgtgtgctgccgttatgttaggaactggacatatctatgttcatatttttttcttgccatactaatatgcttggtatcaattagatgagctaaaattatttttattacataattgaggagtatgatagatatgcacgattgcctcaagatgtattttgaagtttgcaggcatcatgagtagcttgattgcaccttttccctactgaatgtttatgaaaattatatcctctgtattctttttaattttctggctctaatctatcaaccttatattgcaggtttgggatgtgatagggcattttgtggagcttattggtgttcccaaggagtgaattcaagtcagcataatccaatctgtgatcaggaaactttcaagatggtaagataatctattacttatatcttttagaccccactgtactccatcatcatacagtacatgttgtgtacttatattcactgtttgacatgttgtgtggataactgcataactttgcagatctctcagcgccatatctctagtgttcctgacacagtacatggaggcaatcaatacgagaaagatgtaggaagttttaacatgatcttatactatcatattgctccttttataccccagatagtagtttcacatgtgagtactgagtatagtattttctcctctctagattacagaaagatgtatacagcaatcaggcaaagcattgcaagctataatctcagagtggatagtgaagtttgacaataaggagcttggtaaccttctatctagttaagctaattttttcgttgatgcaaaatctgattatatttgttatttagttgtagtacatattcatgttgcagttttgcatttcttacatcgtgattacatcatgattgttctagcatacgaatgacctgttaatagcaacaatttacacagtgcctgagttgtgtttttgctttgaatggacaaaatttatgtatgacttgaatgttgagaaggaaaacctacttctggggacaattttctctttgtttagcggattactatcttgttgcacaatggacatgcccccatctgtcacattgtatgatatgctgttcttactgcacatgccatctgtcacatttgtatgatatactgttcttttgtgcatgcagatcgctcaaggctgcagctgaaccatgttgatgcaattacttctaggacatacgtctgcaagtaattattttccctagtttacaagaatagttcgatttcatcttgctcatttatctcattttggacttccaacaaatgcagccaatgctacagcaagttcatcgatttcctgctctactggttccgtgtatcaatgccaagaaatgtatgtatacttcacacagttactaataattactattatcaatccctcttcatgatgcgaatgctttatgataatattaatcaattcctcttctttaaatagtcatatgtgataggtcccctgtattctgaagccacaccatttctgaaacttaacatgtcttacagaaattgttctagaactttcctgtgttccaaaccaactttgttgaatggtgttctaattatttggatggtcaattttgcaacatatctctaaactatacatggaattaatacttggtttgttcgactgcttagttttgctgcacatatattctatagttgctttcatgatctaatcctggactcctattctaaccactggacccttgttgctttctaatatcctgagtagaacaacatataaatgtttcatttaacaatagtaagctcatgaacctgtaaaaatctttgatcgccgctacactgcttcatttattcatagatcataccagtcttctaatattgatggtgatgttctgttccagctccttccacctgatgctgctaacagggagagctgctggtatggtttcatgtgccgaacccagcaccaccggcctgaccatgctaagaagctcaaccatgtctgtcgtccaacaagaggcaacccctagcctgcctcgttctctgaaaaaaatcatctattttcagtgttcaacagcagcattgtacagcaaagagcaagtgccataggctctggtttctcagtgtttaacagctctgtttgattagtaggaatgattgtcaggtacatcaaccagtttcaaatgcctaaactgatacaacctgtttatcttaatctctcctattgcaaccttccatacttatgtttttgcaatgcaacctcacatgctttc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
