BGIOSGA034761
| Gene Name |
BGIOSGA034761 |
|---|---|
| Description |
Probable calcium-transporting ATPase 4, plasma |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA034761, complete gene. |
| LocusTag |
OS12G0136900 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA034761-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA034761-PA |
| Length |
5659 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:1584042..1589700 |
| Sequence Coding Region |
1584042..1584227,1586039..1586093,1586181..1588123,1588198..1588356,1588548..1588719 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:1584042..1589700 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGAAGCTTGACAGGTACCTGCAGGAGCACTTCGATGTGCCGGCCAAGAACCCGTCGGAGGAGGCGCAGCGGCGATGGCGGCAAGCCGTTGGCACCATCGTCAAGAACCGCCGCCGCCGCTTCCGCTGGGTGCCCGACCTCGACCGCCGCTCCTTGGACAAGGCCAAGGTCCGCTCCACCCAGGAAAAGATTCGGGTTGCCCTCTATGTGCAGCAGGCTGCACTCATTTTTAGTGATGGTGCCAAAAAGAAAGAGTTCAAGCTAACAGAGGATATTATTAAAGCTAGATTTTCCATCAATCCAGATGAACTAGCATTGATCACAAGCAAGCATGATTCGAAAGCTTTAAAGATGCATGGTGGGGTAGATGGGATATCTAAAAAAGTCCGTTCATCGTTTGATCATGGCATATGTGCTAGTGACTTAGATACAAGACAGAACATATATGGCGTCAACCGTTATGCAGAAAAGCCTTCAAGAAGTTTCTGGATGTTTGTTTGGGATGCATTCCAGGACATGACCCTTATAATTCTTATGGTATGTGCATTGCTATCTGTTGCAGTTGGTTTGGCAACAGAAGGATGGCCAAAGGGCATGTATGATGGCTTGGGTATAATACTCAGCATTTTCTTAGTTGTTATGGTTACTGCTGTTAGTGATTATAAGCAGTCACTCCAATTTAAGGAGCTAGACAATGAAAAGAAAAAGATATTTATCCATGTAACCAGAGATGGGCGTCGACAAAAGATCTCTATATATGACTTGGTAGTTGGTGATATAGTTCATCTGTCAATTGGAGATCAAGTACCTGCTGATGGACTATATATACATGGGTACTCCCTTTTGATTGATGAGTCCAGCTTATCTGGTGAGAGTGACCCAATGTATGTTTCTCAAGGCAAACCATTCATCTTGGCAGGAACTAAAGTGCAAGATGGATCTGCTAAGATGATAGTAACTGCTGTCGGTATGCGCACTGAATGGGGAAAATTGATGAGCACATTGAGTGAGGGAGGAGAGGATGAGACACCACTGCAGGTTAAGCTAAATGGAGTTGCGACCGTTATAGGAAAGATTGGACTGGTATTTGCCATATTAACATTTTTAGTTCTGCTGGTTAGATTCCTCATTGACAAAGGCATGACGGTTGGTCTGCTCAAATGGTATTCTACCGATGCATTGACTATAGTAAACTACTTTGCAACAGCGGTAACCATTATAGTTGTTGCTGTACCTGAAGGATTACCCTTGGCTGTTACTTTGAGTCTTGCATTTGCAATGAAAAAGTTAATGAATGATAAAGCACTTGTTAGACATCTTTCAGCGTGCGAAACAATGGGATCTGCTGGTACCATCTGCACGGACAAAACAGGAACTTTGACTACTAACCATATGGTTGTTGACAAAATATGGATATCTGAGGTTTCAAAGTCAGTTACCAGTAACACCATTTCAGGAGAACTTAATTCTGTGGTTTCTTCTAGAACATTGAGTCTGCTTTTGCAGGGAATTTTTGAGAATACTAGCGCTGAGGTGGTCAAGGAAAAGGATGGCAAGCAAACTGTCTTAGGAACTCCAACAGAAAGAGCAATATTAGAATTTGGCTTGGGCTTGGAAGGAGTTCATGATGCTGAGTATAGTGCCTGCACCAAGGTTAAGGTTGAGCCTTTCAATTCAGTCAAGAAGAAGATGGCAGTGCTGATTTCATTACCCAGTGGCACGTCCAGATGGTTTTGCAAAGGTGCATCAGAAATTATTTTGCAGATGTGCGACATGATGGTTGATGGCGATGGAAATGCTATTCCCTTATCGGAAGCTCAGAGAAAGAACATCTTAGATACTATCAACTCATTTGCTTCAGATGCTTTAAGGACGTTGTGCCTGGCATATAAGGAAGTGGATGATGATATTGATGACAATGCAGATAGTCCAACAAGTGGTTTTACTCTAATAGCCATTTTCGGTATCAAGGATCCTGTGCGCCCTGGAGTTAAGGATGCTGTTAAGACCTGTATGTCTGCTGGTATCACAGTAAGAATGGTAACTGGTGATAATATAAATACAGCTAAAGCTATAGCTAAAGAGTGTGGAATATTGACTGAAGATGGTGTAGCAATAGAAGGACCAGAATTCCATAGCAAGAGCCCAGAAGAGATGAGGGACCTGATACCGAATATTCAGGTTATGGCCCGTTCTTTACCATTGGATAAGCATACACTCGTGACAAACTTGCGAGGTATGTTTGATGAGGTGGTTTCTGTGACAGGTGATGGTACAAATGATGCTCCTGCATTACACGAAGCAGATATCGGGCTTGCTATGGGCATTGCAGGAACAGAGGTTGCCAAGGAGAGTGCAGATGTCATAGTACTTGACGACAATTTCACTACTATAATAAATGTTGCAAGATGGGTTCGTGCAGTTTATATTAACATCCAAAAGTTTGTGCAGTTTCAATTGACTGTCAATATTGTTGCTTTAGTTATCAATTTTGTCTCAGCATGCATCACAGGGAGCGCTCCTCTCACTGCTGTGCAGCTGTTGTGGGTCAATATGATCATGGATACACTGGGAGCTTTAGCACTAGCAACAGAGCCTCCAAATGATGAAATGATGAAGAGGCCACCTGTCCGAAAAGGGGAAAGTTTCATTACCAAGGTCATGTGGAGAAATATCATGGGCCAAAGTTTGTATCAGCTATTTGTACTTGGAGCTCTCATGTTTGGTGGAGAAAGCCTTCTGAACATCAAGGGTGCAGATTCCAAATCCATCATAAATACACTGATCTTCAACTCCTTCGTGTTTTGTCAGGTATTCAATGAAATAAACAGCAGAGAAATGCAGAAGATCAATGTTTTCCGTGGTATCATCAGCAATTGGATCTTCATTGCAGTCATAGCTGCAACCGTAGCATTTCAAGTGGTGATCATAGAGTTTCTTGGCACTTTCGCCAGTACTGTTCCGCTCAACTGGCAACATTGGCTGCTCAGCGTCGGCCTTGGCTCCATCAGCCTGATTGTTGGTGTCATCTTGAAGTGTATACCAGTTGGTTCAGGTGAAACCTCTGCAACTCCAAATGGATACAGCCCACTTGCCAATGACCCTGATGACATATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEKLDRYLQEHFDVPAKNPSEEAQRRWRQAVGTIVKNRRRRFRWVPDLDRRSLDKAKVRSTQEKIRVALYVQQAALIFSDGAKKKEFKLTEDIIKARFSINPDELALITSKHDSKALKMHGGVDGISKKVRSSFDHGICASDLDTRQNIYGVNRYAEKPSRSFWMFVWDAFQDMTLIILMVCALLSVAVGLATEGWPKGMYDGLGIILSIFLVVMVTAVSDYKQSLQFKELDNEKKKIFIHVTRDGRRQKISIYDLVVGDIVHLSIGDQVPADGLYIHGYSLLIDESSLSGESDPMYVSQGKPFILAGTKVQDGSAKMIVTAVGMRTEWGKLMSTLSEGGEDETPLQVKLNGVATVIGKIGLVFAILTFLVLLVRFLIDKGMTVGLLKWYSTDALTIVNYFATAVTIIVVAVPEGLPLAVTLSLAFAMKKLMNDKALVRHLSACETMGSAGTICTDKTGTLTTNHMVVDKIWISEVSKSVTSNTISGELNSVVSSRTLSLLLQGIFENTSAEVVKEKDGKQTVLGTPTERAILEFGLGLEGVHDAEYSACTKVKVEPFNSVKKKMAVLISLPSGTSRWFCKGASEIILQMCDMMVDGDGNAIPLSEAQRKNILDTINSFASDALRTLCLAYKEVDDDIDDNADSPTSGFTLIAIFGIKDPVRPGVKDAVKTCMSAGITVRMVTGDNINTAKAIAKECGILTEDGVAIEGPEFHSKSPEEMRDLIPNIQVMARSLPLDKHTLVTNLRGMFDEVVSVTGDGTNDAPALHEADIGLAMGIAGTEVAKESADVIVLDDNFTTIINVARWVRAVYINIQKFVQFQLTVNIVALVINFVSACITGSAPLTAVQLLWVNMIMDTLGALALATEPPNDEMMKRPPVRKGESFITKVMWRNIMGQSLYQLFVLGALMFGGESLLNIKGADSKSIINTLIFNSFVFCQVFNEINSREMQKINVFRGIISNWIFIAVIAATVAFQVVIIEFLGTFASTVPLNWQHWLLSVGLGSISLIVGVILKCIPVGSGETSATPNGYSPLANDPDDI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..186#1998..2052#2140..4082#4157..4315#4507..4678#4780..5078#5354..5659#ATGGAGAAGCTTGACAGGTACCTGCAGGAGCACTTCGATGTGCCGGCCAAGAACCCGTCGGAGGAGGCGCAGCGGCGATGGCGGCAAGCCGTTGGCACCATCGTCAAGAACCGCCGCCGCCGCTTCCGCTGGGTGCCCGACCTCGACCGCCGCTCCTTGGACAAGGCCAAGGTCCGCTCCACCCAGGTACTAACCAACCACGAACTACCCCGCCCTAATTCATCCATTCTCCTTTCCGCCATCACTTCGTTCTTCACTGCATCTCATCGTGAGTCGATTTGCCTAGCAAGAACAACACTTTGATTAAAAAAAAAACAAACTGCTTTTGGTTTGGGCATGTTCAGTATTCAGTAACCGTTGTTGGTCTTGTCTTGCCGGTTGCCATCAGATTGTATGACAATAATACACTTTGTTTGAATCGCTGCCACCCAAACAATCAAAGCCACAAAAGCAGGATATTTATGCTATTTCTTCGCGGTACTGGGCACGGACGCACAATACGGCCGTATCATGTTGACTTGTATACTCAGCTTTATTAGGGAGGAAAAGACCAAATTATCAGGGCCAACCTGACCGCGACCGTCAAGGAAGCTTCCGCGAAGCTTACAAGAGTCCAAAGAAAATGGTGTTAAAAGGACAAATATATCACCTTATTATCACATCGATTCTGTTATAAAGTTCTCTCCACCTGTCAATCTCATTGCAAATCTAAAATCATTGTTTATATTCTACTAGTCTTTCATATCGATTCCAAGTGTTCAACTATTTTGTCCCCATGTGAAAAAAAAGGAATCTTGTTTGTTTGGTGGGGAATCCAACATTGCGTCTTGAGACTCTTAATTCAGGGATTTGTTCTACATTACTATGCGCTATATATATTTTTAGTTATATACTTATATGCCTGTATTCTAGGTTTGGTGGATAGGGTGGGCCGATCCGCAGATGTCTATTTCTGATTTCTGAGACCCTTTCTTATATTATTTTCTTGTATTATTTCCATCACATAAAAATTCCCCTATTTTACCGTTCAGTCAACTGAGAACTCTAACTTCAGTTCATTAGGGGCCTTCTTGTTTTACGATAATGCTAGTCAAAGATGCATACTTTGTAAGCAGAACCAGAGTTGTTCATGACAAAAACTTACTTTACTCTTTATATATTTTCCAAAACCAGTCCTTAACTCCTATTGGTATTCGATTAAGAAGGTACATTCAATACTTTGTTGGCATGTTCAAGTTTGCAAATCAATAAGCAGTTCTTAAAGCAGATAATCTTCTTACTGGTTGGTGGCCGAAAGACACTTTTCAAAACCAGAATTAACTGACAACTAGTTTGATTTGTAATTATTGTTTGAATTCTAGACGCTTCACATTTTGTTGTCTTAGATGCAATATTTTTTATGTGAATGTAATTACTCTATGCTTAAAATGTAACCGATTTATTTTTGACAATCATGCTGGAAAAATTTGCAAACACCAAATTCAATCATTTGGTTGATCTGCTTTCTTCTAGGCTGGAAAACTTTCTTGTTACACAATGCAAATAACAGCTAGTTCTTTCTTCCAATGATCCAATCCATTTCTAACATAAATCAAGAGTAGGGAAGGTATTTCTATTATAAGGAGATTAGGAGGATGACACTGGATGATGCAGGTATAGTGGCAATATAACTTCAAATGTAGGATGACTATCATGTTTGCAATAAAGCTCAACACCATGTTTCTTGTAAGAACAATCATGGGGCTAGAACTTGTACCACTATATTTGAACAAAGCTTTCCAAGCCTTCCATATGCGCAACTTAAATGAGTTATATTTTTGCATCCGAATGGTTGGATTAATTAACTTCATTGTCATGGGCTAAACAACAGTATTACTATTCCTTATCAGTTACCGCATTTTATAATATGTGATTTTATCTTACGACTACAAGAAAATGATTATAATATTATATATAAGCAGTAAAAATGGTTTCCCTTTTTGTGTTTGCTTTACCAGGAAAAGATTCGGGTTGCCCTCTATGTGCAGCAGGCTGCACTCATTTTTAGTGATGGTATGGAGTAGCTTTTCTATGTTACTGTTCTTTTTTAGTATGGAATAACTCTATGTAACTTGATTTACTCCCAATATTTAACAAAAGGTGCCAAAAAGAAAGAGTTCAAGCTAACAGAGGATATTATTAAAGCTAGATTTTCCATCAATCCAGATGAACTAGCATTGATCACAAGCAAGCATGATTCGAAAGCTTTAAAGATGCATGGTGGGGTAGATGGGATATCTAAAAAAGTCCGTTCATCGTTTGATCATGGCATATGTGCTAGTGACTTAGATACAAGACAGAACATATATGGCGTCAACCGTTATGCAGAAAAGCCTTCAAGAAGTTTCTGGATGTTTGTTTGGGATGCATTCCAGGACATGACCCTTATAATTCTTATGGTATGTGCATTGCTATCTGTTGCAGTTGGTTTGGCAACAGAAGGATGGCCAAAGGGCATGTATGATGGCTTGGGTATAATACTCAGCATTTTCTTAGTTGTTATGGTTACTGCTGTTAGTGATTATAAGCAGTCACTCCAATTTAAGGAGCTAGACAATGAAAAGAAAAAGATATTTATCCATGTAACCAGAGATGGGCGTCGACAAAAGATCTCTATATATGACTTGGTAGTTGGTGATATAGTTCATCTGTCAATTGGAGATCAAGTACCTGCTGATGGACTATATATACATGGGTACTCCCTTTTGATTGATGAGTCCAGCTTATCTGGTGAGAGTGACCCAATGTATGTTTCTCAAGGCAAACCATTCATCTTGGCAGGAACTAAAGTGCAAGATGGATCTGCTAAGATGATAGTAACTGCTGTCGGTATGCGCACTGAATGGGGAAAATTGATGAGCACATTGAGTGAGGGAGGAGAGGATGAGACACCACTGCAGGTTAAGCTAAATGGAGTTGCGACCGTTATAGGAAAGATTGGACTGGTATTTGCCATATTAACATTTTTAGTTCTGCTGGTTAGATTCCTCATTGACAAAGGCATGACGGTTGGTCTGCTCAAATGGTATTCTACCGATGCATTGACTATAGTAAACTACTTTGCAACAGCGGTAACCATTATAGTTGTTGCTGTACCTGAAGGATTACCCTTGGCTGTTACTTTGAGTCTTGCATTTGCAATGAAAAAGTTAATGAATGATAAAGCACTTGTTAGACATCTTTCAGCGTGCGAAACAATGGGATCTGCTGGTACCATCTGCACGGACAAAACAGGAACTTTGACTACTAACCATATGGTTGTTGACAAAATATGGATATCTGAGGTTTCAAAGTCAGTTACCAGTAACACCATTTCAGGAGAACTTAATTCTGTGGTTTCTTCTAGAACATTGAGTCTGCTTTTGCAGGGAATTTTTGAGAATACTAGCGCTGAGGTGGTCAAGGAAAAGGATGGCAAGCAAACTGTCTTAGGAACTCCAACAGAAAGAGCAATATTAGAATTTGGCTTGGGCTTGGAAGGAGTTCATGATGCTGAGTATAGTGCCTGCACCAAGGTTAAGGTTGAGCCTTTCAATTCAGTCAAGAAGAAGATGGCAGTGCTGATTTCATTACCCAGTGGCACGTCCAGATGGTTTTGCAAAGGTGCATCAGAAATTATTTTGCAGATGTGCGACATGATGGTTGATGGCGATGGAAATGCTATTCCCTTATCGGAAGCTCAGAGAAAGAACATCTTAGATACTATCAACTCATTTGCTTCAGATGCTTTAAGGACGTTGTGCCTGGCATATAAGGAAGTGGATGATGATATTGATGACAATGCAGATAGTCCAACAAGTGGTTTTACTCTAATAGCCATTTTCGGTATCAAGGATCCTGTGCGCCCTGGAGTTAAGGATGCTGTTAAGACCTGTATGTCTGCTGGTATCACAGTAAGAATGGTAACTGGTGATAATATAAATACAGCTAAAGCTATAGCTAAAGAGTGTGGAATATTGACTGAAGATGGTGTAGCAATAGAAGGACCAGAATTCCATAGCAAGAGCCCAGAAGAGATGAGGGACCTGATACCGAATATTCAGGTTCATAATGTTTTCCTCAGTCTATATGTTTACTCAAATATTGACCAAACTTAATATCTGGAAATATTTTGCAGGTTATGGCCCGTTCTTTACCATTGGATAAGCATACACTCGTGACAAACTTGCGAGGTATGTTTGATGAGGTGGTTTCTGTGACAGGTGATGGTACAAATGATGCTCCTGCATTACACGAAGCAGATATCGGGCTTGCTATGGGCATTGCAGGAACAGAGGTACTGTTTCCTATGCAGTTCAAAACTTATGGACGTAGCATCAATAGACATTAAAAAAGTCAGATATTTAGGACGAATATGTCAGTATTCATTCTTACTGAAATAAGTTGACCCTGATAACCCATTTTGGATACTTTGTATTTTCTTTTTCATCTTCTGAAATGGAGTAATTTTGTCTTTTATTTGTGCAGGTTGCCAAGGAGAGTGCAGATGTCATAGTACTTGACGACAATTTCACTACTATAATAAATGTTGCAAGATGGGTTCGTGCAGTTTATATTAACATCCAAAAGTTTGTGCAGTTTCAATTGACTGTCAATATTGTTGCTTTAGTTATCAATTTTGTCTCAGCATGCATCACAGGTGAGGGCAACATTATAGTATTCATCTGATACTATGTATTTCCATTAAGTGGTTCCCCATGATCTCCAACACAGTACTAATGTTTCTCTCTTCCGTCACAGGGAGCGCTCCTCTCACTGCTGTGCAGCTGTTGTGGGTCAATATGATCATGGATACACTGGGAGCTTTAGCACTAGCAACAGAGCCTCCAAATGATGAAATGATGAAGAGGCCACCTGTCCGAAAAGGGGAAAGT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