BGIOSGA000020
| Gene Name |
BGIOSGA000020 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA000020, complete gene. |
| LocusTag |
P0518C01.18 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA000020-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA000020-PA |
| Length |
5470 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:46914698..46920167 |
| Sequence Coding Region |
46919712..46920167,46917382..46918628,46916966..46917107,46916784..46916891,46916132..46916344 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:46914698..46920167 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGTGACCGAGATGGCGATGCGAGGTGAGCCGTGGCGGCGCCAGGAGGGGGAGCAGGCGCAGGCGGAGGCCGATCGGGAACGCGAGCTGGACCTCTTCCGCAGCGGCTCCGCGCCGCCCACGGTCGAGGGCTCCATGGGCGCGCTCCACGCCGCCGCCGCCGCCGACGTGTTCCTGGAGGACGAGCTCCGGGCCGACCCGGCCTACCACTCCTACTACTACTCCAACGGCAACATCAACCCTCGCCTCCCGCCGCCGCTGCTGTCCAAGGAGGACTGGCGCTCCGCGCAGCGCCTTCGCCCCGGCTTGGGTGGGATCGGCGACGGGAGGAAGCCCAGAGGTGGAGGTGGAGGCCGCGGCGGCGGCGGCGCTGGAGGGATGGGTCCAGGGGATGGCCTCATTGGGATGCCCGGTCTCGAGATTGGCCGCCAGAATAGCTTCTCCGGTATCTTTCAGGATGACTCGTATCAACACGATACGGATAGACAGGGTGCCAACTGCAATGGTACAGACTTGTTGAGTTCTTCTAAAGTGCAGTATGGTCTACATCGTGAGACTGGAGCTATTAGTGGCCTTCACTCAGACAGCAAAGCACCATGCTTGCCAGAAAACCAGAATGAATCATCACACTCATATGCATCAATAATAGGATCATCACTTTCAAGAAGTGCATCTCCAGATCCTGAACTAGTGAGGAGAGTTCCTAGTCCTTGCCTCCCCCCAATTGGTGTGAAACTTGGTGCTACAGATAAGAAGAATAATGTTGGTTCATCTTCTTTCAATTGTAGTTCTCCCAATATTATTGAATCTGATGATTTGGTGTCTGCTCTATCTGGTATGAACCTGTCGTCATCAAGAGCAATGAACGGAAACACAATGGACCAATCTAAGCTCCATCAGGATGTGGATGATGTTCGTAAGTTCCTTTTTGATCAGTACATGGATCAAACAAATGGCAATCAGCGCCATTCCTACATGAAACGTTCTGAACAAGGACACGTGAAGGTTCCTCAAGAATATTCTGGTGCTTCTATGAATCCTTCTGTTATGAGAAGCCAGATCAATGCTGGTGGTTTCACATCATTTAACAACTCATCGGTGGGATCTGGCTTTGCTTCTCCTAGGCTTGGATCCCGATCACCAGGTGGGAGTTTATCTTCACGGCAAAATCTAACTGGTGCATCTAACCTTCCAAACTACGTTGGAATTGGAAGTCCAACTGCAGCTTCTGCTCACCAGATGCCTGTTGATCCACTGTATGTTCAGTTCCTTCGGGCAGCAGAAATTGCTGCCCTTGCAGCTAACTGTGAGGATCCTTTGATGGATAGGGCTAATCTAGGAGGTTCTTACATGGATCTATTTGGCCCTCAGAAGGCGTACCTTAGTCCATTGCTTCAGTCACAGAAGCAATATAGTTACTACGGGAATCTCGGGGTTGGTCTTGGCTATGCTGGTAACTCTTTAACAAGTCCTATTCTTCCCTCGTCACCAGGTGGACCTGGTAGTCCACTTAGGCACGGGGATCGCAGCATGCGCTATCCATCTGGGATGAGAAATTTTGGTGGTTCCTTTGGCTCCTGGAATTCAGATCTCGGTGGTAAGATGGAGGCCAATTTAGTTCCATCACTTCTGGAAGAATTTAAGAGCAACAAAAGCAAATCATATGAGCTCTCTGAAATCGCTGGTCATGTTGTTGAGTTCAGTGCGGATCAATATGGAAGTAGATTCATACAGCAAAAGCTTGAAACAGCCAGCACTGAAGAAAAAGACATGGTTTTTGCTGAAATCATGCCTCAGGCTCTCACATTGATGACTGATGTCTTTGGAAACTATGTTGTTCAGAAGTTTTTTGAGCATGGGAGCTCAGCTCAGATAAAGGAGTTGGCTGATCAGCTAATTGGACGTGTCTTAGCACTCAGCCTCCAAATGTATGGTTGCCGAGTTATACAGAAGGCCATAGAAGTTGTTGATTTAGATCAGCAGACTAAAATGGTTGCTGAGCTTGATGGACAAGTGATGCGCTGTGTACGTGATCAAAATGGAAATCACGTTATACAGAAATGTATTGAATGCATTCCACAGCATGCTATCCAGTTCATTGTTTCAACCTTCTATGGTCAAGTTGTGATGCTATCAACTCATCCATATGGTTGTCGGGTGATACAGAGGGTGCTGGAGCATTGTGATGATCCTAAAACCCAGCAAATCATGATGGATGAGATCCTACAATCTGTTTGCTTGCTGGCTACAGACCAGTATGGTAACTATGTTGTCCAGCATGTTCTGGAACATGGCAAACCCCACGAGAGATCTGCTATTATTGAGAAGTTGATTGGGCAGATAGTACAAATGAGCCAGCAAAAGTTTGCTTCAAATGTCATTGAGAAGTGTTTAGCCTTTGGGAATCCTGTGGAGCGTCAAGTCCTGATTGGTGAAATGCTTGGCTCCAGTAATGAGAGCGAACATCTTGAGGTGATGATGAAAGATCAATTTGCAAACTATGTGGTACAGAAGGTGTTAGAGACCTGTGATGATCAGCAGAGAGAGATGATCCTTACAAGGATAAAAGCTCATCTGAACACACTGAAGAAATATACTTACGGGAAGCATATAGTGGCACGCGTGGAAAAGCTCGTCGCAGCCGGAGAAAAGCGGCTTGGGCTTCAACCATCAACTGCAGCTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVTEMAMRGEPWRRQEGEQAQAEADRERELDLFRSGSAPPTVEGSMGALHAAAAADVFLEDELRADPAYHSYYYSNGNINPRLPPPLLSKEDWRSAQRLRPGLGGIGDGRKPRGGGGGRGGGGAGGMGPGDGLIGMPGLEIGRQNSFSGIFQDDSYQHDTDRQGANCNGTDLLSSSKVQYGLHRETGAISGLHSDSKAPCLPENQNESSHSYASIIGSSLSRSASPDPELVRRVPSPCLPPIGVKLGATDKKNNVGSSSFNCSSPNIIESDDLVSALSGMNLSSSRAMNGNTMDQSKLHQDVDDVRKFLFDQYMDQTNGNQRHSYMKRSEQGHVKVPQEYSGASMNPSVMRSQINAGGFTSFNNSSVGSGFASPRLGSRSPGGSLSSRQNLTGASNLPNYVGIGSPTAASAHQMPVDPLYVQFLRAAEIAALAANCEDPLMDRANLGGSYMDLFGPQKAYLSPLLQSQKQYSYYGNLGVGLGYAGNSLTSPILPSSPGGPGSPLRHGDRSMRYPSGMRNFGGSFGSWNSDLGGKMEANLVPSLLEEFKSNKSKSYELSEIAGHVVEFSADQYGSRFIQQKLETASTEEKDMVFAEIMPQALTLMTDVFGNYVVQKFFEHGSSAQIKELADQLIGRVLALSLQMYGCRVIQKAIEVVDLDQQTKMVAELDGQVMRCVRDQNGNHVIQKCIECIPQHAIQFIVSTFYGQVVMLSTHPYGCRVIQRVLEHCDDPKTQQIMMDEILQSVCLLATDQYGNYVVQHVLEHGKPHERSAIIEKLIGQIVQMSQQKFASNVIEKCLAFGNPVERQVLIGEMLGSSNESEHLEVMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQREMILTRIKAHLNTLKKYTYGKHIVARVEKLVAAGEKRLGLQPSTAA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..456#1540..2786#3061..3202#3277..3384#3824..4036#4147..4257#4818..5012#5164..5338#5433..5470#ATGGTGACCGAGATGGCGATGCGAGGTGAGCCGTGGCGGCGCCAGGAGGGGGAGCAGGCGCAGGCGGAGGCCGATCGGGAACGCGAGCTGGACCTCTTCCGCAGCGGCTCCGCGCCGCCCACGGTCGAGGGCTCCATGGGCGCGCTCCACGCCGCCGCCGCCGCCGACGTGTTCCTGGAGGACGAGCTCCGGGCCGACCCGGCCTACCACTCCTACTACTACTCCAACGGCAACATCAACCCTCGCCTCCCGCCGCCGCTGCTGTCCAAGGAGGACTGGCGCTCCGCGCAGCGCCTTCGCCCCGGCTTGGGTGGGATCGGCGACGGGAGGAAGCCCAGAGGTGGAGGTGGAGGCCGCGGCGGCGGCGGCGCTGGAGGGATGGGTCCAGGGGATGGCCTCATTGGGATGCCCGGTCTCGAGATTGGCCGCCAGAATAGCTTCTCCGGTATCTTTCAGGTGGTGCTTCTTCTACACTAGAACAACTTATCCTATCTTATTTAACTGCCATTGCATTGCTTGCACCTAAGCTTTCATGACTTGATTATGTCAGTGGTTCACGCAGTAGATGTCGAGTACAAGCATTGGCATAGGAGTTTTATTACTTTTGGTTCCTTTTTTCGTTCATTCAAGTAGATGAGTTCGTTTGAGTCAATGTTCATGTCTAAATTTTTTACCAGGGTATACGCTTCTCCTGCTGCTTTTACTGTTACGGAGTTAGATTGGTTTATTGTGATTGATAACTCCAATAGTTGAGTTAGATTGGTTTATTGTGACTGATAACTCCAATAGTTCTCCACCTTCATAGCTACTTTGTATGATAAAACCTCAAGTTCTGGCTGACGTTTGCTAGGTTTTGGCACTATAAAACGCCTTTCTGTCGCAAAAGTATTGGTCCTGAAACTTCGTAAGTTGTCGACCAATATGCTATTTGCAGCCAAAATTGTTGTGTTACTGCCTTGTTGTTTGTTACCACATTCTTGGATCTGTACCCATTCCCTATGCTATGTTTGTCTCGGTCATCTGAGTAATGTGATCTGTACATGGTTAGGGAGATGCTGAATTTAGCATGCATACACAAAATTGGTCTAGATTCCACGGAAGCTGCATAATATTCAGGAAATATTTTCTGCAGTATATTTCATTACAAGTAGATGGAAATGGTTCTGAGAAAGCTTCCCTTGCCACACATGCTAGAATAGTGCAGTATGATAATTGGCCAGCAAATGTCATATTTATATCTTCTTCTGTTTTTTTTTGCAATAAAGTTTATATCATTATTGTATTGATATTCGGTGCAACATGTATTGTTGGCTTCTAGAACTGCTATCTAGGGATGTGGCATCGCATTTCTTGCCAAATGCACTGCATCATGATTACAATTATTATCTTACATTGACATGTAGGTCATTTCCCGTATACGTGTGCGGATTGTATAAAATAGGGTAGATCTTAACTCTCAAGGGAATTTAATTACTCTTTTCTTCAGTTATAATTCTATTCAAGGCTAAAGAAATAGCTTCTGACCTATATATGATGCAGGATGACTCGTATCAACACGATACGGATAGACAGGGTGCCAACTGCAATGGTACAGACTTGTTGAGTTCTTCTAAAGTGCAGTATGGTCTACATCGTGAGACTGGAGCTATTAGTGGCCTTCACTCAGACAGCAAAGCACCATGCTTGCCAGAAAACCAGAATGAATCATCACACTCATATGCATCAATAATAGGATCATCACTTTCAAGAAGTGCATCTCCAGATCCTGAACTAGTGAGGAGAGTTCCTAGTCCTTGCCTCCCCCCAATTGGTGTGAAACTTGGTGCTACAGATAAGAAGAATAATGTTGGTTCATCTTCTTTCAATTGTAGTTCTCCCAATATTATTGAATCTGATGATTTGGTGTCTGCTCTATCTGGTATGAACCTGTCGTCATCAAGAGCAATGAACGGAAACACAATGGACCAATCTAAGCTCCATCAGGATGTGGATGATGTTCGTAAGTTCCTTTTTGATCAGTACATGGATCAAACAAATGGCAATCAGCGCCATTCCTACATGAAACGTTCTGAACAAGGACACGTGAAGGTTCCTCAAGAATATTCTGGTGCTTCTATGAATCCTTCTGTTATGAGAAGCCAGATCAATGCTGGTGGTTTCACATCATTTAACAACTCATCGGTGGGATCTGGCTTTGCTTCTCCTAGGCTTGGATCCCGATCACCAGGTGGGAGTTTATCTTCACGGCAAAATCTAACTGGTGCATCTAACCTTCCAAACTACGTTGGAATTGGAAGTCCAACTGCAGCTTCTGCTCACCAGATGCCTGTTGATCCACTGTATGTTCAGTTCCTTCGGGCAGCAGAAATTGCTGCCCTTGCAGCTAACTGTGAGGATCCTTTGATGGATAGGGCTAATCTAGGAGGTTCTTACATGGATCTATTTGGCCCTCAGAAGGCGTACCTTAGTCCATTGCTTCAGTCACAGAAGCAATATAGTTACTACGGGAATCTCGGGGTTGGTCTTGGCTATGCTGGTAACTCTTTAACAAGTCCTATTCTTCCCTCGTCACCAGGTGGACCTGGTAGTCCACTTAGGCACGGGGATCGCAGCATGCGCTATCCATCTGGGATGAGAAATTTTGGTGGTTCCTTTGGCTCCTGGAATTCAGATCTCGGTGGTAAGATGGAGGCCAATTTAGTTCCATCACTTCTGGAAGAATTTAAGAGCAACAAAAGCAAATCATATGAGCTCTCTGAAATCGCTGGTCATGTTGTTGAGTTCAGGTACTCCTTCTCAGTGGATTAATATGTTTCTGTATAACCCACTAAATTTTAAGGATATGTGGTAGAATGGGGAAAATTGAAATATATAGAAAACCCCCATACCATATTGGATAGCGCTAACTTTCATATATTAGTTCTAGATTGGAGGATTCAGTGATTGCATGAAAGATGTTTAATATTGGTAACTGCTTCATTCCATAATTGTTGGAAGAGCTATGTACACAGATCTCTCATCTTTATTGGTCTAATCTTTTTTTTTTTGGTTTACATTCAGTGCGGATCAATATGGAAGTAGATTCATACAGCAAAAGCTTGAAACAGCCAGCACTGAAGAAAAAGACATGGTTTTTGCTGAAATCATGCCTCAGGCTCTCACATTGATGACTGATGTCTTTGGAAACTATGTTGTTCAGAAGGTATTGATAACATTTTTTTTGTCAGTATAATAGCCATCATGATTTTACCCGCTGACAGTAATCCTTTGAACCAGTTTTTTGAGCATGGGAGCTCAGCTCAGATAAAGGAGTTGGCTGATCAGCTAATTGGACGTGTCTTAGCACTCAGCCTCCAAATGTATGGTTGCCGAGTTATACAGAAGGTGCAGATAATTTGAAAACCCATCTGTTGGTTCTTGAATTAAACCCATAATGATCATTTTGCTTAGTCAAATATATTTTACTTTTCCAAGTAGGCAAGTACTAATAATAAAAAACTTTTACAATCTGATCACATGGATCCCTTAGCAACCTATATTGTGGACAAAAGAGAGTACAAGTTACCTAGTTGTCAGCAAAACTCTTGGTTTGCAAGGCATGACAGATTGAATTTATATTTATACATGTGTGTCGATTCCTATTCATCGGTCTTTGACATATAATGCATCTCTGGTTATCTAAGTGCATATTGGCAACCACAGGCATGCTTGATCTTATCCAGTTATTTGTGTCCATGCACATATACCCTTATATATTGCATGAAGGGCTCAAAGGTGCAGCAAATAAGATGTTTAACTGATGTTATGGACAATATTCATGCAGGCCATAGAAGTTGTTGATTTAGATCAGCAGACTAAAATGGTTGCTGAGCTTGATGGACAAGTGATGCGCTGTGTACGTGATCAAAATGGAAATCACGTTATACAGAAATGTATTGAATGCATTCCACAGCATGCTATCCAGTTCATTGTTTCAACCTTCTATGGTCAAGTTGTGATGCTATCAACTCATCCATATGGTTGTCGGGTGATACAGGTACACTTGTAGTGCCACAGCATGCTATCCGTTGATTGCTTCAATATCCAGTCTATTCATGCTACTTCATAGCTACACTAACCTTTGTCATGCAAATTCACTGGACGCAGAGGGTGCTGGAGCATTGTGATGATCCTAAAACCCAGCAAATCATGATGGATGAGATCCTACAATCTGTTTGCTTGCTGGCTACAGACCAGTATGGTAACTATGTTGTCCAGGTCAGTGACAAAATTTTCCCTTTTTGTTTTTATGGTGGATTTGCTCCTGTTCAGCACCTGTCAACTGTAGCCGCTTGCTAAAAAATAGGGTTTCTGCTACTTGAAATACTGACTACTACATGAGATACTGACCCAAATGTTCATCAATTACATGTAAGAGATTCTTAATATTTCTTTAGCACTGTGATGTGCAAACATGGTTATATTAAATAATTTCAACCACTTCCTATGACATGTCTAGATATTAGAGATAGGATTTTTATGAGGAAAGCTCAGTTTGCTTGGACCTTGCCGAACTGTGTTTCCCCAAGAGTAATACACTCGCTCAGTTGAACATGCTTTTCCTTCCCCTTTTCCACCTTAAGCTATTTTGCATTTATGTATAGGGTGAACGATGAAAATAGTTTGCATATACTGTGATTGATTGATCAGTGGAATTTAGCAGTTGTGCAAGTAGACATGATAAGCCTGGAATGTTGATGCATGTGCTTCTTTCCCCTCATTTGCTCTCTCACTGCAAAAGGCATTTTCTCTCTTCAATAACCAACCTTATTTGACAGCATGTTCTGGAACATGGCAAACCCCACGAGAGATCTGCTATTATTGAGAAGTTGATTGGGCAGATAGTACAAAT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