BGIOSGA000098
| Gene Name |
BGIOSGA000098 |
|---|---|
| Description |
Zinc finger protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA000098, complete gene. |
| LocusTag |
OS01G0952300 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA000098-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA000098-PA |
| Length |
6616 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:45955353..45961968 |
| Sequence Coding Region |
45961900..45961968,45960584..45960670,45960402..45960491,45959565..45959645,45959227..45959421 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:45955353..45961968 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:45955353..45961968 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGGACGCGTCGTCGGATCTCGCCGGCGGTCGGGCGGCCCCCCCCGTGGAGCGCGACATCGAGCAGGCTATCACCGCCCTTAAGAAAGGAGCTTACTTATTGAAGTATGGACGTAGGGGAAAACCAAAGTTCTGTCCATTTAGGTTATCCAATGACGAATCTGTACTGATATGGTTCTCAGGGAAAGAGGAGAAACATCTAAGGTTGAGCCAAGTGTCCAGGATAGTTCCTGGGCAACGGACTGCAATTTTTCAGAGGTATCCACGACCTGAGAAGGAATGTCAGTCGTTTTCTCTGATTTCACATGATAGATCATTGGACATCATTTGTAAAGATAAAGATGAGGCAGAAGTGTGGTTTGCTGGGCTGAAAACATTGATTTCACATAGCCATCAAAGAAAATGGAGAACAGAATCGAGAAGTGATATCATATCCTCTGGTGCAACTAGTCCAAGGACTTATACACGTCGGAGTTCTCCATTGAGTTCTCCCTTCAGTAGCAATGACAGTGTCCATAAGGATGGCAGTGATCATTACCGACTCCGGAGTCCATTTGGGAGTCCACCAAAGAATGCATTGGATAAGGCCTTTTCTGACGTTGTGTTATATGCAGTTCCTCCCAAGGGCTTCTTCCCATCAGATTCTAATGCCGGATCAGTCCACTCTATGTCGTCTGGACACTCAGATAACACAAATGGTCACCCAAGAGGCATCCCAATGGATGCTTTTCGGGTCAGTTATTCAAGTGCTATCAGTTCGTCAAGTCATGGTTCAGGTCATGATGATGGGGATGCTTTAGGTGACGTTTTCATATGGGGAGAAGGAACTGGGGAAGGAATTCTCGGTGGTGGTAGTTCAAGGGTTGGAAGCTCTTCTAGTGCAAAGATGGATTATCTTGTACCAAAACCATTAGAGTTCGCTGTGCGACTTGATGTGCAGAATATATCTTGTGGAGGAAGGCATGCTGCATTGGTCACTAAACAAGGGGAGATCTACTCTTGGGGTGAGGAATCAGGTGGCCGGCTTGGGCATGGTGTAGATTGTGATGTGGCACAACCAAAACTCATTGATTCTCTTGCTCACATGAACATAGAGCTGGTAGCATGCGGTGAATACCATACCTGTGCTGTTACACTATCTGGAGATCTGTATACATGGGGGGATGGCACCTTTAAATTTGGGCTTTTGGGTCATGGAAATGATGTCAGTCACTGGGTACCAAAAAGGGTTGATGGGCCATTAGAGGGTATACATGTATCATCAATTTCTTGTGGCCCTTGGCATACGGCCCTAGTAACTTCTGCTGGCCAGCTGTTCACATTTGGAGATGGATCTTTTGGTGTTCTAGGGCATGGAGATCGTGCAAGTCTTTCAGTCCCCAGGGAAGTAGAATCCCTAAAAGGTCTACGAACGGTTCGGGCAGCTTGTGGTGTTTGGCACACTGCTGCTGTTGTAGAAGTCATGGTTGGGAATTCAAGTTCTAGCAATTGTTCATCTGGCAAGATATTTACTTGGGGTGATGGAGATAAAGGCCGTTTAGGACATGGTGACAAGGACTCAAGATTTGTCCCAACATGTGTGGCTGCTTTGGTGGAGCCCAATTTTTGTCAAGTTGCTTGTGGGCATTGCTTGACAGTGGCTCTTACAACCTCAGGGCATGTATATACAATGGGTAGTGCTGTCTATGGTCAGCTTGGAAATCCACAAGCAGATGGTTTGCTTCCTGTACGTGTTGAAGGGAAGCTGCACAAAAACTTTGTAGAAGAAATTTCTTGTGGTGCTTATCATGTGGCTGTATTGACATCCAGGACTGAGGTGTACACGTGGGGTAAAGGTGCAAATGGTCGGTTAGGTCATGGTGGTACTGATGATAAGAATACTCCTACATTGGTTGAAGCATTGAAAGATAAGCAAGTCAGAAGTGTTGTGTGTGGAATTAACTTCACTGCAGCAATATGCATTCATAAATGGGTATCTGGAAGTGATCAGTCAATGTGCTCTGGATGCCGTCAGCCGTTTAACTTGAGGAGAAAACGTCATAATTGCTACAATTGTGCTCTAGTATTTTGTCATTCATGCAGCAGTAAAAAATCTTTGAAGGCTTCATTGGCGCCAAACCCGAACAAGCCTTACCGCGTCTGTGATAGTTGCTACAGCAAACTCACTAAGGGGCTTGAAACAGACACAAACTCCTCAACTAAGCGAGGCACTGTTGTACAGGGATTCAGTGAAACTAATGAGGAGGAGCTGGAAACACGGTCAAATACCCAACTGTTGAGATTGTCTTCTATGGAATCTTTTAAGAACATGGACAGTAGATATTCGAAGAAAAACAAAAAGTTTGAATTCAACAGCACTCGTGTTTCCCCTGTTCCAAATGGCAGTTCACACTGGAGCGGGCTCAATATTTCAAGATCCTTCAATCCTGTATTTGGATCCTCAAAGAAGTTTTTTTCAGCATCTGTTCCTGGATCAAGAATTGTTTCTAGGGCAACATCACCTGTCTCAAGAAGAACAAGCCCTCCTAGATCGACAACCCCAACGCCTACTTTGGGTGGTCTAACTTCTCCTAGAGTTATTGCCAATGATGCCAAGCCTACAAATGATAGTCTAAGCCACGAGGTCTTGAATTTGAGGTCCCAGGTGGAGAATCTTACTAGGAAGTCTCATCTTCTGGAAGTTGAGCTGGAGAGAACTACGAAACAATTGAAGGAAGCAATTGTAATTGCTGGGGAGGAAACTGCCAAGTGCAAGGCTGCAAAAGAAGTAATCAAATCACTCACGGCACAATTGAAGGGAATGGCAGAGAGATTGCCTGGAGGAGTAACCAAGAATAGCAAACTGCCGCCCCTATCTGGATTTCCTATGCCAAGTGAGCTATCATCCATGGCTACAGAAAGTTTGGGTAGCCCAAGCAGTGTAGGAGAACAAATTTCAAATGGTCCTAATGGGCTGCTTGCTTCTAATGGACCAAGTTCTGTTAGAATCAAGGCAGGTCATCCAGAAGTTGGCAAAAATGGTAGTAGACTGCCTGAAGCAGAATCATGCCATGAGGCTGAATGGGTGGAGCAAGACGAACCAGGCGTTTACATCACTCTAACCGCCTTGCCTGGAGGTGCGAGAGATCTCAAGCGGGTTCGGTTCAGCCGGAAGAGATTCAGCGAGACCCAGGCAGAACAATGGTGGCAGGAGAACAGGACAAGGGTATACCAGCATTACAATGTTCGGATGGTTGAAAAATCAGCCTCCAGTATCGATAATGAGATTGCATCTCGGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSDASSDLAGGRAAPPVERDIEQAITALKKGAYLLKYGRRGKPKFCPFRLSNDESVLIWFSGKEEKHLRLSQVSRIVPGQRTAIFQRYPRPEKECQSFSLISHDRSLDIICKDKDEAEVWFAGLKTLISHSHQRKWRTESRSDIISSGATSPRTYTRRSSPLSSPFSSNDSVHKDGSDHYRLRSPFGSPPKNALDKAFSDVVLYAVPPKGFFPSDSNAGSVHSMSSGHSDNTNGHPRGIPMDAFRVSYSSAISSSSHGSGHDDGDALGDVFIWGEGTGEGILGGGSSRVGSSSSAKMDYLVPKPLEFAVRLDVQNISCGGRHAALVTKQGEIYSWGEESGGRLGHGVDCDVAQPKLIDSLAHMNIELVACGEYHTCAVTLSGDLYTWGDGTFKFGLLGHGNDVSHWVPKRVDGPLEGIHVSSISCGPWHTALVTSAGQLFTFGDGSFGVLGHGDRASLSVPREVESLKGLRTVRAACGVWHTAAVVEVMVGNSSSSNCSSGKIFTWGDGDKGRLGHGDKDSRFVPTCVAALVEPNFCQVACGHCLTVALTTSGHVYTMGSAVYGQLGNPQADGLLPVRVEGKLHKNFVEEISCGAYHVAVLTSRTEVYTWGKGANGRLGHGGTDDKNTPTLVEALKDKQVRSVVCGINFTAAICIHKWVSGSDQSMCSGCRQPFNLRRKRHNCYNCALVFCHSCSSKKSLKASLAPNPNKPYRVCDSCYSKLTKGLETDTNSSTKRGTVVQGFSETNEEELETRSNTQLLRLSSMESFKNMDSRYSKKNKKFEFNSTRVSPVPNGSSHWSGLNISRSFNPVFGSSKKFFSASVPGSRIVSRATSPVSRRTSPPRSTTPTPTLGGLTSPRVIANDAKPTNDSLSHEVLNLRSQVENLTRKSHLLEVELERTTKQLKEAIVIAGEETAKCKAAKEVIKSLTAQLKGMAERLPGGVTKNSKLPPLSGFPMPSELSSMATESLGSPSSVGEQISNGPNGLLASNGPSSVRIKAGHPEVGKNGSRLPEAESCHEAEWVEQDEPGVYITLTALPGGARDLKRVRFSRKRFSETQAEQWWQENRTRVYQHYNVRMVEKSASSIDNEIASR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..69#1299..1385#1478..1567#2324..2404#2548..2742#3103..5226#5655..5801#6051..6406#6484..6616#ATGTCGGACGCGTCGTCGGATCTCGCCGGCGGTCGGGCGGCCCCCCCCGTGGAGCGCGACATCGAGCAGGTGCGGTGCTGCTGCCGCCTCGCCGCCACTCCCCCATTTGCACGACATCTCAGTGAATCGGTTTTCCCGTACTTGTTTTTCTTTTAGTTTGTTTTTTTTTTTGGTTTCTCGTGGGGTGCAACTCTGAGGAAGAGAGAGAGAGAGTAGTACTCCACACCACATGCTTCTGCTTGGGTCTCTGTGCTCATGTGCTGTGCCGAATTGGTTGCTGGATTCGTCAGTTCGTGCCGATTGGGCCTTGGGGGTGAAATGGTGCCCGAATTCGCGGAGCTAGATAGAAGCTATTTGACCGTGTTCCAGTTGGTTTTCTAGTATTTGAATTGAGCTGGGATTTCTAGTTGAATTGAATTGGGAGCGACGGCTTGCTCTTGCTCTCGTGAGATTCCGGGAGCCGGAGAAATGATTAACCTGATATCGTCTATCTGGATTCTGGAGTTTTAGTAGTATGCATTTGAGGTCTAATTGGAGTTAGTCCTTTGTACATTTTCTGGAGTTGGGAGCCTGAAGGGAGTTCAGTTTCGAATTAGTCTTGGAGCGTCAGGAGTTCGTGTTGTTTTTCAGTTACAGATGCTTGGCTTGTCCTCAGGGCTGTTGGGCATTTGCTAAATGATTGTCCATTCTGATGTAGTTGGTAAAGTGGACCTGAATTTCGGAAATTCTGATGGGGCTATAATAGGATTTTTATGACTTGTTAAAATTGTCGAGAGACTGAGTGCATATAAAGTCTTAATGCTGCTGTGGATTGAACTCCTGTAGATTTCGAAGGAGGTTGTCAGTCAAATGGATAGGAGATGCTTATTTTGCCCGTATAATCCTCTGTCTGCTCTTTTGTCGCTGAGATGAGTGGATTGTTCAGCTGAAATGCCGTTTATTTTGTGTTCTTTTCTGCTACTTTGTATTCTAGTTGAGGTAAAACCTGTTCAACAAGATAAAATGGGAAGTGGGGGTGAAAGCAGGACGGTTTCTGTTCAAGATTGAACCAATACCGCGACACGGCATAGAAATTACTCTATTCAGTTCATTATTTTTATAATTAATGACCGAATGCCTATAGTTAGCGGAAGATCACATTTCTTTATTGTTTGATTTGTTATGAAAGATACTCAGCCTTCGAAACATTTAGTGACTGGTGTTCTATGCCTATATTACTTTCCCTTGTGTCATGGCATCTGAAGGTTGCATTCTCCTGATGATCACTAGCCTCTTTTGATTAATTCGACTTTCTGCAGGCTATCACCGCCCTTAAGAAAGGAGCTTACTTATTGAAGTATGGACGTAGGGGAAAACCAAAGTTCTGTCCATTTAGGTTATCCAATGTGAGTTTTTACTTTCCCACCCGTTAAGTTTTTTTTTTCTGAACTTCTATGTGATTTTCTCACTTTTAAGGTGTCTTTTTGTATTCCTTCAGGACGAATCTGTACTGATATGGTTCTCAGGGAAAGAGGAGAAACATCTAAGGTTGAGCCAAGTGTCCAGGATAGTTCCTGGGCAACGGACTGTAAGTTAACACTCCTAAAAACTATCCAGAATTTTACAAGGCAGGGGTGGATCTAAAAAAATGTCATTGAGGTCACTCTTTTCACATATCATGGTGAAAATGCCTAAGTATAAGAGTGATTTATTAGTTCCTAAGAATATTTGGTAGTGTAATTAGCAAAAGTCATAGGTGTCATCCGACACCAGTAATTATACTGTGGATCTGCTCCTGCTACAAGGTGATCCTGTTTAACTATGCTTGCCCATTATGACAAACTATTCTGATTAACAAACATAATTACAAGAGAAGTTTGATATTTATATTCTTGCTGTTTATGTTTCCTTCAGCCTCTTGCATCATTCTTTTGTTTTCTCTGTGGTAAACTAAACTACGGCAAACTTTACTAGTGTCTCTGCAAGTTCTTACTTGTTTAAGTTTCTATAATATGTATATTTTTTTTGAAAGACGTGTCTATAATATATTGGCACTAAACCTACTAACCTAGTATCATTAAGTGGAATAGCGATTCCGGTCTATGCAATTGGTTCAAATCACTGGTAGCCTTAAATCTGTATTTGAATAAATTGGTTCATTGTCTAATCTGACCAATCTACTGAGGAAGCTATTAGCATCACTCCAAACTGTCATGTGATGGTTTGACCGTATGATCGCCTCCCATTTTTAATGAATGTTCTGATGAGTTTGGTTACAGGTATTTCTAATCTGATGTTGGCACACAACTTACTGACTAGAAATCATTTTTTGGGATAAATCTAGGCAATTTTTCAGAGGTATCCACGACCTGAGAAGGAATGTCAGTCGTTTTCTCTGATTTCACATGATAGATCATTGGACATCGTAAGTTCTTCATGGTTCACATTTCATGTTTATCTTTGTCGATCTCTTTCAAACTTTGATGTAACCTGCATTACTTTCTTTTGCTTTTGACTTGTATGGAGTCTCTTCTTTACATGGAAATATGTTTTCCTTAATAATTTCAGATTTGTAAAGATAAAGATGAGGCAGAAGTGTGGTTTGCTGGGCTGAAAACATTGATTTCACATAGCCATCAAAGAAAATGGAGAACAGAATCGAGAAGTGATATCATATCCTCTGGTGCAACTAGTCCAAGGACTTATACACGTCGGAGTTCTCCATTGAGTTCTCCCTTCAGTAGCAATGACAGTGTCCATAAGGTATTTGCTATCCATCATCTCTTGAATATGAATGATCTACTCTTGTATTCCATCATCTTTCCACTTTGCTCATGTCTCATCTCTTGTTCAAAGTCATGCCAACATCTGTCTGTGGTCCTGAGTGCTCTACCTGTAGTATTATAGTTTAAGCTAAATAATATCTCACGCGTGGTCAAGTATTGTTATGTGTGTTTTCATTTCATTGACATGAGCAATAGTTAAACATAAGGGAGTATACAAGTTTTAATTATTTTTATGACCTTCCTTCTCATCATGTTGAATCATATGCTATTCCATTTGATACGACACTATTTTTAACACCAATTCATAAAGTGATTTCTGACAGTTATTTTACATCAGGATGGCAGTGATCATTACCGACTCCGGAGTCCATTTGGGAGTCCACCAAAGAATGCATTGGATAAGGCCTTTTCTGACGTTGTGTTATATGCAGTTCCTCCCAAGGGCTTCTTCCCATCAGATTCTAATGCCGGATCAGTCCACTCTATGTCGTCTGGACACTCAGATAACACAAATGGTCACCCAAGAGGCATCCCAATGGATGCTTTTCGGGTCAGTTATTCAAGTGCTATCAGTTCGTCAAGTCATGGTTCAGGTCATGATGATGGGGATGCTTTAGGTGACGTTTTCATATGGGGAGAAGGAACTGGGGAAGGAATTCTCGGTGGTGGTAGTTCAAGGGTTGGAAGCTCTTCTAGTGCAAAGATGGATTATCTTGTACCAAAACCATTAGAGTTCGCTGTGCGACTTGATGTGCAGAATATATCTTGTGGAGGAAGGCATGCTGCATTGGTCACTAAACAAGGGGAGATCTACTCTTGGGGTGAGGAATCAGGTGGCCGGCTTGGGCATGGTGTAGATTGTGATGTGGCACAACCAAAACTCATTGATTCTCTTGCTCACATGAACATAGAGCTGGTAGCATGCGGTGAATACCATACCTGTGCTGTTACACTATCTGGAGATCTGTATACATGGGGGGATGGCACCTTTAAATTTGGGCTTTTGGGTCATGGAAATGATGTCAGTCACTGGGTACCAAAAAGGGTTGATGGGCCATTAGAGGGTATACATGTATCATCAATTTCTTGTGGCCCTTGGCATACGGCCCTAGTAACTTCTGCTGGCCAGCTGTTCACATTTGGAGATGGATCTTTTGGTGTTCTAGGGCATGGAGATCGTGCAAGTCTTTCAGTCCCCAGGGAAGTAGAATCCCTAAAAGGTCTACGAACGGTTCGGGCAGCTTGTGGTGTTTGGCACACTGCTGCTGTTGTAGAAGTCATGGTTGGGAATTCAAGTTCTAGCAATTGTTCATCTGGCAAGATATTTACTTGGGGTGATGGAGATAAAGGCCGTTTAGGACATGGTGACAAGGACTCAAGATTTGTCCCAACATGTGTGGCTGCTTTGGTGGAGCCCAATTTTTGTCAAGTTGCTTGTGGGCATTGCTTGACAGTGGCTCTTACAACCTCAGGGCATGTATATACAATGGGTAGTGCTGTCTATGGTCAGCTTGGAAATCCACAAGCAGATGGTTTGCTTCCTGTACGTGTTGAAGGGAAGCTGCACAAAAACTTTGTAGAAGAAATTTCTTGTGGTGCTTATCATGTGGCTGTATTGACATCCAGGACTGAGGTGTACACGTGGGGTAAAGGTGCAAATGGTCGGTTAGGTCATGGTGGTACTGATGATAAGAATACTCCTACATTGGTTGAAGCATTGAAAGATAAGCAAGTCAGAAGTGTTGTGTGTGGAATTAACTTCACTGCAGCAATATGCATTCATAAATGGGTATCTGGAAGTGATCAGTCAATGTGCTCTGGATGCCGTCAGCCGTTTAACTTGAGGAGAAAACGTCATAATTGCTACAATTGTGCTCTAGTATTTTGTCATTCATGCAGCAGTAAAAAATCTTTGAAGGCTTCATTGGCGCCAAACCCGAACAAGCCTTACCGCGTCTGTGATAGTTGCTACAGCAAACTCACTAAGGGGCTTGAAACAGACACAAACTCCTCAACTAAGCGAGGCACTGTTGTACAGGGATTCAGTGAAACTAATGAGGAGGAGCTGGAAACACGGTCAAATACCCAACTGTTGAGATTGTCTTCTATGGAATCTTTTAAGAACAT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| External Link(s) |
