BGIOSGA000249
| Gene Name |
BGIOSGA000249 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA000249, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_04935 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA000249-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA000249-PA |
| Length |
4092 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:43812049..43816140 |
| Sequence Coding Region |
43815969..43816140,43815254..43815414,43814819..43814881,43814217..43814336,43813826..43814122 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:43812049..43816140 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGACGACGCCGGAAGGGCCTCCGCTCCAGCGGTGGTGACGGTGACGGCCTCCGCCGCCGCCCCCACGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGCCTCCCCCCCCTCCCTCGCAGCTCCCCGCCACCGCCGCCGCCACGGACGAGCCTTCCCACGACCCCGCCGCTCTCTATGGAGAGGGTATGTGGCAGCAGATGACCATGAGCGGCAGTGGCGCTATGCAACCTGGACCATATCCTGAGCGGTCCGGAGAACCGGACTGCACTTACTACCTCAGGACTGGATTGTGCAGGTTCGGTATGAGCTGCAGGTTCAATCATCCTCAGGATAGGAATCTGGCTATTGCCTCTGCCAGAATGAAAGGAGAATACCCTGAGAGGATGGGGCAACCAGAATGTCAGTATTATCTGAAGACTGGAACATGCAAGTTTGGGCCTACATGCAAATTCCATCATCCCAGAGAAAAAGCTGGAATTGCAGGGAGGGTGCAGCTAAACACATTAGGATATCCACTCCGACCGAGTGAAAAGGAGTGTGCATATTACTTAAAAACAGGACAGTGTAAATATGGGAATACATGTAAATTTCACCATCCAGAACTTTTCAATGCTATGGCTTCTTCACGTGGTTCACCTATTTATCCTTCTGTACATTCCTCTGCAACCGCGGGTCCACCTTCTTATACTGGAACAATGGCTAGCTGGGCTTTTCCAAGAGGTTCTTTTATTCCAAGCCCTAGATGGCAGAATCCCTCAAATTATGCACCGATGATTGTACCGCAAGGTCTTGTTCAAGTACCAAGCTGGAACTCATATACTGGCCAAATGATGCCTGTTTCATCTTCTGAGAGTCGACTGCAGTCCCCAGGGGCTCAACAAACCTATGGAACTTCTCAGCAAGTTGATGCCAGTGCAGGCAATCAGGGAATGTTGTCACCCTACAGATCTAGTTCATATCCTGTACCTCAATACGCATTGCAGAGAGAGAATGTATTTCCTGAGAGACCTGATCAACCAGAATGTCAATACTACATGAAGACTGGAGACTGTAAATTTGGTGCGGTGTGCAAGTTCCATCATCCCCGGGTGCGATCAATGCCTACTCCAGATTGTGTCTTGAGTCCAGTGGGTCTTCCACTACGTCCGGGAGAAGAACTGTGCAAGTTCTATTCTCGCTATGGCATCTGCAAGTTCGGCGCGAATTGCAAATTTGACCATCCAACGATGGCTCCTCCAATGGGAGTGTATGCCTACGGCTCTGCTTCAACTAATGTACCTATGGTTCGGCGTCTCCTGCAATCCCCATCCGCATCCGCGTACACTTCCTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDDAGRASAPAVVTVTASAAAPTPPPPPPPPPPPPSQLPATAAATDEPSHDPAALYGEGMWQQMTMSGSGAMQPGPYPERSGEPDCTYYLRTGLCRFGMSCRFNHPQDRNLAIASARMKGEYPERMGQPECQYYLKTGTCKFGPTCKFHHPREKAGIAGRVQLNTLGYPLRPSEKECAYYLKTGQCKYGNTCKFHHPELFNAMASSRGSPIYPSVHSSATAGPPSYTGTMASWAFPRGSFIPSPRWQNPSNYAPMIVPQGLVQVPSWNSYTGQMMPVSSSESRLQSPGAQQTYGTSQQVDASAGNQGMLSPYRSSSYPVPQYALQRENVFPERPDQPECQYYMKTGDCKFGAVCKFHHPRVRSMPTPDCVLSPVGLPLRPGEELCKFYSRYGICKFGANCKFDHPTMAPPMGVYAYGSASTNVPMVRRLLQSPSASAYTS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..172#727..887#1260..1322#1805..1924#2019..2315#3105..3431#3910..4092#ATGGACGACGCCGGAAGGGCCTCCGCTCCAGCGGTGGTGACGGTGACGGCCTCCGCCGCCGCCCCCACGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGCCTCCCCCCCCTCCCTCGCAGCTCCCCGCCACCGCCGCCGCCACGGACGAGCCTTCCCACGACCCCGCCGCTCTCTATGGAGGTTTGGATTTCTCCTGCGCTTTTTACCCTGCGCGCTTGATTGGTCGGTCGGTGGAATTGGGGTTTGGAGGGGATTAATTCTGAGTAGGTTTAGCTCTCCGGTGCGTAGTGTTTCGTGATTTTTCTCATGGATTTAACTAGCAGCTACTCCGCTGGTATTTTTGTTATGAATCACGGAGTAATAATAATCCATCAAATCATATTGCAACGGAAACTACTCCTTGTAGGCGCGTAAGTGAGGTTTTCGTGGTGTGACTCATTCTGGTTAGACAGTGATGTGCTTATCAGCTATCCTTTTTTTTTTTTTTACAATTTCATGTTTAACCTGTGATACATCTAGAATGAGTGGATGCTATTGTAGAATTTTCGTTACTACCACAAGTGAGATATTAGCGAATCAAGTGGTGTTTGGGTCTGTTTATTGTGTTTGTGCCGTTGCTGGTGAAATGTGGGTAGTTTTATAGCGTGACCTTATTGACGCCGAACAAATTTCATCTTGTGTGCTTGTTGGTCTTGGATTTTTGTTTCATGTGGTGTGTGCAATGTTGGTTGCAGAGGGTATGTGGCAGCAGATGACCATGAGCGGCAGTGGCGCTATGCAACCTGGACCATATCCTGAGCGGTCCGGAGAACCGGACTGCACTTACTACCTCAGGACTGGATTGTGCAGGTTCGGTATGAGCTGCAGGTTCAATCATCCTCAGGATAGGAATCTGGTGAATAGATACTTGACCCAACTGTTCTTATGTAGCATTATTGTTTCTTATCACACTGATTCATGGGGTAATCTCAGTCAGGATGTCATCATTAGGTTGTAGTTTAGAAGAATAGGCTGAAACTGGGGAAGGACTACGCAATGGAGCATGTTCAGCTGTATGTAATGTAACCCATGTTTCATGATAAGCAGAGACCCATTCTCCTTTGGACAATTGCCACCAGCAGGCATAGGCCGAGTGATGCATTACAGATTTAAATTAGTGACTACCATTTTTCTGTAAATTATATCTTATATTCAATTCTGATCGTTTTATCTTTTCTTCATACCTCATGTTTTATTCTCAAGTTAGATTGGATCTGTTTAATGTTAGGCTATTGCCTCTGCCAGAATGAAAGGAGAATACCCTGAGAGGATGGGGCAACCAGAATGTCAGGTAATTATGGTTACTTGAACTCAGGCCAGGGTTTATTAGTTAACAATGGCTAGCAATCTACTGCATATGCATTCTGTGACAAGAAATGGTTTGTCTGGTCGTATATGCTTTGAAAAAACATGTAGCTAGAAAGGAGGTATTGAATTTGTGCACCATAGGTTGACAAAAGGTTGAAGTTCATGTGAGAGCCTAGATCCCTAGACTTAATCTTTATTCTTTCTTCTTCATGTGAAAACGGAAACCAGACAAGAATTACATGCATTAGTTGTGCATTCATGCAGCAACAACAGAACAGCTAGACTAGCTTCAGTTTTCTCCAAATTATAATCACACAATTGCAGATTGTCCTTGTGTAAGGAAACTAGCTGTTTTTGTTTGTCTATGTTTCTAGAGTTGACATTATGCAATTTAGAGTGGTGTAGTTTTTTTATTAAGTTGGACAGGTGTTGAAATGAAATAATTTCTCAAAATTTTCTGTTCAGTATTATCTGAAGACTGGAACATGCAAGTTTGGGCCTACATGCAAATTCCATCATCCCAGAGAAAAAGCTGGAATTGCAGGGAGGGTGCAGCTAAACACATTAGGATATCCACTCCGACCGGTTTGTAGTTTATTGCTGCAGCACATCATCTGCCCTTCCTTTTTATAGTTTCTTCTCTTTGATGTACTGAAGTGAAGTCTGTTTGCTTCTGTAGAGTGAAAAGGAGTGTGCATATTACTTAAAAACAGGACAGTGTAAATATGGGAATACATGTAAATTTCACCATCCAGAACTTTTCAATGCTATGGCTTCTTCACGTGGTTCACCTATTTATCCTTCTGTACATTCCTCTGCAACCGCGGGTCCACCTTCTTATACTGGAACAATGGCTAGCTGGGCTTTTCCAAGAGGTTCTTTTATTCCAAGCCCTAGATGGCAGAATCCCTCAAATTATGCACCGATGATTGTACCGCAAGGTCTTGTTCAAGTACCAAGCTGGAACTCATATACTGTAAGATCATTTCTTCTCACAGTCATAGACATATAGTGGAGACGTGATTTTCCCAATCATGGATTGTTTACGTTGGCTTTCATGCTCTGTTAATTTCCTAACAATCTGGGTTGATCTTTAATTGCTCTCGACCCTGTTAAAATATAAAACTGAATTGCAAAAATATACCATTATTAACTTTAGTTGTGATCTTCATCAGAACTATACTGACTCCACAGGCCACTAGTAATGTTGCATATCAAATCCCACTTCCTACAATGATGGTTTCTCTCATTTAACTAGGTATGAAGTGATTTATTCAATGGAAAGAACTATGTGATGATTGCTGAATAGTTCTCTTTTGGGCATGAACTAATGTTCTATGTGGTTTTGTTTCTGTATAAATGGCATTGTTGTGTGCTATGGTGTTTCTAATTGATTAATAATCCTTTGTAGATCCATTGACTGCAGCTTGCCCTACAATTTAAGTTTGTAGATCCATTGACTGCAGCTTGCCCTACAATTTAAGTTTGGCTGCTACTGAACTAAATGTTCTTTGTGGTTTTGTTTCTGTATAAATGGGATTGTTGTGTGCTATGGTATTTCTAATTGATTAATAATCCTTTGTAGATCCGTTGACTGCAGCTTGCCCTACAATTTAAGTTTGGCTGCTACAGTTTATATCCTCTGATTTGTTTAGAACACTAATATTTATTTTTTGAAAGTGAAAAGCTATAACATTGGAATCCACTCTTACACCAATTGCTGGAGTCATACTAAAGTTGATTTTTTGTGATTTTGCTTTTCAAGGGCCAAATGATGCCTGTTTCATCTTCTGAGAGTCGACTGCAGTCCCCAGGGGCTCAACAAACCTATGGAACTTCTCAGCAAGTTGATGCCAGTGCAGGCAATCAGGGAATGTTGTCACCCTACAGATCTAGTTCATATCCTGTACCTCAATACGCATTGCAGAGAGAGAATGTATTTCCTGAGAGACCTGATCAACCAGAATGTCAATACTACATGAAGACTGGAGACTGTAAATTTGGTGCGGTGTGCAAGTTCCATCATCCCCGGGTGCGATCAATGCCTACTCCAGATTGTGTCTTGAGTCCAGTGGGTCTTCCACTACGTCCGGTAAGTTACTACAAACCTTTTTGTACTTATGTTCCAGTGACAATTATTTGTGTTCTCATGTTCCACGTATCACTTTAATGTTCATGGTTGATCATTGTACCGCCTCATCTCTTTTAGAGGATCAAGAGTATATGCCCGTCTTAACTTTTTCTTTCTCTGGTCCAGTCTTTCCGCTGATATTAAGATGAATTTTACAACAAAAAATGTGCTGCCTGTGTATGAAGGTTCAGAGGCATAGTTCATAATTTTACCCTGTTCTCAATTAGGAAATGTATTTTGCAAGGTCATAAAGTCTTGACATTGATGATCAAATATTTTCTAGAGCTAAAATTTCATAATCAAATATGACAGTTCCACAGCAGTAGATAAAGAGTACCCACTGTATATATTAATATGAAGATTAACACTTGAAAAAACCTTTGATTGTTCCTATAACACCTAATGATTGACTATGACACGGCTGTTTCGAGATTTTCAGGGAGAAGAACTGTGCAAGTTCTATTCTCGCTATGGCATCTGCAAGTTCGGCGCGAATTGCAAATTTGACCATCCAACGATGGCTCCTCCAATGGGAGTGTATGCCTACGGCTCTGCTTCAACTAATGTACCTATGGTTCGGCGTCTCCTGCAATCCCCATCCGCATCCGCGTACACTTCCTAA</dnaseqindica> |
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