BGIOSGA000477
| Gene Name |
BGIOSGA000477 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA000477, complete gene. |
| LocusTag |
P0529E05.3 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA000477-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA000477-PA |
| Length |
7291 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:40217541..40224831 |
| Sequence Coding Region |
40224412..40224831,40223746..40223972,40223271..40223634,40223124..40223168,40222881..40223027 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:40217541..40224831 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTCCTCCGGGCCAACTGCTCCCCTTGGCCCGCTCGCTCCTGCCCCTTTCCGCTCCTCCCTTCGTCTCCGGCCGCCGCCGCCGCCTCCCTACTTTGGTCCTCGGCAGGGCGCTACCTCCGCCTACATGGCTGCCGCACGGCCGCCTCCCGCCGGCGCATCCACTTCCCTTTGCGCCTCCCCGGCGTCTGTCCAGGCCGCCTCCTCCCGCTACGTCGCTTCCTGGGGCTTCGCCCGGCGGCGGAGCCGAGGCCCAGGCGGTGTTGGCGGAGTTCGTGACGTCCGAGAGGGTGAAGGTGGCGGCGATGCTGGGGCTGGCTCTCGCGCTCTGCAACGCCGACCGCGTCGTCATGTCCGTCGCCATCGTGCCGCTGTCGCAGGCGTACGGATGGACCCCGTCCTTCGCCGGCGTCGTGCAGTCATCCTTCCTTTGGGGTTATCTGGTGTCACCAATAATTGGTGGAGCACTGGTCGACTACTATGGCGGAAAGCGAGTTATGGCTTATGGCGTGGCTCTATGGTCCTTGGCTACATTCCTCTCCCCTTGGGCAGCTGCTCGCTCTCTCTGGTTGTTCCTCTCAACTAGAGTTCTGCTGGGTATGGCAGAAGGGGTGGCACTCCCAAGTATGAACAACATGGTGTTGAGGTGGTTTCCTCGCACAGAGCGATCAAGTGCTGTCGGGATTGCAATGGCTGGTTTTCAGCTTGGCAATACCATTGGTTTACTTCTTTCCCCTATCATCATGTCACGAGCTGGAATTTTTGGACCATTTGTGATATTTGGATTATTTGGATTTCTATGGGTGTTGGTGTGGATATCTGCTATATCAGGGACTCCAGGTGAAAATGCGCAAATATCAGCACATGAACTAGATTATATAACCAGGGGTCAGAAATTGGTAAAAACTCAATCTGGAGGTGAAAGATTACGAAAGGTCCCTCCTTTCAGCAAGCTACTCTCTAAATGGCCAACATGGGCTTTAATTTCTGCAAATGCTATGCATAGTTGGGGTTATTTTGTCATTCTTTCATGGATGCCAGTGTATTTCAAAACAATATATCATGTTAATCTGAGAGAAGCTGCATGGTTTAGTGCACTCCCCTGGGTCATGATGGCAGTTTTAGGCTATGTTGCTGGTGTTGTATCAGACAGGCTTATCCAAAATGGTACAAGCATCACTTTGACTCGGAAGATAATGCAGACAATTGGCTTTGTGGGTCCTGGTGTGGCTCTTCTTGGACTAAATGCAGCAAAGAGTCCAGTCATCGCTTCTGCTTGGCTTACTATCGCTGTAGGTTTGAAGTCCTTTGGTCACTCAGGTTTTCTAGTAAATCTTCAGGAGATTGCTCCACAATATGCTGGAGTGCTACATGGAATGTCAAATACAGCTGGAACATTTGCTGCCATTTTAGGAACTGTTGGAGCAGGACGCCGCGGGGCATCAAGCACCAGCCAAGGGAGAGAGTCTACTAGTTTCAACCATGAGTTTCAGTCAGATCCTGGGTTCTCCTGGACATCCACCTATGCAGCTCGTTCCCCCCCTAAGGTTAGCAAGAATGGCAAAAGCTCAAGATCATTCTGGGAGGTAGTTGACACAATTACAGGGGGATGCACAAGCTGTTTTGCTCCTCGTCAATCCAAAATCAAGGAAAGACATGTCAAGCCCTCAAACGATGGCCATGATATTTCTATTAGTTCAATAGTCTCAAGAATCTCGTCAGCAAGTAGCACAAGCACTAATACATCCAGACAGAGAGGCGATGACAGTCAAAAGAAGTCATGGCAAGAACAATGCTCATTTCAGGAAATTTGTATGGCTACTTCAAACTTCAGTGAACAAAACAGAATTGGGCTAGGAAATTTTGGCACTGTATATAAGGGGAAGCTCAGGGATGGATCCATCATAGCTGTAAAGAGAGCAACTAAGAATATGTATGACAGGCACCTATCTGAAGAGTTCAGAAGTGAAATACAGACATTGTCAAAGGTTGAGCATTTAAACTTGGTGAAGTTTCTTGGGTACCTAGAACATGAGGATGAACGCCTAATTCTGGTTGAGTATGTCAACAATGGATCACTTCGTGAACACTTGGATGGATTGCGAGGAGAACCATTGGAATTTTCGCAGCGTCTCAACATCGCTATTGACATAGTTCATGCTGTCTCGTACTTACATGGATATACAGACCATCCAATCATCCACCGTGACATCAAGTCATCCAACATTCTCCTAACTGATCAACTTAGAGCAAAGGTGGCCGATTTCGGCTTCGCACGGCTAGCGCCTGACAACACTGAAGCAACGCACGTCTCAACAATGGTGAAGGGCACTGCAGGATACGTAGACCCAGAGTACATGCGGACGAACCAACTCACCGACCGCAGCGACGTCTACTCCTTCGGCGTCCTCCTCGTGGAGCTCCTCACCGGCCGACGCCCCATCGAGCGCGGCCGCGGCCGCCACCAACGCCTCACCACGCAATGGGCGCTGCGGAAGTGCCGGGACGGCGATGCGGTGGTGGCGATGGACGCCCGGATGCGGAGGACCAGCGCGGTGGTGGCGGCCATGGAGAAAGTGATGGCGCTGGCGGCCGAGTGCACCGCGCCGGACCGCGCGGCGCGCCCTGCCATGCGGCGTTGCGCCGAGGTCCTCTGGTCCATCCGGCGCGACTTCCAGCACGACCAGCAGCGCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCAGGCGCCAGAGGGAAGCGGCACGACGGCTCCACGTACGGGCCGTCGATCACGAGCCTGAAGGAGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAPPGQLLPLARSLLPLSAPPFVSGRRRRLPTLVLGRALPPPTWLPHGRLPPAHPLPFAPPRRLSRPPPPATSLPGASPGGGAEAQAVLAEFVTSERVKVAAMLGLALALCNADRVVMSVAIVPLSQAYGWTPSFAGVVQSSFLWGYLVSPIIGGALVDYYGGKRVMAYGVALWSLATFLSPWAAARSLWLFLSTRVLLGMAEGVALPSMNNMVLRWFPRTERSSAVGIAMAGFQLGNTIGLLLSPIIMSRAGIFGPFVIFGLFGFLWVLVWISAISGTPGENAQISAHELDYITRGQKLVKTQSGGERLRKVPPFSKLLSKWPTWALISANAMHSWGYFVILSWMPVYFKTIYHVNLREAAWFSALPWVMMAVLGYVAGVVSDRLIQNGTSITLTRKIMQTIGFVGPGVALLGLNAAKSPVIASAWLTIAVGLKSFGHSGFLVNLQEIAPQYAGVLHGMSNTAGTFAAILGTVGAGRRGASSTSQGRESTSFNHEFQSDPGFSWTSTYAARSPPKVSKNGKSSRSFWEVVDTITGGCTSCFAPRQSKIKERHVKPSNDGHDISISSIVSRISSASSTSTNTSRQRGDDSQKKSWQEQCSFQEICMATSNFSEQNRIGLGNFGTVYKGKLRDGSIIAVKRATKNMYDRHLSEEFRSEIQTLSKVEHLNLVKFLGYLEHEDERLILVEYVNNGSLREHLDGLRGEPLEFSQRLNIAIDIVHAVSYLHGYTDHPIIHRDIKSSNILLTDQLRAKVADFGFARLAPDNTEATHVSTMVKGTAGYVDPEYMRTNQLTDRSDVYSFGVLLVELLTGRRPIERGRGRHQRLTTQWALRKCRDGDAVVAMDARMRRTSAVVAAMEKVMALAAECTAPDRAARPAMRRCAEVLWSIRRDFQHDQQRATAAAAAGARGKRHDGSTYGPSITSLKE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..420#860..1086#1198..1561#1664..1708#1805..1951#2375..2512#2621..2654#2740..2793#4281..4553#5099..5325#5431..5599#6048..6137#6613..6911#6998..7291#ATGGCTCCTCCGGGCCAACTGCTCCCCTTGGCCCGCTCGCTCCTGCCCCTTTCCGCTCCTCCCTTCGTCTCCGGCCGCCGCCGCCGCCTCCCTACTTTGGTCCTCGGCAGGGCGCTACCTCCGCCTACATGGCTGCCGCACGGCCGCCTCCCGCCGGCGCATCCACTTCCCTTTGCGCCTCCCCGGCGTCTGTCCAGGCCGCCTCCTCCCGCTACGTCGCTTCCTGGGGCTTCGCCCGGCGGCGGAGCCGAGGCCCAGGCGGTGTTGGCGGAGTTCGTGACGTCCGAGAGGGTGAAGGTGGCGGCGATGCTGGGGCTGGCTCTCGCGCTCTGCAACGCCGACCGCGTCGTCATGTCCGTCGCCATCGTGCCGCTGTCGCAGGCGTACGGATGGACCCCGTCCTTCGCCGGCGTCGTGCAGGTCCCTCCCCAGCTTTAGTCAATTCTGTCTACATTTGTTTGGCTGCAGGTACAGATGCACATACACGGGTCGTCATAGAATGTGTGCTGATGTTAGAAAGATTGAAATACAATGTTATTCATTTAATGATGCGGTCATATAATCAGGTGCAAACAGTTAAGGTTTAATGATGCTGTGGCTACTGTAAATTTAGTTCATTTCCTTCAAATGGAGGAGGAAGATTTTTTTTTCTTTGTCAGTTTAGTTTAGTCAATCGTTTTAAACTTCATTCTTAATATCATCATTTTATTTCTTCAAGAGAACTTGAGACAATCAAGCATTCTAGTATAAATAATGTCGCATTTGAGGAAGTAGCATGAACTACCAATGGTTTCTATGCATCCTATCTGTACAGTATGGTGATATCACCGAGTTAATGAATTGTTGACACTCCAAACAGTCATCCTTCCTTTGGGGTTATCTGGTGTCACCAATAATTGGTGGAGCACTGGTCGACTACTATGGCGGAAAGCGAGTTATGGCTTATGGCGTGGCTCTATGGTCCTTGGCTACATTCCTCTCCCCTTGGGCAGCTGCTCGCTCTCTCTGGTTGTTCCTCTCAACTAGAGTTCTGCTGGGTATGGCAGAAGGGGTGGCACTCCCAAGTATGAACAACATGGTGTTGAGGTATTTCTTTTGATCATTTATCAATCTTCACGTTTTCGCCACAACCTAATATTATGTGTTTGCATTGCTGCCCTGTTTAGGAAACTAATTGGTTCAAGTCTTTTCTTATAGGTGGTTTCCTCGCACAGAGCGATCAAGTGCTGTCGGGATTGCAATGGCTGGTTTTCAGCTTGGCAATACCATTGGTTTACTTCTTTCCCCTATCATCATGTCACGAGCTGGAATTTTTGGACCATTTGTGATATTTGGATTATTTGGATTTCTATGGGTGTTGGTGTGGATATCTGCTATATCAGGGACTCCAGGTGAAAATGCGCAAATATCAGCACATGAACTAGATTATATAACCAGGGGTCAGAAATTGGTAAAAACTCAATCTGGAGGTGAAAGATTACGAAAGGTCCCTCCTTTCAGCAAGCTACTCTCTAAATGGCCAACATGGGCTTTAATTTCTGCAAATGCTATGCATAGTTGGGTAACTCCTATAAACACACTTTTATTGGTTTGGTTCTGTCACGTCAAAAGCATTATTTATTCATTTAAGATAATTTCTTAAGTGCTGTGCTATATTTTTCAGGGTTATTTTGTCATTCTTTCATGGATGCCAGTGTATTTCAAAACAGTAAGTCCTCATTCAGTTTCAGAGTGCTGAATAAAGAAAATTAAAAATCTCCCAACATTTTTGTAATACTGCTAATCTGCTATCGATGGTGATCAGATATATCATGTTAATCTGAGAGAAGCTGCATGGTTTAGTGCACTCCCCTGGGTCATGATGGCAGTTTTAGGCTATGTTGCTGGTGTTGTATCAGACAGGCTTATCCAAAATGGTACAAGCATCACTTTGACTCGGAAGATAATGCAGGTGGGCTGTTGAATAATTTCAGGTTATATAAATGGAGGGTGATATGTATAATTTTCATTTATGTCATTTATATGGTCGTGGGTGCACCTCCACATTCGTATAGAATGTAACACATAATATGCTATGCTTAAAGTAACATAATTTGTTTTACACTACTCAATTACTGACATAGGTGAAACCTCATGAATAATTTGTTCTACCAAGATACCTCTTTTCTCTTGATTGAACCTTTATTAAATAAACCCATAACTAATGAAGTATCCATGTCACCTTTCTCACATTGGTAAGCCATACTGCTGTTTTATAAAAAAGAAATGTCATTTTCTGTGATATTGGCAATTTGTTTGTTTTAATCAGTAATGAACGTTTATCCAATTTGCCTCTAATGAAGCTCAAGTTGACTATTTACTATGCCTTTTGCAGACAATTGGCTTTGTGGGTCCTGGTGTGGCTCTTCTTGGACTAAATGCAGCAAAGAGTCCAGTCATCGCTTCTGCTTGGCTTACTATCGCTGTAGGTTTGAAGTCCTTTGGTCACTCAGGTTTTCTAGTAAATCTTCAGGTATTTTACACTCGTTATGCCATGTACTATATGAATCTTTTCTGTTTTCCCCCTCAATTTGGATTCTCTTTTACCCTCTGATACAATTCATTCCTAAACTTTTATCAGGAGATTGCTCCACAATATGCTGGAGTGCTACATGGTAATAAATATGTTCACTCGTTGCTTTTGTTATGCACTTTATTCTGTCAGAATTAAGTGTTTAATCGATGATTTTTTATTCACAGGAATGTCAAATACAGCTGGAACATTTGCTGCCATTTTAGGAACTGTTGGAGCAGGTTTCTTTGTCGATCGGATGGGTTCTTTCCGTGGATTTTTAATATTAACATCTCTTCTATACTTCAGTAGCACACTGTTCTGGGATATATTTGCTACTGGAGAGCGTGTTGATTTTGATGGCACTGGCTAGCGCCTAAGAGAAAATCTACAGTTGCTATCCTAGAATATGATGATTGGTTGGAGAATTATGTGCCATCATCTTCTGGTATGCTATTGGAAAGCTCCATGCACACACAAGCAAACAGAGTTATGACGTCTACCGATTATGGCATTGTGCTTCCATTTAGTAGGGGTAGCAGTGAAGAAAAAATGGAACCAGCTACTGTGATCATTCGAGTTTTCGTACTATGGAGACTGGAGAGTCCAAAATGTGAGTCAAGGATAGCTGAAGCAGTTACATAGAACTAATGACTGGAGAGTCCAAAATGTGAGTCAAGGATAGGTGTGGTAATATTAGTTGTAGAGATCTGAAAATGATTGGCACTTGACAAGAATTAAGCTTGGAATCAAGCACGGTTTGATGAGGGTTGTCAAGTTTTTAAATGGAAAGTAGATGGAATACGTTTTAGTCCTTTATAGTTTTATAGTTAATAGAAAAAATGACTCAACAGTCATAGCCTCATAGGGCACCTTCGACTTTGTAAATGCCACAACATGTGGATGGCTTTAAAGATCCAACGAATTGCAAGGATTTTCAGTTTCCTTCTGTTAAAAATTAGAATTCCCGCATGGGGAATAGCTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGTCTCGTTGACTAGCCATACACGCAAATGAAGGGTGTGATATAAGGGATATAATGGTCGAATTTGCCCCACTGTAGGGTTGTTAAGTACTCTCTTTGATTCACAGTTTTATCCAGTTCATGATAAACGATCATATCAACAATTTCAAGATACATGTTATTTTAGTACTTTTACTGTGCTCAGAAGCTATCATGCATCGCAGTTGCTATGATCAAAATCTTGAATCTTTACGAGTAGCATTTGGGATGATGGGAAGTGAAGACTACCTATGGGCTATGGCACAGTGGCAGACTGGTAGCATCGAGCCAGAAAAGACGATGCTACTTGACTTGTGTTCGAACTTAAGCAGAGAATGATGCCCTGGTTCAGTTCTCTCCTTCAAAGAATGATCATCCCTATAAATTCAGACAGTGACATCGATCCTCCAATATTAAATCTCCACGAACTGTAGTTGTCATGCATAAATATGCACCTATCCCATTGGGTTGACCTGGAACTCCCATACCAACTACTATTTTCATATGATTATTATGCAGTGGCGTGCACTCGGTCAGACTTGAATGAGTCCACTGCATTCGACTCTTCGTCTGCAAAAGTCCTTAAGGAAATAACCAAAGAAACATGTTACCTGATTACTCGGGAGCAGTATCTCTAAATCCCATCGATTATGCAAGCAGGACGCCGCGGGGCATCAAGCACCAGCCAAGGGAGAGAGTCTACTAGTTTCAACCATGAGTTTCAGTCAGATCCTGGGTTCTCCTGGACATCCACCTATGCAGCTCGTTCCCCCCCTAAGGTTAGCAAGAATGGCAAAAGCTCAAGATCATTCTGGGAGGTAGTTGACACAATTACAGGGGGATGCACAAGCTGTTTTGCTCCTCGTCAATCCAAAATCAAGGAAAGACATGTCAAGCCCTCAAACGATGGCCATGATATTTCTATTAGTTCAAGTAAGCTCACCTTCCTTTCTTGATTTATCAATCAAACATCTATTTCTGCAGTTACGAAATCATTAATCATATTATGATCTTTGCATACAAACAACATAAGATATATCTATATTTCCAAGTTAGATGTGGTTGGATTTTTAGGATTTGCCGTACATGAAAAGTGCAATACTGCAGAATTGCAGCATAATATCAGAACTGAATCAATCTGGATCAAAATTGTAATTTGAGTTATAAAAGCAATATGGCATGATAGTTTCTCTTCAACGAGACCAACATGAGCTTGT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|
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