BGIOSGA000544
| Gene Name |
BGIOSGA000544 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA000544, complete gene. |
| LocusTag |
OsJ_03976 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA000544-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA000544-PA |
| Length |
6900 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:39103526..39110425 |
| Sequence Coding Region |
39110352..39110425,39108674..39108773,39108207..39108246,39107686..39107862,39107062..39107273 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:39103526..39110425 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCACAAGGCACTTACTAATCATTTGTCGAAAGAAAAGTCTTTTGCTTCGCTGAAAGCACCATTCTTCTCCAATAACTTTGATTGGCCTCAATTGGATCTTGAACTATTGATGCAATTCAAGTGTGCTGGTTTTTATTTAGTTTATGCATCACAACAGCGGCAGTATTCTCTGGTGGTTCTTGCAGCTTCTATTATATCGAAGTCTGGAAAAGCTCTTGTTTCGAGACAATTTGTTGACATGTCCCGGATAAGGATCGAGGGGCTGCTTGCAGCATTTCCGAAGCTGGTCGGAAGTGGAAAGCAACATACTTATGTTGAGACTGAAAATGTTCGTTATGTCTATCAACCAATTGAAGCACTGTATTTGCTTCTCATCACAAATAAGCAAAAGGGTGTCTGTAAGGCAGCATTCGAGCTTCTGTTTGCCTTTATTGAAGCCATTTCTCTTGGAAACAAAGAGAACGTAACTGTTGCACAAGTTAAACAATACTGTGAAATGGAGAGCCATGAAGAAAAGCTGCACAAGCTGGTTATGCAAAGCAAAATAAATGAAACTAAGGATGTCATGAGGAGGAAAGTCACTGAGATTGAGAAAAGCAAGACTGATAGAGGGAAGCCTGACAAGGGAGGATTTGGATCCTTGAGAACTCCAAACAGCTTCAGTGACATGGGCATTAGAGGTGGTGGTCCAGGGGGCGATCCTATATTTGGTGATATGGACTCGTTCACCCACAAGGCCAAAGGCCGCCCATCTGCTCCTGCTCCTGCATCTGCTTCTACTAAAGTTCCTGGTGGTATGAAATTAAGCAAAGCACAGAAGACAAACCAGTTCCTTGAGTCTTTGAAAGCTGAAGGAGAAATCATTTTGGAGGACACTCAACCAAGTGCAACTCAATCAAGGTCATCATATATCCCACCAAGCGATCCTATCACAGTGACAATTGAAGAGAAGCTCAATGTCACTGTTAAAAGGGATGGGGGAGTTAGCAATTTTGATATTCAAGGAACCCTGGCTCTCCAAATTCTGAATGACACTGATGGTTTTATTCAGTTACAGATTGAGAACCAAGATGTACCTGGCCTTAACTTCAAGACACACCCCAATATCAACAAAGAGTTATTCAACAGTCAACAAATTGTGGGGGCAAAAGATCCAAACAGGCCTTTCCCCAGTGGTCAAAATGAAACACCGTTGGTGAAATGGAGAATCCAGGAGTTGAATGAGTCATCTCTTCCATTGGCAGTGAACTGTTGGCCTTCGGTGTCCGGAAATGAAACCTATGTGAACATTGAATATGAAGCTTCAGAGATGTTTGATTTGCACAATGTTGTCATCTCTATCCCTCTCCCCGCACTTAGGGAGGCTCCAGGTGTTAGGCAGATAGACGGAGAATGGAGGTATGACTCAAGAAATTCAGTGTTGGAGTGGTCCATTATTCTTGTTGATCAATCAAACCGCAGTGGTTCTTTGGAGTTCACTGTCCCTGCAGCTGATCCATCAACATTCTTCCCGATATCTGTTGGGTTTTCTGCATCAAATACATTTAGTGATTTGAAGGTTGGTTATTATATCCCACTGTGTCATACATGCATACTTTCTGATTTTCCTTCTTTACCATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MHKALTNHLSKEKSFASLKAPFFSNNFDWPQLDLELLMQFKCAGFYLVYASQQRQYSLVVLAASIISKSGKALVSRQFVDMSRIRIEGLLAAFPKLVGSGKQHTYVETENVRYVYQPIEALYLLLITNKQKGVCKAAFELLFAFIEAISLGNKENVTVAQVKQYCEMESHEEKLHKLVMQSKINETKDVMRRKVTEIEKSKTDRGKPDKGGFGSLRTPNSFSDMGIRGGGPGGDPIFGDMDSFTHKAKGRPSAPAPASASTKVPGGMKLSKAQKTNQFLESLKAEGEIILEDTQPSATQSRSSYIPPSDPITVTIEEKLNVTVKRDGGVSNFDIQGTLALQILNDTDGFIQLQIENQDVPGLNFKTHPNINKELFNSQQIVGAKDPNRPFPSGQNETPLVKWRIQELNESSLPLAVNCWPSVSGNETYVNIEYEASEMFDLHNVVISIPLPALREAPGVRQIDGEWRYDSRNSVLEWSIILVDQSNRSGSLEFTVPAADPSTFFPISVGFSASNTFSDLKVGYYIPLCHTCILSDFPSLP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..74#1653..1752#2180..2219#2564..2740#3153..3364#3589..3730#4495..4808#5320..5506#5577..5730#6579..6641#6741..6900#ATGCACAAGGCACTTACTAATCATTTGTCGAAAGAAAAGTCTTTTGCTTCGCTGAAAGCACCATTCTTCTCCAAGTAAGTTTAATAGCAGAGTTAACTATTGTCTATAAGCTCTTACACGTAGTATACTGCAGCTAACATCTAGGAGTACAATAGTTTGTCTACAAAGATGTCTCCAATTTTTATCCTCCCCTCTCTTTCTTCAGTTCCTCTATTTCATTCACCTCTTTTGGATCGCCTGCAAGATTGACTCTTGCATAAAAGCATGCTCTCTCTTTTTCTCGTCTCTCTTCTCCATATTTGAGAAGAAAAAAAAAGTAAGCAAGCTTGTAGCTTGCTATTGTACTTGCTCTCAGTTTTTCTTCATTTTGGTTGCAGGATTGGAATTCCCTTCCCCTTCTGAAACCAGCATAAACCAATGATACTTTTCTTTTTGACACAAAATAACTAGCAAGAGCATTGGATGCTGATGCTCTCTAACAAAACAAAAACATAGCATAAACTCTGCCCATAGATATAGCTCAATGCCCAATATTGGGCCTAACTTCCACAGAACTAGGCCCTGGGCTCAATCAGCCTATTTGCTAGGCCTTTGGGCCCAATTAGCCCGTGCTTGTACGGCCCAACCAGTTCACCACCCACCGATAAATGGCCCGACCCGCGACCGCGCGAGCGAGCGAGGCGAGCGAGCGAGCGAGCTCACTGTCGCCTGCGTCGTCGTCCTCGGCTCGGCTCCTCCCTTCCCTCGCGGATCTGAGGTACGCGCGCACCCGACCTCCTCCCTTCTCCCCGTCGCGTTCGCCTTCTCTCCATTCCGGATTCTCCCTGGGAGCCCTAGGGTTTGATTCGGGTTGGTTTTCTCCGCCCGCGCGCGGGTGCTGCCTGCGGTGCGGGGCGCGAGGATCTGATCGGGACTCGTGCCTTCCGCCATCGACGCGCCGCAGTGACGGAGCCGCCTGGTCGGTCGCGCCACCCGGAGGCCGGATCCGCAGGGCGCTGGCCTTGTTGATTCATTTCGCTGGGTGCGTTTGCCTGTCGGAATCTCTCGGGTTGGAGTCCAGGCTCGTGTTGGGAGTGCCGGTGGGGTTTGCACGAGTTCTTCGTAGCGTCTCTTAATTGCTTAGAAAATTTAGTTTGTGCGCCACCGGGGCGTTCCGTTTGTCTGGATGGTCGGTTTACGTGTGCAGTATGAGGATCGTCCGATCGTGTGCGTTTTTACGAGGAGTGTTGCATGCCAAGCAGTTTGGTTGTGAGATTTTCTTCCTGTGATTCAGTACTTTGTGAGTCTGGATCTCTGGATATACGCACGTTATGCTTAGAATTTCTGCACTAGTTGGACGTTGCTTAATTAGGAAAACTAGCTTGAGCCTTACGTTGTTTCAATTAGGCATTGATATCATATTTTTTCTGTTACGTGGGTTTGTATTATGTGATTTTTTTTAACATGGTTGTTATAAATCTATGAAAGTTTGTATTTTTTTCATCACATCGGATGTAGTAACGTCTAGTGGTATGCTGATTGATGCCTATCCATCATCAGCAATTTATGCTATATAAATTCCTAATAACCAGTATTCCCAAATATGTCTGATTTCATCTGTGTTCACGATGGTCACTAACTTCATGCAGTTTTTCCTTGTTATTATGTTTTAGTAACTTTGATTGGCCTCAATTGGATCTTGAACTATTGATGCAATTCAAGTGTGCTGGTTTTTATTTAGTTTATGCATCACAACAGCGGCAGTATTCTCTGGTCATTAATAAAGTTTGCTAAATCCTGTTGGACATGTGACGCAAAAGCATAAGAAACATTGTACTTATTGACAAACTCATTATTTATGTTTTCTGTGGTTATGCATCTGCAGTGTTGACAAATTTATTTTGTTCAGTTGTCTCGCATGGATCGATTGCTTTGGAACTCATTACTTTCCGTCTTGCAGTTCTATATCTTGTCAACTTGGATTTGGTAATCCCTGGAACTAAAAAGGCCATTCAAAATGGTATGGCTGGTTTATTCGAATTGCTCATTTGCAATGTTACTGTGTTGTAAATTGATTCAGGAAAGGACATTTAGTAAGGGCATCACAGCAAAGGAATGAGCATTATCCTTGTTTCATTTTAAACTGTTGCATTTTTTTGCTCTATTAAGAAGAGTGATTGTTTCTTTTGTACACATACAGGTGGTTCTTGCAGCTTCTATTATATCGAAGTCTGGAAAAGGTGAGTTTGTTGAAAATTTCCAATTCACAGTATCTTTTGTTATTGATTTATTTATTGGATTCACAACTTTCTCGAACAATTGACTTGTTGGATTCACAATTCTCTAATGGGATGTCCTCTTATATTAGCTCTTGCAGCCCAAAAAAGGGGCAATACAATTTTGCTAACAATAGCAATTAACATCCTTTTCTTATACGCAAGTACACCAATTCTATCCAAGTAACAACACTAAAATGGCTTTTATATGCACAAGTTTTGGTCTTTAGAATTTTTGCATTTTGTAGTCTGTTTATGTCTACACTTATAATGTTATGAACAAGAAATTTGTCATTTTTTGATTTCAGCTCTTGTTTCGAGACAATTTGTTGACATGTCCCGGATAAGGATCGAGGGGCTGCTTGCAGCATTTCCGAAGCTGGTCGGAAGTGGAAAGCAACATACTTATGTTGAGACTGAAAATGTTCGTTATGTCTATCAACCAATTGAAGCACTGTATTTGCTTCTCATCACAAATAAGCAAAGTAACATTCTTGAAGATCTGGATACTTTAAGGCTACTCTCCAAGCTTGTATCCTACCATCAGTTGTGCTATATTTCTATTCTCAAACGCTAAATTATTTCTTTAAAAAAAATGTAGCTATTTCAGAAAGATTAAAAAAAAGGCTGTAGCTCCGCATTCAATAGTTTTATCACAATGAAAAATTCGAACTTATATTCTTTTTGGCAAGGAGAAAAGGGCAGTATTAAGTGTAACTGCAGAACAACTTCACTTTGGAACAAAGATCAACAGAGTAGTCACCACTAACCTGATAAACCCTATTTCTTGTTGCTGACGACATAGTTAGTATTTGCCTTTTGTGCATACCAATTCAATGCAGTGATTTCCTTGAACGTCTACAAAGATACCTGAATATGCTCCCTCTTTGGATGAAGAGGGTGTCTGTAAGGCAGCATTCGAGCTTCTGTTTGCCTTTATTGAAGCCATTTCTCTTGGAAACAAAGAGAACGTAACTGTTGCACAAGTTAAACAATACTGTGAAATGGAGAGCCATGAAGAAAAGCTGCACAAGCTGGTTATGCAAAGCAAAATAAATGAAACTAAGGATGTCATGAGGAGGAAAGTCACTGAGATTGAGAAAAGCAAGGTTTGTGCTACCTATACTCAAATATAGAGCATGTAGTTATCTGGTTCAGTGTAGTTACATCTCAGTATCACATGGAACCTTAGATCTTAAATGTTGCAAACTGTATCTACGAACACATAGGAAGTATATGCTAAAAATTAATGTTGAAGGCGTAGTGAACCAGTAACTGCATAGCTTTATTTTTCATCTTTATATAAGTTGGTAAAATCTGTTGAAATATGCAGACTGATAGAGGGAAGCCTGACAAGGGAGGATTTGGATCCTTGAGAACTCCAAACAGCTTCAGTGACATGGGCATTAGAGGTGGTGGTCCAGGGGGCGATCCTATATTTGGTGATATGGACTCGTTCACCCACAAGGCCAAAGGTTTGTACTCAAACAAATGCCTTACATGTGGAAATGGAAATATTATTTAGCATTTCCTTTTGGAGTCCTATCAAGGAAGCTGACTAGACTTGTAATATTCCTGTAACAATAAATTTTCCTGAGCATTGGTAACCAAAACTAGTACTAAATATTTTATGGCAGTTCTTTTAGCCTGTTCATACATACACCTAATGATTTAGGGAGAGAATCATCCATGCAGCATAAGATAGGATTTCAACCAGTTATTTTAAATTATATTTCCGTGCTCCTATGATTTGGATTAGGTTCTACCCAGGATCTTGATACTGAGTTAGACAACCTTTCTTTATTATGTGAGACAAACAATATTGTACTTGTACTAATGTGCTTTTTAAGTTTGTCAGTTGTGACATGCCAGAAAGTAATACACATAACTATTTGCCAAATTGCAGGGCAAATGTGCATCTTACACATTGTTCATCTAACACCGTAGCTCATAAATAAAATCACTTGATTGTGCAATAGTTTGTTGATTTGTTCGAAAGTAGTGATGGGTTCTGCCACAACAAAAGTACCAACGAAATGGCTAGTGGTTCAAGAAAGAAATACCTGCATCCACAATTCCACATGTATTTTAACTCAATTTATTGAGACCTCTTTTGACTTGAGTAAAGTCGATTCTCTAGGGTAATGGTGTGGCTAGTGGATATAGGATGGTTAATTTTGGTTGGTGGTGTTATGACTATCTATATGCTGTTTTATCTTGACGGCTGGCATATGTACAGGCCGCCCATCTGCTCCTGCTCCTGCATCTGCTTCTACTAAAGTTCCTGGTGGTATGAAATTAAGCAAAGCACAGAAGACAAACCAGTTCCTTGAGTCTTTGAAAGCTGAAGGAGAAATCATTTTGGAGGACACTCAACCAAGTGCAACTCAATCAAGGTCATCATATATCCCACCAAGCGATCCTATCACAGTGACAATTGAAGAGAAGCTCAATGTCACTGTTAAAAGGGATGGGGGAGTTAGCAATTTTGATATTCAAGGAACCCTGGCTCTCCAAATTCTGAATGACACTGATGGTTTTATTCAGTTACAGGTTATTTTCTATATATGGTGTCTGGATCTTTTAGTCTGATTATGCCCTTGTTTGGAATCAAC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