BGIOSGA000620
| Gene Name |
BGIOSGA000620 |
|---|---|
| Description |
cDNA, clone: J100063K14, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA000620, complete gene. |
| LocusTag |
P0468B07.41 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA000620-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA000620-PA |
| Length |
8245 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:37866437..37874681 |
| Sequence Coding Region |
37874555..37874681,37873610..37874177,37872131..37872630,37871831..37871972,37871679..37871750 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:37866437..37874681 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:37866437..37874681 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCTAAAACAGAAGGATTTGATGGTGATCAGCTACAGCTGCTCGGCTGGTACCAAGCTGGCATGGATATTGTCGTTACTGCTCATCCTGGTCGCGGCGACACAAGTCCATGGCGTGTCTCCTCCTGGGTTTTTAAACATCGACTGTGGATTGACAAATCGTAGTACTTACAATGACACCGACACAACTTTGACGTACGTTTCTGACAGAGAATTTGTTGAGAGCGGCAAGAGCTACGATATTATGGCACAATACATGGCAGGTGCTGCAAATGAACAAGAAAAAACGTTGAGAAGCTTCCCTGATGGCCAACGGAACTGTTATACATTACCAACCAACAGTACTAAGAAGTATCTCATCAGAGCCACCTTCACTTATGGAAACTACGATGGGCTCAACTCGTCAGAGAAGGGTTCTCTGTTTCTCTTTGGACTCCATATCGGTGTCAACTTCTGGACGACGGTAAACTTGACAAAGTGGGATCCATCGAACACGGTATGGAAAGAGGTGATCACGGTTGCTCCGGACAAGTCCGTATCTGTCTGTCTGATAAACATGGGATCAGGAACTCCCTTCATATCTACACTGGATCTTAGGCCCTTGCAAGACACAATGTATCCCTTCGTGAATGCCTCAACGTCCGTCAGCTATTTTTCTCGGATAAGATTTGGATCGGTTGATGAATACATCACAAGATTCCCAACGGATCAGTATGATCGCTTCTGGGAGGGCTGGGTCTTTACCATGCACACCTTTCCATGGGTTAATAAGAGTAGCAACGGCAAGGTGGCTGAACTTCCTAATATTGACACCTTTGGGCTTCCTCCAGCCATTCTGGGAAGCGCTTCAACCATAAACGGAAACTACTCTTGGCTCAACATCAGCGTTAGTGCCAGTAACTCTCTCGCAACAGACCTAGAGCTTCTTCCAGTCTTTCACTTTGTTGAACTCGGCAATAATGGTTCAAAGAGAATTTTTGACATCTACAATGTCGATGAACCGCAAGCGCTGTTCTCCAACTTCAGCCCACCGTCATTCCTGAGCTCCATGTTCCACAACTGGTTCTTGCGCAAAGGCAGAAGGGCATATTTTCAGCTTCGCAAGACCCCAGACTCACAGCTACCACCTCTTATTAACGCATATGAGGTGTACTCCCGTGTCCAGGTGGAGAACTTCACCACTGCTTCAAGTGATGTTGACTCCATGAAAACAATCAAAGAGAAGTACATGGTAATAAAAAACTGGAACGGGGATCCATGCTCACCAAGAGAGTACGTCTGGAATGGTTTGACTTGCACCTACCCTAATGGTGGCCAGAACCCAAGGATTATTGAAATAAATCTATCTGGCAGCGGTCTGCAAGGAGAGTTAGAAATATCATTCATGAAAATGTCATCACTGAAGAAATTGGATTTATCACACAACAACCTGACAGGCACCATTCCGGACTATCAAGTAAATTCCCTCACAGTTATTGACTTGTCTAATAACCAGCTCAATGGATCCATCCCTGATTCTATTCTTCAAAGATACAAAGCCGGTTTGCTTGAGCTAAGACTAGAAGGCAATCCCATATGCACCAAAGTCAGAGCTAGCTACTGTGGAAATAAGAAGAACACACGCACACGTATTTTGCTCATCAGTGTGTTAGTTCCTGTGACATCTCTCCTAGTGGTGCTGTTCATATTCTGGAGGTTATGCTGGAAAGGGAAGTCAAGAAAATCAGAAGATGATTATGATATGTATGAAGAGGAGACTCCCCTACATATCGACATCAGACGGTTCACATATGCAGAGCTGAAGCTCATAACTAACAATTTCCAATCAATCATTGGAAAAGGAGGTTTTGGTACTGTTTATCATGGCATACTGGAAAATAATGATGAAGTAGCTGTTAAGGTGCTTGTGGAGACATCCATAGCAGAGTCAAAAGACTTTCTCCCTGAGGTACAAACCTTGTCAAAAGTTCATCACAAGAATCTTGTCGCTTTGGTAGGGTATTGCCAAAACAAGAAGTGCCTTGCACTTGTTTATGATTTCATGCCTAGAGGAAATCTTCAACAGCTTTTAAGAGGAGGATATGACAGTTTGAATTGGGAAGAGCGACTTCACATTGCACTTGACGCTGCACAAGGTCTGGAATACCTTCATGAATCATGCACCCCATCAATAGTTCACAGAGATGTGAAGACACCCAACATCCTTCTGGACAAGAATCTGGTGGCCAAGATATCTGATTTTGGGCTTTCACGGGCTTTTAATGCTGCTCACACGCATATATCTACTGTTGCTGCTGGCACTCTTGGTTACCTTGACCCTGAGTACCATGCCACTTTCCAGCTTACTGTTAAGACAGACGTTTACAGTTTCGGAATCGTCCTCTTGGAGATTGTGACTGGTCAACCCCCGGTATTCATGGACCCTCAAACCGTCCACCTGCCAAATTGGGTGCGACAAAAGATTGCTAATGGGAGCGTTCACGATGTTGTGGACAAGAAGCTGTTGGATCAGTATGATGCCACGCACCTGCAGACTGTGATAGACCTCGCCATGAACTGTCTTGAAAACGCATCGATTGACAGGCCAAGCATGACCGAGGTTGTTTCCGTGCTTAAGGTGTGCTTGCCGATTTCAAGCGAGAGACAATCGGCAACTTCAACCCCTCGAAAGAAGAACGTCATGGATGCAGAGATTCCAAGACAGTTCCAGTTGATGATTTCTGGAGCTTCAACAACAAGCTACGAGGGCAGCTCCTTTCAGTCTGGATATACCGGTGGGGTATCAGAAATAAGCCACATTTCTGGGCGGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
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| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..127#505..1072#2052..2551#2710..2851#2932..3003#3083..3148#3234..3314#3685..3836#3953..4191#4620..4749#7420..7476#7569..8245#ATGCTAAAACAGAAGGATTTGATGGTGATCAGCTACAGCTGCTCGGCTGGTACCAAGCTGGCATGGATATTGTCGTTACTGCTCATCCTGGTCGCGGCGACACAAGTCCATGGCGTGTCTCCTCCTGGTAATTATCAGAGCTGTTTCCTTTGCGAGCCTGCTTCTTTGTAATCCATGCTCCATCTGCACAGTTCAGATTACTTCATTATATGCAGCTCTAGAAATCAGTGCATAATACTTGAGAGCTAAACACTTCTCATATACTTCCTCCCAAGAATAAATATGTAAGCACTTCCCATATACTTAGCGACCAAATATCTAGCTGCATGATCGAGCTAAATGATGAACTCACATGAACCTTAACTTGAAACACACGACATGAATAAACACTCGTAATACCAATTTTCTTCTCAACCAAGCATCGGTCAGTATCTGGTCTGTTTTAGGCTGTTATTACTTTTTGTTACAGAAAACTGTTACTTACAGGGATGTGTGTCTGTGTAGGGTTTTTAAACATCGACTGTGGATTGACAAATCGTAGTACTTACAATGACACCGACACAACTTTGACGTACGTTTCTGACAGAGAATTTGTTGAGAGCGGCAAGAGCTACGATATTATGGCACAATACATGGCAGGTGCTGCAAATGAACAAGAAAAAACGTTGAGAAGCTTCCCTGATGGCCAACGGAACTGTTATACATTACCAACCAACAGTACTAAGAAGTATCTCATCAGAGCCACCTTCACTTATGGAAACTACGATGGGCTCAACTCGTCAGAGAAGGGTTCTCTGTTTCTCTTTGGACTCCATATCGGTGTCAACTTCTGGACGACGGTAAACTTGACAAAGTGGGATCCATCGAACACGGTATGGAAAGAGGTGATCACGGTTGCTCCGGACAAGTCCGTATCTGTCTGTCTGATAAACATGGGATCAGGAACTCCCTTCATATCTACACTGGATCTTAGGCCCTTGCAAGACACAATGTATCCCTTCGTGAATGCCTCAACGTCCGTCAGCTATTTTTCTCGGATAAGATTTGGATCGGTTGATGAATACATCACAAGGTGAGATCGAAAACTGCAGTTTCGAATCAGCTGATCAGGAATGCATGCTGCTAGAATACTGTCGGATATCCAGATAAAACGAATTCTGTAGATTGTAGAACACATCTATAAAGTAATTACATTTACAGATTACTAGCTCCGCATCTGTTTTACTTGGTATTTTTTGACTTTTTAGAATCTTAGAGGTGCAGTTTGAGCATTAAACACATCTATATAGTTTCAAACATATTAGCAACCAAACTTTCAGGATATTGACACCTATATACTGTCAATGTTAGGAAGTGCAGCCAAATATAACATCATTTTTCATTGGCACAAATTTTAGGACTTATAAGAACAGTTTCATACCCCGTATATTATCCGTATATCTTGTTATAGTTGAATACCTTTTGATCATAACTATTTGATATTTAAGATAAGATTTGATTAAGATAACTTAAACTATAAATACTTTCTCAAATTATTAGCTTTTTTTTACCAGGTCAGCCGAAAGATTCGGTCGACCAATTTCATTAAGAGGGAAGGGTAGTTCATTACATTTGAAGCTTACAACGACAGCATGCTGGCTGTCGAGATGGATGGGAAAGTCCCCAACCTAGTAAACTAAAGTTACATGCTACGTGTCATTACAAATTATTCACTATCGCCATTGCAGGTTGTGAAAACTCCTGCTGTCTTCCAAACAAGGATTTCCTCTTTGAGGCTAGTGAGTGGATTTGACTTGAAGAGTTCTATCATAATATCATAAACCTATTAGATTTTTATGAACTTAAATAACATAAAATTAATGGTCAAAGGCTCGAAGCTTTGAAAATATGATCAAAATTTACTCCAAATATCAAATATTTATGACCGGAGCGAGTACATCAATAGCCATAAGCCTTAAAGCTTAGCAAAAACAACGGCAATGACAATGCTGAATCCAGTTATATTTACGTTGGCATAATCTTTTCTTTGTTTTGTCCTCTGTCATGGTCAGATTCCCAACGGATCAGTATGATCGCTTCTGGGAGGGCTGGGTCTTTACCATGCACACCTTTCCATGGGTTAATAAGAGTAGCAACGGCAAGGTGGCTGAACTTCCTAATATTGACACCTTTGGGCTTCCTCCAGCCATTCTGGGAAGCGCTTCAACCATAAACGGAAACTACTCTTGGCTCAACATCAGCGTTAGTGCCAGTAACTCTCTCGCAACAGACCTAGAGCTTCTTCCAGTCTTTCACTTTGTTGAACTCGGCAATAATGGTTCAAAGAGAATTTTTGACATCTACAATGTCGATGAACCGCAAGCGCTGTTCTCCAACTTCAGCCCACCGTCATTCCTGAGCTCCATGTTCCACAACTGGTTCTTGCGCAAAGGCAGAAGGGCATATTTTCAGCTTCGCAAGACCCCAGACTCACAGCTACCACCTCTTATTAACGCATATGAGGTGTACTCCCGTGTCCAGGTGGAGAACTTCACCACTGCTTCAAGTGATGGTACGTCAATTGGCTTCACTATTACTCATTCCAATTTGTAAGGAACCTGTTGCATAACATACAGTAAACACATCAATGCTAATGTAGATTATCCTGAGACCAAGCTGACTGAAGCATATATTGACACCTATTCTGTGTTGTTTGTACCATTTGCTTAGTTGACTCCATGAAAACAATCAAAGAGAAGTACATGGTAATAAAAAACTGGAACGGGGATCCATGCTCACCAAGAGAGTACGTCTGGAATGGTTTGACTTGCACCTACCCTAATGGTGGCCAGAACCCAAGGATTATTGAAATGTAAGAGCAAAACATTTTGGTTTTGAAAAAAAAAAATGATGGTGGATATTATTACTATGTTAAAACGAGTTGCTATGCAGAAATCTATCTGGCAGCGGTCTGCAAGGAGAGTTAGAAATATCATTCATGAAAATGTCATCACTGAAGAAATTGTAAGTGCTATCTACCATTCACAAACTAAATGAAATTGGGTGGGCATCGATGCAATCCTAAACATCTAAAAACATGCAGGGATTTATCACACAACAACCTGACAGGCACCATTCCGGACTATCAAGTAAATTCCCTCACAGTTATGTAAGTCTCTACAGCAATTTATGGGATCTTTAGTGCCGAATATAAAATTTAAATGAATGAATGATTTGAAGTGCTGTTTTTTCAGTGACTTGTCTAATAACCAGCTCAATGGATCCATCCCTGATTCTATTCTTCAAAGATACAAAGCCGGTTTGCTTGAGCTAAGGTTTGGCTTCTCCTTGAACATGGCCCCTTATCAATAGAAGAAAAGATGATAAAAAAAACTGCTCAAAAGGCAAAATCAACTAAAGGTTAACCATCACATGGAAATACGACATCTGCACATAGAAAGCAAACCTTCTGAATCCGAAACTACTTGAGGGGCAGATGTGAAAATATTAATAACTGCATATGCTTTAGAACATTTAGTTTTTTAGATTACAATTGTAATATAAGGAGGTTGGTCATATTAGAAAAAAGTAGGTGTCCATTGTAATAATTTTAAAGATACTCCTAACCTATCTCTGTGTTTTTACTCTCGTGTTTCTTTGGCTGATTTTAGTTCATGTTTATCTGTTGTGTAAATGAATCACTAGACTAGAAGGCAATCCCATATGCACCAAAGTCAGAGCTAGCTACTGTGGAAATAAGAAGAACACACGCACACGTATTTTGCTCATCAGTGTGTTAGTTCCTGTGACATCTCTCCTAGTGGTGCTGTTCATATTCTGGAGGTTATGCTGGAAAGGTAAAAGAAAGTGCTTTTTGGTTAAGTCCTGTTTAACCAATGCAATAAGTGTAAAACAATAGACAACAGTTCCAAACATTTACTTCCATGAAAAATGCATCTTCTGGAATTTGCAGGGAAGTCAAGAAAATCAGAAGATGATTATGATATGTATGAAGAGGAGACTCCCCTACATATCGACATCAGACGGTTCACATATGCAGAGCTGAAGCTCATAACTAACAATTTCCAATCAATCATTGGAAAAGGAGGTTTTGGTACTGTTTATCATGGCATACTGGAAAATAATGATGAAGTAGCTGTTAAGGTGCTTGTGGAGACATCCATAGCAGAGTCAAAAGACTTTCTCCCTGAGGTATGCAACAGAACTAATTAGGACAAAGCGCTGTTTAGTTCAATCCGAAGTAGATTGAAGGACATCTAAAGCAATTTCCATAGTCTATATCTATACTCATTAAAATGAGGTAGTGGTGGTGGCCATGAATTTGCCACCCCACCAACTCCCATTGTAAATTTTGCAAATTACTCCTTGAACTTCTTAATATTAAGAAACAACCAAATCTTAATGGGTACCGACATATAAAATCAAATCAAGGTGAATATTCCCCATAGAAAAAAGATGTATAACACATTTTAAGGAAAATATATTTTTATTTATTTTAGGAAATATTATAAAAGAATTTCTTTTATATGTCGCAACGCACAGGCATTTAGCTAGTATTTAAGAAAGAAATGCAACTGACCTCAACTCTACATTGTTTGAAATGGTATCTCCTGCTGCAGGTACAAACCTTGTCAAAAGTTCATCACAAGAATCTTGTCGCTTTGGTAGGGTATTGCCAAAACAAGAAGTGCCTTGCACTTGTTTATGATTTCATGCCTAGAGGAAATCTTCAACAGCTTTTAAGAGGAGGTTTTACCCTTTTCCTCTTTACATTTTTTTAAATTTCTATCTGTAAAAGCATAACTGACTTAAGTAGTTAATAATACAGGTTGGAATTCCATGCTGTTATGATCACTGAC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| External Link(s) |
