BGIOSGA001388
| Gene Name |
BGIOSGA001388 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001388, complete gene. |
| LocusTag |
P0002B05.15 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001388-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001388-PA |
| Length |
4194 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:24012746..24016939 |
| Sequence Coding Region |
24016808..24016939,24016251..24016382,24016100..24016150,24015595..24015691,24014674..24014720 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:24012746..24016939 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCTGGTTGTTACTAAACCTGGTCAACTCCCAGTTGAGTTTCTTGAACCCTCTGCTGCCCAGAAACTGGTGATTGGATTTGATTGTGAAGGCGTAGACCTTTGCCGCCATGGTGCTCTCTGTATCATGCAGATTGCATTTCCTGACGCTGTTTACTTAGTTGATGCTATTGAGGGTGGGAAAGAACTTATTGAAGCTTGCAAACCAGCACTTGAGTCAGAATATGTCACCAAAGTTATTCATGACTGCAAAAGGGACAGTGAGGCTCTGTATTTCCAGTTTGGCATAAAATTGCATAATGTGATGGATACACAGATCGCTTATTCTCTGTTAGAGGAGCAGGAAGGGAAAAAGAGAGGATACGATGAGTACATATCTTTTGTCAGCCTCCTTGCTGATCCCCGATATTGTGGAATGGCATATCCTGAAAAGGAAGAAGTCCGTACCCTTCTAAGGCAGGACCCTAACTTTTGGACGCATAGGCCTTTATCTGAAATGATGATTCGAGCAGCCACAGATGATGTCCGCTTCCTTCTCAGTATACATGAGAAAATGATGGAGAAGTTAAGCAAAGTATCTTTATGGCGTCTGTCAGTTCGCAGTGAGCTATACTGCAGGTGCTTTTGCATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCTTGGATGTGCCTCCTGGCAAAATGGGGCGTGTTATTGGCAGAAAAGGATCATCAATAATGGAAGTGAAAGCATCTTGCAATGTTGAAATCCATATTGGTGGTGCAAAGGGACCTCCAGACAGGGTATTCATCATTGGACCAGTGCAGGAAGTCAGAAAAGCTGAGGCTATCCTCCGAGGCCGCATGCTGGAGTTCTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MLVVTKPGQLPVEFLEPSAAQKLVIGFDCEGVDLCRHGALCIMQIAFPDAVYLVDAIEGGKELIEACKPALESEYVTKVIHDCKRDSEALYFQFGIKLHNVMDTQIAYSLLEEQEGKKRGYDEYISFVSLLADPRYCGMAYPEKEEVRTLLRQDPNFWTHRPLSEMMIRAATDDVRFLLSIHEKMMEKLSKVSLWRLSVRSELYCRCFCINDNKYADWPPLPTVPDEIEPDVYVPEVDILSVLDVPPGKMGRVIGRKGSSIMEVKASCNVEIHIGGAKGPPDRVFIIGPVQEVRKAEAILRGRMLEF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..132#558..689#790..840#1249..1345#2220..2266#2440..2656#3014..3143#3240..3282#4120..4194#ATGCTGGTTGTTACTAAACCTGGTCAACTCCCAGTTGAGTTTCTTGAACCCTCTGCTGCCCAGAAACTGGTGATTGGATTTGATTGTGAAGGCGTAGACCTTTGCCGCCATGGTGCTCTCTGTATCATGCAGGTGAGTTCAAATGAAGCTTATGAAGCATGAAGTATGTTCATGCGATCTTCTGTTTCATAATAGTGGTCCTTTCAAACTATTTTGTATCTACCATCTCCTAATAGTGGTCCTTCCATCCTGCAAAGTGTCAGCCATGCCCTACATAAGGAAGTTCACTATCGCTTATATGCTTTTAGATTCCTTTTTCACGATCTTCCAAACTAGGAAAATCATTCGCAATGGTAATTGCTTGTTGTCTTGCCTCACCTTTGAGTACTATGTATTGATATGCGCCTTTTAGATGCAACCACTACCTCCTGTTATTTCCGTGTATTGTGTACACATAGATTCCTATTGAGCTTATTTTTAATTTCGACATATTGTTTGGTCCTTGCTGATGTAATGATGAATACCTTTTTATTGGTCCATTTGGATTTTTTTTTCAGATTGCATTTCCTGACGCTGTTTACTTAGTTGATGCTATTGAGGGTGGGAAAGAACTTATTGAAGCTTGCAAACCAGCACTTGAGTCAGAATATGTCACCAAAGTTATTCATGACTGCAAAAGGGACAGTGAGGTGCCTAACCCACAACTCTGAAGTTATTGTAGTGCATTATTATTTTTTTCTGTTCTAGAAGATTGATCCTGACTAATGGTTGAGAGTTACGATATTGCAGGCTCTGTATTTCCAGTTTGGCATAAAATTGCATAATGTGATGGATACACAGGTAATCAGCATATGCATGTTGTGTGCACTATAGTGGCATGCTTACTGACTAAATTTATAGTTAACTTGGTACTTTCTCTGTTGTTTACATGTAAATTATTATCTGCTGCTTTCTTAATGATGTTCATATGCATGTGGTATGCGCCACAGTGGCATGCTTACTGACTAAATTTATAGGCATCTCGGTAATTTTTCTGTTGTGCACATGCAAATTATAATCTGCTGCTTTTCTAATTCTATTCATCAAAACTGAACCATTACCAATTTATCATGAGCTTAGGACCATTAACCCTGTACAGAGCTGAAATAATTGCATTATCATTTGCCATTGTAGATATGTAATGCGAATTGGCAGCTATTTGTATGGTAGTTTCTATTTGGAGGGACTTCAATTATCACTCTTGTGCAGATCGCTTATTCTCTGTTAGAGGAGCAGGAAGGGAAAAAGAGAGGATACGATGAGTACATATCTTTTGTCAGCCTCCTTGCTGATCCCCGATATTGTGGTACTTACTATACTGAATTAGTTTAAACCATTGAGTTCCTTTGAATCGAAAAGACGAAACTGCTGTGCATGTTTTGTTCCTTCTGATCTGTTCTTTCACAGTATACTGTATACTTATATAAGCTCCCCTTGGTTGTAGTTTACCTTGTGCTGGCATGCAAGCTCTTTCTTTTCCTTATACATATTATCTGCTCCTACGTTTTACATTTATATATTCTTAAGCATTGTCGCCATACCACCCTTTTTTTTTAGAAAAAAAAAGGAAGTGTTGCCTCAGTTTTTTTTTTTGTATTCATGAAGTTCCACTTGATTGTGATCTTTTGGTGCCAGGTTCTTATTTTGAACTATAAGTTAATGTAATGCAACACATTATGCTTAGTGTTACTGCTAGTGCTTTAACTTTGATGTATATGCCTTACATATCCAAGCTGCTGCAAGTTTTGTCCAAGCGTAACTTCTATATGACATGGTTATTTCAGTCATGAATCGTTTCAACGTGGACATTCTGCCTTATTATATGTTCATTTAATGTGTGTATGATTAGGCCTTAGGCTGCAACCTATCAGTTCACCCATGAATATTAGAACACCTGGGATGATTGCTCCCTCTCTCTTATACAGTTTTCTATTACTTCTGTAATTCTTTAAATTAATACTTTGCAAATATGTTGAAAGCCTTTTGGTAGGTTGTGCGTTGAAACTACAAAATGTACTGTGGTTGCATCACAGCAGTTTGCTGCTTCTGTCAAACATTTTTATCAATTAATTGTTATGCTCTTTAAGCTACCTAGATGTTGACAAAGTGTATGAAGGACCGCAGCGCATTTTCTTGTGTTCTGTTTGATTGATCATATGGTGTGATACTGCTTTGTGTAGGAATGGCATATCCTGAAAAGGAAGAAGTCCGTACCCTTCTAAGGCAGGTTAGCAATATGTGACGGGAATTGTAGAACTTTGTTAGACAGAAAGTTATTGTGCTGAAGATCTGAAATCTTATGTTACTCTCTATTTTATGATAATGCTTGGCTATCCGATGCTTCACTGTGCTGATATCCTGGTTTCTTGACAACTGACAAGTGCTTACATCGGTTTTCAGGACCCTAACTTTTGGACGCATAGGCCTTTATCTGAAATGATGATTCGAGCAGCCACAGATGATGTCCGCTTCCTTCTCAGTATACATGAGAAAATGATGGAGAAGTTAAGCAAAGTATCTTTATGGCGTCTGTCAGTTCGCAGTGAGCTATACTGCAGGTGCTTTTGCATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGGTCAGTGCATCTAAATGTGTTTTTCTCCCCATTTGTTCATATTGCAAATCCATTTAGTTATCATATGCTAAAAGGTCCATTTTGCCTATAGTTTCTTCAGATACTATTGAAACTTGATAGTCAGAATGACAATTTTGAAATGCAAGTCAGGGTTGCTTTATGGGCTGGCATTTTTAGGTGAAGTGTTAGAAAGTAACTTGGACCTTGGCAAGCAAGTATAGTCTTAAATATAAGCATCACTAACACATCATGGATGTCTTTCAATTGTATTATTTAATTCTTCAAGTTTATTTTATATTCAACTTTGTAAAACCGGACATTTGTGCTAAACTGCTGATTGATATTTGTGTCATACAGATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCTTGGATGTGCCTCCTGGCAAAATGGGGCGTGTTATTGGCAGAAAAGGATCATCAATAATGGAAGTGAAAGCATCTTGCAAGTAAACATACTAAGTCTGATTTTGTAGATGTTCTCTAAATCTATATTATTCTGTGAAGCTTTATTTATTCCTTTTCATTTCAACGCATATTTGCAGTGTTGAAATCCATATTGGTGGTGCAAAGGGACCTCCAGACAGGGTAAGTTTCCTAGGGCCTTTGTCTGTTGTAATTAATATGTTCAATTGGTTACTGGTCAGTCCACACTCCACAGTCATGCTTCACTGACTTACTGGCTCCATCTATCGACTTGAACAAATTAATACTACTAATAACTAAAGTTCTTGTAATTCTACAAATGGAAAAAGACTACCAAATAGGTAGTCATTGAAACATGTTATTTTGAAGTGCCAGGCTCAGCACATTGTTGTCCTAACAAACTTGTTAAGTTTAGAGTGGGTTTCATATAATCACAAACATTTAGCGGGACTGGGCTCCTAACATGTATGGCTCTAATAAAAAGTTGTTTCTGATTTATATTTTGGCACAAGTCTTGCTGCTCTTTTTTTTTTTATTTACATTTTGCCCTATGAGGTTCCATTCCTTGTCTTTACTACCTGTAAGTCTGTAACATTCTAAGCAGACTTATCTCAAGGTGATCACTACTGAACAGATATATCTATCTTCTAGCTAAGGTGATCAGTACCATAGTAGGCTTGCGTGGGCTAGGGCTGGATGCATATGAAAATTGTGTGCAGCCTATATATGTCACAATCAGTACCCTAGCTGGACTGATCCGTGAGGCAACACGTAGTGAGAAAGCAATTGCTGCTAGTAAATGAATAGCGAGATCACATTAGGTGGTCCTTCTCCCTAGCACATGAAAAGACGGTGGAAAAAAGGCGATACATACCCAAACACTGAATAGTCTTCCATTCTCTTCTTTGAATAACCTTCTACATTATGCAGACAAACCAATCGACCATATACATATTTTTCTAATTTCCACTGATCCTCATCCAATTTCCCTTAATTCAGGTATTCATCATTGGACCAGTGCAGGAAGTCAGAAAAGCTGAGGCTATCCTCCGAGGCCGCATGCTGGAGTTCTAG</dnaseqindica> |
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