BGIOSGA001572
| Gene Name |
BGIOSGA001572 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001572, complete gene. |
| LocusTag |
B1080D07.19 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001572-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001572-PA |
| Length |
5413 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:19054067..19059479 |
| Sequence Coding Region |
19059288..19059479,19056564..19056626,19055685..19055765,19054067..19054096 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:19054067..19059479 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:19054067..19059479 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGATCAGCACCACGTGCAGCAGCAGCAGTATGTTGACCCTTATCGGACAATGGTGCTGTCACCACAGCCTGACCACCTCAATGCCCTCCAGTACAATCACCAGCAGCAGCCACAGCCACCACCGCAAGCAACTCCACCACCACCACAACATCACCATGCCTCACTCGCCTCCCACTTCCATCTCCTCCATTTGACGACAAGATTAGCTGATGCTATTGGAAAGGGCACAAGGGATCAAAATTCTGATGCACTGGTTGAAGATTTGACCAGTCAATTTGCTAGGTGTCAACAACTATTAAACTCCATATCGGGAACACTAAGCTCGAAATCTATACTCTGCGCGCTGATGAGGGTCAGGGAGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDQHHVQQQQYVDPYRTMVLSPQPDHLNALQYNHQQQPQPPPQATPPPPQHHHASLASHFHLLHLTTRLADAIGKGTRDQNSDALVEDLTSQFARCQQLLNSISGTLSSKSILCALMRVRE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..192#2854..2916#3715..3795#5384..5413#ATGGATCAGCACCACGTGCAGCAGCAGCAGTATGTTGACCCTTATCGGACAATGGTGCTGTCACCACAGCCTGACCACCTCAATGCCCTCCAGTACAATCACCAGCAGCAGCCACAGCCACCACCGCAAGCAACTCCACCACCACCACAACATCACCATGCCTCACTCGCCTCCCACTTCCATCTCCTCCATGTAAGTCACAGTCCTGATCTCTTAATGCTTGTCTTTGTGTCTAATAAATTGAAGGGGAAGGATGTCATGACAAATTTTGGCTGCCGGAGTGCCGGTAGTTGGTCTTCCATTATCTAAAAAAAGTCTATACACACAAAGGTTCAGCTCATTCTGCAGTTGCAACTTGGCCATAGAAGCATCCTAGAGGCTGTTATTCTCTTGCTATATTATAATTGGATAACTTAAGTGCAAATTGTCTGCTGCATCGTCTCTTGTGAAGAAAAAGGTTGCTACAAACTATGCATTTTGCTAATTACATGTCTTTCTTAAGTTGACAACTGTTGTAAATCAAGTCTGCTCGAGTTATTTATGTGTCTGCAAGAGCATTAGTGTATTGGCTGCCACTTTTCTGTGTATTTGGATGCTTATGTGTTGCTTCTGTCCTTTTAGGAATATAGAACTTCACTATTATGCATGCTCTACAATGCTCAGTTTTCCATAATTGTTACTACCTTCATCCCGAAATATAAGGGATCTTTTTTGGACGGAGGTAGTACCAAATACTACTTACACAGGAGGTCACTATATCTGCACACCTGTATCAATTAACTCTATGAATCATGCAAATTATTTTCTTGCCTCCCTGAACTTGCTATTCGTATGTTAAGTCATTATTGAGATAACTAACAGAATGTGGTGATCTGGTCAGCACCAGTGGATGGTGTCAGTACATACTCCAATGTGGAAGAGTACTTTTAGGGCAGTGGTGGAGCTGGAACCATATTGAGGGTGGTGCCCTACTTTACTATATAGATGGCAGCAATTACTCTAAATAATGGTATTTGTTCATTTGTAGATAACTATTGACACAAAAAATCATTGAGTAGCAAGTAAAAGTGCTTACCGAAATATAAGATGAAAAGAAACCGCAAAGGGGAACATCAAAAAATACATAAAAGACGATCAATTTATGCAAAATACATCCTCGGCCTCAAAGCTGTCAATCTCAATATCATCGATAGGTAATAGCCTACAATAAAAGCAGAACAGAAGTTAGAAACATATTAATTTCAACTAAAAATTTATATCCAATGAACATGTAAAAACATAAAAATAAATGTGTTACCTTTTAGTATACTCGTGTTCTCATGTTCATAAAACGGTCAACTACAGCTTTGTTGGTTACTCTTCTCATTTCTTCTTTCTCCAGATAGCAAATAAGACTATGACTTAAGTAGTCATCACCCAACTATTGTCATCTTGTTCTGAACAAGAATTTCGTACAGCTACATTATTGGAACTATCGGGCGCTTTCCTCTTGAGATACTTGTCCATAACCTGTCAATTAAATAGTTTTATTATGTTAGACTTACACTGCACAATAGAACAATGTATACCCCCAAAACAATTAAGCAATGATGGTGTCACAGTATGCTTACAATTTTACTAAGTGATGGTTGATGGACTGATGGCTGCAGGACAATAGGACTACTTGTCCCTTCTAGAGATCAATTGAAACTTTCAGTTCTTCAAACTTTAAACCCTACCTTATATAAATCTGGATATTGACAGGGTGCTATCAACAAGTTACAAATGAAACTAATATGATTAAAAATAAGACTAGAACTAGAAGAGAGGATAAATTGAAAGTTTGGAACTAATTAAAAGGAAGATAATACATCTCTTAATTTAGTCTCTTGCTTGTGCACTGCTGACTGCTCGGCTGCTGGCTGCTGGCTGCAGGCTGCCCCTGTAGTCTGGCTGCTCGCTGCCGCAGTGCCGCTGTAATGCTGCCGGCGGCCGGCTAGGGCGACCAGCACCAGGCCAGGACGGCGAGCAATGGCGAGTCGGCGACCAACGGCTGAGCATGAGCAGCAGGAGTAGACGGCGACTCGGCGAGCAGTGGCGAGACGAACAGACACACAGCCGCGCAGATGCTGTATTGTGGTTTGGAAAAAGAAAGAAAAGAAAAAGCAAAAAACGGGAGTCGAGGAGGTGTGCGGTGCCGGCGTGGCTGTGATTGACGCTCGAGGCGTCGTCTCGCTTCCAGTAGCCCAGACGGTGCACTGTTTTCATGGGCCTTAGGCCTTCCACGACTTGCTTATGGGCCAGGGGTGGTGCACGAATTTGGGCCAAGGGGTTCCCATGTGGTGAAAATAAGGGGGTAAGTACTAAATCTGAAAATTGGGCCAGGTGCCTGGGAACCCCCCTAGGCCCATTGGGCTCCGCCCCTGTTTTAGGGGTCTATTTATTAAATAATAAGTTATCAAAAAGGACTAGAAATTCCTGCACTGTTAAATTAAGCAATAGGTGAATAGGATAAGAGGCAACAATGTAGTAATTGGCTGGGAGAGGGACAACAGCTGCCATTCTGCCACAAGTGGAGTAGATGGACTAAGATGTGAATAATTAAATATGGATGCTAATTTTAGTCAGGTGGGTGAAATTCTGAAAAGGAGATTTGCTACAATCAACGAATGAAATACCGGTGTGTTTTTTTTAACATTAAAAAGCTATTTTTGAGCTGCTTTTGGAATTTAACATGTGGCAGTGTAAATGATGATTGCTTGTTATGGAATATCCGCCAAGCACATCTACACAATGGCGTATATCTAATTTTCTTATTTCATTTACAAGAAAGTACTACCTTTACAAATCAATGGTTTTTTATTTGTTTATCAGTTGACGACAAGATTAGCTGATGCTATTGGAAAGGGCACAAGGGATCAAAATTCTGATGCACTGGTAAGAAATTCATGTAGCTCTTAATAGTGTTTTAATAAATTGATGTGATTCTACTCCATGATGCATGATTCTTGTTGTAAAGAATGAAATTAGTTTCTCTTTGGAGTGTACATATTCTTGGAAAGTTTATTGTGTAGGAACTATTTTTCAGTTGTTTTGCTTCATAAACTTATTATGAAACCACTTCCTGTTGTAATATAATATGGAGGAAATGTATGGAATATGCTAGGTGACTGATTCTTACCATATAATATTTTCTACTGAGAGCGATGAATCTGAAAGACAATATGCCAATGTTGTCACATTGTCGCTATGTCATATGCCGTCCTGGTGATGGGTGGCACTTGCCTGGGGTCCTCATCTAGGATGAGAGCTAGAGGGAGGGAGCTGAGTTTATCTGTTTATGTGTTGCGCTACTCCTTTCCTTTTTATATTTTATTTCCGTAGCATTGCTATGGCCTGACCTGGATGCCACCNTGGCTCTGTGGGCTTACGGTGCCTTGCCAGAGCACCGTGACAACATCAATATACTTGAATTATATTATTATAAACTACATATTTTTTATAGTTAATATGTACACTGAACTGGGATTAATGCTCTCTGCGATCTGTTTCCACACTCTTTATTGATGCTATCAAACTTTCCAGTTTGTAAACCTGCGTATTTTGTATCTCATATGTGCCTGTGCAAAATTGTATAACTTTCCAGTTTCCACTATCCTGTTATTGTTGTACTGCTTATAATGTTATAGCATGAATATCTGAGTAATTAGATGGTCTTTTTATATGTTTGTGTAGGTTGAAGATTTGACCAGTCAATTTGCTAGGTGTCAACAACTATTAAACTCCATATCGGGAACACTAAGCTCGAAATCTATAGTAAGTTTTGTTACATCTAATGAGGTATTTGGCTTGTTAAATTTGCTATGCGATCTGATCACATAGTAATAGATATCGTTAAATCTTCTTTGTTGTAGCTAGGCTGTAATTCAAATACATGGTAACAAATAACAGCGTGATAGAAATCTGGTATGTCCCATCCTTGGAAATCAGTAATCTGCCGAGTGCCAACGTACACATCAGATCTAGTTCTTGTGATTTTTTGTCTGAATTGTTGTCTTGCCTTTCGTATTTATGTGGTGAATTGCTTGTTTATATGTTCATTGCATGGATGATCACTTATTCGAACCAAACGATGGAAAGGGTTTCCATTCCATTCCTTGATTCAGCCAGACAAAGTCGGCATTTTGCTTAATCCATTTCAGTTTCCAGTGTTTCTAAGTTCCAACACTACCTATATGACTCCTTCTGTTGCACGAAGACCGTAAGAGTGAGGAGACACAAAATCTAAGAATCACGTAATGGCATTTCAAAGTTTTGTAGCATTGAAGCATGGTAGGCAGGAAATATTCTAATACTATGCTCATGATTCATCAATTAACAAGCATTATATGAAATGACCCTTCGATTATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTCAGATCACCATGTGGAAGAGCGAAAAACATTTCAGAAATCATTGAAAAAGCGAAACTGGCAATGTGGCGACTAGCATACGCTCGAGATTGGCATTTTATCTAGTGGCAGAGCCAAAAAGATTTTTGAGTCCAGGCAAACTTTAATACAACTATAGAAATTTCATCATCAGTTTATTCATCAATATTAAAATTTAATAGAGTTTTCGTGAACTAGATGGGTGGTGGCTCTGCTATTTATTTTATTGAATCGCGTTATGAGAATAGCGTAATAGCTAAAGTTTCCAAGATGATCAAATGTCCATATTCTGGCTGTATCGTGCAGGTTCGTCCGCTTGCAGTGCTCGTGTTTACCCTCGAGGCACCACGGACGGATAGGGGTGGGCATTCGGTCAGACCGAAAATTTCGGTCTTTCGGTCATTTTGGTTTCTGAAAAGTGAAAACTGAATTTTAACTAAAAATGTTAGGACCAACATATTCGGTCTTGGTCTACAGACCGAAATT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| External Link(s) |
