BGIOSGA001820
| Gene Name |
BGIOSGA001820 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001820, complete gene. |
| LocusTag |
P0487H02.31 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001820-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001820-PA |
| Length |
4417 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:12062121..12066537 |
| Sequence Coding Region |
12066438..12066537,12066244..12066346,12066086..12066151,12065876..12065999,12065483..12065617 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:12062121..12066537 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGACAGGTCAAATTTTCTCCAAAACCACCCAAGCGTTATTCTATAATTATAAGCAACTTCCGATCCAACGGATGCTTGATTTTGACTTCCTATGTGGGAGAGAAACACCTTCTGTTGCTGGAATAATCAATCCTGGTTCTGATGGGTTTCAGAAACTTTTCTTTGGACAAGAAGAAATTGCCATTCCAGTTCATCCTACAATTGAAGCTGCCTGCAATGCACACCCAACTGCTGATGTATTTATCAACTTTGCATCCTTTCGGAGCGCTGCCGCTTCTTCAATGTCAGCTTTGAAGCAGCCAACAATCAGAGTTGTAGCCATCATAGCAGAGGGTGTTCCTGAATCAGATACAAAACAACTTATTAGTTATGCACGTGCCAACAACAAGGTAATCATTGGACCAGCAACAGTTGGAGGAATCCAAGCTGGTGCTTTCAAGATTGGTGATACTGCTGGAACCATTGACAACATTATTCAATGCAAGCTTTACAGGCCTGGATCTGTTGGCTTTGTTTCTAAATCGGGTGGCATGTCAAATGAGATGTACAACACCATTGCCAGAGTGACAGATGGTATTTATGAAGGAATTGCAATTGGAGGGGATGTTTTCCCTGGCTCAACTCTGTCAGACCACATCCTGCGTTTCAACAACATACCTCAGGTCAAAATGATGGTTGTTCTTGGGGAGCTTGGAGGAAAAGATGAGTATTCTCTTGTTGAAGCCCTGAAACAAGGAAAGGTTCAGAAACCTGTTGTTGCATGGGTTAGTGGGACATGCGCTCGTCTATTCAAGTCTGAAGTGCAGTTTGGCCATGCTGGTGCGAAAAGTGGTGGTGAGTTGGAATCAGCACAAGCTAAGAACCAGGCACTAAAAGATGCCGGGGCAGTTGTCCCTACTTCATATGAAGCTCTTGAAACTGCGATCAAGGAGACATTTGAGAAACTGGTTGAGGACGGAAAGATCTCTCCTGTTACTGAGATTACACCACCTCCTATTCCAGAGGATCTTAAAACCGCAATTAAGAGTGGGAAGGTCCGAGCTCCCACACACATTATCTCCACTATCTCGGATGACAGAGGCGAGGAACCCTGCTATGCTGGTGTCCCCATGTCTACAATTATTGAACAGGGTTATGGAGTTGGTGACGTTATTTCGCTTTTGTGGTTCAAGCGCAGTCTTCCTCGTTACTGCACTCAGTTTATTGAGATGTGCATCATGCTTTGTGCTGATCATGGTCCTTGTGTATCCGGTGCTCACAATTCTATAGTTACTGCTAGGGCTGGAAAGGACCTTGTTTCCAGCTTGGTATCTGGTTTATTGACAATTGGCCCCCGTTTTGGTGGTGCAATTGATGATGCTGCCCGGTACTTCAAAGATGCATATGATAGAAATCTCACACCTTATGAGTTCGTTGAGGGTATGAAAAAGAAGGGAATCCGTGTCCCTGGGATTGGTCACAGGATCAAGAGCAGAGACAACAGAGATAAGAGAGTGCAGCTTCTACAGAAATATGCCCACACACATTTCCCTTCTGTCAAATACATGGAGTATGCTGTCCAGGTTGAGACCTACACCCTGTCAAAAGCCAACAATTTGGTTCTGAACGTCGATGGTGCGATTGGGTCGCTTTTCTTGGATCTTCTTTCTGGCAGTGGAATGTTCAGCAAACAAGAAATCGATGAGATTGTTGAGATTGGTTACCTTAATGGACTCTTTGTGCTTGCGCGTTCAATTGGTCTCATCGGGCACACCTTTGACCAGAAGAGGCTCAAGCAACCACTCTACCGCCACCCATGGGAGGATGTCCTCTACACCAAGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATGQIFSKTTQALFYNYKQLPIQRMLDFDFLCGRETPSVAGIINPGSDGFQKLFFGQEEIAIPVHPTIEAACNAHPTADVFINFASFRSAAASSMSALKQPTIRVVAIIAEGVPESDTKQLISYARANNKVIIGPATVGGIQAGAFKIGDTAGTIDNIIQCKLYRPGSVGFVSKSGGMSNEMYNTIARVTDGIYEGIAIGGDVFPGSTLSDHILRFNNIPQVKMMVVLGELGGKDEYSLVEALKQGKVQKPVVAWVSGTCARLFKSEVQFGHAGAKSGGELESAQAKNQALKDAGAVVPTSYEALETAIKETFEKLVEDGKISPVTEITPPPIPEDLKTAIKSGKVRAPTHIISTISDDRGEEPCYAGVPMSTIIEQGYGVGDVISLLWFKRSLPRYCTQFIEMCIMLCADHGPCVSGAHNSIVTARAGKDLVSSLVSGLLTIGPRFGGAIDDAARYFKDAYDRNLTPYEFVEGMKKKGIRVPGIGHRIKSRDNRDKRVQLLQKYAHTHFPSVKYMEYAVQVETYTLSKANNLVLNVDGAIGSLFLDLLSGSGMFSKQEIDEIVEIGYLNGLFVLARSIGLIGHTFDQKRLKQPLYRHPWEDVLYTK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..100#192..294#387..452#539..662#921..1055#1306..1366#1458..1534#1929..2084#2171..2299#2881..3013#3115..3242#3341..3446#3542..3618#3713..3783#3879..4163#4342..4417#ATGGCGACAGGTCAAATTTTCTCCAAAACCACCCAAGCGTTATTCTATAATTATAAGCAACTTCCGATCCAACGGATGCTTGATTTTGACTTCCTATGTGGTACGCTGTCTGTCTTATCAATATTGGCTAAGAAATGTTGCACGTTGTTTCTTTTTTGCTTCTTGCTTGCTGACCTTACTCTGCTTTATAGGGAGAGAAACACCTTCTGTTGCTGGAATAATCAATCCTGGTTCTGATGGGTTTCAGAAACTTTTCTTTGGACAAGAAGAAATTGCCATTCCAGTTCATCCTACGTGAGTGCTCTGCTCCTCATATAAGTTCATGTGTACATTAACAGATTGTTCGTTTGTAAACAATTTATTTATACTCATTTATATTTTTGCAGAATTGAAGCTGCCTGCAATGCACACCCAACTGCTGATGTATTTATCAACTTTGCATCCTTTCGGAGGTTAGTTAGCATTCTGATATTCCTTTGAGCAAAAACCACATGATCCTAGAACAACTACAAGTGTTTTTTATTTGCTTAATCTGCAGCGCTGCCGCTTCTTCAATGTCAGCTTTGAAGCAGCCAACAATCAGAGTTGTAGCCATCATAGCAGAGGGTGTTCCTGAATCAGATACAAAACAACTTATTAGTTATGCACGTGCCAACAACAAGGTAGGGATTATGCCTTGCATGAATTTAACTGCTTTGCAAACATGATATTTGCACCAGATTCTCGCCGTAAAAGTCTTACAAATTAAATATGAATAAATTACTGTCTCCTTATAAAATAATATGTAAACACAATGGTGGTATTTTGTCCATTCCAGATATTGGTGTTGGCATGCTATTTTATTGCCTGCCAGGCACTAACGCTGACGGCGGCCTGCATGTTTCTCGTTTATTTTACCAAGTAACTGTTGTTGTTTCTAGGTAATCATTGGACCAGCAACAGTTGGAGGAATCCAAGCTGGTGCTTTCAAGATTGGTGATACTGCTGGAACCATTGACAACATTATTCAATGCAAGCTTTACAGGCCTGGATCTGTTGGCTTTGTTTCTAAATCGGTATGCATTTATTTGATTTTTGTTAAAGTTGTTTGTACAAAAGAAATTTACCTTCCGTACTATTTCTGATCCATAAAAAGGCAATATTCTATTTTTAAAAAAGAACATTTGTAGCACTACCAACTTTTGATCTGTTAAATATCTGACCTTTTAATCTGTACACATGCAACTTCACATCTTAGCTCTTAACGTACATTGTAATGCTCATATGTAACCCCAATGACAAACTGAACTTGCATTACATTAACAGGGTGGCATGTCAAATGAGATGTACAACACCATTGCCAGAGTGACAGATGGTATTTATGAAGGTAACTGGTTTATAGATATATGTAAACATTTCTGCATTGGGTTATCTCATGAATATTGAACCTATGCTAACTTCTTTTTTAACATACTCAGGAATTGCAATTGGAGGGGATGTTTTCCCTGGCTCAACTCTGTCAGACCACATCCTGCGTTTCAACAACATACCTCAGGTTTGAATGTTAACATTTGAACATCTTCTACACAAATGTTAGTGCAATCGTTCTTTTAGGGCATTTATTTGGTATCTTTGTCATGCAACTCTGCATCAAGGGATCAACTTATATCTTGCGTTTGAATCAGATAAATGTTGGAATTAGTTCTTTTGGTCACACTCATTAGCTTCTTTTTTTTTTCCTGAGACAGTTCCTTTACCATAATCTTGTTCTATCTTTATTGCCTTTGCACCCACTCAGCCATATATAAATTTAGACATGTGGATTGCTCAGTATGCAAGTAATATTTCCTCAAAATGCCATCCATGCATTTTATGTAAACCACGTCTGGATTCTTGGAGCATTGCTGTATCAATAACATCTCATCGTGCACCATGTTTATTGGAATTAGGTCAAAATGATGGTTGTTCTTGGGGAGCTTGGAGGAAAAGATGAGTATTCTCTTGTTGAAGCCCTGAAACAAGGAAAGGTTCAGAAACCTGTTGTTGCATGGGTTAGTGGGACATGCGCTCGTCTATTCAAGTCTGAAGTGCAGTTTGGCCATGCTGTAAGTCTGAAACTGTTCCTTTTCAGTAATTTCTGTGTTGAACAGTATTTTAAGTGCTCATCTGAATTAATTTATTGGCCCAACAGGGTGCGAAAAGTGGTGGTGAGTTGGAATCAGCACAAGCTAAGAACCAGGCACTAAAAGATGCCGGGGCAGTTGTCCCTACTTCATATGAAGCTCTTGAAACTGCGATCAAGGAGACATTTGAGAAACTGGTAAGCAGTACTATTATTACATGCAGTGATTTCAAGTCGTCTAGTCGGGACTAGTCGTAAGGGCACCGACTAGTCGACTAATCGCAATTAGTCACGACTAATCGTAGATTAGTCGGTGACTATAGGCTAGGGGTATCCAGGATAATGTATAGATGTTTATAAGTATTAATTACCATAGTATACTAGTATAGTATAGTACAAACTAAGGATAATAAGATTTTCAATGGCTGGTTAGGGTTAGATGAGGGGTACAGGCCTTCTTGGGCTGGGCAAATGGCCTGCCACTGAAGTGTAAAGTCCAACACATATTTTTAGCCCTAACAGACTAGTCGTCCACGACTAATTTGATCGACTAGTCGTGATTAGTCGGACGATAAGTTTTTCTGGTGGAACTAATCGCTTCGAAGTTCCTGATCGAGGTCAGGGTAGCGATAAGGACGACTAATCGTGATTAGTCGCGACTAATCGGACGACTTGAAAACACTGATTACATGTCATGGCCAGTGTCTTTCAAGCTTTTTAACCTTTTTGAGAATTTTTATTGTGAGTATCAAGCCTCTGAAATTAAATGTATTTCCCAGGTTGAGGACGGAAAGATCTCTCCTGTTACTGAGATTACACCACCTCCTATTCCAGAGGATCTTAAAACCGCAATTAAGAGTGGGAAGGTCCGAGCTCCCACACACATTATCTCCACTATCTCGGATGACAGAGGTTAGATTGGTGGCAATGTGTTTTTCCACATATTCTCCATGTTCAATCTTTGTCATACTATCCCTACCAGGAAGTAATATAGGTGCATTTTTGTGATACAGGCGAGGAACCCTGCTATGCTGGTGTCCCCATGTCTACAATTATTGAACAGGGTTATGGAGTTGGTGACGTTATTTCGCTTTTGTGGTTCAAGCGCAGTCTTCCTCGTTACTGCACTCAGTTTATTGAGGTAAACAATTGGTAAAATATGATATGGATAATCTATTTTTTGAATGATAGTCATTTAGTCTTCATTTGATCCTAGAAGGATTTCATGTGTCTTGACAGATGTGCATCATGCTTTGTGCTGATCATGGTCCTTGTGTATCCGGTGCTCACAATTCTATAGTTACTGCTAGGGCTGGAAAGGACCTTGTTTCCAGCTTGGTATCTGGTGAGCTTCTTCTACATGTACATGTAAACATTGTCCGTTAAGTTGTTTGATATATTACAGCATAGGTTATGAAGATTGCTATTGAAATATTGCAGGTTTATTGACAATTGGCCCCCGTTTTGGTGGTGCAATTGATGATGCTGCCCGGTACTTCAAAGATGCATATGATAGAGTGAGCCAACTTATTTCCTATCCCTTTGCTACATCATCGCCATGTTTCCTGCGTTGCATAGTTGCTCTAATAGGTATGCATCAATTGCTTGTAGAATCTCACACCTTATGAGTTCGTTGAGGGTATGAAAAAGAAGGGAATCCGTGTCCCTGGGATTGGTCACAGGTATGTTCTATCTGTTTGCTTGACATGACATTTCCTAAGAATCCTTCATCCAGAATAGATTTCCTCAAATTTCACTCGCCTTTCTTGATTATTAGGATCAAGAGCAGAGACAACAGAGATAAGAGAGTGCAGCTTCTACAGAAATATGCCCACACACATTTCCCTTCTGTCAAATACATGGAGTATGCTGTCCAGGTTGAGACCTACACCCTGTCAAAAGCCAACAATTTGGTTCTGAACGTCGATGGTGCGATTGGGTCGCTTTTCTTGGATCTTCTTTCTGGCAGTGGAATGTTCAGCAAACAAGAAATCGATGAGATTGTTGAGATTGGTTACCTTAATGGACTCTTTGTGCTTGCGCGTTCAATTGGTCTCATCGGGTGAGTCTCATTCTTGTTGCATTCCAATTGAGTGGGTATATCTATATGAATGTTATCTTCTAGCTGCTTCCAACATTAGAATAAATGGTATGGACTATAGAGATACGTCCGTTTTGTTAAGTCATAGTTTCTTTTGTAATTTCCACATAGCTGATCAAATTTGTCGCTTGGTTCGCAGGCACACCTTTGACCAGAAGAGGCTCAAGCAACCACTCTACCGCCACCCATGGGAGGATGTCCTCTACACCAAGTGA</dnaseqindica> |
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