BGIOSGA001889
| Gene Name |
BGIOSGA001889 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:001-043-G05, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001889, complete gene. |
| LocusTag |
B1085F09.4 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001889-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001889-PA |
| Length |
17286 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:10884476..10901761 |
| Sequence Coding Region |
10901368..10901761,10893406..10893989,10892032..10892207,10884476..10884956 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:10884476..10901761 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGCGGCGGCGCCGGCGCCGATGCAGTGGGCGCGCACGGTGGCCTGCGCGCGATGAGCGCCTGCATGCTCTGCAGCATGGCGGCGGCCTGCCGGCGAACGAGGAAGCCACGCACCAGCGCCTGCAGCTTCACCAGCGCCTTGAGCGCTCGCAGCGCCTTCTTCGCCTGCACAAACACACGGCATGATTACTCCATCGAAGCAGAGCTAGAACACGAGCACCCATTGCTTACCAGGAAGCCTCTGAATGCTGTCTGGATTCTGACGGCGGCGCTGATGCGCAGAGGGAGGGAGGGGGCAGCAGGCAGTGGGAGCGACGGCGGAGCACGGAGGGGGCAGCGACGGCGGCGTTGGCACACGGAGGGAGCGGCGGCAGCGCACGAAGGGAGTGACGAGGAAATGCAAGTTAATAAAGAGGCACCTCTGGGGTGCCTCAAGCCAATTTCTCAGTATAACCCGCAAGAGCAGAGAAGCAACGGGTTTCCTGAGAATAGTGAAAAAAAGAATGATAGTATTGCAACAGAAAGAGTCTTGGAGGCATCTCCTCTTCCAAATCAAGGCGTTTTCAGACCCGTTCAACGGACAGAATATTATGCCTATCCATTTATTTATGCTGATTACCAAATGCCGGGACAGCCACAACCTTACAACTTAGATAACCAATTTTATCAAATAAACAGGGACCACAGTTTTCCTATTGAGAGTAGAGTTCAATATCTTCCATTCAAGATGCCCCCTCAAGGTTACCCTCCTGATGCACAACTTCAGGAATTTCAATATTTTGTGGTTATTGACTTTGAAGCAACCTGTGACAAGGAGAACAATCCACATCCACAAGAAATCATTGAGTTTCCATCTGTCTTGGTTAACAGTGCAACTGGACAACTTGAAGCTTCCTTCCAAACGTATGTTCGGCCGGCATATAATCAACTTTTGACTGACTTTTGCAAGGAGCTTACGGGCATTCAACAAATTCAGGTAGATAGAGGTGTGCCTCTAAGTGAGGCATTGCTCATGCATGATAAGTGGTTGGAGGAAAAAGGGATTAAGCACAAGAACTTCGCTGTTGTGACATGGTCTAACTGGGATTGCCGTGTAATGTTGGAATCTGAGTGCAGATTAAAGAGAATCAGGAAGCCCCCTTACTTTAACAGGTGGATAAACTTGAAGGTTCCTTTCCAGGAAGTGTTTGGGGGTGTCCGGTGCAACTTAAAAGAGGCAGTTCAGTTGTCTGGCCTTACATGGGAGGGCCGTGCCCACTGTGGGCTCGATGATGCTCGCAACACCGCTCGCCTCCTTGCATTGCTGATGCACCGGGGCTTCAAGTTTTCGATCACCAACTCGCTTGTGTGGCAATCTGCCCCGCAGTCAATAACATGCCAGTCGTCCCCTGCGCACTCTCCGTATCCCAACCAATCACACCATAAGCCAATGGAAGTGATGGGATCTCCTGTGCAGGTTAACCCATACGCCGGCATCACAGTGAAGAAGCCGATGTACTGCCACTGCGGCGTGCTGAGCCAGATCAAAGTTACCTACAGACCAGGCCCGATGCACGGTCGATATTTCTACGGATGCGGAAACTGGACATCCACAAGGGGGGCAAACTGTGACTACTGGGTATGGTTGTCATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGGGAGADAVGAHGGLRAMSACMLCSMAAACRRTRKPRTSACSFTSALSARSAFFACTNTRHDYSIEAELEHEHPLLTRKPLNAVWILTAALMRRGREGAAGSGSDGGARRGQRRRRWHTEGAAAAHEGSDEEMQVNKEAPLGCLKPISQYNPQEQRSNGFPENSEKKNDSIATERVLEASPLPNQGVFRPVQRTEYYAYPFIYADYQMPGQPQPYNLDNQFYQINRDHSFPIESRVQYLPFKMPPQGYPPDAQLQEFQYFVVIDFEATCDKENNPHPQEIIEFPSVLVNSATGQLEASFQTYVRPAYNQLLTDFCKELTGIQQIQVDRGVPLSEALLMHDKWLEEKGIKHKNFAVVTWSNWDCRVMLESECRLKRIRKPPYFNRWINLKVPFQEVFGGVRCNLKEAVQLSGLTWEGRAHCGLDDARNTARLLALLMHRGFKFSITNSLVWQSAPQSITCQSSPAHSPYPNQSHHKPMEVMGSPVQVNPYAGITVKKPMYCHCGVLSQIKVTYRPGPMHGRYFYGCGNWTSTRGANCDYWVWLS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..394#7773..8356#9555..9730#16806..17286#ATGGGCGGCGGCGCCGGCGCCGATGCAGTGGGCGCGCACGGTGGCCTGCGCGCGATGAGCGCCTGCATGCTCTGCAGCATGGCGGCGGCCTGCCGGCGAACGAGGAAGCCACGCACCAGCGCCTGCAGCTTCACCAGCGCCTTGAGCGCTCGCAGCGCCTTCTTCGCCTGCACAAACACACGGCATGATTACTCCATCGAAGCAGAGCTAGAACACGAGCACCCATTGCTTACCAGGAAGCCTCTGAATGCTGTCTGGATTCTGACGGCGGCGCTGATGCGCAGAGGGAGGGAGGGGGCAGCAGGCAGTGGGAGCGACGGCGGAGCACGGAGGGGGCAGCGACGGCGGCGTTGGCACACGGAGGGAGCGGCGGCAGCGCACGAAGGGAGTGACGGTAGTGGCATGCAGGAGCTGCGGCACCCACCCTGCCCCTCTCACTAATCCCATCTCATCGGCCACGTGGCACACGTGGCATGCCACGTAGGTCAGACCATGGTCAAACTAGATTTTGGACCGGGATGATACAATAAACCAAGTTTAGGGGCCTTGATGTGCGTTTTGTAAGTTTGTGGACCTAAGTGAAACCTCATGACAAGTTTAAGGACCGCTGCTGTATTTTACTCTTTTGACTATGAGGAGATATATTTGGTTCGAACCTTTACCAGATTTTGATGTGATTTAAAGGGTGGGAGATCTCAAAACTACCAAAATTTTGTATGTTAACAATGGTTGGAATACGTTTGATTTAGTTTGGTAATGATGGTTATAGTATACTAGGTGAAACCCTGCGCGTTGCTGTGGGACTTTAGTATAGTAACAATAAATAAAAATAATGTGTAGGATTTCTAGATAATATAAGATTATGTAAGTTAACGTGGTTTATGATAATTTAAATTTGAATAGTATATAGAATGATGATTTAAATGTAAAAGTATGGTGATATGACTTTATGAAAGAAGAAAAGTATTGAGATAGTTTGGACCGTAGATTAATTATCTAAAGGCTAAAAATAATTAAGGTGATATGGATTAATGAGAGAAGAAAATGAGAGAGATAATTTGGACCATAGATTATTTATTTAAGCACTTAAAAAAATTGATGTGATATGGTTTAATGAGAGAAGAGAGAAATAAATATTAATTAAGTGATGATGAACTATATATGTACATAGCATATTATAAAAAAATAATAAATATATATATTAAAATATTATGTGAATTATGTGCGATGATGATTTAACATGCTTACATTTTTGAAAGCTCGAAAATTTAATAATTTATAAAATTATAGATAATATAACATGTTTGCATGCTGTTTAAATTTAATGATTGTTAGTGGATGATGATGTGACATCTTTGCATGTTAAGTTTTAGTAGTTAGTGAGTTAATTTTATAGTAAGAGATGATTTGGTTTATTGTCCTATTAAAAATTGATAAGGTTGAAAGTGGCAACAAAACAAATATACCGGGAAATGCTACGCTGACTAGTGGAATTATTTTTCAATAAAAACTTCATACATGTATGCCTGATATATTTATGTATATGGTTAGCAGTTGACAAAAAGATATAGGAATCAATCCACCAACTAAACGTTTGTTAGGAAAATTATTATTGGTGAACAAATAAAAAGCGCTAGTCATAGCTCTCACCATTGGGGTTTTCTTCAAAATATTTGTTAGGAAAAATGGTTGATTAACAAATATAAAGTCCTTACCATAGCTCTCACTACTGTATCTTTCTTCAATGTTTGTTAGGAAAATAGTTGATTTAACAACTGTAACGTGTTTGGTATTGCTCTCAATAATGGATTTTTCTTCTACAGTCATGCATTGATCTTCCTTTTTCATACCTATCAATTATTGATTCAGCTACTAAATCAACATCCAACGACATATGCTTTCCTTTCTATCAGGATGGGACATAAAAGAAAATTGTAACATACTCCTAAGAAACTACACTTCGGTGAATATCTACAAAGGTAAATAATACTAAGACCAATAAAAAATAATAGAAATTCATATGCTTGAAACGATATAAAATAAACAAATTTAACTAAAGTCGATCATATGTGGCACTTTTGGGACATCGCTTAAAATCTTATTACACTTGCTCTTAAGAGATGGAGCCAAACATAAATACATTGTGACGGTGATATGGGCCCGGGGTATCAAGGCTATAGGGGAGAGGCTTCCCCCGGTAGCCACGTGGCCCTCCCCCAGAGGGGGTTGGGCCCGAGGCGGGGCGGCAGCCGCTCCCGCATGCCTGGGCGTCGGGCTACCCCGACCTCCTCCGCGCGGCGTCGCATGTACCGCATTTAAGGCGGTCTGAGAGAGCGCACCACGCGCCGGCGTGGTGCGCTTGACTGTTCCGTGACCGGTCTGTGACCGGTCGAATAACCGATGTGGTCGGGGTAGTGCGCCTGTGCACTGGCTCCATGTCAGGCAATCCTATCGGGAGCTTCAGCTCCACTCCACAGGCAAAACTCAACTGGGGTCTGAGCCTTGGTCCTCTAACATCGTCTTCAGCTCAGAAGCGCTACACTTCTGAAAAAGGGGAATAATAGCAAGACTGAGTACAATAACTGTACTCAGCAAGCCACACCAATGATGCAGACGTGCAATGGGATACAGCGGAGGGCTTGTGTCTATTTGCATGAAGGCGCGTTGCAAAGCATTTTATTGAGCGAAACAATAAAACAGTTGATTAATTAAGGTAATATTAAAGTTGCATAAATCATCGATATCTACAACTTTTATTTTGGTCATTTTGCTATATGACTCTATTTCAATAATTTGAATTTGAATTTCAAATTATGACAACTTCAAACATTATTTTCAAATACTAAATGATTTCAACTGAAAAAGTTATCAACATCAAAGTTGTATAACTCATCAATATCTATAACTTTTATTTTAGTCATTTCTTCATCCGATGAAGTGATAGTAATATTGTTCACAAAATTTACATATCTCTTATATGGTTTTGAAGTATTTAAATAGCAACGAAATTGCTATAATGTCACAGGCTTTGGGCCAGTTTATGACGAAATCGATAAACTGTCACGGTATTATGGGCCTTGTATCCATAGTTGCATATCCGTGACGATATCTAAAAACATCACGAAAATTTCGTCACAGATTAAATAGATTCTTGTAGTGGCGGTTGCAAAGCATTTTATTGAGCGAAACAATAAAACAATTGATTAATTAAGGTAATATTAAATCTCCACTGATCAACGCTACACCATGTTGAACAGGCCCAACCAAACCACCTAAACTACCTAGTTCATTAAGCCAGTTAAAGGTGAGACTAATCACGGTGAATATGGTCGATCGCCCATAACCGCGGGCACGGCTATTCGAATAGTTTTACTCTTGCCAGAGGTGCACAACTATACCCACAAGTCACAATCCACCGGCATGTCACCGTGCCTACGCAGACACATCACTATGTTGAGTGATTGTGACAAGACCCTTCACATAACCCTCCCCTAACCATCCACACCACGCAAAGGATTCACCCCCACCCCTACCCCGGAGGTGGGCAGTCCCCTCGTGCATCGCGGTGAATTTGGCATCTGGAAAACCGGACACCCCGTTCGACCCAACTCCATCACGCCCACCCTCGCCACCGGTGCCTAGGAAAGGGTCGAGCTATACTACGGATCAAGCAGTTACCTATTCCCGCTTGTGGTAAGCACCGTAAGTCTTCCAGGGTTTCCCGTGAACCGGTCCTTAATTACTATGGGCGCGACTAGCAAAACCATGCACCTACAGCCCACATTCAGCCGCATTTTAGTTGGATAATTACGACCAATGAAACATGGCCGGATGTCTCGAGCATGCAGCTCGTCAAGATACTAGATGTCTAAAACTGTAATTATCCCATTATGTGAGCTAGTGGTAATTAAGCATGGCTAAGCATGTAGTTCTAGCTAGGTCAACATAAGTAACACAAGCTAGTCGAATTATCACCCAAGTTTGACAAAGGACGGACATCAAATAATATGGCACAAGCGAGCAGATAGGTTGTACCCTTATCCCATGTAATTAGCAAAACATGCATATTTATTTGCAAACGGTAAAACATTTATAAAGTAGGCTCAATATGCTCAAGGGGGGAATGTATGACTTGCCTTGCTTCTTCAAAAGATCTTCTGAACTCTTTTCCTCGCGATCGCGAACTTCCGAAATGACGGATTTTACACACTGGCAGGCAAAACGATGAAAAACCCTAAAAACCAAGTAAACAATACATCAAAAGTAAACAAACATGTAGAGCTCAATTTAAGATGAATTTTGCAATTTGAATGGCCCAATTTAAAGTTTGAATGAATTATATATGAATTTTAGAAGTTTTGAGCCATTTAAATGGATTTCTATAATTAAACTCGATTTATTGCATAATTATTAATTATTTTTAAAGGGAAAATAGGTGGTCGCTGACGTCAGCAAAAGGGAGAAGCTTTTCGCACGTCAGCGGCTCCAAGGGAAGGGCACACGGTGGACCAAGTCCACCGCGGTCTAGGTGGCGCCGAGGACCAGGAGCACGGGCGGTCCACGGGCAGCGCCAAAATAGGCAACGAAGGAAGGGGGCTGGCTCGTCAGCCAGCTCGAACAGGCGGCGGCGGCACCCGGCCGGACGGCCAGCAGCGACGGCAGCACGACGTGGGCAAGGGGAGCAGCGGAGGAGGGGAAAAAAGAAGAGGCGGAGGGAGGCGGCGGCGCTCCGGTGACTGACGGCGACGACAGAGGGACAGCCGAGGATCAGGACGACCTAGGAAAGGTGGTGGCATGGCCGGGCGAAACCCCTCTCGCACGCGGGGAGCGGCTGAAGGCAGCCAAAGGCGGCTGTGGCTTGGGAGCGCGAGGGAGAAGGCGTTTAGGCGGTGGGTTGGAGGAGCAAAGCAGCGCCCGGGGTGGAGCTTGATGCAGCGAAGTCGA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