BGIOSGA002266
| Gene Name |
BGIOSGA002266 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:001-014-E11, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA002266, complete gene. |
| LocusTag |
OS01G0177900 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA002266-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA002266-PA |
| Length |
9358 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:4511214..4520571 |
| Sequence Coding Region |
4520276..4520571,4519614..4519734),complement(4519315..4519403,4519145..4519229),complement(4518662..4518821 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:4511214..4520571 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:4511214..4520571 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTGGGCGGCGGAGGCGGCGTTCGCGAGGTCGGGGTCGTGGAGGGAGGAGGAGGACGAGCAGGAGGCGCTGCGGTGGGCGGCGCTGCAGCGGCTGCCGACGGTGGCGCGCGCGAGGAGGGGCCTGCTCAGGTCGCCCGCGCCGGGGGAGGACCGGGTCCAGGGCGACGACGCGCTCTGCGAGGTCGACGTCGCGGGCCTCTCCCCCGGCGACCGCACCGCCCTCGTCGATCGCCTCCTCGCCGACTCCGGCGACGTTGAGGACTTCTTCCGCCGCATCCGCTCCCGCTTCGACGCAGTGCAGATAGAGTTCCCCAAGATCGAAGTGAGGTACGAGGATCTGACAGTGGACGCATACGTGCATGTCGGGAGCAGGGCGCTGCCAACCATCCCAAACTTCATTTGCAACATGACAGAGGCATTTCTGAGGCATTTGAGGATCTATCGAGGGGGAAGAGTGAAGTTGCCGATATTGGATAATGTTAGTGGGATCATTCGTCCATCAAGAATGACACTGCTATTGGGCCCTCCAAGTTCAGGAAAGACAACCTTGCTTTTAGCCCTTGCCGGACGGCTTGGCCCTGGACTAAAGGTGTCTGGAAATATCACTTACAACGGCCATCATCTGAATGAATTTGTGCCCCAGAGAACATCTGCTTATGTCAGTCAGCAAGACTGGCATGCCTCAGAGATGACGGTCAGAGAAACCTTAGAGTTTGCTGGGCGCTGTCAGGGTGTTGGAATAAAGTATGATATGCTCGTTGAACTCTTGAGGAGAGAAAAGAATGAAGGTATAAAACCCGATGAGGACCTTGATGTGTTCATGAAGGCATTGGCTCTTGAGGGGAAGCAGACAAGCCTTGTCGCAGAATATATAATGAAGATTTTAGGGCTGGACATTTGTGCGGACACAATTGTTGGTGATGAAATGATCAAAGGAATCTCTGGGGGACAAAAGAAGCGCCTGACAACAGGTGAGCTGTTAGTTGGTTCTGCTCGTGTGCTGTTCATGGATGAGATATCTACTGGACTTGACAGTGCAACCACATATCAGATTATCAAGTATTTAAGGCATTCTACTCATGCTCTTGACGGCACTACAATCATATCCTTGTTGCAACCAGCTCCAGAAACTTACGAACTATTTGACGATGTCATCCTCATATCTGAAGGGCAAATTGTATATCAGGGACCACGTGAATATGCTGTTGATTTTTTTGCCGGTATGGGATTCAGATGTCCTGAAAGAAAAAACGTCGCTGACTTCTTGCAAGAAGTTTTGTCCAAGAAAGACCAGCAACAATATTGGTGCCACTATGATTATCCTTACCAGTATGTCTCTGTATCAAAATTTGCTGAAGCCTTTAAAACATTTGTTATTGGCAAGAGGCTGCACGATGAGTTAGCAGTTCCATACAATAGACATCGCAATCATCCCGCAGCTCTTTCAACATCAAATTATGGTGTAAGGAGGCTTGAGCTTCTAAAGTCCAACTTTCAATGGCAGCATCTGCTGATGAAAAGGAATTCGTTCATCTATGTCTTCAAATTCATTCAGCTTTTACTTGTTGCCCTCATCACAATGACAGTGTTTTTCCGATCAACAATGCACCGTGACTCAGTTGATGATGGGATTATTTATCTTGGAGCCCTCTATTTTGCAATAGTGATGATTCTATTTAATGGCTTTACTGAAGTCTCACTCTTGGTCACGAAGCTTCCAATTCTTTACAAGCACAGGGATTTGCACTTCTACCCTCCATGGGCTTACACACTTCCGTCTTGGCTCTTGAGCATTCCAACCTCGCTTATTGAATCAGGAATGTGGGTACTAGTAACATATTATGTGGTCGGCTATGATCCCCAATTTACAAGATGTCTTGGACAATTTCTCTTGCTCTTTTTTCTACACCAAACATCTTTGGCTCTTTTCCGGGTCATGGCATCTTTGGGTCGGAACATGATAGTCGCTAACACCTTTGGATCGTTTGCTTTGTTGGTTGTTATGATCCTTGGAGGATTCATTATAACCAAAGAGAGCATACCAGCCTGGTGGATTTGGGGTTATTGGATATCTCCTATGATGTATGCACAAAATGCTATTTCCGTAAATGAATTCCTTGGCCATTCTTGGAGCCAGCAATTTGCAAACCAGAACATCACATTAGGGGAGGCAATACTCACTGGATATGGATTATTCAAGGAGAAATACTGGTTCTGGATTGGGGTTGGAGCATTGTTTGGTTATGCAATTGTTTTGAACTTCTTATTCACATTGTTCTTGACTCTTCTCAACCCTATTGGGAATATACAAGCTGTTGTGTCCAAAGATGATATTCAGCATAGGGCTCCTAGGAGGAAGAATGGCAAATTAGCCCTAGAGCTAAGATCTTACCTGCACTCAGCTTCATTGAATGGGCATAATCTCAAGGACCAGAAGGGCATGGTGTTACCATTTCAACCCCTTTCTATGTGCTTTAAGAACATCAACTACTACGTTGATGTACCAGCGGAATTGAAAAGTCAAGGTATAGTAGAAGACCGCCTACAGTTGCTTATTGATGTCACTGGAGCATTTAGGCCAGGGATACTAACAGCACTTGTTGGAGTAAGTGGAGCTGGCAAAACCACCCTCATGGATGTTTTAGCTGGCCGGAAAACTGGAGGACTAATAGAAGGAAGCATCACTATATCTGGGTATCCTAAAAACCAAGAGACTTTCACTAGGATCTCTGGTTATTGTGAACAAAATGATGTGCATTCACCTTGCTTGACTGTAATTGAGTCATTGCTGTACTCTGCATGCCTCCGATTGCCTTCTCATGTTGATGTGAACACTCGAAGGGTTTTTGTTGAAGAGGTGATGGAACTTGTTGAGCTAAATGCATTAAGTGGTGCTCTTGTTGGCCTACCAGGAGTGAATGGTCTGTCAACTGAACAACGCAAGAGGTTGACGATAGCTGTGGAGCTTGTGGCAAATCCTTCAATCGTGTTCATGGATGAACCTACATCAGGATTGGATGCTAGGTCAGCAGCTATTGTGATGAGAACCGTACGGAATATTGTTAATACAGGACGGACAATTGTGTGCACCATCCATCAGCCAAGCATCGACATATTCGAGTCATTTGATGAGGGAAACCGCGAAATTTTCTTATACAAGTATGTACTAACATTTAACCAGCACCCTCTCCTAACTCATTCATATGCTGGTCAGCTTTTGTTCATGAAGCGTGGGGGGCAACTTATATATGCTGGTCCCTTGGGCTCGAAATCACGCAATCTGGTCGAGTTTTTTGAGGCAATTCCAGGAGTTCCTAAAATCAGGGATGGCTATAATCCTGCTGCATGGATGTTGGAAGTCACAAGTACTCAAATGGAGCAAATTCTTGGAGTGGATTTTGCTGAATACTACCGGCAGTCAAAATTATTTCAGCAGACCCAAGAAATGGTTGATATCCTGAGCAGACCAAGAAGAGAATCAAAAGAACTTACTTTTGCCACCAAGTATTCCCAACCATTCTTTGCTCAATATGCTGCTTGCTTATGGAAGCAGAACCTGTCGTACTGGAGAAATCCTCAATACACTGCGGTCCGATTCTTCTACACCGTCATCATTTCCTTGATGTTCGGGACAATCTGCTGGAAATTTGGGTCTCGAAGGGAGACCCAACATGACATATTCAATGCCATGGGTGCCATGTACGCAGCAGTACTCTTCATAGGAATCACTAACGCCACCTCTGTTCAACCTGTGATTTCCATCGAAAGATTTGTCTCGTACAGAGAGAGGGCAGCTGGGATGTACTCGGCACTGCCTTTTGCATTCTCCCTGGTTACAGTGGAGTTCCCTTACATTCTTGTGCAGTCACTTATCTACGGCACGATTTTCTACAGCTTGGGCTCGTTCGAGTGGACAGCAGTGAAGTTCTTGTGGTACCTGTTCTTCATGTACTTCACCTTGCTGTACTTCACTTTCTATGGCATGATGACAACGGCGATCACTCCCAACCACACTGTTGCGCCTATTATTGCTGCTCCATTCTACACGCTGTGGAATCTCTTCTGTGGGTTCATGATCCCAAGAAAGAGGATTCCTGCGTGGTGGAGGTGGTATTACTGGGCCAACCCGGTGTCATGGACCCTGTACGGCCTGCTAACCTCCCAGTTCGGCGACCTGGATCAGCCGCTGCTGCTCGCCGACGGCATCACCACCACCACCGCCGTCGACTTCCTCCGGGACCACTTCGGCTTCCGCCACGACTTCCTCGGCGTCGTCGCCGGCATGGTCGCCGGCTTCTGCGTGCTCTTCGCCGTCGTCTTCGCCCTGGCCATCAAGTACCTCAACTTCCAGAGAAGATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MWAAEAAFARSGSWREEEDEQEALRWAALQRLPTVARARRGLLRSPAPGEDRVQGDDALCEVDVAGLSPGDRTALVDRLLADSGDVEDFFRRIRSRFDAVQIEFPKIEVRYEDLTVDAYVHVGSRALPTIPNFICNMTEAFLRHLRIYRGGRVKLPILDNVSGIIRPSRMTLLLGPPSSGKTTLLLALAGRLGPGLKVSGNITYNGHHLNEFVPQRTSAYVSQQDWHASEMTVRETLEFAGRCQGVGIKYDMLVELLRREKNEGIKPDEDLDVFMKALALEGKQTSLVAEYIMKILGLDICADTIVGDEMIKGISGGQKKRLTTGELLVGSARVLFMDEISTGLDSATTYQIIKYLRHSTHALDGTTIISLLQPAPETYELFDDVILISEGQIVYQGPREYAVDFFAGMGFRCPERKNVADFLQEVLSKKDQQQYWCHYDYPYQYVSVSKFAEAFKTFVIGKRLHDELAVPYNRHRNHPAALSTSNYGVRRLELLKSNFQWQHLLMKRNSFIYVFKFIQLLLVALITMTVFFRSTMHRDSVDDGIIYLGALYFAIVMILFNGFTEVSLLVTKLPILYKHRDLHFYPPWAYTLPSWLLSIPTSLIESGMWVLVTYYVVGYDPQFTRCLGQFLLLFFLHQTSLALFRVMASLGRNMIVANTFGSFALLVVMILGGFIITKESIPAWWIWGYWISPMMYAQNAISVNEFLGHSWSQQFANQNITLGEAILTGYGLFKEKYWFWIGVGALFGYAIVLNFLFTLFLTLLNPIGNIQAVVSKDDIQHRAPRRKNGKLALELRSYLHSASLNGHNLKDQKGMVLPFQPLSMCFKNINYYVDVPAELKSQGIVEDRLQLLIDVTGAFRPGILTALVGVSGAGKTTLMDVLAGRKTGGLIEGSITISGYPKNQETFTRISGYCEQNDVHSPCLTVIESLLYSACLRLPSHVDVNTRRVFVEEVMELVELNALSGALVGLPGVNGLSTEQRKRLTIAVELVANPSIVFMDEPTSGLDARSAAIVMRTVRNIVNTGRTIVCTIHQPSIDIFESFDEGNREIFLYKYVLTFNQHPLLTHSYAGQLLFMKRGGQLIYAGPLGSKSRNLVEFFEAIPGVPKIRDGYNPAAWMLEVTSTQMEQILGVDFAEYYRQSKLFQQTQEMVDILSRPRRESKELTFATKYSQPFFAQYAACLWKQNLSYWRNPQYTAVRFFYTVIISLMFGTICWKFGSRRETQHDIFNAMGAMYAAVLFIGITNATSVQPVISIERFVSYRERAAGMYSALPFAFSLVTVEFPYILVQSLIYGTIFYSLGSFEWTAVKFLWYLFFMYFTLLYFTFYGMMTTAITPNHTVAPIIAAPFYTLWNLFCGFMIPRKRIPAWWRWYYWANPVSWTLYGLLTSQFGDLDQPLLLADGITTTTAVDFLRDHFGFRHDFLGVVAGMVAGFCVLFAVVFALAIKYLNFQRR</aaseq> |
| Gene Sequence |
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