Os11g0429100

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Gene Name

Os11g0429100

Description

Similar to NBS-LRR type resistance protein (Fragment)

Version

NM_001074317.1 GI:115485282 GeneID:4350389

Length

5637 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os11g0429100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:15567607..15573243

Sequence Coding Region

15567607..15567670,15567933..15568016,15568913..15569112,15569344..15573243

Expression

GEO Profiles:Os11g0429100

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggatgtggtgggggcggcgtcctggctggttcaggtcgtcctggagaagctcgtcggcgacggcatcgacgccgcctgggccgcggcgcgcgccgggggggacccgggccgcgcccacggcggcgacgtccgccgcctcggctcccgcctccagagcctccacgccctcctctccgaggcccaagagcacgcgcccatggcacgcaggcgcagcgaggccctccttcgctctctccgtagcctggagagcctcgccaccgatgctgacaacctgctcgacgaaatgctgtaccaccaaatccaccgacggctacatccggacgagcctagtacctcctccaactcttgctcctcattgtttgcagtccaactagtggagcccaataatcgcgttgccaagagggtgcgccatagtggagatggcgataccaccggtagaattaaagacatcctagagcggatgtgtgaagccggagatgatgttcgtgaggcaatcaagatggagaaactggacgtcagtgccgctgggggaggccaagatgatcgtataattcaacggaggccaacaacatcttactccactgagccaaaggtgtttgggagggacaccgtgaaggatcgcattgtggtgatgttgattagctcagagacatgtggtgctgatttggcagtccttccaattgtggggaatggtggcgttggtaaaactacactggcacagctagtctacagtgacacaagagtgcaagctcaattcagcaagcgaatatggatttcagtgtctgttgacttcgatgaagttaggcttactcgtgagctactcgattgtgtgtccaatggtgtcaataagcatggtggtatcactaacctgaataagctccaagagattcttgaggaggatcttaagtccgagcggctactccttgttttggatgacatgtgggaagacaatgataaaagccgttggaacaagctattagcacctctgagatgtagttcattgaggggcaatgcaatcttggttacaacaagaaatcactctgtagtaaagatgattgctacaatggatcctatccatttggatggtttggaagatggtgacttttggcttctgttcaaggcatgtgcatttggtgatgaaaaatatgaagggcatccaagtttgcaggttattgggaagtgcatagctaacaagttgaagggttatcccttagctgcaaaaagtgttggtgcccttttgaatagagaccttgatggtgggcattggatgagcatattgcaaagtgacgaatggaaactgcagagaggacctgatgatatcattccagcattgatgcttagttacatacacttgccttttcatctacaaaggtgtttttcttactgtgcattgtttcctaagggtcacaggtttgatggcttagatttggtccgtgtttggatatcacaaggttttgtttcttcgaacaataagaaaatggaggacattggccatcaatatttgaatgatttagtggattgtggattttttcaaagaagcacatactattctatgcacgacctgattcatgacctggcacatattgtttcagcagatgaatgccatatgattgatggttttaattcaagtggaatagctcagtcaaccattcaacatttatctattaatacaaggtatgcttataagtgggatgtatattcccagaagttttattcaaaagatgacttccagaggaagcttacttatgttggtgaaacagtgcaaaccaggaacttgagtacattaatgctatttggaaagtatgacgcagacttttctgaaactttttcccatatttttaaagaagtgcaatatcttcgtgttctgaggctacccacgctcacttatagcatagactatttactctctaacttcagcaaattgatccatcttcgctaccttgagctaatatccagtggtcctggtggacccttgccagaggttatatgtcagctttatcatctacaggtccttgatgtcgagtactgggtacacctctccactttaccaagagccatgaatgatcttgtcaacttgaggcattttgttgcccgtggtgaattgcacgcactgattgctggagttgggagattaaagtttctccaggagttaaaggaattccgagttggaaagactactgactttcagattggacagttgaatggattaagggaattgggaggatcattagcaatttacaatctagagaacatatgtagcaaagaggagtctaagaatgctggattaagggataaaatatacctaaaggatttgttgctatcatggtgtagcaaccgatttgaggtaagttctgttatcgaggaagaggtgcttgagagccttcaaccacactctgggcttaagtgtctaagtataaatggctatggaggtatttcttgcccaacatggttgagctccattaatccactcatcagcttagagactatctgtctagatagttgcacaaaatgggaggtccttccaccgcttgggcaatttccactccttagaacactgcatttgattcagttgccttcttcaagggttgtaccaactgtatccagtgacgactggactggttctgaaaaacatattatatttccatgcctagaagaacttgtgataagggattgccctgaactaaggacattaggattgtcaccatgctcttttgaaactgaaggctctcacacatttggccgtctccatcatgctactatctataactgtcctcaactaatgaatttaccacaatttggtcagacaaaatatttgtccacaatatctattgagggagtaggatcatttccttacatccgattgtttgtgcgagcattgtatatcaagggatgcgctagcccaagtaaattggatcaaatattaatgttgattgagggcaacctatgtcttcttgagaaattaacgattgagagttgcctcgatcttacatatttgccatggaaaacactcagcaaacttgtctctttggagatgctggtaattgtggactgcccaaggctttctttgactttatatccatataaccaagatgggggtaatttttctttcatgtcattgctcaacaagcttgtaatccgagcatgtagcattacagggaagcagttatctcacttgatcttacagttgcccttccttcattacttgacaattggaaagtgcccaaagataacatccttgttgcttggtgatgtgattaatgggagtgacagctcttcaacatctgattacctccaattgacaactgatggcatgttgcaaataccatctcatctcttaattcaacttcagtatttgagcatagatgactttccagatctggttctactctggaaagaaggcttccatggattcacctcacttcggaccctacacatcacaggatgcacacaacttctctcccccatgataacagaaaacaaaagatccaacaaaaactcttccctcctgccaccattactacatgaccttatggttactcatgtgcataatgagttgctacctttcttgctctcgaacctcacctcgttatccatatttgcaatatctaacagtccagagttaacatcccttgttcttcattcttgcacatctttagaaactttgatcattgagaaatgtgttgggctgtctgctctagagggtttgcattccctccccaaacttaagcatctacggatttttcaatgccctagtttggctaaaacatggggcccttcctcagtggacaggccaggtttctctttatatctagacaagcttgaaattgataccactgtgttatttaacacagaagtttgcaagaagcttccatctcttcgacatttagtgtttttcatgttgtcaatcaaggcttgtccaggaattaaatcattgccagaaaatggcctcccagcttccttacacgagctctacgtgagcagttgcagtgcagaactaaaggagcagtgcaagaagacaaaaaatgttagatgtgtttatgttgatagaaatgcaagcaaattcatagttatatgcaagctgctacgtctctattttaggatcaccaagctgggagcatggcagcgatcactatggctgcaatcaagaactgggggaagcaatgagctcatggtcctaaccaaagtcctatttactatcgccactacagttgttttcagaactggactagtcatctctgaactctga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDVVGAASWLVQVVLEKLVGDGIDAAWAAARAGGDPGRAHGGDV RRLGSRLQSLHALLSEAQEHAPMARRRSEALLRSLRSLESLATDADNLLDEMLYHQIH RRLHPDEPSTSSNSCSSLFAVQLVEPNNRVAKRVRHSGDGDTTGRIKDILERMCEAGD DVREAIKMEKLDVSAAGGGQDDRIIQRRPTTSYSTEPKVFGRDTVKDRIVVMLISSET CGADLAVLPIVGNGGVGKTTLAQLVYSDTRVQAQFSKRIWISVSVDFDEVRLTRELLD CVSNGVNKHGGITNLNKLQEILEEDLKSERLLLVLDDMWEDNDKSRWNKLLAPLRCSS LRGNAILVTTRNHSVVKMIATMDPIHLDGLEDGDFWLLFKACAFGDEKYEGHPSLQVI GKCIANKLKGYPLAAKSVGALLNRDLDGGHWMSILQSDEWKLQRGPDDIIPALMLSYI HLPFHLQRCFSYCALFPKGHRFDGLDLVRVWISQGFVSSNNKKMEDIGHQYLNDLVDC GFFQRSTYYSMHDLIHDLAHIVSADECHMIDGFNSSGIAQSTIQHLSINTRYAYKWDV YSQKFYSKDDFQRKLTYVGETVQTRNLSTLMLFGKYDADFSETFSHIFKEVQYLRVLR LPTLTYSIDYLLSNFSKLIHLRYLELISSGPGGPLPEVICQLYHLQVLDVEYWVHLST LPRAMNDLVNLRHFVARGELHALIAGVGRLKFLQELKEFRVGKTTDFQIGQLNGLREL GGSLAIYNLENICSKEESKNAGLRDKIYLKDLLLSWCSNRFEVSSVIEEEVLESLQPH SGLKCLSINGYGGISCPTWLSSINPLISLETICLDSCTKWEVLPPLGQFPLLRTLHLI QLPSSRVVPTVSSDDWTGSEKHIIFPCLEELVIRDCPELRTLGLSPCSFETEGSHTFG RLHHATIYNCPQLMNLPQFGQTKYLSTISIEGVGSFPYIRLFVRALYIKGCASPSKLD QILMLIEGNLCLLEKLTIESCLDLTYLPWKTLSKLVSLEMLVIVDCPRLSLTLYPYNQ DGGNFSFMSLLNKLVIRACSITGKQLSHLILQLPFLHYLTIGKCPKITSLLLGDVING SDSSSTSDYLQLTTDGMLQIPSHLLIQLQYLSIDDFPDLVLLWKEGFHGFTSLRTLHI TGCTQLLSPMITENKRSNKNSSLLPPLLHDLMVTHVHNELLPFLLSNLTSLSIFAISN SPELTSLVLHSCTSLETLIIEKCVGLSALEGLHSLPKLKHLRIFQCPSLAKTWGPSSV DRPGFSLYLDKLEIDTTVLFNTEVCKKLPSLRHLVFFMLSIKACPGIKSLPENGLPAS LHELYVSSCSAELKEQCKKTKNVRCVYVDRNASKFIVICKLLRLYFRITKLGAWQRSL WLQSRTGGSNELMVLTKVLFTIATTVVFRTGLVISEL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>5574..5637#5228..5311#4132..4331#1..3900#atggatgtggtgggggcggcgtcctggctggttcaggtcgtcctggagaagctcgtcggcgacggcatcgacgccgcctgggccgcggcgcgcgccgggggggacccgggccgcgcccacggcggcgacgtccgccgcctcggctcccgcctccagagcctccacgccctcctctccgaggcccaagagcacgcgcccatggcacgcaggcgcagcgaggccctccttcgctctctccgtagcctggagagcctcgccaccgatgctgacaacctgctcgacgaaatgctgtaccaccaaatccaccgacggctacatccggacgagcctagtacctcctccaactcttgctcctcattgtttgcagtccaactagtggagcccaataatcgcgttgccaagagggtgcgccatagtggagatggcgataccaccggtagaattaaagacatcctagagcggatgtgtgaagccggagatgatgttcgtgaggcaatcaagatggagaaactggacgtcagtgccgctgggggaggccaagatgatcgtataattcaacggaggccaacaacatcttactccactgagccaaaggtgtttgggagggacaccgtgaaggatcgcattgtggtgatgttgattagctcagagacatgtggtgctgatttggcagtccttccaattgtggggaatggtggcgttggtaaaactacactggcacagctagtctacagtgacacaagagtgcaagctcaattcagcaagcgaatatggatttcagtgtctgttgacttcgatgaagttaggcttactcgtgagctactcgattgtgtgtccaatggtgtcaataagcatggtggtatcactaacctgaataagctccaagagattcttgaggaggatcttaagtccgagcggctactccttgttttggatgacatgtgggaagacaatgataaaagccgttggaacaagctattagcacctctgagatgtagttcattgaggggcaatgcaatcttggttacaacaagaaatcactctgtagtaaagatgattgctacaatggatcctatccatttggatggtttggaagatggtgacttttggcttctgttcaaggcatgtgcatttggtgatgaaaaatatgaagggcatccaagtttgcaggttattgggaagtgcatagctaacaagttgaagggttatcccttagctgcaaaaagtgttggtgcccttttgaatagagaccttgatggtgggcattggatgagcatattgcaaagtgacgaatggaaactgcagagaggacctgatgatatcattccagcattgatgcttagttacatacacttgccttttcatctacaaaggtgtttttcttactgtgcattgtttcctaagggtcacaggtttgatggcttagatttggtccgtgtttggatatcacaaggttttgtttcttcgaacaataagaaaatggaggacattggccatcaatatttgaatgatttagtggattgtggattttttcaaagaagcacatactattctatgcacgacctgattcatgacctggcacatattgtttcagcagatgaatgccatatgattgatggttttaattcaagtggaatagctcagtcaaccattcaacatttatctattaatacaaggtatgcttataagtgggatgtatattcccagaagttttattcaaaagatgacttccagaggaagcttacttatgttggtgaaacagtgcaaaccaggaacttgagtacattaatgctatttggaaagtatgacgcagacttttctgaaactttttcccatatttttaaagaagtgcaatatcttcgtgttctgaggctacccacgctcacttatagcatagactatttactctctaacttcagcaaattgatccatcttcgctaccttgagctaatatccagtggtcctggtggacccttgccagaggttatatgtcagctttatcatctacaggtccttgatgtcgagtactgggtacacctctccactttaccaagagccatgaatgatcttgtcaacttgaggcattttgttgcccgtggtgaattgcacgcactgattgctggagttgggagattaaagtttctccaggagttaaaggaattccgagttggaaagactactgactttcagattggacagttgaatggattaagggaattgggaggatcattagcaatttacaatctagagaacatatgtagcaaagaggagtctaagaatgctggattaagggataaaatatacctaaaggatttgttgctatcatggtgtagcaaccgatttgaggtaagttctgttatcgaggaagaggtgcttgagagccttcaaccacactctgggcttaagtgtctaagtataaatggctatggaggtatttcttgcccaacatggttgagctccattaatccactcatcagcttagagactatctgtctagatagttgcacaaaatgggaggtccttccaccgcttgggcaatttccactccttagaacactgcatttgattcagttgccttcttcaagggttgtaccaactgtatccagtgacgactggactggttctgaaaaacatattatatttccatgcctagaagaacttgtgataagggattgccctgaactaaggacattaggattgtcaccatgctcttttgaaactgaaggctctcacacatttggccgtctccatcatgctactatctataactgtcctcaactaatgaatttaccacaatttggtcagacaaaatatttgtccacaatatctattgagggagtaggatcatttccttacatccgattgtttgtgcgagcattgtatatcaagggatgcgctagcccaagtaaattggatcaaatattaatgttgattgagggcaacctatgtcttcttgagaaattaacgattgagagttgcctcgatcttacatatttgccatggaaaacactcagcaaacttgtctctttggagatgctggtaattgtggactgcccaaggctttctttgactttatatccatataaccaagatgggggtaatttttctttcatgtcattgctcaacaagcttgtaatccgagcatgtagcattacagggaagcagttatctcacttgatcttacagttgcccttccttcattacttgacaattggaaagtgcccaaagataacatccttgttgcttggtgatgtgattaatgggagtgacagctcttcaacatctgattacctccaattgacaactgatggcatgttgcaaataccatctcatctcttaattcaacttcagtatttgagcatagatgactttccagatctggttctactctggaaagaaggcttccatggattcacctcacttcggaccctacacatcacaggatgcacacaacttctctcccccatgataacagaaaacaaaagatccaacaaaaactcttccctcctgccaccattactacatgaccttatggttactcatgtgcataatgagttgctacctttcttgctctcgaacctcacctcgttatccatatttgcaatatctaacagtccagagttaacatcccttgttcttcattcttgcacatctttagaaactttgatcattgagaaatgtgttgggctgtctgctctagagggtttgcattccctccccaaacttaagcatctacggatttttcaatgccctagtttggctaaaacatggggcccttcctcagtggacaggccaggtttctctttatatctagacaagcttgaaattgataccactgtgttatttaacacagaagtttgcaagaagcttccatctcttcgacatttagtgtttttcatggtaactattaacacaattagtcaataatttcgttggaacagataaacttgctcaatatacagtggtttctcatcacttcattttttgcaggcaaagaatgtgagatccttcacagaagaagaagaaaaagcactttgtcacctcacatctctccatgtacttgatttttgttattgccctaatctcctatcactgcctaaaatgttgcattgcctttcttccctgaagcagttgtcaatcaaggcttgtccaggaattaaatcattgccagaaaatggcctcccagcttccttacacgagctctacgtgagcagttgcagtgcagaactaaaggagcagtgcaagaagacaaaaaatgttagatgtgtttatgttgatagaaatgcaagcaaattcatagttatatgcaagctgctacgtctctattttaggtattattttacagttttaaaaagattagcaattttattttgtgttttagacactcgtggaatgggtgctctctgtataattgttttaactgtatcaattgattagtatttatttttgttgaataactggtattgctaacctcagtttattttttgccaacctggttcatttgtaggaaacggaagagatgagaaaaatgagaactactagttatgaatgaaccttcagtttctcaatttataaaaggcatgcctatgcttcgcttaattgattattttttgtcacaagaggaggatagaagatattactgatgaaggttcacatgcagatgaattcaataaaccttgtgtgcactcaaccattctgtttaatatagtagtctcctcagatatctgtaactggatggagcttgaaatgaagatgccatgacttcagcagattagttaggctgcttcatcaccagctggatcaataactactgtctacatgaagtcaagacaacacaaggtgtggctacacttctttgcagaagatttgtttcaattgcgtttgccattattttgtattaaatcatcttttcataacaacaaataaatatttatttgcgatacct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External Link(s)

NCBI Gene:Os11g0429100, RefSeq:Os11g0429100