BGIOSGA002548
| Gene Name |
BGIOSGA002548 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA002548, complete gene. |
| LocusTag |
OS01G0106900 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA002548-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA002548-PA |
| Length |
5478 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:461957..467434 |
| Sequence Coding Region |
467344..467434,466151..466332),complement(465786..465872,465561..465686),complement(465416..465478 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:461957..467434 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:461957..467434 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGCTCAAGGTCGTCTCTTTCCCCGGGGACTTGGCCGCGGTCTCATTCCTCGACTCCAACAGAGGAGGAGCTTTCAACCAGCTCAAAGTGGACCTCCCGTTTCAAACGAGGGACAGAAGAGCAGTTTCCCTGAGAAGGACTTGCTGTTCAATGCAACAGGCTCCACCACCAGCATGGCCTGGTCGAGCCGTTGTTGAACCTGGGAGGAGGTCATGGGATGGCCCCAAGCCTATCTCAATTGTTGGCTCAACCGGTTCTATTGGCACACAGACATTGGACATAGTTGCGGAGAATCCAGATAAATTCCGGGTTGTTGCTCTTGCTGCTGGCTCCAATGTGACTCTTCTAGCTGATCAGGTGAAAACATTCAAACCAAAGCTTGTTGCTGTAAGAAATGAGTCATTAGTTGATGAGCTAAAGGAAGCCTTAGCTGATTGTGATTGGAAGCCAGAAATTATTCCTGGTGAGCAAGGTGTCATAGAGGTTGCTCGCCACCCAGATGCAGTTACAGTTGTTACTGGGATAGTAGGGTGTGCAGGACTGAAGCCTACAGTTGCTGCAATTGAAGCTGGGAAAGATATAGCATTGGCGAACAAAGAGACACTTATTGCAGGTGGTCCTTTTGTGCTTCCCCTTGCACAAAAGCACAAAGTGAAAATACTTCCTGCTGATTCTGAGCACTCTGCTATATTTCAGTGTATACAAGGCTTGCCCGAAGGAGCACTTCGCCGCATTATTTTGACTGCATCAGGTGGTGCTTTCAGGGACTGGCCAGTTGACAAGTTGAAAGAAGTAAAAGTTGCTGATGCTTTAAAGCACCCGAACTGGAATATGGGGAAGAAGATTACTGTAGATTCTGCTACATTATTCAACAAGGGTTTAGAAGTTATTGAAGCACATTATTTATTTGGTGCTGAATACGATGACATTGAAATTGTGATCCACCCACAATCTATCATACACTCTATGATTGAAACCCAGGATTCATCTGTGTTGGCTCAACTGGGATGGCCAGATATGCGGATACCAATCTTATACACCATGTCTTGGCCAGACAGAATCTATTGCTCAGAGATCACCTGGCCCCGACTAGATCTTTGCAAGCTGGGTTCACTGACATTCAAAGCTCCTGACAATGTGAAATACCCGTCGATGGATCTCGCCTATGCAGCTGGAAGAGCTGGGGGCACCATGACAGGAGTTCTGAGTGCTGCTAATGAGAAGGCTGTGGAGTTGTTCATCGATGAAAAGATCGGGTACCTGGACATTTTCAAGGTGGTGGAGCTGACATGCGACGCTCATCGGAATGAGCTAGTAACAAGGCCATCACTGGAGGAGATCATACATTATGATCTGTGGGCGAGGGAGTATGCTGCCAGCCTACAGCCATCCACTGGCCTCAGCCCTGTACCTGTCTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MALKVVSFPGDLAAVSFLDSNRGGAFNQLKVDLPFQTRDRRAVSLRRTCCSMQQAPPPAWPGRAVVEPGRRSWDGPKPISIVGSTGSIGTQTLDIVAENPDKFRVVALAAGSNVTLLADQVKTFKPKLVAVRNESLVDELKEALADCDWKPEIIPGEQGVIEVARHPDAVTVVTGIVGCAGLKPTVAAIEAGKDIALANKETLIAGGPFVLPLAQKHKVKILPADSEHSAIFQCIQGLPEGALRRIILTASGGAFRDWPVDKLKEVKVADALKHPNWNMGKKITVDSATLFNKGLEVIEAHYLFGAEYDDIEIVIHPQSIIHSMIETQDSSVLAQLGWPDMRIPILYTMSWPDRIYCSEITWPRLDLCKLGSLTFKAPDNVKYPSMDLAYAAGRAGGTMTGVLSAANEKAVELFIDEKIGYLDIFKVVELTCDAHRNELVTRPSLEEIIHYDLWAREYAASLQPSTGLSPVPV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..91#1103..1284#1563..1649#1749..1874#1957..2019#2724..2873#3109..3176#3256..3367#3448..3552#3722..3843#4341..4487#5310..5478#ATGGCGCTCAAGGTCGTCTCTTTCCCCGGGGACTTGGCCGCGGTCTCATTCCTCGACTCCAACAGAGGAGGAGCTTTCAACCAGCTCAAAGGTTGGATCTTTTCCTCTTTCTTATCCCCTTCCGGATCAACTTTACTGCTCTTTCTTGTTTCTTGGCCCTCGACTTGCTTCTGTTTTCCTCTCATCTTGTTTAGACTTCATTTCGTCTGTTTAGCCTGTTTCAAGATAATCCGCAGTGTGTTCAAAGAGCACCCATTCCTGGTGCCGATTAAATTAGGCACTTCTACTCACTCGACACAGCCGGCACCCATGCTGTGAGTGGGATTAGGAAAGCTGCTGCTTTTGCAAGGATTTATGCCACAATTTTGGTTTGGATTGCTTGGGCTAAAATAAAATTGGTCTTCGTTCTCACAGTGCATGGGAATGGCAGCTTCTGAGTTCTGGAGAACATAGACACACAGTCATTGTAAAGTTGCAAACTCTGTGCCTTAACTGTTTTGATTTTGACATCTGAAAAGGTGGAATTTCCCCGGTTCGCAGAAAAAAAAGGGGTCTGAATTCATTTCTTTGAGATTAAAAACGGGTTCAGATTTTTCTCTTATACGGGTATAAGACACAATTCTTCCAGAATTTATGCAACTTCCTCTTGGTCGAGAATTATGCTGTTGTCAGTATTACGTGTCTAGAATCGAACCCCTTTTTGTAATCAACTGGGTGGATTAAATTCTGAAATATCTGAGCATTATCTTCATGCTTGCAACTTCTATCTTTGGAATATCTAGTGTTCTGAGAATATATTCTGCATAGATTCCAATTCAGTTTCTACTTTCTAGTGATATGGTTCTATTCAGATGAGTTGCACTACTGTAACGTGCTTTTACTCTAAATTGCTTGGTGCACATGAAACACGCAGTCTGCCAAATTGTCAAGATCGGCCTCAATTAGCTCAGGCCTCAGGACTATTTTTTTTTTTCTGCCATGTTTCTTGAGCATATTGCAGCAAACGAGTTAGCAGAGAGTTGTAGGCACGTATATATGCCTGAACATTGATTACTAGTACTATTTTCATTCATATATCTTAATTTGGCTGTCTTTATTGCAGTGGACCTCCCGTTTCAAACGAGGGACAGAAGAGCAGTTTCCCTGAGAAGGACTTGCTGTTCAATGCAACAGGCTCCACCACCAGCATGGCCTGGTCGAGCCGTTGTTGAACCTGGGAGGAGGTCATGGGATGGCCCCAAGCCTATCTCAATTGTTGGCTCAACCGGTTCTATTGGCACACAGGTAAATGGAACATCAAGATCTAAGATTAACGGATGGAAATTAATACTCCATACCTTTTTTATATCTGTCAGTTGTGCTAGTACATCAATGTTTGGTCAATTAGTTCATCTAAGAGTAAATGTTTGACCTATTTATCTGATGATACGAGTTGACCCTTTCAAGATCAATCAACATGTCTTGAGCTATTCATTGAAATTAGTTGGACATGAAAATGCGACGTTTATATTCTGTGGTACTAATAGTGTTTTATCTTTTCTTTTCTTTGCATAACTTAAAAGACATTGGACATAGTTGCGGAGAATCCAGATAAATTCCGGGTTGTTGCTCTTGCTGCTGGCTCCAATGTGACTCTTCTAGCTGATCAGGTATAATGATTTTGTGAGGAAAATATCCCTTCTTTCGACCTTTCATGGTAGGATTATGGACATGAAAGTTAACTGAATATAGGTTGTTTAACTAAACAGGTGAAAACATTCAAACCAAAGCTTGTTGCTGTAAGAAATGAGTCATTAGTTGATGAGCTAAAGGAAGCCTTAGCTGATTGTGATTGGAAGCCAGAAATTATTCCTGGTGAGCAAGGTGTCATAGAGGTGAGTTTTTCATGTCATATTTATGTTTAAATAGCTGATGCTTTGCTGTGAATTTTATAAAGATTCAACTCTCATATAATAGGTTGCTCGCCACCCAGATGCAGTTACAGTTGTTACTGGGATAGTAGGGTGTGCAGGACTGAAGGTAATCTTTCTTTTTATATTGCATATTCTTTGCTCTGCTTCCTTTAATATTAGGTGTTAATATTACAAAAACTCAATTATTTCTTTGATGTTTCAACAAGTATATTCAAGAATTTATTGAGAAAGAAATGAAAATATATGTGCTTGAAAATTATATTCCCAGTGTTATATTACCATAACAACAGGCCATTTTAAACATATAGTACTGAAACACTTGGAATACATACGTTATTATGGTTACATGAATGTACTTGCAATTTTTCAAGGCGAGTATGTTTGAATTGGAAGAGCTCATGCCAAAACAGTCCTTTTGTAGAGTTGCTGATTATCTACTCAAAAGTGTCTAGCAATTTGAGATTTTTTTTAATAGAGTTCTGATGCACCAAAAAATAAAGTTTGATATGCAACAACTAAAACGGTAGTGGTACATATATCCTATTCTTATCTTGTAGAACATTCGTGCATGGACCGTTTTGTATATCAGGTCACCCATCATACCTTGATGATGCTACTTTTAGACTACTCAATATCTTGATCTTCTTTTTGGTACTTATTTCTTAAAAGTTTGATTTATCTAGACGAATGAGTTGTGTAGCCAAACGAAAGAATTGAATGCTTGCTGAAGTTCTGTATGCATGCAAACTACATTACCAGAATCTGGCACCACTTGCTGATTTGCCTACTTAAATTTCTTTGCTCTGCCAGCCTACAGTTGCTGCAATTGAAGCTGGGAAAGATATAGCATTGGCGAACAAAGAGACACTTATTGCAGGTGGTCCTTTTGTGCTTCCCCTTGCACAAAAGCACAAAGTGAAAATACTTCCTGCTGATTCTGAGCACTCTGCTATATTTCAGGTACCACAGAAAATAAATTACCTGTAACTAATTTTACTTGGTTCATCTGATATAAGTTTGGTGTAAGGTTGTGATAGTCTGGTACGTACTCAACGTTGCCTGTTCAAAAACCTCTTATACACTAGTGGCTTTATCTTTAACACTTAAACAAAGTAGCAGTAAGATGTATGTTGCTTGTTATAGTTTACTGTTGTTCTATTATATGCTGATTTGCAGTTTCCCTCTACTATCATAGTGTATACAAGGCTTGCCCGAAGGAGCACTTCGCCGCATTATTTTGACTGCATCAGGTGGTGCTTTCAGGTAAATCTACTGACATACATGTTATATATGTTTTTCTACTGGACATTGGACTCCATCTTATATCCATTGATGATGTCAGGGACTGGCCAGTTGACAAGTTGAAAGAAGTAAAAGTTGCTGATGCTTTAAAGCACCCGAACTGGAATATGGGGAAGAAGATTACTGTAGATTCTGCTACATTATTCAACAAGGTGTTTGCAGTAAACTTTCAGAATTTTACTGAGGTCATGTTGGCAGTATTTGCACTAAAATGATCACTTGATTCATACAGGGTTTAGAAGTTATTGAAGCACATTATTTATTTGGTGCTGAATACGATGACATTGAAATTGTGATCCACCCACAATCTATCATACACTCTATGATTGAAACCCAGGTGAGTCCTACAGCACAGCTATGGAAAATGTTTAGCGGTTATGCTCAACTGCAGTGGATTTTAAACTGTTAATGCATGCACACTTAATCCTGATATGGCAACCGTATTTTCATGTTTACGTTTGGCTTAATATTTTTTTTCAAGTATTCATGAAGTTCTGTTTCTCCAGGATTCATCTGTGTTGGCTCAACTGGGATGGCCAGATATGCGGATACCAATCTTATACACCATGTCTTGGCCAGACAGAATCTATTGCTCAGAGATCACCTGGCCCCGACTAGATCTTTGCAAGTACAGGCTCTTCCCTTAAATGCTGTGCTACTTTTGCATTACCACTGATAATTTTGTTCGAGAATGACCTCAAAGAATTTTAGCTTTCTTATTGTTATCGCATGGTTCTCTCATAGCCCACTCAGATTATCAGTAAGCTTGAGCAGCCATCCTATAACAGTTAATATGTGGATCTACTCTACTTAAATTCAATGAAGCTCGTATCGAACCTTCATACAAAGTTCAATGGATTGATTAAGTCCCTTTTGGCTGGTTGGTTACCAGTGATACGCAAGTAGTTAACGCTTGTAATGAATTATGCTTTGGTTGTTAGGCATGAACGCTGCTTCATGTTACTAGCTATATTTTGGGACGAAGGGAGTAGTAATAAATTTAAAGAATAAAAGGTTAATAAAGTAAAAGAACTAGATGCAACAAAAAATTGTTAAGTTATAGTACTTAACCGTGAAGACCTTTTTTCATTGCACGAAGGGTTAATTTTTAATTTGATAATGCAGGCTGGGTTCACTGACATTCAAAGCTCCTGACAATGTGAAATACCCGTCGATGGATCTCGCCTATGCAGCTGGAAGAGCTGGGGGCACCATGACAGGAGTTCTGAGTGCTGCTAATGAGAAGGCTGTGGAGTTGTTCATCGATGAAAAGTATGACACTCATCATCATCCCTTTTCCTCTTTCCATTGCATAGTGGATTCCATCGTCTGATTTTGTTTACGCACCTATTCTCTGCAATTTTAAAGGAGAATTATGTCCTGCTGATTGCAGCAATGCAGCAAAACGAATAACTGGTATCTACCAAAGTCCATAGATATCTCTTGCCCTTTGGAAAGTGCGAGCTGAAAGGAGAGAGCATACATGTCGTCAAAGCTAATATTCTCCGGCACTTTCTGAGCCTTAAGATATATCATGGATTATAATAAACCGACAACATCTTGATTGATGCTAGTAGGCCTGTTTATATATTGTAACTTGCTAGCTTAGCTGGGGGCTACCTATTGTTGTGAATGCCATGCTGT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| External Link(s) |
