Os11g0448000
| Gene Name |
Os11g0448000 |
|---|---|
| Description |
Surface protein from Gram-positive cocci, anchor region domain containing protein |
| Version |
NM_001074361.1 GI:115485370 GeneID:4350438 |
| Length |
6867 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0448000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:16784633..16791499 |
| Sequence Coding Region |
16784633..16786901,16791030..16791499 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008404:16784633..16791499 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008404:16784633..16791499 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggggagggacgcccgccgcctccccctcctccccttcctcctcctcctcctcgccgccgccgccggcgtcgccgagtcggcgaccgacgcggaagccatccacgacctggccaggtcggtcccggccctagggtgggatggcgacaacgtgtgcggcttcgagggcgtcacctgcgagcggggcggggcggggaaggtgacggagctcaacctcgccgacagggggctctccggcacgctcccggactcgctctcctccctcacctcgctcaccgcgctgcagctccaggggaacgcgctcaccggcgccgtcccttccctcgccaggatgggctccctcgcccgcctcgccctcgacggcaacgccttcacctccctcccccccgacttcctccacggcctcacctcactgcagtatctcaccatggagaacctccccctcccgccatggcccgtccccgacgccatcgccaactgctcctccctcgacaccttctccgcctccaacgcctccatctcggggcccttccccgccgtgctcgccaccctcgtttcgctcaggaacctccgcctctcctacaacaacctcaccggcgggctgccgcccgagttgtcctcgctcattgccatggagagcctgcagctcaacaaccagaggtcggatgacaagctatcgggcccaatcgatgtcatcgcctcgatgaagagcctcaagctgctgtggattcagtccaacaagttcaccggcccgatcccggatttgaacggcacgcagctggaagcgttcaatgtcagggacaatatgctcactggtgtggtgccgccctcgctgacagggttaatgagcttgaagaatgtttcactgtccaacaataattttcaggggccgaagccagcgtttgctgcgatccccgggcaagatgaggatagcgggaatgggttttgtcttaatacacctggtccatgttctccactgacaaccactcttcttcaggtggctgaagggtttggttacccgtatgagctcgccaagacgtggaaagggaatgatccatgcagtccagcctgggtcggaatcgtttgcacttcgtcggatgtgtccatgatcaacttgtctcgtaagaacttatcaggtaggatatcgcctgctttggcaaacctgactaggctcgcgaggctggatctttcgaacaataacctcacaggggtgataccggatgttttgactacattgccgagccttacagttcttaatgtcgcaaataacagactcactggcgaagtgcccaagtttaagccatcagttaatgtgcttgctcaaggaaacctgttcgggcaatcaagtggtagcagtggagggggaggtggttctgatggtgactcttcatcgtcagattctgcaggtggaggaaagtcaaagccaaatactggaatgattattggaattattgtagctgtgattattctttttgcttgcattgcgcttttggtgcatcatcgaaagaagaagaatgtagaaaagttcaggcctgtgtcaaccaaaacctctcctgctgaatctgagatgatgaagattcaggtggttggagcaaatggcattagcaatggaagcagtgcattcccaactgagctttacagccatgtgagcgctgctaacagctcaaacatttctgagctgtttgagtcccatggaatgcagttgtcagtagaagtgctgctaaaagccacaaacaacttcagtgaggactgcatcttaggtagaggggggtttggtgtggttttcaagggcaacctcaatggaaagctggtagctgtgaagaggtgcgacagtggtaccatggggactaaagggcaggaagaattcctggctgaaattgatgttcttaggaaagtaagacaccggcacttggttgcactacttggttactgcacccatggcaatgagagactcttggtctatgagtacatgtctggtggaacattacgtgagcatctctgtgatcttcagcagagtgggtttatccctcttacatggacgcagagaatgacaatagctttggatgttgctagggggatagaatatttgcatggcttggcacaggaaactttcatccatagagatcttaagccctccaatatattgttagatcaagatttgagagctaaggtttcggactttgggttggtcaagcttgccaaagatacagataagtcattgatgacaagaattgccgggacatttgggtacctcgcgcctgaatatgctactacaggaaaagttactacaaaagttgatgtgtatgcatatggtgtgatactaatggagatgattacgggaaggaaagtacttgatgattcgttacctgatgatgaaacacatcttgtaacaatcttccgaagaaatattcttgataaagagaagttcaggaagtttgtagatcccacgctggagctcagtgcagaaggttggacgagtttgctggaggtagccgaccttgcccgccactgcacagcaagagaaccataccagaggccagacatgtgccactgtgtgaaccgactatccagcctggtggatcagtggaagcctacaaacattgatgaagatgactacgagggtgagacaagcgagatgggcctccaccagcaactagagaaatggagatgtgatgatttcactatttctgactcagatacatttggctcattcaacgtgccaaggaagtacaatggataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGRDARRLPLLPFLLLLLAAAAGVAESATDAEAIHDLARSVPAL GWDGDNVCGFEGVTCERGGAGKVTELNLADRGLSGTLPDSLSSLTSLTALQLQGNALT GAVPSLARMGSLARLALDGNAFTSLPPDFLHGLTSLQYLTMENLPLPPWPVPDAIANC SSLDTFSASNASISGPFPAVLATLVSLRNLRLSYNNLTGGLPPELSSLIAMESLQLNN QRSDDKLSGPIDVIASMKSLKLLWIQSNKFTGPIPDLNGTQLEAFNVRDNMLTGVVPP SLTGLMSLKNVSLSNNNFQGPKPAFAAIPGQDEDSGNGFCLNTPGPCSPLTTTLLQVA EGFGYPYELAKTWKGNDPCSPAWVGIVCTSSDVSMINLSRKNLSGRISPALANLTRLA RLDLSNNNLTGVIPDVLTTLPSLTVLNVANNRLTGEVPKFKPSVNVLAQGNLFGQSSG SSGGGGGSDGDSSSSDSAGGGKSKPNTGMIIGIIVAVIILFACIALLVHHRKKKNVEK FRPVSTKTSPAESEMMKIQVVGANGISNGSSAFPTELYSHVSAANSSNISELFESHGM QLSVEVLLKATNNFSEDCILGRGGFGVVFKGNLNGKLVAVKRCDSGTMGTKGQEEFLA EIDVLRKVRHRHLVALLGYCTHGNERLLVYEYMSGGTLREHLCDLQQSGFIPLTWTQR MTIALDVARGIEYLHGLAQETFIHRDLKPSNILLDQDLRAKVSDFGLVKLAKDTDKSL MTRIAGTFGYLAPEYATTGKVTTKVDVYAYGVILMEMITGRKVLDDSLPDDETHLVTI FRRNILDKEKFRKFVDPTLELSAEGWTSLLEVADLARHCTAREPYQRPDMCHCVNRLS SLVDQWKPTNIDEDDYEGETSEMGLHQQLEKWRCDDFTISDSDTFGSFNVPRKYNG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..2269#6398..6867#atggggagggacgcccgccgcctccccctcctccccttcctcctcctcctcctcgccgccgccgccggcgtcgccgagtcggcgaccgacgcggaagccatccacgacctggccaggtcggtcccggccctagggtgggatggcgacaacgtgtgcggcttcgagggcgtcacctgcgagcggggcggggcggggaaggtgacggagctcaacctcgccgacagggggctctccggcacgctcccggactcgctctcctccctcacctcgctcaccgcgctgcagctccaggggaacgcgctcaccggcgccgtcccttccctcgccaggatgggctccctcgcccgcctcgccctcgacggcaacgccttcacctccctcccccccgacttcctccacggcctcacctcactgcagtatctcaccatggagaacctccccctcccgccatggcccgtccccgacgccatcgccaactgctcctccctcgacaccttctccgcctccaacgcctccatctcggggcccttccccgccgtgctcgccaccctcgtttcgctcaggaacctccgcctctcctacaacaacctcaccggcgggctgccgcccgagttgtcctcgctcattgccatggagagcctgcagctcaacaaccagaggtcggatgacaagctatcgggcccaatcgatgtcatcgcctcgatgaagagcctcaagctgctgtggattcagtccaacaagttcaccggcccgatcccggatttgaacggcacgcagctggaagcgttcaatgtcagggacaatatgctcactggtgtggtgccgccctcgctgacagggttaatgagcttgaagaatgtttcactgtccaacaataattttcaggggccgaagccagcgtttgctgcgatccccgggcaagatgaggatagcgggaatgggttttgtcttaatacacctggtccatgttctccactgacaaccactcttcttcaggtggctgaagggtttggttacccgtatgagctcgccaagacgtggaaagggaatgatccatgcagtccagcctgggtcggaatcgtttgcacttcgtcggatgtgtccatgatcaacttgtctcgtaagaacttatcaggtaggatatcgcctgctttggcaaacctgactaggctcgcgaggctggatctttcgaacaataacctcacaggggtgataccggatgttttgactacattgccgagccttacagttcttaatgtcgcaaataacagactcactggcgaagtgcccaagtttaagccatcagttaatgtgcttgctcaaggaaacctgttcgggcaatcaagtggtagcagtggagggggaggtggttctgatggtgactcttcatcgtcagattctgcaggtggaggaaagtcaaagccaaatactggaatgattattggaattattgtagctgtgattattctttttgcttgcattgcgcttttggtgcatcatcgaaagaagaagaatgtagaaaagttcaggcctgtgtcaaccaaaacctctcctgctgaatctgagatgatgaagattcaggtggttggagcaaatggcattagcaatggaagcagtgcattcccaactgagctttacagccatgtgagcgctgctaacagctcaaacatttctgagctgtttgagtcccatggaatgcagttgtcagtagaagtgctgctaaaagccacaaacaacttcagtgaggactgcatcttaggtagaggggggtttggtgtggttttcaagggcaacctcaatggaaagctggtagctgtgaagaggtgcgacagtggtaccatggggactaaagggcaggaagaattcctggctgaaattgatgttcttaggaaagtaagacaccggcacttggttgcactacttggttactgcacccatggcaatgagagactcttggtctatgagtacatgtctggtggaacattacgtgagcatctctgtgatcttcagcagagtgggtttatccctcttacatggacgcagagaatgacaatagctttggatgttgctagggggatagaatatttgcatggcttggcacaggaaactttcatccatagagatcttaagccctccaatatattgttagatcaagatttgagagctaaggtttcggactttgggttggtcaagcttgccaaagatacagataagtcattgatgacaagaattgccgggacatttgggtacctcgcgcctgaatatgctagtaagtgtacttctctctgctgttaatttttttattctaaattaccagtctgtagtttctttttgcacacttttctcctctgttacaatctgttttttttttggagtgattgcagtttgattacatttgtcttggaacaaattttcagctttgcatattcactagtatcataattcaaggacgagcacaattgtgttgcactctgacacttcctaggaggacccatagggcatttccaattagaaatgacttggccatttctataggatttcatatcacccaggaacaatgatagtaacagccattacaaagggttccttgaagaattactgattggtaggctttattcaaaatttattttgaaataggatgggttcagtcctataaatatgtgaggtgtgatttgtttaagtagtttcataagtcgaaggagctaatagcattaattgtttcatggaatctcttagtgtagtgaatttggtgttggcctaggtttctttttgtttctatccccaaaagagttctctctatagagaaacaacttgcttctctctcctctccatctctctgcctaataaaaataatgatgctgggcttatagaaactaggatacaaggttagtatagcatagggattatcgattaggaaatagaacatcgattagtaggaacatagaaatgttttatatgcatcaattattacatagatccttttgaaatgctgcacttggaattctgggcgcacctagaataatggaccagcatatggtttttttggtacatggtataatacgtggttaattgtaatgggagcattgcgcttgtgaactgcacaaagcaatgtcttggcagagtattagcattggcctcagtttgttcttttaacgtgagtagttttacctttggccttgtttgtgaaatcttgtttatgacttagaacatataagtatcttatgcaggactgaagtgtccagtgaagtattggatgtactacaatgctgtattatctagccatttacattctaggaaacaaaatatagatcttagacacctagagctttcctctcctttattctaagagcttctgtgggatgtgcagttattttatgatgtcacttttcagagtaggtgttgataagttaaccatattgcatctttttactcctgttagctggacagcactactggtttcttggatacatgagcaccattttttttataaggatgccatagtgctttgcagatcctagccttgttatgcttcttaaagtaatgcaaatttcataaccactccgtatgttgcttttttcatagtagaggtttgactaccttgttcatactatcaatccattagactaaagggtacatcaatgtaataggagagaaataaatatggaagggtaagtgggtaacccgattgtttagtctgaggggagagatcaatagtactattcataaatggttttcttcaattggggcatgtttatatcctttaattgaacagctaatatttgtgtatccttcgaacattgaacttcttactttgttgacacataatctcttgtgacaatgaacgttgcccaaaccaattatccaggtttctgctggagataattttaatctgttaagtcctcttaacggaatgggggaagagttcaaaaaaatgagggcgaaaccacaaagttgggaaagtaggggtaaaaatcacaattggagttgaaaacaggctcaattgtcactttactaggggttttattgcttttctttatccaaactctaaaacatgtctcaaatccacagccagtggttacactaatagctggtcgtatttgttagggaaacactaggtcactagttatccttgcggtgacacatttttgtattgttcattctactgttctatcaactcaagttttcacatgcatcatgtctattagcagttattccttgactgtgtacctccatgatgcagaggctggagatatcttctgttatctaaaaaagttatgttttcctagggacaggaaatgcattatcttgatattgtgaaatttggagcttctcagttcacatgttgttttttcctcctagatgcttgagcataattatgacatcaataaatcattccatagaaattattagttctggttgctgatatacttacaaagaatagctattatcaattgatatgctcagagaaaataagggtcctacttaactcatgacatgtgatcaatatagttgtagtttagtatatatgaagagccatgatacattcctgggaatacaacgaatattcccttatgtgccggtcgaggtaacttagcctggtaaaggtggtagggatggagacgagtagcagaaggatgaaaagggagtgaacagctagggaactagcacaaggtatgttgcaaggtaggaggggagagtttagttgtgagacgagcatatgcataggttgacatgggaagtccgaaacaatatattgaatgcaactagcagataacaaatatttatttgttttcaactaaaaaatcagcttcgagcacaccacatactgttgctgctggtgtgatgcttgtccttgggccttgttgagttattctatttctataggctacaagaagtttttgcattgatctataaaaaaatgctggatatgggaggaggggctctcatatcgaaatttattaagagcggtgaggctcgaacttgcgtcggctagcccacaccttgtggtgctagccggaaggcccccaggcctttcttgcattgatctatctgtttaaagtaaaaataggtgactgtttgaatttgagtaagttggagacaaatgaaaaaaaagtgactgaaacaaaatactctgatctcatggagttaatctatatgttggaagtaaatgcagatgactgtttgaatttgagtaagttggagacagatgaaaaaaaaagactgaaataaagcactaagatctcatgggattaataagttggttctggaaattttcctttttcccgagcaagtttcgtgacaattcagttggtttcccaattggcttagtttttcgtatttcaaccctaagttcattcgtccatccttaattattccgcatctaccgatctactccctccatcccaaaatgtaacaacttttgaacggatgggacacatcctagtaatacgaatctagataagggcctgcacagattcttagtactaggttgtctcatccattcaaaaattgctatactttgggacagaggtagtacataaataaaagaaaggaaaaaaatcaattctctgttccttaactcactcagttcagttttcatctctcaattgccaaactggtttaatctgtccctcaactaccaaaatgtgtaagctgtaaagtccatctcttcactctacttgatagtggttctgatcttcatagagaattggccatcaatgatccataatattctaatttactgtttgtcatatgaacctatcacttatacagtctgtatgaatgtggaccccgctatctacttaactgaaaaaccacagttaaacaggcaaagtgatttgttaaactactcactcacagccactgggatttgaaacttgtttatccatcctctaaaatgtaggtaatacaggtggtcatgttacatagttggggctacaatgaactaaatgttctgtttatttatttcttttaagttaagttactctgttatttctttttctgtttatacaaaaggatgagcttgttaatgaaaaagttcttctgaatttattctacgatttttttcgcaataaatatttgcgaaagatttactgaattctattgccattgtaagccatagtgcttagtgtgtattcattaaattcctttgtttgaatgcatctccacataaatatgtgagcacatacattatcactccatctttatttaataaagaatgggttattaatttggattttttatctatctttgagtaacattttagcggtgattataatgcatatacatgtgcctatggaaaaccaaacctttatgtgtgattgtgtgtattgtacacatttccatgtgtctcattctttgatggtgtaatgactaacatgccatcttatctttacagctacaggaaaagttactacaaaagttgatgtgtatgcatatggtgtgatactaatggagatgattacgggaaggaaagtacttgatgattcgttacctgatgatgaaacacatcttgtaacaatcttccgaagaaatattcttgataaagagaagttcaggaagtttgtagatcccacgctggagctcagtgcagaaggttggacgagtttgctggaggtagccgaccttgcccgccactgcacagcaagagaaccataccagaggccagacatgtgccactgtgtgaaccgactatccagcctggtggatcagtggaagcctacaaacattgatgaagatgactacgagggtgagacaagcgagatgggcctccaccagcaactagagaaatggagatgtgatgatttcactatttctgactcagatacatttggctcattcaacgtgccaaggaagtacaatggataa</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
