BGIOSGA002786
| Gene Name |
BGIOSGA002786 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J023078H07, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA002786, complete gene. |
| LocusTag |
OS01G0150100 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA002786-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA002786-PA |
| Length |
3779 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:3180619..3184397 |
| Sequence Coding Region |
3180619..3180783,3181872..3181947,3182049..3182107,3182218..3182357,3182899..3182954 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:3180619..3184397 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:3180619..3184397 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGAGCCGGAGCAGCCGGAGTTCGCGCGCGAGCGGCACGTGCTGTTTCTGGAGGCTATGGCGTCGGAGCTCCCCGCGGACTACGCCTCGCAGGAGGTCAACCACCTCACCCTCGCCTACTTCGCCGTCGCCGGCCTATCTCTCCTTCGTGAGCTCGACAGTGTTAACAAGGATCAAATAGCCAAATGGATTTTGTCTTTTCAAGTACATCCTAAGACAGACAATGAATTAGATAATGGACAATTTTATGGATTCTGTGGCTCTAGAACAACTCAGTTTCCCTCAACTAACATGAAGGACCCTTGCCACAATGGTAGTCATCTTGCAAGCACTTATTCTGCCCTTGCTATCCTGAAGATTGTAGGTTATGATTTAGCAAACATTGATAACAAGGTTCTTTTGTCCTCAATGAGAAACCTCCAACAGCCAGATGGAAGCTTCATGCCTACTCATATTGGTGCGGAAACAGACCTACGCTTTGTATACTGTGCAGCTGCAATCTGCTCGATGCTAAAAGATTGGACAGGAATGGACAAGGAAAAGGCCAAGCAATACATTCTTAGTTGCCAGTCATACGATGGTGGCTTTGGCTTGGTTCCTGGTTCAGAATCTCATGGTGGAGGGACATTCTGTGCTGTTGCAGCTTTGTGCCTGATGGGTTTCATTCAAGTTGATTTGGCATCAAATTTACAAGAACCATCATCAATTGATGTACGCTTGCTCCTGGAGTGGTGTCTTCAGAGACAAGCGGCAGACGGAGGTTTTCAAGGAAGAAGGAACAAATCCAGTGACACATGCTATGCATTTTGGATTGGAGGTGTCCTAAAGATCATCGGTGCATACCGCTTCATTGATCATGGTGCTTTGCGAAGTTTTTTGCTCTATTGCCAATCACCTTATGGAGGTTTTACAAAGTTTTTGTACGATCAATTCCCGGATATCTACCATTCTTACTATGGACTTGCCGCTCTTTCCTTGCTGGAAGAGGAAGGGCTGGAGCCACTCTGCACCGAACTGGGGATCCTCTCTGCTGCATTGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAEPEQPEFARERHVLFLEAMASELPADYASQEVNHLTLAYFAVAGLSLLRELDSVNKDQIAKWILSFQVHPKTDNELDNGQFYGFCGSRTTQFPSTNMKDPCHNGSHLASTYSALAILKIVGYDLANIDNKVLLSSMRNLQQPDGSFMPTHIGAETDLRFVYCAAAICSMLKDWTGMDKEKAKQYILSCQSYDGGFGLVPGSESHGGGTFCAVAALCLMGFIQVDLASNLQEPSSIDVRLLLEWCLQRQAADGGFQGRRNKSSDTCYAFWIGGVLKIIGAYRFIDHGALRSFLLYCQSPYGGFTKFLYDQFPDIYHSYYGLAALSLLEEEGLEPLCTELGILSAAL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..165#1254..1329#1431..1489#1600..1739#2281..2336#2423..2499#2598..2643#2812..2936#3294..3361#3456..3543#3636..3779#ATGGCGGAGCCGGAGCAGCCGGAGTTCGCGCGCGAGCGGCACGTGCTGTTTCTGGAGGCTATGGCGTCGGAGCTCCCCGCGGACTACGCCTCGCAGGAGGTCAACCACCTCACCCTCGCCTACTTCGCCGTCGCCGGCCTATCTCTCCTTCGTGAGCTCGACAGTGTAAGATCCCCGCTCTCCGCCTGATCTGCCCTAGCGGTTATCCTCTCGATCCGTTTCCTGAATTACGCGTAAATTCGTTTTTTTTTAGTTATTTGTTGAACTCTAGTCTAGACTAGATGTGCCCGTGTGCAAAGCTTGGATCTTTACTTTACCTTGTGTGGTCGCTTTGCTTGCATTTAGTGGAAGCAAAGTTGCATCTGTAGGAATAAAATCAATCAGCAGATTTGGTGCACTTATGGTACCATGAAGTATTTTGAAACCTCAAGGATGGCTATTGGTAGTATATTCAGAGATAAATTAGTTGCTGTATCCATAATGGGAGTTGCAATTGATCTTTATTGTGACAAACACAGGGATCCAAAGTTTGTGGATAGCAGAATGCCAAGTGTGGAAGGGTCTTTTCAATATTTTTTTTTTTTTGGAATTCCTGTAAAGAACAACCACTAGCTGCAAGGTTTAAGCACTTTAGCCCATAAGTGGTCACTGACCAGTAACCAGTCTACTCAAAGCAGTTAGAGATTATTGCGGTTAGGCAATTTGCATCTGTCCGGCAACTAGATCACAATATCACATAACTACATTCGCTTTCGATTTCTAGCCAAACTAAGAGGAAAGGGGCCCATGTGATGTTTCTGTAGCAACGAATTGGTCCACGTCCCTTAATTCGGTCTAAATTCCGTTCGTCTTTGTCTTGTCCATGGGCAGTTGCCTTAATGCTCTGCACAGTTAGGAGCCGCCTAGTTGGTTATGATTTAAGTTCATCATACTTGATGCCTTGCTCATGTAAACTACCAAAACATGATAGCCTCCTGATATCTCCATTCTCAAATTACTAGTAACTTCTAAAAAAACTTATAGCCTCATGCAAATATTTTTTTACCAGTCTTATCATGAAAATTGTACCTGTATGTATTATGTATTAAAACAAGTAACCATGCCTGGTTGCTAGCTGAAATATTTATTGTGGGAATTTAAGTTCACTTTGTGCCTTGACTGAGTTGACTCTTCAGGAAGAAGTAATATACTGAGTTGACTGAGTAGTAATTTGATGAGTTGTGTACTTGTTTGCCCTTTTATACTTTCTTTAGGTTAACAAGGATCAAATAGCCAAATGGATTTTGTCTTTTCAAGTACATCCTAAGACAGACAATGAATTAGATAATGGTGAGTTTTCCTCAGTACTTATGTAATAAAGCTCTCAAGATAGCTAATTCATATTTTTCAGATGCAATATATTCATTATATGACAATTTATATGTTTTTAGGACAATTTTATGGATTCTGTGGCTCTAGAACAACTCAGTTTCCCTCAACTAACATGAAGGTAGATGTGGCTAATTCTCAAGTCAACCCTTTTTTTTTTCACACATATCAATTTGTCATTTAATTTTTACATTCTGACAGTTTGAAATATGAATTCATGCCCTTCCTCAGGACCCTTGCCACAATGGTAGTCATCTTGCAAGCACTTATTCTGCCCTTGCTATCCTGAAGATTGTAGGTTATGATTTAGCAAACATTGATAACAAGGTTCTTTTGTCCTCAATGAGAAACCTCCAACAGCCAGATGGAAGGTATGCATTTTAGTTTTGGTCTCCATGCTAATTATTCTTGTAATTATCCTCCAAAAATATCTATGCATTTACATCTGCTACCTGTGTTTAGTTTTAACTGTACCACCAAAAGAGTTTCAGCCAACTCACATTCTGTCTTAAGATTTCATAATACCCCATAGTTGGCCCACCTCCTTGATTATTTTTTGTATGTGTTGATTGCTACCTTTCCATTTGCATATGTTTTCTCTGCATGAATTTAGTCATGCCATGTCGTTCGACAAACTTGATATTGGTAAATACCTCCTTTCTGGTATATCTCTGTATTGTTGGTCAGTCTTCAAGCTTGTTCAATCAGAATGTTAATTAATGTGCTGTGATCCTAACTGCATGCATGTGATAGAGGTGTTTGTGCATGTGCAATGCAATCTTGCTTGCCTGTGAGCATTTCATTGATTTCACTAAGATGGCTTCCATGGTTCCATTCTGCAAACAACTAAACTCCACGCACCGCTTAAATGCATTATCTTATTGGCCAACTTGAGAAACATTTTTTTTTTAGCTTCATGCCTACTCATATTGGTGCGGAAACAGACCTACGCTTTGTATACTGTGCAGGTGGGTTGCACTGTCATTTATATTTAGTATGCTTTCAATTTTATCTTTGTTTGAAATAACTTGACACACTTGTGTTGTCTTCTCAGCTGCAATCTGCTCGATGCTAAAAGATTGGACAGGAATGGACAAGGAAAAGGCCAAGCAATACATTCTTAGTTGCCAGGTTGGCTTACAACAATTCCTGATGCACTTGGTTTTGAGACACCAGTGTTTTGCACCATGCTATTTAAAATCCTTAATTCTTGTTTCTACCACATGCAGTCATACGATGGTGGCTTTGGCTTGGTTCCTGGTTCAGAATCTCATGGTACAGCTTCTTTTAACCTTTGATGTGCTTCTTGTCCTACTGAGTTTGTCATTTCATGTGGCAGTTTTCTTCAGAGTTTCAGAATGCAATAATTCAGCTAAATTTTTGTTTTATTTTTTTGGAGTCGGTTATGGGTACTCATTGTTTGTCTTTGTGTTAGTGAGTCAGGTGGAGGGACATTCTGTGCTGTTGCAGCTTTGTGCCTGATGGGTTTCATTCAAGTTGATTTGGCATCAAATTTACAAGAACCATCATCAATTGATGTACGCTTGCTCCTGGAGTGGTGTCTTCAGGTTAAATTCTGCTCAACCATATATATCTGCTATTACCATCAAAATCTGCCCTTTGATGTGATTTATAGGACTAACATATATTTCCAAAACTGGACAGACACTATATGCAGTACACCAACCCGTTTTAAATGTTTCTAATTTAGTAGATATATGCATCAACCATTCAATTTTCATTTATTCATGATGGAGAAGTGCAGCTTGCTCAATGACACCACACCATCCAGTTGTTTTTAAAATCTCCCTTATGTAGAGTAAAAAAAATGTGAATCATAAACGGATTTAGTTAGAAATGATTAATAAGGACTAGGACGACTTTACTAGTAGGGAATCTTAACTGTTTTCACTATTATCATATAGAGACAAGCGGCAGACGGAGGTTTTCAAGGAAGAAGGAACAAATCCAGTGACACATGCTATGCATTTTGGTAAATACACCATTCAGAGTTATATATACTAATTGCCTGACAATCAAATAGCAAATTTGGGTAATCTGTCTTGCTGCCAATCAACACTCTGCAGGATTGGAGGTGTCCTAAAGATCATCGGTGCATACCGCTTCATTGATCATGGTGCTTTGCGAAGTTTTTTGCTCTATTGCCAATCACCTGTAATGACTTCCTCTCTAATCAGCTTAATTTCTCACATTGATCAAGTTGCATCTTTACTGATCATGTATGCCCTTGTTTACCATTGCAACAGTATGGAGGTTTTACAAAGTTTTTGTACGATCAATTCCCGGATATCTACCATTCTTACTATGGACTTGCCGCTCTTTCCTTGCTGGAAGAGGAAGGGCTGGAGCCACTCTGCACCGAACTGGGGATCCTCTCTGCTGCATTGTAG</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
