BGIOSGA002979
| Gene Name |
BGIOSGA002979 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA002979, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0016I09.30 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA002979-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA002979-PA |
| Length |
4764 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:6355242..6360005 |
| Sequence Coding Region |
6355242..6355516,6357102..6357189,6357303..6357462,6357570..6357790,6357868..6358163 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:6355242..6360005 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:6355242..6360005 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGCTCTCGTCGGCGCGTCAGCGTCGGGCCACGGCCGCGTCGCCGCCGACCGACGACGGCTACTCCAAGGAAGCCAAGGACAGGAGGCGGCGCCCCAGCGGCGAGGAGGAGGAGGAGGGCATCCGGTGGTTCCTCCCGTTCCTCGCCCTCGGCCTCCTCCGCCACATGAGCGCGTCCTCCAACCTGATCCACGACTGCGACGAGGTGTTCAACTACTGGGAGCCCCTCCACTTCCTCCTCTACCGCTCCGGCTTCCAGACCTGGGAGTACAGTTCCAACTTTGCTCTTAGATCATATCTGTACCTTTTCATTCACGCTCTTGTAGCTGGGCCTGCTTCAATGATTTTTGGGGAGCATAAGGTTCGAGTGTTCTACTCTGTGAGAATCTTTCTTGGCCTTATATCAACTATAACAGAAACTGTTCTGGTTGTTGCTCTTTCAAGAAAATATGGAAAAAGACTTGCTTGTTATGTCCTTGCAATGCTGTGCTTAACCAGTGGCTGCTTCTTTGCCAGTACCAGTTTCTTGCCAAGTTCATTCTCCATGTATGCTGTAACACTTTCCTCTGCACTCTTCCTACTTGAGAACTATGCTGCTGCAGTCTCTGTTGCAGCTGCAGGAGTTATCCTTGGTTGGCCTTTCTCAATTTTGGTGTTTCTCCCTGTTACGGTTTACTCACTAATTAGAGGATCTTTCAGAAGAGTATTTTTATCTGGATTTCTGACTTCCATGTTCCTTCTTGTCCTTTCGGTTATTGCTGATTACTACTGCTATGGCAAATGGACAGCATCAGTGTTCAATCTTCTGAAATATAATGTGTTTGGTGGTGGTGAAAGTCACTTGTATGGAACAGAGGGGCCTTCATTCTATTTTAAGAATGGATTCAATAACTTCAATTTTGCGTTCATCTTGGCTCTGCTATTTTTGGGGTTTGTGCCATTTGCAAAGAAGAAATATGTCCCAGATCTATTGATAGTTGTATCTCCTGTCTACATTTGGTTGGCTTTCATGTCCTTGCAGGCACACAAAGAAGAAAGGTTTCTTTATCCAATTTACCCATTGATATGTGTTGCAGCTGCAGCTGTTATTGACACCTTTCCAGATTTTTTCCATGACAAATATTCATCTGAACAGTCTATCTTTGAAAAGATAGCAAAGGGCCTGCGACCTTTGATCCTTGGCTTCATTTTGTGTGCTTCCCACAGCCGAACATTCTCCATGTTGAATGGATATGGTGCCCCTATTCAGATCTACCAGCATCTGGAACATCATGAAGATACTGGGCCTGGTTCTGTTCTCTGTGTTGGGAGTGAATGGCACCGCTATCCATCATCGTTCTTCATACCCTCCTATATTAGTGAAGTTTGGTGGATAGATGATGGCTTCCGAGGGCTTCTTCCATTTCCCTTCAATGAAACCCTGGGAGGCACCACTGCTGCTCCATCTTATTTCAATGACAAGAACAAGGCCTCTGATGAACAATATCTGAAAGACATTGGGGCATGTAGCTTACTGGTGGAACTTGATCTTAGACGGCCTTACCCATCCCGAGGAAGTGATTTGTCGACATGGGAGACACTGGCTGCGCTGCCCTTTCTGGATAGAGAGCTTTCACCTGCATTATACCGGTCATTCTTCATACCGCACCGATGGCAGCAAAACAATGTTTTTGGCCTGTACAAACTGCTGAGGAGGCTGCCTACTGACCAAGCGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSLSSARQRRATAASPPTDDGYSKEAKDRRRRPSGEEEEEGIRWFLPFLALGLLRHMSASSNLIHDCDEVFNYWEPLHFLLYRSGFQTWEYSSNFALRSYLYLFIHALVAGPASMIFGEHKVRVFYSVRIFLGLISTITETVLVVALSRKYGKRLACYVLAMLCLTSGCFFASTSFLPSSFSMYAVTLSSALFLLENYAAAVSVAAAGVILGWPFSILVFLPVTVYSLIRGSFRRVFLSGFLTSMFLLVLSVIADYYCYGKWTASVFNLLKYNVFGGGESHLYGTEGPSFYFKNGFNNFNFAFILALLFLGFVPFAKKKYVPDLLIVVSPVYIWLAFMSLQAHKEERFLYPIYPLICVAAAAVIDTFPDFFHDKYSSEQSIFEKIAKGLRPLILGFILCASHSRTFSMLNGYGAPIQIYQHLEHHEDTGPGSVLCVGSEWHRYPSSFFIPSYISEVWWIDDGFRGLLPFPFNETLGGTTAAPSYFNDKNKASDEQYLKDIGACSLLVELDLRRPYPSRGSDLSTWETLAALPFLDRELSPALYRSFFIPHRWQQNNVFGLYKLLRRLPTDQA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..275#1861..1948#2062..2221#2329..2549#2627..2922#3488..3599#3688..3826#4162..4358#4446..4535#4624..4764#ATGTCGCTCTCGTCGGCGCGTCAGCGTCGGGCCACGGCCGCGTCGCCGCCGACCGACGACGGCTACTCCAAGGAAGCCAAGGACAGGAGGCGGCGCCCCAGCGGCGAGGAGGAGGAGGAGGGCATCCGGTGGTTCCTCCCGTTCCTCGCCCTCGGCCTCCTCCGCCACATGAGCGCGTCCTCCAACCTGATCCACGACTGCGACGAGGTGTTCAACTACTGGGAGCCCCTCCACTTCCTCCTCTACCGCTCCGGCTTCCAGACCTGGGAGTACAGGTCTCGCTTTTTTCTCGCTTCACTCTCCCTAAACTAAACCCTAGCTGTACAGTTCGTTTTGATGCTCGATGCGCGGGCGGAATCGCGGACCGGGATTGCACGGATTTGTGCTGTTGTACGGAGCAGGAGAGAATCGGAGGGTAGATTTTAACAAGTGTTCGTAGTGGTTCGATGGGGATGTGAAGATCTGCCGCTATTTGGGGATGGTTTGCTGACACTTCTGGGTGGGCGAGTCTGAGTGGAATGGAGCCTTGGAGATTACCTGGGAATGCGTAGTGGCGGGTGAGCATTTGAAGGACTTCGGCTTGGGAGCAATGGTGTAGCCGTGTAGGTTAGTGGAGGTGCTTGATTGAAGGGTTTTAGGTCGCGTGAGTATGCACTGAGTTACAATTCGGAGGTTTATGACATGAAGCGTTTTGTTTTAGATTTGGCACCAATGATGAGTCTGTGTGTTGGGGCTTTGCATTGTCTGCTTCTGTAGTTTGTCTGATTTGGGGTTTTGCAAATTGTGGTGATTTGATGAGGCTGGGGTGTCCAAATGATTATATGAGGTCTTCAGATGCATGGCAGATTTATGGAGCAAAATTGTTTGATTTTCATTAATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGGAATAGTTTTAGGTAAGGGTGACTGACTATACCACTAGGATAAAAGGCACTGGTGCAGTGATAAACATGGCCAACTATCTTAGAATCAAAGAGAACGGTATTTAATTGTTTCAATTTTTATTGGGTTACCATATTTTTCTTGTATTCTAAGATTGGAAATAAGCTGTGATACTTAACAGCTCATTGTAACTATATTGCCAAACTGACATTTAAAATAAATATTGACAGTTCATTCATGTTTGAGGCTCCAATGTTTTGCATTCCTAGGGGTTCCATTTGAAGCCTGGTTTCAGAGAACTAGTGAAGTTGCTGGTATGGTTTTATTATAATTAGCATGCGGAAGTTTGTTTCGAGTGGCTTCAGAATCGGATGATGATAAGGCAGTTGCATGGTTTCTGTAACTGTGGCTGAAAAAATGTTGCTTACACTAACAAGGATTTGTTTTGATAGATCTTGTTCTAACAATATGATTCCTTCTATTATTATTATTTTTGCTAATCCATACATGTAACAATATGTGTTCTCACTCGATGGTGCCTCCCTGGCTGGCAATATGGAGGTGGATGGAAATCTTCATAGTGTAGATGGGCCACTTTGTGTTTTGGTTTCAGCTTCTGCAGTCTTTTATCTTTCAATTCCAGAGCTTGTAATTTTGTTTGGGGGATCACACAGGCAGTAGGATGGCATTGTTGCAGTGTGCTTACCACTTGTTATGCTTTTTCTATTGTTAGTTTACTATGTAGCGGGATGCTTTTCCTATAATGGAAAGGGGGGACTGGGGGAGGCATGGCCTCTCTGTTTTGAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGCTCTAGTATCTAAACAGAATCAACTAGACATAGATCTAATTCGAAGAATTCTTGTATATAATTTCACAGCGTTTGTGAGTACATGACGATATGAATGGTTTTGATATTGATTTTGTGTAATTCTATCCTTGCAGTTCCAACTTTGCTCTTAGATCATATCTGTACCTTTTCATTCACGCTCTTGTAGCTGGGCCTGCTTCAATGATTTTTGGGGAGCATAAGGTTTGTACTGTTCTATTCTTTGTTTCCTCACCTTTTAAGATCTGCTAATTAAATTCTTACTAGTCAATACCTACCACTAATCGTATTTAATTTATTCTTTCATGATTGTTAAGGTTCGAGTGTTCTACTCTGTGAGAATCTTTCTTGGCCTTATATCAACTATAACAGAAACTGTTCTGGTTGTTGCTCTTTCAAGAAAATATGGAAAAAGACTTGCTTGTTATGTCCTTGCAATGCTGTGCTTAACCAGTGGCTGCTTCTTTGCCAGTACCAGTATGTTTCTCAGATTTCAGTTCTATATTATCATATGGAAGCTCTATTGCAGCTGTGTAACTATTCAAACTGAAGTGGTAGCTTATTTTTTTTTTTCCTTATTGCAGGTTTCTTGCCAAGTTCATTCTCCATGTATGCTGTAACACTTTCCTCTGCACTCTTCCTACTTGAGAACTATGCTGCTGCAGTCTCTGTTGCAGCTGCAGGAGTTATCCTTGGTTGGCCTTTCTCAATTTTGGTGTTTCTCCCTGTTACGGTTTACTCACTAATTAGAGGATCTTTCAGAAGAGTATTTTTATCTGGATTTCTGACTTCCATGTTCCTTCTTGTAAGTTGCACATGTATATTGTCATTGTTTTTACAATGAAGTCCAAATTTGATCTGATTGTGAAAGTTGCATGCCAGGTCCTTTCGGTTATTGCTGATTACTACTGCTATGGCAAATGGACAGCATCAGTGTTCAATCTTCTGAAATATAATGTGTTTGGTGGTGGTGAAAGTCACTTGTATGGAACAGAGGGGCCTTCATTCTATTTTAAGAATGGATTCAATAACTTCAATTTTGCGTTCATCTTGGCTCTGCTATTTTTGGGGTTTGTGCCATTTGCAAAGAAGAAATATGTCCCAGATCTATTGATAGTTGTATCTCCTGTCTACATTTGGTTGGCTTTCATGTCCTTGCAGGCACACAAAGAAGAAAGGTAATCATCTGAATGTAAATATTAACTTGTTTATCAGTTGAGTATGCAATATATATAAGATTTATTAATCTGAGTGAAACGATTTTTCTCTGCATAAACACAATGAAGAGATAACTAAACATGCTTATTCTGTTTGTTTCCTCTCATGAACTTAACACAGTATCTGCATTTGTGTTTTGTATAGCTGTATGCCCCTGTTGCCACTGGCCAACAGTAGCAGTGTTTTCTTTCAGTTGCTTTATCGCTGGCATGTTCTTCATCCTATAAATTTCATGTTTGCCCACAGTAACAAGTTAAACTTTCTGAATCTAGAATTAGATACAGCAACAAGGTTCTCCCAAACTTGTCTTAACCTGGCAAACTTCAAGGCAGTGTGTTTGGCACCTTGTGATTATTAATTATGTTGATGTGGAAAAAAAACACCATTGTTCTGGGGCATGAAAACAATTATCTGTTTGAGTGCTTCTGATATTCTCCTAGTTTTTTTTTTATGGTTAATGCTACTCTACAGATGAGAACTACAAAAACTGACCATTTTTTTTCTTTCCTCTATCTGTTTATGCAGGTTTCTTTATCCAATTTACCCATTGATATGTGTTGCAGCTGCAGCTGTTATTGACACCTTTCCAGATTTTTTCCATGACAAATATTCATCTGAACAGTCTATCTTTGAAAAGGTTATCTTAAAGACCTTGATTGCATTTTTATATCATTTTGTTAATGTGATAATATTTTTTAAAAAAATTCCTCTGATAAATATGGCAGATAGCAAAGGGCCTGCGACCTTTGATCCTTGGCTTCATTTTGTGTGCTTCCCACAGCCGAACATTCTCCATGTTGAATGGATATGGTGCCCCTATTCAGATCTACCAGCATCTGGAACATCATGAAGATACTGGGCCTGGTAAGGATCTACCAATGTGTTGATCCACTAATTAAACATTTCTCTCTGTGATACATTTTTTCTCTTGTTTGGAGTTTTGGACCTGTGGTTGCTTATTGCACACTGCGCAGAGCTATTATGGATTCGTGATATAACAATGGCTTCAACCTTGTGCGTATTATTGCGAGGGTTTGCTGTAGTCTTGCTCTTGTAGGGCTCTTACTGTAGTGATAGTTACACAACTGCTGATTGAGATTTATTGAGTAATCTTTCGATAGAATTAAGCAATCTTTCATGGAACGATGAATTATGAAGGAAGCATTTTGAACTCACTAGCTGTGTCTCTTTGTTTTCAGGTTCTGTTCTCTGTGTTGGGAGTGAATGGCACCGCTATCCATCATCGTTCTTCATACCCTCCTATATTAGTGAAGTTTGGTGGATAGATGATGGCTTCCGAGGGCTTCTTCCATTTCCCTTCAATGAAACCCTGGGAGGCACCACTGCTGCTCCATCTTATTTCAATGACAAGAACAAGGCCTCTGATGAACAATATGTATTTTCTCTTGCCTTTAAACTTTACAGCACATATTTTCTCTTGACAATACTCCGAGTAACAACCTCCTTGCACTTCTGGTTGCAGCTGAAAGACATTGGGGCATGTAGCTTACTGGTGGAACTTGATCTTAGACGGCCTTACCCATCCCGAGGAAGTGATTTGTCGACATGGGAGGTAATTCCATGTTCACAATTTCATTCATTTGTTAACTCTCATGTCTGTTTTCCTACTTTTGCCATCTGATAATTCGTTTAAACTCCAGACACTGGCTGCGCTGCCCTTTCTGGATAGAGAGCTTTCACCTGCATTATACCGGTCATTCTTCATACCGCACCGATGGCAGCAAAACAATGTTTTTGGCCTGTACAAACTGCTGAGGAGGCTGCCTACTGACCAAGCGTAA</dnaseqindica> |
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