BGIOSGA003242
| Gene Name |
BGIOSGA003242 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA003242, complete gene. |
| LocusTag |
P0424A08.1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA003242-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA003242-PA |
| Length |
7894 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:10409390..10417283 |
| Sequence Coding Region |
10409390..10411149,10411627..10411857,10413081..10413210,10414140..10414292,10415071..10415277 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:10409390..10417283 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:10409390..10417283 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGATCCGCCCGCCGATCCGCTGTCCGCCTCCGCCCCATTCCCCACCATCCCCGCCGCCTCGAGCCCCAGGCACCCCCGCGCCGCCAGGCCGCGGCGCCAGCCCGCGCCCTTCCGGTCGTCGGACCACCCCGGCGCCGCCTCCGCCTCCGCCTCCGCCTCCTCGTCCTCGTCGTCGTCGTCGACGCGGCGCCTCGGCGTCGATATCCCGGTCCGCCACGGCGTGCGGCTTGGCGCTGGGGCCGCGGGATCGCGCGCTCCCTCGGGCTTCGTCTTCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGGGACACCGCGGCGCCCGGCCTCGTCGACGTGGAGGGGTGCTCGCCGACGTTGGCGAGCTCCTGGAGCTCGTCCAGCTTCGTGTTCGGGGCGTCGGACACGAGGAGCAGCTTCTCGTTTGGATCCAGCAAGGCCGCACCGTCGTCGAGCTTCTCAGCAACGGTGGGCGAGCTCACCATAGATGATCCCCGCAATAGGCAAGGCGATGTCGATGTTTCTGGAGGAAATGGTTCACTTCCGGAGATGATTACGGATTCGGTTTTGAGTCCGAATATTGTTCGTCAAGAGATCGATCACCGTGATGAAGGGCTTGGTGCTCCTTCTCAAACAATGGGACGCGAGAGTACAGAGAGTAGCTGCTCACTAGTTGGTCAAGTGGATAGGCCATCACTATGTACCACAGAAAATGTTGCTACGCAATTCGCAAAGGATGAAGGCAAAATTTCTGCAGATGGTGCTGATAGCAGGGAGAGTAAATCTGTTTTTGTCTTTGGTGAGAATTCTGAGGAAAGGGGGTTCACTACAAAAATAACAGAAACTGAAATTAAGAAGGGAGATTCAGTAGAGAAAAAGATTGTAGCATTTGGTTCTGATCAGCTTGATGCCTCAGTTGCCGAAGGTAATGCATGCACCGAGTCCAGTTTTCAGGGTGAAAGGCATGGATGTGGCTCAAGTATGAGGGATCATCGTGGAGTTTCCACTAGAGCAAAAGCCTCAAATGCTTTACCTTTTGGCCTTGTAGTTCAGGATAGTGGTGCAAAGGTTTCTTCCACAAAGTTGTCTGATGAAAGACGAAGCGCCGGAGTACCAACATCAGAACTTGGCGATTTGGGGTTGGTTGATGAGCAATCCTTTACTGTACGTGACAACGATGCAGCGTCCAGAGAATATGGAGGGGTTAAGGGTGTGAGCATGAATAAAAGAGCAGTTCAACAAGAGAAGTTCTCAGCCCACCAGGTACCGCTACCACTCTTTATAAGCGATCAGAAAGCAGCTCCAGAAGTAAATTTGCATTTGAAGGAAGTCACTAACTTCAGACTAGAGGACTCTGATATCAGTAAAGGAAACTCTGGCACAAAGGAAGAAGATGTTAACTGCTTTAGCCCGCAAGCAACAGAGAGTAATCATGACAGAACAGTGTTTATTTCTGTGACAAACCTGGAAAATTCTAGTCGTTCTGATTTCATATTTGCGGCATCAACTGATCATAGTAAATTGCACTCACAAAGACGACCTAGCAAGAAAAAAATTGGAGGAATGAGTAATCATGCTAATTCTGTTGAAAGCCATCCGTCATCTGCCATTGGTCTTGCACACTCAGAAATCTCAAGGCAGCAATACACAGATTTACCTGCTCAATGGACCAAATACAACAAAACAGATCCTAAAACAGTTACAGTGAGTGTAGGACCAGCAATTAAGGAAAACATTGGACATCAAGAAGACTGTGAAACATGGCGTATAAGGGGGAACCAAGCATATGCTGAAGGACAGTTAGCTAAGGCCGAGGAGTGCTATACCCATGGAATCAATTCTGTTTCTTTGAATGAGGCTTCTTGGAAATCATTGATGCTGTGCTACAGCAATCGTGCAGCTACTCGGATGTCTCTTGGTAGGATGAGAGAGGCCCTTTCTGATTGTCGAAAAGCCACTGATATTGATTCCAGCTTTCTGAAGGCTCAAATCAGAGCTGCCAATTGCCTACTTGCTTTGGGGGATGTAGAAGAAGCACAAAAGGGTTTTGAAATATGTTTGAAGTCTAATCATGAAGCAATCTTGGACAGTAAAATCACGGAAGAGGCTTCTGATGGCATAAAAAAAGCTAAGAAAGTATCTAATTTTATGCTCCTATCCAAGGAATATATTGTAAAAAAGGAATTTGATAAGATACCCAGCGCCTTACAGATGATCTCTGATGCTTTGTCCACAAGTACTTATTCAGATAATTTGATGATGATGAAAGCAGAAGCTTTGTTACTGGCTGCTGGGAACAAAGCATTTCAAGCTGGTAAATATTCAGAGGCTGTGGAGCATTACACTGCTGCTTTGTTAAGCAATACCGAGTCACCGCGTTTTTCAGCAATCTGCTTTGCTAACCGCGCAGCTGCTTACCAAGCAATGGGCCAAATTTTAGATGCAATAGCAGATTGCTCACTAGCCATAGCCCTTGACTCCAATTATTCTAAGGCTATTTCTAGAAGAGCTGGTTTGTATGAACTTATAAGGGACTATGATCAGGCAGGGAATGATCTTCGTAGGTTAATTTCTCTTCTTGAGAGACAGCTTCAAGAAAATATATACATGCCTTCAGAAAAATCAGATGGTATTCGCAGCAGTCTGAACCGATCCAATCTTAGGCTTTCTGCTTTGGAGCGGGATGCCAAGAAGGGGATCTCACTGAATGTATATTTGATACTAGGAATCGAACCATCTTGCACTTTCTTGGATATAAAGAAGGCATACCGCAAAGCAGCACTAAGGCATCATCCAGACAAAGCTGGTAATTTTCTTGTGAGAAGTGAAAATATCAACGATGCAGTATGGAGAGATATTGCTAATGACATCCGCAAAGATGCTGACTATCTATTCAAACTAATTGGGAAAGCATATGCTATACTTTCGGACCGTACAACTAATTGGTATGCGATAATAGCTGCCGATCCATTTTGGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDPPADPLSASAPFPTIPAASSPRHPRAARPRRQPAPFRSSDHPGAASASASASSSSSSSSTRRLGVDIPVRHGVRLGAGAAGSRAPSGFVFGGGGGGGDTAAPGLVDVEGCSPTLASSWSSSSFVFGASDTRSSFSFGSSKAAPSSSFSATVGELTIDDPRNRQGDVDVSGGNGSLPEMITDSVLSPNIVRQEIDHRDEGLGAPSQTMGRESTESSCSLVGQVDRPSLCTTENVATQFAKDEGKISADGADSRESKSVFVFGENSEERGFTTKITETEIKKGDSVEKKIVAFGSDQLDASVAEGNACTESSFQGERHGCGSSMRDHRGVSTRAKASNALPFGLVVQDSGAKVSSTKLSDERRSAGVPTSELGDLGLVDEQSFTVRDNDAASREYGGVKGVSMNKRAVQQEKFSAHQVPLPLFISDQKAAPEVNLHLKEVTNFRLEDSDISKGNSGTKEEDVNCFSPQATESNHDRTVFISVTNLENSSRSDFIFAASTDHSKLHSQRRPSKKKIGGMSNHANSVESHPSSAIGLAHSEISRQQYTDLPAQWTKYNKTDPKTVTVSVGPAIKENIGHQEDCETWRIRGNQAYAEGQLAKAEECYTHGINSVSLNEASWKSLMLCYSNRAATRMSLGRMREALSDCRKATDIDSSFLKAQIRAANCLLALGDVEEAQKGFEICLKSNHEAILDSKITEEASDGIKKAKKVSNFMLLSKEYIVKKEFDKIPSALQMISDALSTSTYSDNLMMMKAEALLLAAGNKAFQAGKYSEAVEHYTAALLSNTESPRFSAICFANRAAAYQAMGQILDAIADCSLAIALDSNYSKAISRRAGLYELIRDYDQAGNDLRRLISLLERQLQENIYMPSEKSDGIRSSLNRSNLRLSALERDAKKGISLNVYLILGIEPSCTFLDIKKAYRKAALRHHPDKAGNFLVRSENINDAVWRDIANDIRKDADYLFKLIGKAYAILSDRTTNWYAIIAADPFW</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..1760#2238..2468#3692..3821#4751..4903#5682..5888#6313..6542#7564..7642#7718..7894#ATGGATCCGCCCGCCGATCCGCTGTCCGCCTCCGCCCCATTCCCCACCATCCCCGCCGCCTCGAGCCCCAGGCACCCCCGCGCCGCCAGGCCGCGGCGCCAGCCCGCGCCCTTCCGGTCGTCGGACCACCCCGGCGCCGCCTCCGCCTCCGCCTCCGCCTCCTCGTCCTCGTCGTCGTCGTCGACGCGGCGCCTCGGCGTCGATATCCCGGTCCGCCACGGCGTGCGGCTTGGCGCTGGGGCCGCGGGATCGCGCGCTCCCTCGGGCTTCGTCTTCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGGGACACCGCGGCGCCCGGCCTCGTCGACGTGGAGGGGTGCTCGCCGACGTTGGCGAGCTCCTGGAGCTCGTCCAGCTTCGTGTTCGGGGCGTCGGACACGAGGAGCAGCTTCTCGTTTGGATCCAGCAAGGCCGCACCGTCGTCGAGCTTCTCAGCAACGGTGGGCGAGCTCACCATAGATGATCCCCGCAATAGGCAAGGCGATGTCGATGTTTCTGGAGGAAATGGTTCACTTCCGGAGATGATTACGGATTCGGTTTTGAGTCCGAATATTGTTCGTCAAGAGATCGATCACCGTGATGAAGGGCTTGGTGCTCCTTCTCAAACAATGGGACGCGAGAGTACAGAGAGTAGCTGCTCACTAGTTGGTCAAGTGGATAGGCCATCACTATGTACCACAGAAAATGTTGCTACGCAATTCGCAAAGGATGAAGGCAAAATTTCTGCAGATGGTGCTGATAGCAGGGAGAGTAAATCTGTTTTTGTCTTTGGTGAGAATTCTGAGGAAAGGGGGTTCACTACAAAAATAACAGAAACTGAAATTAAGAAGGGAGATTCAGTAGAGAAAAAGATTGTAGCATTTGGTTCTGATCAGCTTGATGCCTCAGTTGCCGAAGGTAATGCATGCACCGAGTCCAGTTTTCAGGGTGAAAGGCATGGATGTGGCTCAAGTATGAGGGATCATCGTGGAGTTTCCACTAGAGCAAAAGCCTCAAATGCTTTACCTTTTGGCCTTGTAGTTCAGGATAGTGGTGCAAAGGTTTCTTCCACAAAGTTGTCTGATGAAAGACGAAGCGCCGGAGTACCAACATCAGAACTTGGCGATTTGGGGTTGGTTGATGAGCAATCCTTTACTGTACGTGACAACGATGCAGCGTCCAGAGAATATGGAGGGGTTAAGGGTGTGAGCATGAATAAAAGAGCAGTTCAACAAGAGAAGTTCTCAGCCCACCAGGTACCGCTACCACTCTTTATAAGCGATCAGAAAGCAGCTCCAGAAGTAAATTTGCATTTGAAGGAAGTCACTAACTTCAGACTAGAGGACTCTGATATCAGTAAAGGAAACTCTGGCACAAAGGAAGAAGATGTTAACTGCTTTAGCCCGCAAGCAACAGAGAGTAATCATGACAGAACAGTGTTTATTTCTGTGACAAACCTGGAAAATTCTAGTCGTTCTGATTTCATATTTGCGGCATCAACTGATCATAGTAAATTGCACTCACAAAGACGACCTAGCAAGAAAAAAATTGGAGGAATGAGTAATCATGCTAATTCTGTTGAAAGCCATCCGTCATCTGCCATTGGTCTTGCACACTCAGAAATCTCAAGGCAGCAATACACAGATTTACCTGCTCAATGGACCAAATACAACAAAACAGATCCTAAAACAGTTACAGTGAGTGTAGGACCAGCAATTAAGGAAAACATTGGACATCAAGAAGACTGTGAAACATGGCGTATAAGGTTCTCAAATCAGCCTTTGTCTTTAGTCACAGGCTTTTTAATTATACACGTTTTGGCATGTATACCAATTCCTTTTCAATAACTTACCTCTCAGCAACCAATTTTATTCTCAAATACAGACAAGCGTATGGTGGTTCTTTACATGTGCCGACGCACAGCATCCCTTTCAATGCCTTGTAATTTATAAATTTTGCAAATAGATTTTTATTGCATTGCTGTTTATTTACTTATTTTGGTTTAGTTGTAGCAACGCAATCATTTGAGAAGTACAACCCTTTATTGCTTAATATAAGACTACTTGCAGATCTTCTGTAACTGAACAAATGATATACATAACACTGTATATCAACCAACCAAATTCAGAAATAAGTATTTTACAATTCGACTGTGATTCAAACAATGGCACACATGTTTTTTCAATATTTTGTGATATTTGGCTTTGCCGCTTTTTAAGCTAAATTATTTGATGTGCATTAGGGGGAACCAAGCATATGCTGAAGGACAGTTAGCTAAGGCCGAGGAGTGCTATACCCATGGAATCAATTCTGTTTCTTTGAATGAGGCTTCTTGGAAATCATTGATGCTGTGCTACAGCAATCGTGCAGCTACTCGGATGTCTCTTGGTAGGATGAGAGAGGCCCTTTCTGATTGTCGAAAAGCCACTGATATTGATTCCAGCTTTCTGAAGGCTCAAATCAGAGCTGCCAAGTAAGATCAATGGCTAGGGATGTGCTTTCACTGAAGTGGCCAATATAATACGGCAAACTTTTGAAATTGCATTATAAATTCATATCATTTAGCATCAAAATATTAAGATATTTTATCATACATAAAAGATCAAGACATGGACTAATTAAATTAATTCTCCTAGGAATCAGTTATTTTTTTAATTCATCCTAATTGATTGCCGTATTTTTTGGCCTCCAGTTCTCAAAGTAAAGAAATATTTCCTTGTTTTAATGTTTAAGGTCAAACTGTAACATTACTATCATAGCGTGATTACAACTTGCAAGGTGATACTATGTTGTTAGCCTTACTGATTCAAGCACCATAAATAGATGTTGTGTTTGTATCATTTATTCAATGAGCTGTGTACTCACGAATTAGTTAAGTACCATTACATAATCATGATCATTTTCTGAAACACACTACAGATATTAGTGTACCATCTTTTGAGTTTTCGAGAGCAAGCAATACAAGATATGGCCAAAATGCCCCTAAGGGTTACAATGTACTGTCACGCCGTGTCTAAGCTTGAGTGGGGTAACAGATGTTAGCTGTTACAGCTCTGCCTGACAACACTGTGTTGGATGGAGTCTCAACTGTAGTATTCCCAAACACGATGCCCTCGACAATTGCCACTGTCAAGGATATTTGCTAAAAGTCCTGCTGTGTCCTGTCCTTCATGCTGTATGCAGCATTGGAGATGCCACGGCATTGTGAGCAGTTATCGCCTCCTCCAGATTGTGGGCGCTGCCACCAGTTTATGTCTAGGTTTAAATGGTTTATGACGAATTTGTTAGGTAGGCAGGGCAGAGTTTCTGAGTTTCTAATTCAAGTCACTTATCTCTCATTTCATTCTTTTAAAAAAACTATATCGGGTGAATCATGATTTGGCAAATGACCGTAATTTCATAGTGACACGTAATTAATTAACGAGTTTGAGGTTTGCTGTAGCCATTTTTGCATGATTTAGTCTAGAGAACAATTACTGTTAAATCTTGATGAAGGTAAAATGATTCCTCCGTCAAAGTTATATTCTGTGAGCTCAGCTCTGGGTCAGGGATGATGCTGAAATCAAATTCTGCATCACAGATTCAATAAGCATAACTAGATAATGCATTTAGTTGCTCATTTTTCTGGCCCTCAGTATACTTCATATTCAACATTGTGATTATGAACTAATCATTGTGCTTGTATAAATGGTATAGTTGCCTACTTGCTTTGGGGGATGTAGAAGAAGCACAAAAGGGTTTTGAAATATGTTTGAAGTCTAATCATGAAGCAATCTTGGACAGTAAAATCACGGAAGAGGCTTCTGATGGCATAAAAAAAGCTAAGGTAGTCAGGTAGCGCAGAAAGTAATTATCTCGTTTTCCGCTGTCATTTTCTAAATTTTGGCATATCTCTAGGAATCCTGGAATCTGTGAAATACGTTTCCTTTTACCATTAGTACATTAGTTTCTACTATGTTTTTTTGTAATCACAAGGTAAACAAGTTTGTAATTTGATTAAAATTTGATGACAACACACACATGTTATTCCTTTACTTATGAATAGCAAAATGAATAACTAGAAGCAAGCTGTTGAGGATCTCCTTGCAGAATAGCTATCTTAGTGGTGCTTATTTTACTTCCTCTAAAAAGAAGATCATGCTTATTTTGTGTGAAATTATTTTTTAATCTAAATTTGGTACATTAGAGGCCAGGGATGTTCTAAAACTAGATGTTATACCAACAGTAAAAATCTAGTTTTACATATCCTAAAGATTCATGCTGTTATGTATAACATTGCCAATCTCCTAAAGATTCATGTTACGTATCTCTTACTTCAACAGTACATACACCTTATAAACTCCCAACTTGTTGCCTCATATACCGTTGAACGTGCCAGACAAACTGAGTGTAATTTAATATTACATAGTACGAGTATATGATAAATATGAGCAGACGCAGGTGGCAATGATGTTCACAGTACTTTTTTAAAATACAATCCTTTTACTGTGGCTGTTTGTAACATTTCTTCCCCTGGTTGCTTTCTAAACCAGACTTTTGGTCACTTTTTCTGTGAGAGACTGATATATTTATTTCTTAATTCATTATATCCATTTAGTGAGAACTATCTTATTTAATCCAAAGGAAAAAACTTATCTTATTTTTACACCCTAATAAATTCTTTCAGGAATTATCTGTTCAAACCAAAATGCTTTGTAACTTTGTTACATGACAATTGACAATCTAATCAGTATGTTATTGTCTTTTTGTTGACAGAAAGTATCTAATTTTATGCTCCTATCCAAGGAATATATTGTAAAAAAGGAATTTGATAAGATACCCAGCGCCTTACAGATGATCTCTGATGCTTTGTCCACAAGTACTTATTCAGATAATTTGATGATGATGAAAGCAGAAGCTTTGTTAC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| External Link(s) |
