BGIOSGA003349
| Gene Name |
BGIOSGA003349 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA003349, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBB0022N24.14-2 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA003349-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA003349-PA |
| Length |
8444 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:12490156..12498599 |
| Sequence Coding Region |
12490156..12490298,12490719..12490825,12494323..12494597,12494825..12494990,12495492..12495733 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:12490156..12498599 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCCGCCCGCGCGCTGGGTCCACCTCCTCTTCACGCTCTCGCAGCCACGCGGCAGGCTCCTCGCTGCCCCCCGGCTGCCGCCGCGCCGCCGACCCATGGCTACCGGCGTGGAGCCGCGGTGCTCTCCGGCCGCCGGGGAAGGCATACTTTGAGTTCAATACAATTGATGCATGCTGTTAGAGGTGGCAATCTTCAAGTGGAACCAAACATGCTTCATTCCCCCAAGCCATTGATGTCCACCAGACGTGGGTGTGTGGCTAGTCCTACTATTGCTAATGTGGATGACTGCACTGAAGGTGAAGGTGCACTGGGGTACACAATGACCCAAATCTGTGATAAGTTTATTGAGTTCTTCATGTACAAGAAACCACAAACAAAGGACTGGAGAAAAGTATTGGTGTTTAGAGAGGAGTGGGAAAGATACAGACCATACTTTTACAAGCACTGTCAAGCACGTATAGATATGGAAAATGATTCTTCAATGAAGCAAAAGTTGGTTGTACTTGCTAGAAAAGTTAAGAAGATTGACAATGAGATAGAGAAGCACATGGAACTCTTCACACAGCTCCGCGAGAATCCCACAGATATTAATGCCATTGTCGCAAGAAGACGAAAGGATTTCACTGGAGGGTTCTTCCAACATCTTAATTTTCTTGTTAATGCATATAATGGTCTTGATGAGAGAGATGCAATTGCCAGGCTTGGGGCGAAGTGCCTGTCTGCAATCCATGCATATGACTGCACACTGGAGCAGTTGGACCTTGATTCTGCTCAATCAAAGTTTGATGACATTCTGAATTCTTCTTCCCTGGATGATGCATGTGACAAGATTAAAAGCTTAGCCAAGACTAAAGAACTTGATTCGTCCTTAATTCTTCTAATAAACAGAGCGTGGGCTGCTGCAAAAGACTCTACAACTATGAAGAATGAGGAGCAGAGTGCAAGTGGAGATTGCTTTAAAGGTCATGCTGCCAAGGACAAGAGGAAGACTGAAAGAACGGTCGGGGGAAGAGGGGGAGAAGCTGAGGTTAAAGATATAATGTGTCATATCTATACAACAACTAAGGAAAGTCTCAAGAGCATCTCGCCTCCAGAGATGAAGCTTCTGAAGTACCTATTGAATATTGAAGATCCTGAAGAGCGGTTTGGTGCTCTTGCAACAGCCTTTTCTCCAGAAGTCGAGCATGAAGCCAAGGATGAAGATGCTCTGTACACAACTCCCAACGAACTCCACAAATGGACCAAAATGATGCTTGATTCGTACCATCTCAATAAGGAGGAGACGGATTTTATGGATGCCAGAAAGATGAGTGACCCAGTGATCATACAGAGGTTAACTTTGCTTAAAGAGACAATCGAAGAAGAATACATGAAGAAGTATATACATCCAGAGGAGCAAGAATCTGAGGACGACGAAGATTCAGAAGAGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAARALGPPPLHALAATRQAPRCPPAAAAPPTHGYRRGAAVLSGRRGRHTLSSIQLMHAVRGGNLQVEPNMLHSPKPLMSTRRGCVASPTIANVDDCTEGEGALGYTMTQICDKFIEFFMYKKPQTKDWRKVLVFREEWERYRPYFYKHCQARIDMENDSSMKQKLVVLARKVKKIDNEIEKHMELFTQLRENPTDINAIVARRRKDFTGGFFQHLNFLVNAYNGLDERDAIARLGAKCLSAIHAYDCTLEQLDLDSAQSKFDDILNSSSLDDACDKIKSLAKTKELDSSLILLINRAWAAAKDSTTMKNEEQSASGDCFKGHAAKDKRKTERTVGGRGGEAEVKDIMCHIYTTTKESLKSISPPEMKLLKYLLNIEDPEERFGALATAFSPEVEHEAKDEDALYTTPNELHKWTKMMLDSYHLNKEETDFMDARKMSDPVIIQRLTLLKETIEEEYMKKYIHPEEQESEDDEDSEE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..143#564..670#4168..4442#4670..4835#5337..5578#6702..6797#7230..7417#8228..8444#ATGGCCGCCCGCGCGCTGGGTCCACCTCCTCTTCACGCTCTCGCAGCCACGCGGCAGGCTCCTCGCTGCCCCCCGGCTGCCGCCGCGCCGCCGACCCATGGCTACCGGCGTGGAGCCGCGGTGCTCTCCGGCCGCCGGGGAAGGTCTGGTCCTCGCCTTTTTCCTCTCCTTGCTTGGTGCCTTGGTGGATATATCATTCTGGTACACCCTTTATTTTTGCTCAATTGCTGGCTTGCAGTTATGGCGGCGGGTTCTTGAAATTTCTTAACCCAGATTGCTTATTATAGTTGTCCTGGAATAATGTCCAGCAAATTCCACTTGTATTTCTGGTGGTATCCTTCACTCCAATCAGCATATCTAGAATGCTAATTACTTAACCCAGATTTGCCTATAATTGTCCTGAAATAATGCCCTGCAAATTCCACTTGTATTCCTGCTGGCATCCTTCGCTTGAATTGGAGCTAGCATGCTAATTACTTAATTTTTGGCTGTTTTTGTTGAGGGAGGTTTGCGTTTTTCGTGGATATTGATTTTCTGGTTAATGTTAACTCATGTTTCTGCAGGCATACTTTGAGTTCAATACAATTGATGCATGCTGTTAGAGGTGGCAATCTTCAAGTGGAACCAAACATGCTTCATTCCCCCAAGCCATTGATGTCCACCAGACGTGGTAATTTCTTTAGTTTAGTTGTCCATATACACTTGAAGCGTATTTGGGATTTTTTATTTGATGAAATATATAACGAGTGTGCTAGGTGGTTCCTGCATAGAACATCAGTTGCATTTCCCAGGAAATTTTTTAGTCATACATTTCAGCAATTTTAACATCAGTTGCTTTACCATGAAGTTGAGGCACGACTTGACTAGTGCGGGTAATGAAATGCGAGGTGCGAGGTTAGCAGTGTCAAAGCAAAGCCTAATTGGTCTGGTGTTAATGATTTTGACTTGGTTTGACCTTGTTCTATTGGCTATACCAAGTTGTTGCACTGGTTTGAACATTTTACAAGTTGTTTACACTTAGATCTTGTTGGTATGAAAGAAAGAAAAATAGTTGCATCTATACTATCAGTTAAAATGCACTTCGCCCGACTTACTGGATTTGTGTCAAAACACGATTTAACTACAAAACATCTTACACATCTCAACTACGAAAGCCAATAAAAAATACCTCCCTAAGAGCAATAGACATAGGTTTCATGGTGGTCTTGAATAGGGAAGAGAATGGTCGGAGTCGGTAGCATCTCTTCAGAAATAATTCTCGGTCAGTCAGGAATCGATCATATTTACTAATTTAATATTGAAAAATACGGTACTAAAAAATAGAAAAAAAAATCTAATTTTATATATTGCTAGAAAATGGTAATGGTTAGAAACGATAACACTTACATGGAAACAATGCTTGGTCAAGAATTTCCATGACCATTTTGATCTCTAGTTCTAAAGACTTTGAATTTCAAATAACACTTATTTTTGTACTTGAATGACACATGGTCAACAAAAGATGTAAAAATGAGTGAAATATAAGTAAAAAACTATTTGGATGTCAAAATCATGAAACTAACCGAGTTGTATCTTCCTTATTTGATTGTTTTAGCCATTTTTATAGTTGCAGGGGTGTAAAATATTCAGTTTTGTAGTTGAGGGGTACTTTTAAGACAAACCCATGATATGAAATGGATTTATTCCTTGTCCCAATGGCAATTACAGTGGTGTCTTTGTCTTAAAAAACAATATGTGTGGAGTGTGGACTAATGTGAATGTTCTTTTAGATGGTTCGCATATTTGAAATTTCTCCATTACAAAGGATACCTAAATTGTTCCCTGTGGATTTTGCACGGGTCCAAATAAGCCCCTAAATCGTTTACGCTTTCAAATGGAGCCTACCCAATATAGCCGAATAGTTTCATGTCAAGACTCTGTTTGTCACACTGCACTATCATCTTTGCGTTCCCCGAAACTGCAATGACTCCTTTGGGCCCTGGGATTTTGATCAGCTGATATGCGTAGTGGGATGCCGCCATGAAATTAGCCAATGCCGTCCTTCCGAGAATAGCATTGTAGGGTTGTGTTGATTCGACTACATCTAATTCAGGAAGTTGTCGGCTGTGCCAAAAGTCACAGGCAAGGTAATCTTTCCCAACCTTTGAAGATGATTCTGGACTAATTCCATGGAAGGGTTGGTCTGATGGTACAAGGTCGTGTCTAGGAATCCCCATAGCATCAAGAGTGTTGGCAGAGAAGGTTAATCGAGTTGCCACCGTCTACGAGGATGCGGGCAACCTTGATGTTTCGGATAGTGGGTTCGACCACTATGGGATACCATCTAAGAGTTGTCACCAGAGTAGGATGGTCGGAATCCGAGAACTCAATCTTTTGATCTGACCATCGCATCTTGGAGTTTGGCACCTCAGTCGTAGAGCATAATTCGCGATTCACCTTATTGTACTCTCTTTTGGAAGAATAGGAGGTGGATCCTCCAAAGATATGTGCTACGTGATGGTTGGAGTCAGGGAACATAGGTCCATCATCGGATGGAGGATTGCTGTTGTCTTTTTCTACCAACCGTACTTGTTTCTCCTGAGAGAGTGCTATCTGTTTAGCCATCCCCTTCTGGAATATAAAGCAACTTTGCAAGGCATGTGAGGTTGTAATGTAGTTACACTATAAATATAATTACAATATAATTACATTTTAGTTAAATTATATAATTATACTATAGTTATATTTGAAAGTTTTCTAGCTAAAAAATCTTGTGCAAATTTTTTTAGCAACTCCCTAGGTAAAAGGCTAAAATTTTATTTTATTTCAAGATAAATTTTAAATTTTATAAATCAACTGAGTAATTAGGACGGATGGAGTTGTTTTCAACAGAGATAATACCCCTGATCTGTAAGCACTAGACTGCAGAATTCCACAAGTAATAATGGATAAACTTCTTTCCTAGAGCGCTTGGCATTTGGGCTGTTGGGCAGTCGGCACTGGAGCTTCCCGTCGCCTCGTTTCGTCGATGGCAAGCCCGGGCATCCTCCTCTCTACTCTCCGCGCCCCATCCGCACATACCACCTCTATGTCCTCCTACGCTACCCGCTTAGCCACCTCAAGCCCCCGCCAGCGTGGAAGCAGCTGCGGCCGCCCCTTCCTCCTCACCCCTCACCCCTCCCCCCCACCCCACCCCCCCCCTCCCCCCTGGCTCGTCGCTGCACCGCCACCTCCATGTAAGGCATGGTTCCTGTTTTTCTTTTTTTTAATCCCATTTATTCACTGCGGAGCATTTTTATTTTCTTGTTCCCCCTCCCCTGGACTGGGAGGGGTTTGTGCTGCCCGTGAGGTGTTCAGCGAATTGCACGAATGCCGCCGGCCATTGCATTTGTTGCCCGTCGTGGTTTGGCAAATTGGCCTTGTGAATTTTTTTTTGCTAGGCTGGCCGAAAGAATGGCTGACCAAATTTAATTAAGATAGGATGAGAACAAATTACAAAGATTACATAACATCGACATTAAGCTGTCGATAACAGGGTCCAGCGGACCAAACTCCTGACACAAAGCAAGCAAGAAAACTAGTTAAACATCATTATTTGTCAACATACCAGCTTCCTTCCATATTACTACCTCATCCTTTATGGCTGCAAAGGCCTTGTAAATTTGCCTTCAATATGTCATCCTTGGACTTTGAGATGCATCTGATTGAGGTTAACTGCAGTCCTTTAGTTGAGACATCTCAGAAAATCAGAATATCTTTTAAAATGTTGGAGAACAAAAATTGAGAAGTTAAGGGCCCAGGCCCTGAGCCTCGAAGGGAGGTCAATGTTAGCCTTCATAGTTCATACTGTCCCAAACACAGTAGCGTATTGAATTATTTGAACTACTTTTCCTAGATTACCTAAAGAGGATTGAGATTACATAATCTATTCAGAACTGCAAAGCTTGGAAGTGGCACAGAGACAACTATTCTTTTTACCCGGAAAAAAATAATCTGTTTTTATGGGCTTGCTAAACTTATTCTATTATGATAATTCATTCTGGCTTTAGGAAGGGGAACTTTCTGGACTTGACATTGTCTTTTGTAATTGTATACAGTTGAACTCTAGTTTTCCAATAGCATGTGTACAACTTTGTTCACTTACAAAAATGTTTCTCGCATCACAAGTTTTTTAACATGAAATTGCAGGGTGTGTGGCTAGTCCTACTATTGCTAATGTGGATGACTGCACTGAAGGTGAAGGTGCACTGGGGTACACAATGACCCAAATCTGTGATAAGTTTATTGAGTTCTTCATGTACAAGAAACCACAAACAAAGGACTGGAGAAAAGTATTGGTGTTTAGAGAGGAGTGGGAAAGATACAGACCATACTTTTACAAGCACTGTCAAGCACGTATAGATATGGAAAATGATTCTTCAATGAAGCAAAAGTTGGTTGTACTTGCTAGAAAAGTTAAGAAGGTATGCTATTATTTGGTCTCTATATGCATCCTTATCTTTTGTAAATTTGTTTGAACAAAGATTTATTTCATAATATGATTGTTAAAATCCACCATGAAAACTTAAGATTTTTTGTGACACAACATATTGGACAGTAGGTCACAAAACTCATAATCAACATATATGTTTATATCAATCATAATGTTGTGACTTGTGAATTTGCCTCATGTTTGCAATTTACTTCTCAGATTGACAATGAGATAGAGAAGCACATGGAACTCTTCACACAGCTCCGCGAGAATCCCACAGATATTAATGCCATTGTCGCAAGAAGACGAAAGGATTTCACTGGAGGGTTCTTCCAACATCTTAATTTTCTTGTTAATGCATATAATGGTCTTGATGAGAGAGATGGTAACTATATGCCTTTTAACAGTTGTTCGTTCCCAAATTGCGCTTATCTAACAAACAACTCAAAGAATT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